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定量性状基因座分析分子标志物与胸膜胸膜胸腔的农业性状相关的分子标记
胸膜售出是一种全球蘑菇作物，具有营养和药用益处。但是，多种商业特征的遗传基础仍然未知。为了解决这个问题，我们分析了两个代表性品种“ Heuktari”和“ Miso”的定量性状基因座（QTLS），具有明显不同的等位基因。构建了一个具有11个连锁基团的遗传图，其中27个QTL分配给14个特征。QTL中解释的表型变化范围为7.8％至22.0％。分别估计了针头周期和有效齿轮的数量，相对较高的LOD值为6.190和5.485。一些QTL衍生的分子标记物在近交系中显示出选择精度的潜在增强率，尤其是对于帽形状（50％）和帽厚度（30％）。候选基因是从QTL区域推断出的，并使用QRT-PCR验证，特别是对于囊肿和谷胱甘肽途径，与Cap Yellowness有关。这项研究中的分子标记物有望促进Heuktari和Miso系的繁殖，并提供探针以鉴定P中的相关基因。ofteatus。
蛋白抑制基于新型多细胞性状的演变
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年1月22日。 https://doi.org/10.1101/2023.05.31.543183 doi：biorxiv preprint
定量性状在锚点中多样性（Coccinia ...
锚点（Coccinia abyssinica（Lam。）Cogn。）是一种土著根作物，用作埃塞俄比亚的食品和营养安全和社会经济上重要的农作物。尽管该作物具有巨大的潜力，但该国的研究和开发业上给予了较低的关注。事件尽管很少有关于锚定在几个加入的遗传多样性的研究，但本研究包括来自巨大生产领域的更多加入。使用定量性状进行了本研究，以评估埃塞俄比亚锚定400种锚定的遗传多样性。现场试验以三个复制的随机三重晶格设计进行了规定。收集了22个定量性状的数据，并进行了方差和多变量分析的分析。方差分析的结果表明，除了每个水果的位置数量和每个果实的6个位置，所有特征在附属中均显示出显着的变化（p <0.01）。在所有根特征的加入中都展示了宽范围；每植物（1-13），植物根重量（0.02-3.52 kg），总砧木（1.67-293.33 t/ha），根长度（6.4-30.08 cm），根宽度（6.09-33.16 cm）和根干重（12.9-55g/100g）。同样，果实和种子特征也表现出宽阔的范围。在根特征之间产生最高的正相关和显着相关性；总根产量（r = 0.37 **，根直径（r = 0.34 **）。根产量与种子产量（-0.001）负相关，但果实的长度与所有根特征呈正相关。聚类分析表明存在五个不同的群体，在这些群体中，它们的收集区域有多样化和各种不同。主成分分析（PCA）的结果表明，将附件分为七个基于评估的特征，即显着（特征值> 1），并解释了总变异性的55.08％。本实验中表现出的变异可以归因于环境和遗传因素。在埃塞俄比亚的锚固种质之间表现出的变异性将是在未来工作中筛选和选择锚定基因型的出色方法。
基因，共发生性状和发展动力学
注意力/多动症（ADHD）是一种异性神经发育状况，同时发生条件的流行率很高，导致长期管理中的困难增加。全基因组关联研究已经鉴定了多动症和同时发生的psy-哲学疾病之间共享的变体。但是，遗传机制尚未完全理解。我们将基因表达和空间组织数据整合到了胎儿和成人皮质组织中推定的因果ADHD基因的两样本的孟德尔随机研究中。我们在皮质组织中鉴定了多动症的四个基因（胎儿：ST3GAL3，PTPRF，PIDD1；成人：ST3GAL3，TIE1）。蛋白质 - 与因果ADHD基因所鉴定的生物学途径相结合的蛋白质相互作用数据库，这些途径将这些基因与条件（例如类风湿关节炎）和生物标志物（例如淋巴细胞计数）联系起来，但已知与ADHD相关，但没有先前显示的遗传关系。在成年肝组织上重复进行分析，在成年肝组织中，假定的因果ADHD基因ST3GAL3与胆固醇特征有关。此分析提供了对组织依赖性的时间关系，同时存在性状和生物标志物之间的依赖性时间关系。重要的是，它提供了先前研究和未研究的同时存在条件之间的遗传相互作用的证据。
定量性状适应不断变化的环境
图1：我们方法的示意图描述。要描述平衡f，我们需要以下步骤：（1）确定缩放参数ε并重新分发分布f满足的方程； （2）将分布F转换为U.转化的分布u是密度F的对数，在无性繁殖情况下按比率ε归一化，在无穷小的性繁殖案例中由ε2归一化； （3）将U的极限方程式确定为ε→0（橙色框），并推断出宏观特性（绿色框），例如平均适应度λ0，种群中的平均相对表型z ∗ 0，进化滞后| z ∗ 0 |或平衡VAR（F）处的表型方差。
物理学的定量性状基因座和候选基因...
