方法 生成并表征了用 EGFP 标记的强力霉素 (Dox) 诱导的 TP53R273H 和 SV40LT 慢病毒。用这些慢病毒转导从 21 个手术切除的 G1/G2 GEP-NET 原发性或转移性组织中消化的细胞,以产生 Dox 诱导的转基因 PDO (GM PDO)。将用荧光素酶慢病毒转导的 PanNET 的 GM PDO 注入 NSG 小鼠的胰腺中,以产生原位 GM PDO 衍生的异种移植瘤 (GM PDX)。通过 WGS 和 RNA-seq 分析检查了 GM PDO 的遗传和生物学特征,并将其与其原始肿瘤细胞进行比较。通过测量 EGFP 荧光强度来量化在 Dox-on 和 Dox-off 条件下培养的 GM PDO 的细胞生长率。通过生物发光成像监测 GM PDX 的肿瘤生长。通过 IHC 染色测量了 GM PDO 中 Dox 开启和关闭条件下的 NET 标记物 Ki67、p53 (R273H) 和 SV40LT 的表达、其原始肿瘤和 GM PDX。
图2。在293 [HEK-293] DCAS9-KRAB细胞(ATCC®CRL-1573DCAS9-KRAB™)中对基因表达敲低的验证。抑制p53和setD9基因表达。表达靶向p53和setD9基因的GRNA的慢病毒分别用于感染293 [HEK-293] DCAS9-KRAB细胞。慢病毒没有GRNA表达作为对照。感染后24小时,将抗生素添加到培养基中,以富集抗生素耐药细胞。细胞颗粒并进行DDPCR基因表达定量分析。p53基因的表达(左)和setD9基因(右)在感染GRNA的细胞中受到了显着抑制。
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注意:在Powerlyzer 24上,相当于慢于2500 rpm或比4000 rpm快的设置,使用FastPREP或前presellys同质化器无法获得。
- (慢)收敛(例如,参见Bakry等,2008) - 快速的对数圆形分布的快速(例如,F convex)(Dalalyan,2017年,Durmus和Moulines,2017年,2017年,Chewi,Chewi,2022等)
2005年,慢曲霉作为烟曲霉的一个隐种被首次报道,此后,其对唑类药物的耐药性和感染者的高死亡率就成为问题。尽管据报道P450 14-α固醇脱甲基酶(Cyp51)与慢曲霉的唑类抗性有关,但具体的抗药机制尚不清楚。在本研究中,我们利用CRISPR/Cas9基因组编辑系统成功地将整个烟曲霉cyp51A基因引入到慢曲霉的cyp51A基因座中。与亲本菌株相比,含有烟曲霉cyp51A的慢曲霉菌株对伊曲康唑和伏立康唑的最低抑菌浓度降低。这一发现表明 Cyp51A 与 A. lentulus 的唑类抗性有关,可能有助于阐明 Cyp51A 对唑类药物产生抗性的机制,并有助于开发新的抗真菌药物。此外,我们成功地将 CRISPR/Cas9 系统应用于 A. lentulus,为研究这种真菌中其他基因的功能打开了大门。关键词:Aspergillus lentulus、唑类抗性、Cas9/CRISPR、Cyp51A