该研究小组此前已展示了开发一种利用人工智能有效修改蛋白质功能的方法的可能性。利用这种方法,我们现在已经成功地以最少的实验显著提高了酶活性(图 1)。该方法首先通过常规随机诱变方法制备少量突变体,并进行实验以获取人工智能的训练数据(机器学习正常运行所需的数据)。接下来,我们使用人工智能技术贝叶斯优化来预测应该引入什么类型的突变才能获得具有所需功能的蛋白质。这将使我们能够提出一组小规模的突变体,该突变体富含具有所需功能的蛋白质,并且可以低成本用于实验。 在本研究中,我们仅使用从大约 80 个突变体的实验结果中获得的训练数据,成功将肽连接酶分选酶的催化活性提高了五倍(图 2)。此外,我们发现,通过稍微改变训练数据的元素,就可以绘制出一张地图,可视化由突变引起的功能变化的整体情况(图 3)。这些结果证明人工智能在修饰蛋白质功能方面是有效的,希望未来该方法能应用于多种功能蛋白质的开发。 [论文信息] 标题:机器学习指导的定向进化文库设计循环
在分子水平上理解竞争性抑制对于揭示酶-抑制剂相互作用的动力学和预测抗性突变的进化结果至关重要。在本研究中,我们提出了一个框架,将竞争性抑制与炼金术自由能扰动 (FEP) 计算联系起来,重点关注大肠杆菌二氢叶酸还原酶 (DHFR) 及其被甲氧苄啶 (TMP) 抑制的情况。使用热力学循环,我们将实验测得的结合常数 (K i 和 K m ) 与野生型和突变型 DHFR 相关的自由能差异联系起来,平均误差为 0.9 kcal/mol,从而深入了解 TMP 抗性的分子基础。我们的研究结果强调了局部构象动力学在竞争性抑制中的重要性。DHFR 突变对底物和抑制剂结合亲和力的影响不同,从而影响 TMP 选择压力下的适应度景观。我们的 FEP 模拟表明,抗性突变通过特定的结构和/或动力学效应稳定抑制剂结合或底物结合状态。这些效应的相互作用在某些情况下显示出显著的上位性。单独评估底物和抑制剂结合的能力提供了有价值的见解,从而可以更精确地解释突变效应和上位性相互作用。此外,我们确定了 FEP 模拟中的关键挑战,包括由电荷改变突变和长距离变构效应引起的收敛问题。通过整合计算和实验数据,我们提供了一种有效的方法来预测抗性突变的功能影响及其对进化适应度景观的贡献。这些见解为构建强大的突变扫描方案和设计更有效的抗耐药细菌菌株治疗策略铺平了道路。
机密健康信息:医疗保健信息是与人的医疗保健有关的个人信息。在适当的授权或不需要授权的情况下,它将被传真给您。您有义务以安全,安全和机密的方式维护它。除非获得法律允许或获得适当的客户/患者授权,否则禁止重新披露此信息。未经授权的重新披露或未能保持机密性可能会受到联邦和州法律中描述的处罚。重要的警告:此消息旨在使用其涉及并可能包含特权和机密信息的人或实体,其披露受适用法律管辖。如果此消息的读者不是预期的收件人,也不是负责将其交付给预期收件人的员工或代理商,则应通知您严格禁止任何传播,分发或复制此信息。如果您已错误地收到此消息,请立即通知我们。品牌名称是其各自所有者的财产。
• 重拾活力;良好的能见度有望实现稳态增长——在连续两年(22 财年、23 财年)低迷之后,公司在 24 财年强势回归,收入增长约 15%,EBITDA 增长 31%,这要归功于人类营养(增长约 18%)和生物加工(增长 21%)的强劲增长。人类营养的增长得益于印度公司的强劲需求以及美国保健食品领域的后期复苏。我们相信,公司在研发和客户参与方面做出了正确的努力。公司在研发方面投入了额外的资金,资本支出约为 3 至 4 亿卢比,使现有研发设置增加了两倍。人类营养和生物加工很可能仍是 25 财年的主要驱动力,因为 24 财年获得了产品批准,此外美国保健食品领域的复苏和增长也推动了这一增长。管理层预计 2025 财年收入将增长 13-16%,利润率将逐步提高。我们认为,大多数增长杠杆都已到位,可以保持增长速度。
