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World File Search System抗原
机器学习方法和统一的数据集改善了免疫原性的新抗原预测
Markus M€Uller，1，2，2，3，4， * Florian Huber，1，2，3 Marion Arnaud，1，2，3 Anne I. Talita Gehret, 1, 2, 3 Aymeric AUGER, 1, 2, 3 Brian J. Stevenson, 3, 4 George Coukos, 1, 2, 3, 5 Alexandre Harari, 1, 2, 3, 5 and Michal Bassani-Sternberg 1, 2, 3, 5, 6, * 1 Ludwig Institute for Cancer Research, University of Lausanne, 25a, 1005 Lausanne, Switzerland 2肿瘤学系，中心医院维多伊大学（CHUV），Rue du Bugnon Rue du Bugnon 46，1005 Lausanne，瑞士洛桑3，瑞士1011 Agora Cancer Research Center，瑞士4 SIB SWISS SWISS Institute of BioIninformitics，Sorge Districtics，Sorge Districtics，Sorgeanne，Switzerland，Switzerland 5 （CHUV），瑞士洛桑（Lausanne），卢桑（Lausanne），第46页，瑞士6铅联系 *通信：markus.muller@chuv.ch（M.M.M.），michal.bassani@chuv.ch（M.B.-S.）https://doi.org/10.1016/j.immuni.2023.09.002
供体衍生的多重白血病抗原特异性T细胞疗法，以防止所有
美国路易斯维尔大学医学院肝病学和营养学系医学系，美国肯塔基州路易斯维尔；美国肯塔基州路易斯维尔市路易斯维尔大学医学院B UOFL酒精研究中心； C诺顿神经科学研究所，4915 Norton Healthcare Blvd，美国肯塔基州路易斯维尔； D UOFL HEPATOBIOLOGY COBRE，美国路易斯维尔大学医学院，美国肯塔基州路易斯维尔； E美国路易斯维尔大学医学院解剖科学与神经生物学系；美国德克萨斯州休斯敦市贝勒医学院分子病毒与微生物学系宏基因组学与微生物组研究中心； G，美国路易斯维尔大学医学院生理学系，美国肯塔基州路易斯维尔； H美国路易斯维尔路易斯维尔大学医学院药理学与毒理学系； i路易斯维尔大学医学院神经外科系，美国肯塔基州路易斯维尔；美国肯塔基州路易斯维尔的Robley Rex VA医学中心医学系J
基于OCT4免疫显性基序抗原的抗癌疫苗的合成及免疫学研究
摘要 目的：肿瘤干细胞是肿瘤形成的重要原因之一，也是恶性肿瘤治疗的药物靶点，但目前尚无针对该细胞的免疫疫苗。八聚体结合转录因子4（OCT4）是胚胎干细胞和生殖细胞的标志，往往在肿瘤形成的早期阶段高表达，是开发肿瘤疫苗的良好候选者。方法：为寻找最佳的载体和佐剂组合，我们化学合成了三种不同的OCT4表位抗原并将其连接到载体蛋白海兔血蓝蛋白（KLH）上，并与Toll样受体9激动剂（TLR9）结合。结果：OCT4-3+TLR9免疫小鼠产生的免疫应答最强。在预防试验中，用OCT4-3+TLR9处理的BABL/c小鼠的肿瘤生长明显受到抑制（P<0.01）。重要的是，结果显示，在用OCT4-3与TLR9联合免疫的小鼠中，细胞毒性T淋巴细胞活性和肿瘤生长抑制得到增强。同时，在用OCT4-3 + TLR9免疫的小鼠中，多种促进细胞免疫反应的细胞因子[例如干扰素（IFN）-γ（P <0.05），白细胞介素（IL）-12（P <0.05），IL-2（P <0.01）和IL-6（P <0.05）]被证明大大增强。此外，我们在疫苗成分方面考虑了安全性，以帮助促进有效的下一代疫苗的开发。结论：总之，这些实验表明与TLR9激动剂的联合治疗可诱导肿瘤特异性适应性免疫反应，从而抑制睾丸胚胎癌的原发性肿瘤生长。关键词癌症预防；癌症免疫学；OCT4；TLR9激动剂