遗传改进计划需要简单，快速和低成本的工具来筛选大量人群。近红外的反射光谱（NIR）已被证明是一种可靠的技术，可以预测D. alata山药物种中主要的块茎成分。9,10然而，由于光谱是由我们的样品而不是从原始样本产生的，因此该协议需要长时间的样本处理时间，并且仍然很难适用于大量基因型。标记辅助选择可能是促进育种工作的高通量方法。的确，随着新一代测序技术的发展，搜索与互动特征相关的基因组区域变得更加容易。已经对山药进行了一些研究，以阐明块茎质量相关特征的遗传决定论。通过在两个双阶层种群上使用定量性状基因座（QTL）映射方法，已经确定了与重要形态和农艺块茎质量性状相关的几个基因组区域。11在包括八种不同的二若氏种类（包括八种不同的二维体物种）上估算了DMC的遗传力。12在D. alata中进行了全基因组关联研究，可以鉴定与与DMC相关的一些单核苷酸多态性（SNP）标记。13
玉米中与耳朵相关性状的定量性状基因座和候选基因的热点区域：文献综述
摘要：在这项研究中，热点区域，QTL簇和候选基因具有八个与耳朵相关的玉米特征（耳长，耳长，耳道，内核行号，每行的内核数，内核长度，内核宽度，内核宽度，内核厚度和100个内核重量），并总结了三个十二次。本评论的目的是（1）全面总结和分析与这八个与耳朵相关性状相关的QTL的研究，并确定位于玉米染色体上的热点式bin区域以及与耳朵相关性状相关的关键候选基因，以及与QTL和稳定的QTL和QTL clusers和QTL clusers相关的杂物和QTL clusique和QTL clusequique and Migapppers的信息，并兴起。用于高收益和高质量玉米的映射，基因克隆和育种。先前的研究表明，与耳朵相关性状的QTL分布在玉米中的所有十种染色体上，而表型变异的解释为单个QTL范围为0.40％至36.76％。总共确定了所有十种染色体的耳朵相关性状的23个QTL热点箱。最突出的热点区域是4号染色体上的bin 4.08，其中15个QTL与八个与耳朵相关性状有关。此外，本研究确定了与耳朵相关性状相关的48个候选基因。在这些研究中，有五个被克隆和验证，而QTL热点中的二十8个候选基因是由本研究定义的。本评论对QTL映射的进步以及与八个与耳朵相关特征相关的关键候选者的识别提供了更深入的了解。这些见解无疑将帮助玉米育种者制定策略来开发高产玉米品种，从而有助于全球粮食安全。
MSA：可伸缩的DNA甲基化筛选贝德奇，用于高通量性状性状关联研究
通过实现遍及表观基因组的性状关联的发现，无花果DNA甲基化beadchip显着促进了种群规模的表观遗传学研究。在这里，我们设计，描述和实验验证了该技术的新迭代，即甲基化筛选阵列（MSA），以关注人类性状筛查和发现。此阵列利用了先前基于Infinium平台的整个表观基因组协会研究（EWAS）的大量数据。它结合了最新的单细胞和细胞类型 - 整个基因组甲基谱的知识。MSA经过设计，以实现超高样品吞吐量中表观遗传学特征关联的可扩展筛选。我们的设计涵盖了各种人类性状关联，包括具有遗传，细胞，环境和人口统计学变量以及人类疾病（例如遗传，神经退行性，心血管，感染性和免疫疾病）的人类疾病。我们全面评估了该阵列的可重复性，准确性和能力，用于细胞型反卷积和支持5-羟基甲基化分析。我们使用此平台的第一个图集数据发现了与人类表型相关的DNA修饰变化和遗传变异的复杂染色质和组织环境。
供体镰状细胞性状状态ma
•生化评估：在基线和在Matini医院实验室进行为期12周的干预期间，禁食血样（10 mL）获得。血清胰岛素，在5％以下的变异系数（CV）内和测定间系数。使用稳态模型评估 - 胰岛素抵抗（HOMA-IR）方法评估胰岛素抵抗[20]。 使用酶试剂盒（Pars Azmun，Tehran，Tehran，Iran，伊朗）评估了评估5％变化的变异量，使用酶试剂盒（PARS Azmun，Tehran，伊朗，伊朗）评估了禁食等离子体葡萄糖（FPG）和脂质型（总胆固醇，HDL，LDL，甘油三酸酯）。 使用ELISA（LDN，Nordhorn，德国）测量血清C反应蛋白（CRP）浓度，而一氧化氮（NO）水平通过Griess方法评估[21]。 使用已建立的技术分析了氧化应激的生物标志物，包括总抗氧化剂能力（TAC），总谷胱甘肽（GSH）和丙二醛（MDA），使用既定技术，具有变异系数（CVS）的等离子MDA，GSH和TAC的变异系数（CVS）。胰岛素抵抗[20]。使用酶试剂盒（Pars Azmun，Tehran，Tehran，Iran，伊朗）评估了评估5％变化的变异量，使用酶试剂盒（PARS Azmun，Tehran，伊朗，伊朗）评估了禁食等离子体葡萄糖（FPG）和脂质型（总胆固醇，HDL，LDL，甘油三酸酯）。血清C反应蛋白（CRP）浓度，而一氧化氮（NO）水平通过Griess方法评估[21]。使用已建立的技术分析了氧化应激的生物标志物，包括总抗氧化剂能力（TAC），总谷胱甘肽（GSH）和丙二醛（MDA），使用既定技术，具有变异系数（CVS）的等离子MDA，GSH和TAC的变异系数（CVS）。
定量性状适应不断变化的环境...
预测人口适应不断变化的环境对于评估人类活动对生物多样性的影响至关重要。许多理论研究通过对围绕最佳表型稳定选择的定量性状的演变进行建模，从而解决了这个问题，该定量性状的进化是在最佳表型周围稳定选择的，该表型的价值随着时间的流逝而连续地转移。在这种情况下，人口命运是由于性状的平衡分布而引起的，相对于移动最佳效果。这样的分布可能随选择形状，繁殖系统，基因座数量，突变内核或其相互作用而变化。在这里，我们开发了一种方法，该方法可以直接从表型分布的整个概况直接从表型分布的整个概况中进行定量测量，而没有任何先验的形状。我们研究了两个不同的繁殖系统（无性和无穷小的性模型），具有各种形式的选择。