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World File Search System支原体
NEP- 2020 理学学士 - 植物学课程大纲
第一单元：生命的起源和进化 生物多样性的进化史，早期地球和生命的起源，自发，生物起源，巴斯德的实验，疾病的细菌理论；生命史上的重大事件，生命多样性的分类，生命王国——原核生物、真核生物、古细菌，达尔文的生命观和物种起源，达尔文的进化论。第二单元：微生物多样性 微生物的分类- R. H. Whittaker的五界概念，Carl Woese的域系统。细菌特殊群体的简要介绍-古细菌、支原体、衣原体、放线菌、立克次体和蓝藻。第三单元：生物分子 碳水化合物：命名和分类。脂质：储存和结构脂质的定义和主要类别。蛋白质：氨基酸的结构；蛋白质结构的层次。核酸：核苷酸的结构和功能；核酸的类型。单元 4：生物学的遗传方法 遗传模式和生物学问题；孟德尔定律的变化；遗传信息的分子基础；遗传信息从 DNA 到 RNA 再到蛋白质的流动。实践 1.学习 a) 显微镜的使用 b) 固定和染色的原理。2.制备正常、摩尔和标准溶液、磷酸盐缓冲液、连续稀释液 3.使用微量移液器 4.通过纸色谱法分离 A) 氨基酸 B) 叶绿体色素。5.对细菌进行革兰氏染色。6.从永久载玻片研究细胞/组织中核酸和粘多糖的细胞化学分布。7.使用 Lowry 法定量估计蛋白质。使用绘制的标准曲线确定未知样品的浓度。8.通过薄层色谱法分离和定量糖。9.培养大肠杆菌并用浊度法估计培养物密度。根据现有数据绘制生长曲线。10.从大肠杆菌中分离基因组 DNA。建议阅读 1.Campbell, N.A.和 Reece, J.B.(2008) 生物学第 8 版，Pearson Benjamin Cummings，旧金山。2.Raven, P.H 等人 (2006) 生物学第 7 版 Tata McGrawHill Publications，新德里 3.Griffiths, A.J.F 等人 (2008) 遗传分析简介，第 9 版，W.H.Freeman & Co. NY
建立 GPR146 敲除人类诱导多能干细胞系 (ITXi001-A-1)
动脉粥样硬化性心血管疾病 (ASCVD) 仍然是全球最大的死亡原因 2 。血脂异常是与 ASCVD 发展有关的一个关键的可改变的因果风险因素。最近，G 蛋白偶联受体家族的成员 G 蛋白偶联受体 146 (GPR146) 被证明是血浆胆固醇的调节剂 3,4 。GPR146 在小鼠体内的肝脏抑制已显示出良好的特性，它对高胆固醇血症和动脉粥样硬化具有保护作用，这种作用独立于低密度脂蛋白受体 (LDLR) 通路 3 。为了更好地理解所涉及的生物学机制，我们开发了一种先进的基因工程人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 模型，该模型因 GPR146 而无效。 GPR146 -/- 细胞系 (ITXi001-A-1) 源自我们实验室先前从尿液祖细胞 (ITXi001-A) 1 中重新编程的对照 hiPSC 的基因组版本。基因组版本使用 Alt-R™ CRISPR-Cas9 系统 (Integrated DNA Technologies) 进行，针对两个等位基因上的 GPR146 外显子 2。ITXi001-A-1 是通过挑选单个菌落建立的，其基因型通过 PCR 筛选 (图 1A - 上图和下图) 并通过 Sanger 测序确认 (图 1B)。我们进一步表明，GPR146 基因的遗传版本不会诱导基因组的脱靶版本（筛选 10 个预测位点 - （补充文件 3A）），也不会诱导 ITXi001-A-1 细胞的基因组完整性（分析 24 个拷贝数变异）（补充文件 1）。我们验证了 ITXi001-A-1 细胞不含支原体（补充文件 3B），并且它们与最初采集的尿液细胞来自同一个体（16 个 STR 的亲子鉴定 - 补充文件 2）。总体而言，ITXi001-A-1 细胞呈现：I- 与 ITXi001-A 细胞相比具有相似的形态（图 1C）II- 多能性标志物的阳性表达（通过 OCT3/4 和 TRA-1–60 的免疫荧光染色检测）（图 1D）。 III- 多能性细胞表面标志表达阳性（流式细胞术检测 SSEA-4 和 TRA1-60）（图 1E）。IV- 多能性标志物的表达水平与 ITXi001-A 细胞相同（NANOG、POU5F1 和 SOX2 - 通过 RT-qPCR 测量）（图 1F）。V- 具有优异的分化为中胚层、内胚层和外胚层的能力（通过 SOX17 和 FOXA2（中胚层）；T(TBXT) 和 HAND1（内胚层）以及 PAX6 和 SOX1（外胚层）的 RT-qPCR 评估，与 ITXi001-A 细胞相似）（图 1G）。
互联之间的互联体 - 穆塔斯链球菌和...