单核细胞人白细胞抗原DR表达患有心肺旁路的年轻婴儿
Alexis Chenouard，Marie Rimbert，Nicolas Joram，CécileBraudeau，Antoine Roquilly等。胸腔手术年鉴，2021，111（5），第1636-1642页。10.1016/j.athoracsur.2020.05.071。hal-04706563
揭露新承诺：扩大抗体 - 药物缀合物的抗原景观
在本期的临床癌症研究中，约翰逊和联盟（1）报告了CX-2029的第一个人类I期研究的剂量降低结果，CX-2029是一种新型探险药物偶联物（PDC），靶向转铁蛋白受体1（TFR1/CD71）。这项工作是第一个在临床上验证CD71作为抗体 - 药物缀合物（ADC）的新靶标。ADC的承诺依赖于通过接头连接到细胞毒性有效载荷的肿瘤抗体的概念。在抗原结合后，ADC被内在化，链接器的裂解发生，有效载荷介导的细胞死亡将发生。这种治疗方式具有提高效率的潜力，同时限制了常规化学疗法的毒性，总体上增加了常规药物的治疗指数。尽管在过去几十年中几百个ADC进入了该诊所，但截至2021年4月，FDA仅批准了10个ADC，在过去的两年中，其中的五年批准了其中的五年。多个组件必须对齐才能建立成功的ADC：靶抗原选择，抗体构建体，接头稳定性以及有效载荷共轭和效力。所有这些领域都是领域重要发展的主题（图1）。到目前为止，一个重要的局限性是抗原选择，因为与血液学肿瘤不同，大多数实体抗原是相关的肿瘤，而不是肿瘤，因此有效载荷递送到正常组织已限制了ADC的治疗指数。因此，在该领域，很明显地需要开发以扩大ADC的抗原光谱。这是一个例子，是bivatuzumab，一种靶向CD44V6的ADC，一种受体大量存在于头和颈部鳞状细胞癌中，但同时在正常的角质形成细胞上，导致I期试验期间致命的皮肤毒性（2）。它值得注意的是，到目前为止，在10个ADC中，只有4种在靶向三种抗原的实体瘤中批准，该抗原，建立了良好的HER2（Trastuzumab Emtansine和Trastuzumab deruxtecan）和最近的Trop2和最近的Trop2（Sacituzumab Govitecan）和nectin4（sacituzumab govitecan）和nectine4（Enectine4）
研究ANTXR2基因突变对保护性抗原结合以增强炭疽抗性的影响
摘要：炭疽芽孢杆菌是负责引起人畜共患病的细菌。该疾病以胃肠道，吸入和皮肤等不同形式表现出来。细菌孢子非常适应能力，可以长时间持续存在，偶尔会危害人类健康。炭疽毒素受体-2（ANTXR2）基因充当膜受体，并促进炭疽毒素进入宿主细胞。此外，ANTXR2基因中的突变与各种自身免疫性疾病有关，包括透明质纤维瘤病综合征（HFS），强直性脊柱炎（AS），少年透明透明纤维瘤病（JHF）和婴儿透明的全身病（ISH）（ISH）。这项研究深入研究了ANTXR2的遗传格局，旨在理解其与多种疾病的关联，阐明其突变的影响，并确定能够减少AntxR2基因与保护性抗原的结合亲和力的最小非疾病突变。认识到单核苷酸多态性（SNP）在塑造遗传多样性中的关键作用，我们进行了计算分析，以识别ANTXR2基因中高度有害和耐受性的非同义SNP（NSSNP）的高度有害和耐受性的非同义性SNP（NSSNP）。MutPred2服务器确定ANTXR2基因中的ARG465TRP改变会导致DNA结合改变（p = 0.22），概率为0.808；值得注意的是，在确定的有害SNP中，RS368288611（ARG465TRP）由于对改变ANTXR2的DNA结合能力的显着影响而脱颖而出。我们提出这些SNP作为与Antxr2基因相关的高血压的潜在候选者，这与血压调节有关。在耐受的取代中值得注意的是RS200536829（ALA33SER），被认为是致病性的较少。这突出了其作为有价值的生物标志物的潜力，可能会减少宿主的副作用，同时还减少与保护性抗原蛋白的结合。研究这些SNP具有与几种自身免疫性疾病相关的潜力，并减轻了炭疽病对人类的影响。
癌症/睾丸抗原 55 是癌细胞增殖和线粒体 DNA 维持所必需的
