242 图 5:组蛋白 H2B 的 NLS 序列将厌氧荧光报告基因定位到真菌细胞的细胞核 243。A) 厌氧真菌在组蛋白 H2B 上具有独特的 5' 前导序列,与模型真菌谱系的前导序列不同。B) 保守厌氧真菌组蛋白 245 2B 前导序列或假定 NLS 的一致序列。C) 用含有潮霉素抗性和 iRFP 的构建体转化的真菌细胞的共聚焦显微镜检查能够选择和可视化 iRFP 表达。有关这些构建体的完整描述,请参阅表 2。248 249
纹状体多巴胺信号传导。使用前摄取蛋白 - 碳报告小鼠系列,我们表征了小鼠背纹状体中PNOC mRNA表达的高度选择性的脑膜图模式,反映了PNOC的早期发育表达。在腹侧纹状体中,将PNOC表达聚集在伏隔核和内侧壳中,包括成年纹状体。我们发现PNOC TDTOMATO报告基因细胞在很大程度上包括多巴胺受体D1(DRD1)表达培养基的棘突投射神经元,位于背纹状体中,已知在
图3。左上角:ADCC生物测定原则的插图。右上:在ADCC生物测定效应子Jurkat细胞系中FcγRIIIIA-F158过表达的流式细胞仪分析(F变体; BPS Bioscience#60540)。左下:在表达HER2 SKBR-3乳腺癌细胞的情况下,ADCC对抗HER2抗体药物曲妥珠单抗反应。右下:在SKBR-3和FcγRIIIIA-F158/NFAT荧光素酶报告基因jurkat细胞(EC50 = 28.1 ng/ml)的共同培养中,ADCC对增加剂量的曲妥珠单抗的反应。用biorender.com创建的插图。
严重交界性大疱性表皮松解症是一种罕见的遗传性产后致死性皮肤病,主要由 LAMB3 基因中的无义/过早终止密码子 (PTC) 序列变体引起。LAMB3 编码 LAMB3,即表皮 e 真皮皮肤锚定层粘连蛋白 332 的 b 亚基。PTC mRNA 的大多数翻译读段都会产生截短的、无功能的蛋白质,而内源性 PTC 读通机制会产生最低水平和不足的全长蛋白质。传统的翻译读通诱导药物会放大内源性 PTC 读通;然而,翻译读通诱导药物要么具有蛋白毒性,要么是非选择性的。核糖体编辑是一种更具选择性且毒性较小的策略。该技术确定了核糖体蛋白 L35/uL29(即 RpL35)和 RpL35 配体可再利用药物青蒿琥酯和阿扎那韦作为增加全长 LAMB3 产量的分子工具。为了评估活细胞中的配体活性,我们通过双荧光素酶报告基因检测监测了青蒿琥酯和阿扎那韦的治疗。青蒿琥酯治疗后全长 LAMB3 的产量水平增加高达 200%,阿扎那韦治疗后增加高达 150%,在降低药物剂量的情况下与 RpL35 配体联合治疗后增加高达 170%,而不相关的 PTC 报告基因无反应。RpL35 配体在选择性增加全长 LAMB3 方面的生物活性证明为补充严重交界性大疱性表皮松解症中的 LAMB3 的替代靶向治疗途径提供了基础。
基因编辑技术已经彻底改变了蚊子感觉双学科的领域。这些技术已被用来用神经元基因与框架敲击报告基因,并使用TAG特定的蚊子神经元使用二进制表达系统来检测其活性。尽管有这些进展,但仍需要开发新的工具来阐明嗅觉信号从pe层到大脑的传播。在这里,我们提出了一组工具的开发,包括新型驱动线和神经调节活动的传感器,这可以介绍我们对感觉输入触发行为输出的了解。这种情况可以改变我们对蚊子神经生物学的理解,并导致制定蚊子行为操纵策略以减少叮咬和疾病的传播。
体内和体外的定量转录调控研究通常使用报告基因蛋白。在这里我们表明,使用西兰花适体,可以在各种调节方案中对转录的定量研究,而无需翻译步骤。为了探索我们研究了使用基于热力学占用模型的几种调节方案,并与以前的研究发现了极好的一致性。在下一步中,我们表明非编码DNA可以对转录水平产生巨大影响,类似于与操作员站点具有很强亲和力的LAC阻遏物的影响。最后,我们指出了该方法的局限性,该延迟时间与适体折叠的关系。我们得出结论,西兰花适体适合定量转录测量。