引言口腔卫生在口腔健康中很重要，因为它意味着对牙菌菌细菌的主要控制，这是由于条件和援助要求，要么是口腔传染病的危险因素。因此，我们患有智障患者（ID）的口腔卫生不良，这使得诸如龋齿（龋齿），牙龈炎和牙周疾病之类的口腔病理的高患病率（横截面），所有这些疾病均由细菌pla plae pla pla pla pla pla pla pla pla pla [1-4-4-4-4-4-4-4-4-4-4-4）。口腔是由软组织，硬组织和唾液组成的空间，该空间由细菌，真菌，病毒，病毒，支原体，原生动物等微生物殖民，当时是细菌斑块的一部分，当钙化并形成牙齿或牙齿钙或tartar时。先前的研究表达了伦敦J.[5]，是仅次于肠道的第二大微生物群落。对人口腔牙垢中祖先微生物组的研究揭示了基于生命功能的人与微生物之间的关联的重要性，例如急性和慢性疾病的作用及其生物人类学进化，随着时间的流逝[6]。祖先，在古代文明中证明了S. utans和牙龈疟原虫的存在，特别是来自智利南部圭蒂卡斯群岛的Chonoan [7,8]。通过人类研究的遗迹，可视化兼容的传染病，例如龋齿，牙周病和骨骼病变，可视化，伴随着口腔卫生不良，就像ID患者中一样[1]。它们可能与符合他们没有口腔卫生习惯的文化和生理因素有关[7,8]。随后的分子生物学研究，例如间接免疫荧光技术和PCR扩增，证明了Chonoan（Chonos）牙齿牙垢中的微生物存在[9,10]。在古代文明中存在两个或多种变体的PCR技术峰会物种，特别是在Chonoan中的p.gingivalis，由于微生物在5个复合物中存在的牙周疾病频率很高，因此，尺寸微生物中的微生物中存在的一部分是一个复杂的网络，p。根据[13]。在古代文明中存在两个或多种变体的PCR技术峰会物种，特别是在Chonoan中的p.gingivalis，由于微生物在5个复合物中存在的牙周疾病频率很高，因此，尺寸微生物中的微生物中存在的一部分是一个复杂的网络，p。根据[13]。
儿童肺炎感染的DNA负荷，基因分型和临床表型的相关性
简介：这项研究旨在研究支原体肺炎（MP） - MP肺炎（MPP）儿童支气管肺泡灌洗液（BALF）中的DNA负荷及其亚型及其亚型的肺炎及其相关的实验室数据，成像，成像儿童及其临时临床的复杂性，并进行了临床临床的临时，并进行了临床。方法：在2017年12月至2020年12月之间在天津儿童医院住院的儿童被选为研究，不包括病毒，细菌和真菌感染的混合病毒。使用实时定量荧光聚合酶链反应（PCR），根据BALF中的MP DNA负载将儿童分为低负载组。成功的MP培养后，阳性样品受到PCR限制片段长度多态性和多级别可变数字串联重复分析键入键入。从研究中包括的所有儿童收集了基本数据，临床信息，实验室数据和放射学结果。结果：PI-I类型主导了不同的负载组。低负荷群体中的儿童喘息和呼吸急促。然而，高负荷组的儿童住院时间更高，最高发烧温度，更高的寒冷/寒冷，腹痛的发生率以及较高的C反应蛋白（CRP），procalcitonin（PCT）和天冬氨酸氨基转移酶（AST）水平。高负载组中的儿童更可能发生成像变化，例如胸腔积液，呼吸道感染和肺外并发症的发生率高于低负载组中的呼吸道感染。我们应用了Spearman的相关分析来阐明MP DNA负载与MPP的临床严重程度之间的关系。我们发现，MP DNA负荷与住院时间，最高发烧温度，CRP，PCT，白介素6（IL-6）和AST水平正相关，并且与发烧和咳嗽持续时间，白细胞计数（WBC）以及单一细胞（MONOO）（MONOO）的比例负相关。相关程度如下：住院时间> IL-6>咳嗽持续时间> AST> AST>发烧持续时间> PCT> WBC>单声道>最高发烧温度> CRP水平的比例。结论：MP DNA负荷与MP键入无关，但与儿童的临床表型显着相关。因此，MP DNA负荷有助于早期诊断感染，并可以更好地预测疾病的回归。
干固化鱼从原材料到加工末端的微生物安全