癌症/睾丸抗原 (CTA) 代表一组蛋白质，其在生理条件下的表达仅限于睾丸，但在许多人类癌症中被激活。此外，据观察，多个 CTA 的共同表达会使患者的预后恶化。据报道，有五种 CTA 作用于线粒体，我们最近报道了 67 种 CTA 编码的 147 个转录本，这些转录本编码了可能针对线粒体的蛋白质。其中，我们确定了 CT55 编码的两种异构体，其功能尚不明确。首先，我们发现表达野生型 CT55 的肿瘤患者生存率较低。此外，CT55 沉默会显著降低细胞增殖。其次，为了研究 CT55 对线粒体的作用，我们首先表明，由于存在不明确的 N 端靶向信号，CT55 定位于线粒体和内质网 (ER)。然后，我们表明 CT55 沉默会降低 mtDNA 拷贝数并延迟急性耗竭后的 mtDNA 恢复。此外，CT55 启动子的去甲基化会增加其表达，进而增加 mtDNA 拷贝数。最后，我们测量了 NCI-60 细胞系中的 mtDNA 拷贝数，并筛选出表达与 mtDNA 量密切相关的基因。我们将 CT55 确定为第二高的相关性命中。此外，我们还表明，与 siRNA 乱序对照 (siCtrl) 治疗相比，CT55 特异性 siRNA (siCT55) 治疗下调了
癌症免疫中的树突状细胞亚群和肿瘤抗原传感
树突状细胞（DC）表现出专门的抗原功能，并在先天和适应性免疫反应中起关键作用。由于它们能够与幼稚的T细胞交叉肿瘤细胞相关的抗原，因此在控制肿瘤生长和肿瘤细胞传播的特定T细胞介导的抗肿瘤效应子反应中发挥了作用。在免疫抑制肿瘤微环境中，直流抗肿瘤功能可能会严重受损。在这篇综述中，我们专注于肿瘤细胞抗原DC捕获和激活的机制，以及肿瘤微环境在塑造DC功能中的作用，利用最近的研究，显示了SCRNA-Seq分析揭示的表型获取，转录状态和功能程序。还讨论了DC介导的肿瘤抗原传感在启动抗肿瘤免疫中的治疗潜力。
Isoginkgetin衍生物IP2增强了针对肿瘤抗原的适应性免疫反应
摘要：人dickkopf（DKK）家族包括四种主要的分泌蛋白质，DKK-1，DKK-2，DKK-3和DKK-4，以及DKK-3相关蛋白质潮湿（SGY-1或DKKL1）。这些糖蛋白在各种生物学过程中起着至关重要的作用，尤其是对Wnt信号通路的调节。dkk-3是不同的，其在发育，干细胞分化和组织稳态中的多面作用。有趣的是，根据环境，DKK-3似乎具有免疫调节功能，在癌症中具有复杂的作用，它是肿瘤抑制剂或癌基因。dkk-3是一个有前途的诊断和治疗靶标，可以通过表观遗传重新激活，基因治疗和DKK-3阻滞剂来调节。但是，需要进一步的研究来优化基于DKK-3的疗法。在这篇综述中，我们全面描述了DKK-3的已知功能，并强调了上下文在理解和利用其在健康和疾病中的作用方面的重要性。
具有提高AAV生产率的新的T抗原负HEK293细胞系
图1Hekexpress®细胞的基因型表征。（a）使用靶向T抗原编码序列的引物（集1）的引物，跨Hekexpress®基因组的TLA序列覆盖率。绘图表明质粒的积分位点位于3染色体等效物（CHR3）上。（b）使用针对T抗原编码序列（集1）或CHR3（集3和4）的引物（集3和4）的引物（集3和4）的引物，（b）在人类CHR3中整合基因座的TLA序列覆盖率。 集合1的覆盖范围表明，与人类HG38基因组相比，Hekexpress®基因组（绿色箭头）中的550 kb缺失。 集合3和4的覆盖范围确认了综合质量PRTAK的连接。 （c）PRTAK质粒图最初集成在Hekexpress®细胞系中。 大小的T抗原序列在橙色的基因中，在深紫色和grnas（grna_beginning和grna_end）中指示。 （d）Chr3等效（红色）的图与550 kb缺失以及包含T抗原序列的PRTAK质粒的整合。 由TLA证实的质粒 - 染色体连接均以蓝色指示。 Hek，人类胚胎肾； TLA，靶向基因座放大。（b）在人类CHR3中整合基因座的TLA序列覆盖率。集合1的覆盖范围表明，与人类HG38基因组相比，Hekexpress®基因组（绿色箭头）中的550 kb缺失。集合3和4的覆盖范围确认了综合质量PRTAK的连接。（c）PRTAK质粒图最初集成在Hekexpress®细胞系中。大小的T抗原序列在橙色的基因中，在深紫色和grnas（grna_beginning和grna_end）中指示。（d）Chr3等效（红色）的图与550 kb缺失以及包含T抗原序列的PRTAK质粒的整合。由TLA证实的质粒 - 染色体连接均以蓝色指示。Hek，人类胚胎肾； TLA，靶向基因座放大。