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World File Search System推断
有效推断分位数治疗效果和超越
我们考虑在估计估计方程式中估计涉及依赖目标参数作为输入的高维滋扰函数的估计参数。一个中心示例是因果推理中（局部）分位处理效应（（l）QTE）的效率估计方程，该方程涉及在分位数上评估的协方差累积分布函数以进行估计。基于估计的滋扰和插入估计值的现有方法，例如伪造的马克内斯学习（DML），我们需要我们在所有可能的输入中学习滋扰。对于（L）QTE，DML要求我们学习整个协变量累积分布函数。我们相反提出了局部付符的机器学习（LDML），该学习避免了此盗窃步骤，并且只需要在单个初始粗略猜测目标参数的情况下估算烦恼。对于（L）QTE，LDML仅涉及学习两个回归功能，这是机器学习方法的标准任务。我们证明，在LAX速率条件下，我们的估计器具有与使用未知的真实滋扰的不可行的估计器相同的渐近行为。因此，LDML显着实现了实际上可比性和理论上的效率估计因果推理中重要数量的效果，例如（l）QTES，当我们必须控制许多协变量和/或相关关系时，正如我们在经验研究中所证明的那样。
心脏谷煤矿中的金丝雀。假肢闭合期间的流速和推断剪切 - 血液损伤和凝结的预测
抽象目的：证明在瓣膜闭合期间预测的血剪力与血栓形成性之间的明确联系，这解释了组织和机械阀之间的血栓形成差异，并提供了一种实用的度量，以开发和完善假体瓣膜设计，以降低血栓形成性。方法：使用脉冲和准稳态流系统进行测试。使用校准预测参考孔口区域的模拟光电电子学测量了预计开放区域（POA）的时间变化。在心脏周期上确定的流速度等于瞬时体积流量除以POA。在闭合阀间隔中，确定并用于性能分析，用于准稳态的背压/流程测试的阀泄漏的等效POA。通过推断的速度梯度（剪切）（剪切）的最大负阴性和正闭合流速度排名的性能。测试了临床，原型和对照阀。结果：多个测试数据集的血液剪切和凝块潜力指导经验优化和阀设计的比较。评估用于软闭合的3D印刷原型阀设计（BV3D）表明了降低血栓形成性的潜力。
CORNN：循环神经网络的凸优化，用于快速推断神经动力学
光学和电生理记录技术的进步使得记录数千个神经元的动态成为可能，为解释和控制行为动物的大量神经元开辟了新的可能性。从这些大型数据集中提取计算原理的一种有前途的方法是训练数据约束的循环神经网络 (dRNN)。实时进行此类训练可以为研究技术和医学应用打开大门，以在单细胞分辨率下建模和控制干预措施并驱动所需的动物行为形式。然而，现有的 dRNN 训练算法效率低下且可扩展性有限，使得即使在离线场景下分析大量神经记录也具有挑战性。为了解决这些问题，我们引入了一种称为循环神经网络凸优化 (CORNN) 1 的训练方法。在模拟记录研究中，CORNN 的训练速度比传统优化方法快 100 倍左右，同时保持或提高了建模准确性。我们进一步在数千个执行简单计算（例如 3 位触发器或定时响应的执行）的单元模拟中验证了 CORNN。最后，我们表明，尽管生成器和推理模型之间存在不匹配、观察到的神经元严重子采样或神经时间尺度不匹配，CORNN 仍可以稳健地重现网络动态和底层吸引子结构。总体而言，通过在标准计算机上以亚分钟级处理时间训练具有数百万个参数的 dRNN，CORNN 迈出了实时网络重现的第一步，该网络重现受限于大规模神经记录，并且是促进神经计算理解的强大计算工具。
通过靶向的无细胞DNA甲基化对神经内分泌前列腺癌的无创检测 发现和基于V形连接器分子的基于葡萄的金属有机框架的原位结晶研究 医学中的人工智能 展开微生物群-Iris -Eperto 自适应进化：细菌和癌细胞如何生存... 固体二氧化硅纳米颗粒作为水性介质中荧光方染料的载体：迈向分子工程方法 内源性心脏保护剂-Iris -Aperto 贝叶斯非参数推断``物种采样...