加工鱼类产品的商业化在餐馆和中小型企业中正在上升。但是，缺乏与此类产品的微生物安全有关的数据。In this study total aerobic colony count and Enterobacteriaceae, as proxy of process hygiene criteria, and detection of Listeria monocytogenes and concentration of histamine, as food safety criteria, were investigated in Salmo salar (salmon), Xiphias gladius (swordfish) and Thunnus albacares (yellowfin tuna), before, during, and at the end of a干燥固定过程，在专用柜子中执行，在受控温度，相对湿度和通风下，长达240小时。通过培养方法和shot弹枪MET捕获性研究在测试的鱼类产品中研究了微生物参数，而通过高性能液相色谱法对组胺和其他生物胺的存在进行了研究。在原材料中，直到干固化过程结束时，肠杆菌科的浓度始终低于10 cfu/g，而总有氧菌落计数在鲑鱼中的含量为3.9至5.4 log cfu/g。 5.5和5.9日志CFU/G中的剑鱼；金枪鱼中的4.4和4.8 log cfu/g。鱼类，原材料和加工期间的pH值显着不同，除T4外，鲑鱼的开始后70小时，箭鱼和金枪鱼的114小时后发生。在特定采样点和处理结束时，水活性不同。总体而言，在测试鱼样品中鉴定的序列的79％分配给Y细菌。最丰富的门是假核，芽孢杆菌和支原体。通过shot弹枪元基因组鉴定的微生物种群在经过测试的鱼类中聚集了一个与彼此分离的。此外，与剑鱼相比，鲑鱼和金枪鱼的微生物丰富度明显更高。李斯特菌单核细胞增生植物，而shot弹枪元基因组在剑鱼和金枪鱼中检测到的读数很少（相对丰度<0.007）。组胺产生的细菌，属于藤本属，摩根菌，光细菌和克雷伯菌，主要在剑鱼中鉴定出来。但是，在任何样品中均未检测到组胺和其他生物胺。据我们所知，这是鲑鱼，箭鱼和金枪鱼，鲑鱼，剑鱼和金枪鱼，期间，之中和结束时的第一个纸张报告时间点确定。本文收集的数据可以帮助预测准备在食用前储存期间食用干燥鱼产品的风险概况。
隐形病毒中的叛逆细菌遗传序列：生物学和诊断意义
摘要在其基因组的结构，复制模式以及水平转移遗传序列的能力的结构中，病毒，细菌和真核细胞之间存在主要差异。DNA测序研究对从慢性疲劳综合征（CFS）患者培养的病毒（CFS）培养的病毒研究已证实，作为感染过程的一部分，某些病毒捕获和转移真核细胞之间的细菌和细胞遗传序列的能力不足。该病毒起源于非洲绿色猴子Simian巨细胞病毒（SCMV）。它被称为隐形适应病毒，因为感染不伴有炎症。免疫逃避归因于编码通常由细胞免疫系统靶向的相对较少成分的基因的丢失和突变。本文提供了对病毒中许多细菌衍生的遗传序列的起源的进一步阐明。有多个具有近距离序列的序列比对的克隆，具有不同的基因组区域的ochrobactrum Quorumnocens A44种细菌的基因组区域。另一组克隆与支原体发酵疫菌的不同基因组区域最紧密匹配。其他几个克隆的序列只能与不同类型细菌的序列近对齐。克隆3B513的序列与几种类型细菌的基因组的遗传贡献一致。术语viteria是指具有细菌衍生的遗传序列的病毒。它们可能是CFS和自闭症的主要原因，并且在包括艾滋病在内的许多疾病中充当主要辅助因子。作为具有不同类型的叛变细菌序列的更普遍的现象，可能导致诊断出细菌疾病而不是病毒疾病的诊断。重要的是要从遗传上对患有广泛疾病的患者进行额外的隐身适应病毒，包括目前归因于分枝杆菌，伯氏菌或链球菌感染的病毒。引言对源自慢性疲劳综合征患者（CFS）患者的病毒培养物的克隆DNA的分子分析表明，培养的病毒起源于非洲绿色猴子Simian simian cintomegalovirus（SCMV）[1-4]。然而，在任何测序的DNA克隆中均未检测到与SCMV基因组主要区域相对应的遗传序列[4-5]。此外，针对其余已识别的SCMV区域的克隆分布不均匀，在克隆中具有与SCMV基因组同一区域相匹配的遗传变异性。这些发现与免疫逃生机制一致，被称为隐形适应，从删除或
MACC1调节LGR5以促进结直肠癌的癌症干细胞特性
