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辐射杂种的汇总分析确定了哺乳动物细胞生长和药物作用的基因座
TN5转座子标记双链DNA和RNA/DNA杂交产生的核酸，这些核酸准备被放大以进行高通量测序。必须探索TN5转座子的核酸底物以增加TN5的应用。在这里，我们发现TN5转座子可以将寡核酸转置超过140个核苷酸的单链DNA的5'端。基于TN5的此属性，我们开发了一种基于标记和启用连接的单链DNA测序方法，称为Table-Seq。通过一系列反应温度，时间和酶浓度测试，我们将表格seq应用于链特异性的RNA测序，从总RNA的30 pg开始。此外，与传统的基于DUTP特异性的RNA测序相比，该方法检测到更多的基因，具有较高的链特异性，并且在基因之间显示出更均匀分布的读数。一起，我们的结果提供了有关TN5转座子特性的见解，并扩展了TN5在尖端测序技术中的应用。
自身免疫性疾病免疫调节药物感染概况：产品特征数据汇总分析
摘要 目的 在为免疫介导的炎症疾病开具免疫调节药物时，严重感染仍然是一个问题。“产品特性摘要”（SmPC）提供了来自临床试验和上市后药物警戒的不良事件（例如感染）信息。本综述旨在比较 SmPC 中报告的免疫调节药物的感染频率、部位和类型。方法 在电子药物汇编中搜索用于治疗类风湿性关节炎、脊柱关节炎、结缔组织病、自身免疫性血管炎、自身炎症综合征、炎症性肠病、牛皮癣、多发性硬化症和/或其他罕见疾病的常用免疫调节药物。提取有关感染频率、部位和生物体的信息。根据 SmPC 记录频率：非常常见（≥1/10）；常见（≥1/100 至<1/10）；不常见（≥1/1,000 至<1/100）；罕见（≥1/10,000 至 <1/1,000）；非常罕见（<1/10 000）。结果共纳入 39 种药物，涉及 20 种适应症：9 种常规合成的抗风湿药物 (csDMARDs)、6 种靶向合成的 DMARDs、24 种生物 (b)DMARDs。记录了 12 个感染部位。大多数 csDMARDs、赛妥珠单抗和利妥昔单抗的部位信息很少/没有。上呼吸道是最常见的部位，尤其是 bDMARDs。下呼吸道、耳/鼻/喉和泌尿道感染较为常见，且在药物组内聚集。记录了 27 种病原体的数据，大多数是病毒，其中单纯疱疹和带状疱疹和流感最常见。机会性感染和某些高流行率感染（例如 Epstein-Barr）的报告不一致/缺失。结论我们的研究结果显示了药物之间的差异，可以与现实世界的安全数据一起帮助做出治疗决策。然而，数据可能会因试验选择标准和每种药物的试验次数不同而产生偏差，并强调需要进行强有力的上市后药物警戒。
完成主要疫苗接种和初始加强针接种后出现严重的 COVID-19 后果：对英格兰、北爱尔兰、苏格兰和威尔士 3000 万个人的国家前瞻性队列研究的汇总分析
方法 我们通过对 3000 万人的初级保健、RT-PCR 检测、疫苗接种、住院和死亡率数据进行关联，构建了英国所有四个国家的前瞻性队列。我们在初步分析中纳入了接种过 BNT162b2（tozinameran；辉瑞-BioNTech）或 ChAdOx1 nCoV-19（牛津-阿斯利康）疫苗初级疫苗剂量的个体。然后，我们将分析范围限制为那些在 2021 年 12 月 20 日至 2022 年 2 月 28 日（当时 omicron (B.1.1.529) 变体占主导地位）期间接种过 BNT162b2 或 mRNA-1273（elasomeran；Moderna）加强剂且 COVID-19 转归严重的人。我们拟合了时间依赖性泊松回归模型，并计算了风险因素与 COVID-19 相关住院或死亡之间关联的调整率比 (aRR) 和 95% 置信区间。我们调整了一系列潜在协变量，包括年龄、性别、合并症和既往 SARS-CoV-2 感染情况。按疫苗类型进行分层分析。然后，我们使用固定效应荟萃分析对英国各国进行了汇总分析。
乳腺癌新辅助化疗后残留癌症负担和长期生存结果：5161 例患者的多中心汇总分析
通信地址：Christina Yau 博士，加利福尼亚大学旧金山分校外科系，美国加利福尼亚州旧金山 94143 HoiSze.Yau@ucsf.edu。贡献者所有作者都已审阅数据分析、审阅或修改了手稿的知识内容、批准了最终发布的版本并同意对工作的所有方面负责。CY、M-OK、MO、MvdN 和 SS 可以访问原始数据。LJE 是手稿的担保人。CY、LJE 和 WFS 构思并监督了这项研究。MO、MvdN、SS、DdC、A-SH、TGS、MdM-M、TH、RG、EP、JST、AG、PH、LM、FF、KS 和 AMDeM 整理数据。MO 和 CY 访问并核实了数据。CY 和 M-OK 正式分析并确认了数据。 DdC、A-SH、EP、JST、AG、PH、LM、FF、KC 和 CY 参与了调查。M-OK 和 WFS 开发了方法和软件。MO、MvdN、JaW 和 SS 提供了行政支持。DdC、A-SH、ML、FR、GSS、TGS、MvS、JeW、MM、MdM-M、SL-T、JCB、MPG、TH、RG、VV、SBE、JEA、JMSB、CC、JD、HE、LaH、LoH、S-JS、DC、AKG、KS、PS、AMDeM、LP、LJvV、LJE 和 WFS 提供了资源。CY 负责数据可视化。CY 和 MO 撰写了初稿。所有作者都拥有所有汇总或分析数据的完全访问权限，并对提交出版的决定负有最终责任。*贡献相同