多酶抑制剂Z-VAD-FMK充当肽的抑制剂:N-糖酶(NGLY1),一种内糖苷酶,一种内吞糖苷酶,从渗透性降级(ERAD)(ERAD)(ERAD)中裂解N-连接的糖蛋白从糖蛋白(ER)中导出的糖蛋白。NGLY1的Z-VAD-FMK和siRNA介导的敲低(KD)抑制NGLY1的药理学N-聚会酶均诱导HEK 293个细胞中的GFP-LC3阳性点。在任何一种情况下都不观察到ER应力标记物的激活或活性氧(ROS)的诱导。此外,当观察细胞内存储释放时,CA 2 +处理不受影响。在小含量NGLY1抑制或NGLY1 KD的条件下,观察到自噬体形成的上调而不会观察到自噬型伏特的损害。富集自噬体揭示了可比的自噬体蛋白含量。基因本体分析 - 某些IPS表明涉及蛋白质翻译,定位和靶向,RNA降解和蛋白质复合物拆卸的因子的代表过多。自噬的上调代表了对NGLY1抑制或KD的细胞适应,并且在这些条件下,ATG13抑制作用的小鼠胚胎爆炸(MEFS)显示出降低的生存能力。相比之下,用pan-caspase抑制剂Q-VD-OPH处理不会诱导细胞自噬。因此,Z-VAD-FMK的实验因NGLY1抑制作用(包括诱导自噬)而变得复杂,而Q-VD-OPH则代表了一种替代性caspase抑制剂,而没有这种限制。
基因组编辑技术的进步使得利用酶的功能进行有效的 DNA 修饰成为可能,这对治疗人类遗传疾病具有巨大的潜力。已经开发出几种核酸酶基因组编辑策略来纠正基因突变,包括大核酸酶 (MN)、锌指核酸酶 (ZFN)、转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN) 和成簇的规律间隔短回文重复序列-CRISPR 相关蛋白 (CRISPR-Cas)。CRISPR-Cas 已被进一步设计为创建切口酶基因组编辑工具,包括具有高精度和高效率的碱基编辑器和主要编辑器。在这篇综述中,我们总结了用于治疗遗传疾病的核酸酶和切口酶基因组编辑方法的最新进展。我们还强调了这些方法转化为临床应用的一些局限性。
2型糖尿病是一种影响我们身体调节血糖(葡萄糖)的疾病。血糖是我们人体的主要燃料来源(能量)。糖尿病可以多种方式发展。它可以开发的一种方法是,如果胰腺(负责制造胰岛素)的器官不能充分产生胰岛素。释放足够的胰岛素很重要,因为胰岛素是一种支持葡萄糖向我们的细胞运动燃料的激素。 另一种2型糖尿病的发展是胰腺释放足够的胰岛素时,即使胰腺释放出足够的胰岛素,我们的细胞对胰岛素(胰岛素耐药性)也不那么敏感。 如果我们的细胞对胰岛素有抵抗力,则不能接受我们血流中循环的葡萄糖。释放足够的胰岛素很重要,因为胰岛素是一种支持葡萄糖向我们的细胞运动燃料的激素。另一种2型糖尿病的发展是胰腺释放足够的胰岛素时,即使胰腺释放出足够的胰岛素,我们的细胞对胰岛素(胰岛素耐药性)也不那么敏感。如果我们的细胞对胰岛素有抵抗力,则不能接受我们血流中循环的葡萄糖。
•不得没有任何pert。这可能导致低血糖,严重的肠症状,其他药物的吸收不良和体重减轻。•Creon®10000胶囊应保留给无法服用Creon®25000胶囊的人,例如儿童和无法吞下更大胶囊的人。•CREON®微胰腺60.12mg胶囊优先考虑儿童和无法打开Creon®25000胶囊的吞咽困难的儿童。•Nutrizym®22应优先考虑无法忍受Creon®的人。这不适合15岁以下的儿童。•应对接受肠内喂养管的患者优先考虑Pancrex®V粉末。在大多数情况下,这不是患者口服服用的合适产品。•确保PERT处方最多1个月。通常,对于成年人来说,这最多为500CREON®25000/Nutrizym®22胶囊。作为EPS处方的单个项目或为患者提供处方令牌。在患者需要之前发出重复处方 - 建议患者提前2周,以便填补处方时间。请确保GP练习处方管理团队意识到与通常的练习的偏差。不要发布日期处方,请使用药房文本框来解释为什么要提交早期处方。•建议开处方:
竞争性抑制是酶学中的关键概念,对酶调节,细胞稳态和疾病发育产生了影响。由于其可逆性和浓度依赖性效应,它是生物系统中重要的调节机制。了解竞争性抑制的复杂性不仅增加了他们对酶过程的理解,而且还为药物设计和治疗方法打开了大门。新见解和应用已准备好随着研究人员对这个迷人的系统进行更深入的探索,从而使新型治疗的前景以及对酶的复杂世界及其在支持生活中的功能有了更深入的了解。
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