从HIV-1 + 2，乙型肝炎和丙型肝炎中分离出外周血单核细胞（PBMC）。pBMC，包括人类基因Oct3/4，Sox2，c-Myc和klf4的矢量。HIPSC线BIHI292-A源自单个菌落，并在E8培养基中保持未分化的HIPSC的典型形态（图1 a）。通过PCR确认缺乏仙台病毒载体（Suppl。图1 a）。BIHI292-A HIPSCS ECT3/4，SSEA-4，NANOG和TRA-1 - 60作为未分化HIPSC状态的典型标记，如使用免疫细胞化学所示（图1 b）。进一步的流式细胞仪证实了OCT3/4，SSEA-4，NANOG和TRA-1-60表达在超过96％的BIHI292-A HIPSC中的SSEA-4，Nanog和Tra-1-60表达中的干性标记表达（图。1 c）。g带核分型在GTG上进行（使用GIEMSA的胰蛋白酶G带）进行染色的中期染色体，并揭示了正常的雌性Karyo 46型，XX（图1 D）。 单核苷酸多态性分析表明，与患者的PBMC相比，BIHI292-A HIPSC线没有任何拷贝数变量> 2 Mb> 2 MB> 5 MB（表1）。 短串联重复（STR）分析的结果表明，BIHI292-A细胞系和患者的PBMC的遗传认同是相同的（表1）。 Sanger测序证实了两个Exon 2中的两个Trem2杂合突变C.313del（P.Ala105fs）和C.199del（p。is67fs）（图） 1 e）。 图1 D）。单核苷酸多态性分析表明，与患者的PBMC相比，BIHI292-A HIPSC线没有任何拷贝数变量> 2 Mb> 2 MB> 5 MB（表1）。短串联重复（STR）分析的结果表明，BIHI292-A细胞系和患者的PBMC的遗传认同是相同的（表1）。Sanger测序证实了两个Exon 2中的两个Trem2杂合突变C.313del（P.Ala105fs）和C.199del（p。is67fs）（图1 e）。图为了确认患者突变的存在（Buthut等，2023），在TREM2基因的外显子2中为复合杂合突变进行了BIHI292-A HIPSC的测序。通过将分化为三个细菌层的细胞进行分化，测试了多能分化势。分化测试证实，BIHI292-A HIPSC具有分化为内胚层（CD184 +，SOX17 +），Meso Dermal（CD140B +，CD144 +）和外胚层（PAX-6 +，SOX2 +）细胞的潜力（1 f）。BIHI292-A HIPSC对支原体进行了阴性测试（Suppl。1 b）。
从常规检测到护理点测试（POCT）方法的小儿呼吸道感染诊断：系统评价
抽象细菌呼吸道感染对儿童造成了重大健康风险，特别是婴儿易受上呼吸道感染（URTIS）的婴儿。coVID-19大流行进一步加剧了这些感染的流行，诸如支原体肺炎，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，葡萄球菌，金黄色葡萄球菌，嗜血杆菌和kelebbsiella symerse comenters commonise commons commons commons commons commons commons commons commons commons commons consimallys symerse semelly simped connecoccus肺炎，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎链球菌，肺炎。在临床实践中，对这些细菌剂进行准确和及时检测的关键需求强调了高级诊断技术（包括多重实时PCR）的重要性。多重实时聚合酶链反应（PCR）具有多种优势，包括快速结果，高灵敏度和特异性。通过加速诊断过程，这种方法可以早期干预和有针对性的治疗，最终改善患者的预后。除了PCR技术外，快速和护理测试（POCT）在迅速诊断细菌呼吸道感染中起着至关重要的作用。这些测试旨在用户友好，敏感并提供快速的结果，使其在紧急临床环境中特别有价值。POCT检验通常分为两个主要组：旨在确定感染原因的测试，以及旨在确认存在特定病原体的那些。 通过利用POCT，医疗保健提供者可以做出快速而明智的治疗决策，从而更有效地治疗儿童细菌呼吸道感染。 