CRISPR/Cas9 编辑的效率和结果取决于切割位点的染色质状态。研究表明,改变染色质状态可以影响效率和修复结果,并且表观遗传药物已被用于改善 Cas9 编辑。然而,由于这些药物的靶蛋白在基因组中分布不均匀,因此这些药物的疗效可能因位点而异。在这里,我们系统地分析了 160 种表观遗传药物的染色质背景依赖性。我们使用具有 19 个稳定整合报告基因的人类细胞系在不同的染色质环境中诱导双链断裂 (DSB)。然后,我们通过对突变特征进行测序来测量 Cas9 编辑效率和修复途径使用情况。我们确定了 67 种药物
检测设置 在第二个案例研究中,我们开发了一种 CBA,使用重组 HEK-Blue™ 报告细胞来检测针对药物的 NAbs,这是一种与细胞因子结合的融合抗体。HEK-Blue™ 报告细胞系统由 HEK293 细胞组成,这些细胞经过基因改造,可表达细胞因子特异性受体和主要信号蛋白,从而获得完全活跃的信号通路(图 2. A)。细胞因子激活受体会触发下游信号传导和分泌性胚胎碱性磷酸酶 (SEAP) 报告基因的表达。细胞上清液中分泌的 SEAP 量可以用 SEAP 检测培养基(比色酶测定)测量,并且与细胞因子活性成正比,与抗细胞因子 NAbs 的浓度成反比
使用Proteome Discoverer 3.2软件和Sequest®HT搜索算法进行数据分析。肽的修饰包括用于HELA的氨基甲基甲基化(C)的动态修饰,用于蛋白质混合物的羧甲基化(C),TMTPRO标签(N-末端,K)和MET氧化。FDR阈值在渗透剂节点中设置为1%,以识别肽和蛋白质鉴定的高置信度。在报告基因离子量化器节点中指定了11 ppm的记者离子峰积分耐受性,并使用新的集成的报告频道控制通道范围的范围范围范围进行了剥离和非剥离的控制通道,对剥离和非置换通道组的归一化进行了归一化。
和进一步经历了同性恋,导致多价相互作用和LLP的诱导。VP16被募集到CMV最小启动子提供的转录起始位点,并诱导报告基因表达。(b)调整转化因子冷凝物的材料特性。要修改凝结物材料特性,采用了两种策略:首先,通过将CRY2换成Cry2 Olig,从而增加了相互作用的价值,而Cry2 Olig构成了高阶寡聚物;其次,通过共转染编码融合到麦克里(可视化)和fus n和nLS的cry2 olig的结构来提高价值和浓度。与CRY2-EYFP-FUS N -VP16或CREY2 OLIG -EYFP-FUS N -VP16构建体(黄色和绿色数据点)共转染了编码CIBN-TER和基于TETO 4的SEAP报告基因。可选地,添加了编码Cry2 Olig -MCH -MCH -FUS n -nls的构造(以2:1的质粒量比为2:1相对于含VP16的构建体,红色和黑色数据点)。在进行FRAP分析之前,将细胞在黑暗中培养32小时。蓝光照明10分钟后(2.5 µmol m -²S-1)开始。 图像在液滴漂白之前直接显示出反应性核。比例尺= 5 µm。 图显示了根据n≥7凝结物回收曲线的非线性拟合计算出的移动部分的平均值和单个值(请参见右图)。 使用学生的t.test(*=p≤0.05; **** =p≤0.0001)进行成对比较。。图像在液滴漂白之前直接显示出反应性核。比例尺= 5 µm。图显示了根据n≥7凝结物回收曲线的非线性拟合计算出的移动部分的平均值和单个值(请参见右图)。使用学生的t.test(*=p≤0.05; **** =p≤0.0001)进行成对比较。