通过谱系可塑性和发散的克隆进化（3，5-7）。CRPC-NE患者通常通过类似于小细胞肺癌（SCLC）的化学疗法方案进行积极治疗，并且还在进行几项CRPC-NE指导的临床试验。当前CRPC-NE的诊断仍然存在，因为需要转移活检以及室内肿瘤异质性。浆细胞-FRE-FREDNA（CFDNA）的DNA测序是一种无创的工具，可检测CER中的体细胞改变（8）。但是，与CRPC-Adeno相比，癌症特异性突变或拷贝数的变化仅在CRPC-NE中适度富集（3，9）。相反，我们和其他人观察到与CRPC-NE相关的广泛的DNA甲基化变化（3，10），并且可以在CFDNA中检测到这种变化（11，12）。DNA甲基化主要是在CpG二核苷酸上进行的，并且与广泛的生物学过程有关，包括调节基因的表达，细胞命运和基因组稳定性（13）。此外，DNA甲基化是高度组织特异性的，并提供了强大的信号来对原始组织进行反v，从而允许增强循环中低癌部分的检测（16、17），并已成功地应用于早期检测和监测（18，19）。如前所述，可以用甲硫酸盐测序来测量基础分辨率下的DNA甲基化，该测序为每种覆盖的CpG提供了一小部分甲基化的胞质的β值的形式，范围为0（无甲基化）至1（完全甲基化）。低通序测序遭受低粒度，并以粗分辨率捕获所有区域。原则上，诸如全基因组Bisulfite CFDNA测序（WGB）之类的方法可以很好地了解患者的疾病状况，并具有最佳的甲基化含量信息。实际上，鉴于高深度全基因组测序的成本，WGB的低通型变种适用于大规模的临床研究。鉴于此上下文中的大多数CPG站点可能是非信息或高度冗余的，我们旨在将测序空间减少到最小设置
通过一般机器学习在随机实验中发现的异质治疗效果的统计推断
ˆτ1-005 2.97 94。0％ - 001 1.57 95。6％ - 001 0.59 97。7％％τ2 - 006 2.58 95。9-004 1.08。2 0。01 0.54 98。6 ˆτ3 - 001 2.56 96。7 - 005 1.06。7 0。02 0.47 98。1τ4 - 012 2.87 97。4 0。05 1.15 97。9-001 0.51 98。6 ˆτ5014 3.45 94。1 0。00 1.62 96。0 - 001 0.62 98。3外观
提出的用于测量比较核酸的中性化推断
摘要本文引入了生物信息学领域的新型中性粒细胞推断模型。该模型用于开发一个可靠的模型，以进行人核酸的精确比较，其中新的DNA序列与旧核酸的综合数据库相匹配。根据准确性，确定性，不确定性，公正性和中立性分析结果。在某些情况下，提出的模型在某些情况下获得了33％的平均准确性率，但序列之间的相似性表明其能够准确地以85％的高准确率差异为85％，这突出了其在区分不同序列方面的有效性。然而，在某些情况下，中立标准产生0％的中性标准可能会引起人们对模型结果对特定样本的潜在偏差的担忧。需要进一步的研究来了解影响中立性的因素并改善其以获得无偏见的结果。总而言之，这项研究强调了在生物信息学领域中采用中性嗜性推断模型的重要性。它为未来的核酸比较建立了可靠的基准，为序列分析和基因组研究中的高级和更全面的应用铺平了道路。
反转问题：为什么算法应推断精神状态，而不仅仅是预测2023年10月6日的行为，乔恩·克莱恩伯格（Jon Kleinberg），詹斯·路德维格（Jens Ludwig），sendhil mull
摘要越来越多地将机器学习应用于人类行为。这些算法越来越遭受一个隐藏但严重的问题。之所以出现，是因为他们经常预测一件事，而希望另一件事。采用推荐系统：它可以预测点击，但希望识别偏好。或一种使放射科医生自动化的算法：它可以预测在静置的诊断，同时希望确定其反思性判断。心理学向我们展示了此类预测任务的目标与我们希望实现的目标之间的差距：人们可以无意识地点击；专家可能会疲倦并犯系统错误。我们认为这种情况无处不在，称它们为“反演问题”：真正的目标需要理解在行为数据中直接测量的精神状态，而必须与行为倒转。识别和解决这些问题需要借鉴行为和计算科学的新工具。
推断人类和猴子虚拟平衡任务中的控制目标
自然行为具有冗余性，这意味着人类和动物可以通过不同的控制目标实现其目标。仅根据行为观察，是否可以推断出受试者正在采用的控制策略？这一挑战在动物行为中尤其严峻，因为我们无法要求或指示受试者使用特定的控制策略。本研究提出了一种三管齐下的方法来从行为中推断动物的控制策略。首先，人类和猴子都执行了虚拟平衡任务，可以使用不同的控制目标。在匹配的实验条件下，在人类和猴子中观察到相应的行为。其次，开发了一个生成模型，该模型代表了实现任务目标的两种主要控制策略。模型模拟用于识别可以区分正在使用哪个控制目标的行为方面。第三，这些行为特征使我们能够推断出被指示使用一个或另一个控制目标的人类受试者所使用的控制目标。基于此验证，我们可以从动物受试者中推断策略。能够从行为中准确识别受试者的控制目标，为神经生理学家寻找感觉运动协调的神经机制提供强有力的工具。