伊朗大四。 2025; 28（2）：112-123。 doi：10.34172/aim.33505测试，以及旨在确认存在特定病原体的那些。通过利用POCT，医疗保健提供者可以做出快速而明智的治疗决策，从而更有效地治疗儿童细菌呼吸道感染。伊朗大四。2025; 28（2）：112-123。 doi：10.34172/aim.33505随着医学界继续探索创新的诊断方法，分子和快速测试方法的整合在细菌呼吸道感染领域提供了重要的希望。通过采用这些尖端技术，医疗保健专业人员可以增强其准确诊断这些感染，量身定制治疗策略并最终改善患者护理的能力。Keywords: Molecular diagnosis, Pediatric infections, POCT, Point-of-care testing, Respiratory infections Cite this article as: Azizian R, Mamishi S, Jafari E, Mohammadi MR, Heidari Tajabadi F, Pourakbari B.从常规检测到护理点测试（POCT）方法的小儿呼吸道感染诊断：系统评价。
干细胞研究
SPG11 中的双等位基因致病变异编码了 spatacsin，可导致罕见的运动神经元疾病，如遗传性痉挛性截瘫 11 型 (SPG11-HSP)、夏科-马里-图斯病和青少年型肌萎缩侧索硬化症-5 (ALS5)。SPG11-HSP 是最常见的复杂常染色体隐性 HSP。除了下肢痉挛和截瘫外，SPG11-HSP 患者还存在其他症状，如认知能力下降、上肢无力和周围神经病变（Pozner et al., 2020）。SPG11 编码一种 ~280 kDa 的蛋白质，称为 spatacsin，其参与自噬溶酶体机制的功能和囊泡运输。然而，由于缺乏特异性抗体，spatacsin 的确切功能尚不清楚。为了克服这一障碍，我们生成了一种内源标记的 SPG11 人诱导多能干细胞 (hiPSC) 系 (SPG11-HA)。标记是通过使用 CRISPR/Cas9 技术将具有同源定向修复的 HA 标签插入市售人类游离型 iPSC 系 (A18945；Thermo Fisher Scientific) 中进行的。用编码 SpCas9、GFP 和单个向导 RNA (gRNA；addgene) 的载体以及单链寡核苷酸 (ssODN) 供体 DNA 进行核转染。ssODN 包含一个 HA 编码区，两侧是 ~66 – 67 个核苷酸同源臂（图 1 AB）。经过单细胞分选程序和克隆扩增后，通过 PCR 扩增和桑格测序鉴定出阳性候选者（图 1 A）。通过 Sanger 和 Amplicon/NGS 测序确认了基因型 (图 1 A、C)。在预测的脱靶位点未检测到致病变异 (图 S1 A)。与未经过 CRISPR 过程的 iPSC 对照细胞 (ctrl) 相比，染色体微阵列分析未发现核转染报告系中存在任何从头拷贝数变异 (CNV) (图 1 D)。然而，在这两种细胞系中均发现了 20q11.21 处的增益。这种 CNV 在 hiPSC 和癌症中反复出现，表明它具有增殖或生存优势 (Nguyen et al., 2014)。ctrl 和 SPG11-HA iPSC 均表现出典型的多能性细胞样形态，并经支原体检测呈阴性 (图 S1 BC)。两种细胞系均表达多能性标记，并在三系分化范式测试中分化为所有三个胚层的衍生物（图 1 EF；图 S1 D；表 1）。为了验证报告细胞系的功能，通过蛋白质印迹研究了标记的 spatacsin 的表达。正如预期的那样，HA 标记的 spatacsin 在 280 kDa 的大小下可检测到（图 1 G）。由于 spatacsin 功能丧失后表现出一系列神经系统症状，因此评估了神经分化能力。近 90% 的分化对照和 SPG11-HA 神经祖细胞 (NPC) 表达