乳腺癌新辅助化疗后残留癌症负担和长期生存结果：5161 例患者的多中心汇总分析
通信地址：Christina Yau 博士，加利福尼亚大学旧金山分校外科系，美国加利福尼亚州旧金山 94143 HoiSze.Yau@ucsf.edu。贡献者所有作者都已审阅数据分析、审阅或修改了手稿的知识内容、批准了最终发布的版本并同意对工作的所有方面负责。CY、M-OK、MO、MvdN 和 SS 可以访问原始数据。LJE 是手稿的担保人。CY、LJE 和 WFS 构思并监督了这项研究。MO、MvdN、SS、DdC、A-SH、TGS、MdM-M、TH、RG、EP、JST、AG、PH、LM、FF、KS 和 AMDeM 整理数据。MO 和 CY 访问并核实了数据。CY 和 M-OK 正式分析并确认了数据。 DdC、A-SH、EP、JST、AG、PH、LM、FF、KC 和 CY 参与了调查。M-OK 和 WFS 开发了方法和软件。MO、MvdN、JaW 和 SS 提供了行政支持。DdC、A-SH、ML、FR、GSS、TGS、MvS、JeW、MM、MdM-M、SL-T、JCB、MPG、TH、RG、VV、SBE、JEA、JMSB、CC、JD、HE、LaH、LoH、S-JS、DC、AKG、KS、PS、AMDeM、LP、LJvV、LJE 和 WFS 提供了资源。CY 负责数据可视化。CY 和 MO 撰写了初稿。所有作者都拥有所有汇总或分析数据的完全访问权限，并对提交出版的决定负有最终责任。*贡献相同
C-MET 抑制剂作为 NSCLC 治疗药物库的新成员——汇总分析
目的：卡马替尼和替泊替尼是两种最近获得 FDA 批准的高特异性 c-MET 外显子 14 跳跃突变小分子抑制剂，是治疗携带 c-MET 变异的 NSCLC 患者的新型重要治疗选择。但这些分子作为一种新治疗选择的具体作用仍未完全确定。方法：为了进一步评估 c-MET 抑制剂对晚期和转移性 NSCLC 治疗方案的贡献，对相关的 II 期和 III 期研究的 ORR 和 mPFS 进行了回顾性分析（目前的 c-MET 试验仍未获得 mOS 数字，因此不用于统计目的）。结果：与标准化疗相比，使用新型高选择性 c-MET 抑制剂治疗携带 c-MET 外显子 14 跳跃突变的晚期和转移性 NSCLC 患者明显优于（p < 0.0001）。然而，当将 c-MET 抑制剂与免疫疗法或免疫疗法和化疗相结合时，在 ORR 和 PFS 方面没有发现显著差异，但据报道 c-MET 治疗的耐受性要好得多。结论：新型高选择性 c-MET 抑制剂卡马替尼和替泊替尼是主要在一线治疗中用于 c-MET 失调 NSCLC 患者的有前途的新型治疗选择，尽管尚未确定明确的 mOS 益处。由于免疫疗法对携带 c-MET 变异的 NSCLC 患者似乎没有特别有效，因此绝大多数此类患者接受免疫疗法加化疗治疗。C-Met 抑制剂似乎同样有效，从而使患者免受化疗的毒性作用。应作为 GEOMETRY 对 c-MET 外显子 14 跳跃突变进行常规检测
引用：Rahlin M, Duncan B, Howe CL, et al. 物理治疗强度如何影响粗大运动功能测量 (GMFM-66) 总分
摘要 简介 对脑瘫 (CP) 儿童实施的强化物理治疗 (PT) 干预已在已发表的文献中引起大量关注。然而，不同研究的治疗强度存在很大差异，而且明显缺乏关于最佳干预剂量的信息。这使得临床医生很难使用证据来指导实践。许多研究使用粗大运动功能测量 (GMFM-66) 来评估 CP 儿童的功能进展。本系统评价的目的是确定已发表研究中报告的 GMFM-66 变化评分，并根据干预强度确定结果。还将评估 PT 干预类型、儿童年龄和粗大运动功能分类系统水平是否影响 GMFM-66 评分。方法与分析本系统评价方案是根据系统评价和荟萃分析方案的首选报告项目 (PRISMA-P) 2015 清单制定的。 2018 年 3 月，我们在九个数据库（PubMed、Ovid MEDLINE、Cochrane Library、Embase、Scopus、Web of Science、CINAHL、ClinicalTrials.gov 和 REHABDATA）中搜索了使用 GMFM-66 作为 18 岁以下 CP 儿童结果测量的任何类型和强度的 PT 干预的临床对照试验和单一受试者设计研究。两位作者独立审查了标题和摘要，并就全文审查的论文选择达成共识。根据进一步详细的纳入标准，全文文章筛选使用相同的流程，最终选择适合数据提取的论文。在开始数据提取之前，所有搜索都将更新，并重新筛选新结果。伦理与传播本研究将涉及对已发表文章的系统评价，但不收集原始数据。因此，不需要伦理批准。结果将在同行评审的出版物中传播并在科学会议上发表。 PROSPERO 注册号码 CRD42020147669