贝叶斯推断划分数据的框架
使用大数据进行贝叶斯计算的常见分裂方法是分区数据，分别对每一部分进行局部推断，并结合结果以获得全局后近近似值。虽然在概念上和计算上具有吸引力，但该方法涉及有问题的需要，也需要将局部推断的先验分开；这些疲软的先验可能无法为每个单独的计算提供足够的正则化，从而消除了贝叶斯方法的关键优势之一。为了解决这一难题，同时仍保留了基本局部推理方法的普遍性，我们将期望传播（EP）的想法应用于分布式贝叶斯推论的框架。鉴于其他近似值和先验的状态，迭代的想法是迭代地更新局部可能性的近似值。
从环境DNA metabarcoding推断功能多样性
Aglieri，G.，Baillie，C.，Mariani，S.，Cattano，C.，Calò，A.，Turco，G.，Spatafora，D.，Di Franco，A.环境DNA有效地捕获了沿海鱼类社区的功能多样性。分子生态学，30（13），3127–3139。https://doi.org/10.1111/mec.15661 Albert，J。S.，Destouni，G.，Duke-Sylvester，S.M.，Magurran，A.E.（2021）。科学家对淡水生物多样性危机的人类警告。Ambio，50，85–94。https://doi.org/10.1007/s1328 0-020-01318 -8 Albert，J.S.，Tagliacollo，V.A。，＆Dagosta，F。（2020）。新热带淡水鱼的多样化。生态，进化和系统学的年度审查，51（1），27-53。https://doi.org/10.1146/annur ev- ecols YS-01162 0-031032 BELLEMAIN，E.，CARLSEN，T.，BROCHMANN，C.，COISSAC，COISSAC，E.它是真菌的环境DNA条形码：一种硅方法揭示了潜在的PCR偏见。BMC微生物学，10（189），189。https：// doi。org/10.1186/1471-2180-10-189 Boyer，F.，Mercier，C.，Bonin，A.，Le Bras，Y.，Taberlet，P。，＆Coissac，E。（2016年）。obitools：用于DNA ME- TABARCODING的UNIX启发的软件包。分子生态资源，16（1），176–182。https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12428 Brosse，S.，Charpin，N.，Guohuan，S.，Toussaint，A.A.，Tedesco，P。和Villeger，S。（2021）。Fishmorph：淡水鱼形态特征的全球数据库。（2021）。全球生态和生物地理学，30，2330–2336。https://doi.org/10.1111/GEB.13395 Cantera，I.，Cilleros，K.，Valentini，A.，A.，A.，Dejean，A.，Dejean，T.，Iribar，A. 为热带流和河流中的鱼类库存优化环境DNA采样工作。 科学报告，9（1），3085 M.，Salguero-Gómez，R.，Vásquez-Valderrama，M。和Toussaint，A。 遍布整个生命树的全球功能多样性。 科学进步，7（13），EABF2675。 https://doi.org/10.1126/sciadv.abf2675 Cilleros，K.，Valentini，A. 使用环境DNA（EDNA）在高分化环境中解锁生物多样性和保护研究：圭亚那的测试https://doi.org/10.1111/GEB.13395 Cantera，I.，Cilleros，K.，Valentini，A.，A.，A.，Dejean，A.，Dejean，T.，Iribar，A.为热带流和河流中的鱼类库存优化环境DNA采样工作。科学报告，9（1），3085 M.，Salguero-Gómez，R.，Vásquez-Valderrama，M。和Toussaint，A。遍布整个生命树的全球功能多样性。科学进步，7（13），EABF2675。https://doi.org/10.1126/sciadv.abf2675 Cilleros，K.，Valentini，A.使用环境DNA（EDNA）在高分化环境中解锁生物多样性和保护研究：圭亚那的测试