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声明代码€声明代码€种植Banaal（细菌学） - 基本速率34.10单纯疱疹1/2病毒（HSV）35.07指示指示。额外的成本阳性繁殖（成本在35.00-240.00之间变化）71118抗体IgG（2x）15.45 75042种植测试2媒体25.42 71126抗体IgM 19.62 7050170501 gram-repreparation1 gram-preparation1 gram-preparation 8.68 HIV 15.45确定7.45的确定为7.45的确定率7.45的确定率7.45的确定。 (Antigen. 12,53 71118 Antistoffen IgT 15,45 70507 Resistentie MIC per antibioticum 9,80 Indicatie extra kosten voor confirmatietesten 93,08 70505 Resistentie disk diffusie 14,12 71144 HIV p24 antigeenbepaling 27,74 - 70185 Antistoffen mbv immunoblot 65,34军团肺炎35,07 71118抗体IgG 15.45 kweek banaal（细菌学） - 基本速率40.24 71126抗体IgM 19.62指示额外的成本积极繁殖（成本在12.00-150.00之间变化）（Syfillis/treponema） - 筛分15.45 75043育种测试> 3 Media 31.56 71118抗体IgG IgG 15.45 70501570501 Gram-Preparation for vertes for Cornsulting 70.68 versition for verte for cornsunseraties for cornerseraties for verte for vitts for cornsultaties for nerkeratiss for确认70062700627000627000627006270062700062700627000627 70507抗生素9.80 70628 VDRL 9.45 70505电阻磁盘扩散14.12莱姆（Borrelia burgdorferi）35.07 707707β-乳用于lyclactamase test 5.89 718 IgGamase Test 5.898 IgGamase Test 5.898 IGMASE TEST 5.898 IGAMASE TEST 5.898 IGAMASE TEST 5.898 IGAMASE TEST 5.898 IGAMASE TEST 5.89898 IGAMASE TEST 5.89 5.898）测试5.898）测试测试5.898。 19.62使用免疫印迹（2x）65.34生长平庸的并发症测试的额外费用130.68 70185粪便）31.56支原体肺炎35.07指示。额外的成本为正育种（成本在28.00-180.00之间，不包括事件。其他MRSA研究）71118抗体IgG 15.45 75043 kweek Test> 3媒体（包括事件。oog，oor，neus）31,56 71126抗抗原Igm 19,62 75045每种细菌的确定性12,53 parvo病毒35,07 70507抗生素抗生素抗生素抗生素抗生素9,80 711118 Antistoffen Igg 15,45 70112 7112 7112 7112 14,26 14,126 diffusemem diffuseen diffusem diffusem diffusem diffuseen diffusem diffusemem 19,62 70517β-内酰胺酶测试5.89红宝石病毒35.07-71118抗体IgG IgG 15.45 71126抗体IGM 19.62毒素gondii 35.07 35.07增长（细菌学）特定（细菌学）基本速率31.56 7118 IGG 15.45。额外的成本为正育种（成本在70.00-150.00之间，不包括其他PCR研究）71126抗体IGM 19.62