XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System放线菌
与牙周炎及其危险因素有关的未诊断糖尿病和糖尿病前期的患病率
目的：估计未诊断的糖尿病的患病率随着年龄的增长而增加，可以达到3.5％。该研究的目的是评估参加牙科诊所的老年患者中未诊断的糖尿病和糖尿病前期的患病率并找到了常见的危险因素。方法：50岁以上的男性患者参加了两年的牙科牙科访问，并提议评估未诊断未诊断的2型糖尿病。进行了牙周，生化，微生物学检查，营养特征和体育活动。结果：总共检查了106例患者，有6例（5.6％）患有糖尿病，37例（34.9％）的前糖尿病前期糖尿病，没有事先诊断。糖尿病患者的牙周炎的严重程度更大。大多数患者超重，收缩压升高。患有糖尿病前期和牙周炎的患者对地中海饮食的依从性较低。Tannerella forsythia存在于更多的牙周炎患者中，除糖尿病组外，牙周炎的聚集放线菌病的患病率实际上不存在于牙周炎的组中。结论：在所研究的人群中，没有诊断糖尿病和糖尿病前期的患者的患病率很高且低估。糖尿病患者牙周炎的严重程度增加，并与牙周炎患者（尤其是患有糖尿病患者）的高水平皮质醇相结合，强调了免疫炎症系统的失调。临床意义：至关重要的是，将所有这些数据添加到我们的牙科实践中，以通过更广泛的景观覆盖患者健康。
质牙齿的根管中细菌的定性和定量分子分析，牙髓坏死
摘要：有关细菌多样性的信息，例如原牙根管中的每个物种的数量，有助于改善我们对原牙中牙髓牙齿起源感染的有效管理。这项研究使用荧光原位杂交（FISH）技术对原代牙齿的根管中的细菌进行了定性和定量评估。使用鱼类技术评估了31名儿童的果肉坏死的三十一颗原发性牙齿，以检测聚集的放线菌菌菌的存在和密度链球菌，链球菌突变，sobrinus链球菌，Tannerella Forsythia和treponema denticola。描述性措施解释了与密度有关的数据，根据症状和症状，学生的T检验评估了每个细菌密度之间的差异。将细菌密度配对并相关。在所有样品中检测并鉴定了所有测试的细菌。每个物种的细菌个体的平均数量范围从1.9 x 10 8细胞/ml（S. mutans）到3.1 x 10 8细胞/ml（F. nucleatum）（p> 0.05）。每个细菌的平均计数总和几乎占整个微生物群落的80％。患有疼痛的患者的牙霉菌明显更高，并且凝血肿的患者表现出更大的链球菌和尼非菌的密度（p <0.05）。这项研究表明，在所有牙髓坏死的所有初级牙齿中都发现了所有12种细菌。所研究的物种之间没有占主导地位。所有物种都有相似数量的个体。
AcaFinder：抗 CRISPR 相关基因的基因组挖掘
摘要 抗 CRISPR（Acr）蛋白由（原）病毒编码，以抑制其宿主的 CRISPR-Cas 系统。编码 Acr 和 Aca（Acr 相关）蛋白的基因通常共定位以形成 acr-aca 操纵子。在这里，我们提出 AcaFinder 作为第一个 Aca 基因组挖掘工具。AcaFinder 可以 (i) 使用关联理论 (GBA) 预测 Acas 及其相关的 acr-aca 操纵子；(ii) 使用 HMM（隐马尔可夫模型）数据库识别已知 Acas 的同源物；(iii) 获取潜在原噬菌体、CRISPR-Cas 系统和自靶向间隔区 (STS) 的输入基因组；(iv) 提供独立程序（https://github.com/boweny920/AcaFinder）和 Web 服务器（http://aca.unl.edu/Aca）。 AcaFinder 被用于挖掘 16,000 多个原核生物和 142,000 个肠道噬菌体基因组。经过多步过滤，鉴定出 36 个高置信度的新 Aca 家族，是已知 12 个 Aca 家族的三倍。七个新的 Aca 家族来自人类主要肠道细菌（拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门）及其噬菌体，而大多数已知的 Aca 家族来自变形菌门和厚壁菌门。通过分析 Acrs 和 Acas 的操纵子共定位，揭示了它们之间复杂的关联网络。相同的 aca 基因可以与不同的 acr 基因重组，反之亦然，从而形成不同的 acr-aca 操纵子组合，这在进化过程中似乎很常见。
链霉菌属的杀虫潜力。反对登革热...
艾德斯·埃及林恩。（Diptera：culicidae）是登革热和基孔肯尼亚等最常见的引起疾病的arbovirus的载体之一。缺乏这些疾病的疫苗以及当前增加杀虫剂耐药性的问题加剧了寻找控制载体种群的新颖和有效方法的需求。因此，本文旨在研究菲律宾链霉菌与AE的生物学活性。埃及作为管理这些蚊子种群的潜在生物学剂。在测试生物学活性之前，使用其16S rRNA序列根据形态，文化和分子表征确定了八个放线菌分离株。生成的核苷酸序列的BLASTN结果显示出98–100％与不同链霉菌物种的相似性，并用GenBank登录号MZ317443 – MZ317450分配。在八个分离株中，针对3至5天的雌性艾迪斯埃及埃及成年人的CDC瓶生物测定法显示，CGS C13（92.68％），DK 5-10（85.53％）（85.53％）和CGS B11（81.91％）表现出最高的成人活性对照（均表现出较高的成人活动）。LC 50通过剂量反应生物测定测定表明，CGS B11的活性最高（2.838 ppm），其次是DK 5-10（6.083 ppm）和CGS C13（519.281 ppm）。这是关于这些链霉菌物种对AE的杀虫活性的第一份报告。埃及。
沿盐梯度的土壤启动效应和相关微生物群落
摘要。土壤盐分介导微生物和土壤过程，如土壤有机碳 (SOC) 循环。然而，土壤盐分如何通过塑造细菌群落多样性和组成来影响 SOC 矿化仍然难以捉摸。因此，沿盐梯度（盐度为 0.25%、0.58%、0.75%、1.00% 和 2.64%）采集土壤样本并培养 90 天，以研究 (i) SOC 矿化（即棉籽粉作为底物引起的土壤启动效应）和 (ii) 负责任的细菌群落，方法是使用高通量测序和 13 C 同位素的天然丰度（以分离棉籽粉衍生的 CO 2 和土壤衍生的 CO 2 ）。我们观察到在培养的前28天中出现负向启动效应，而在56天之后转为正向启动效应。早期的负向启动可能是由于优先利用棉籽粕所致。随后的正向启动随着盐度的增加而降低，这可能是由于高盐度土壤中微生物群落的α多样性降低所致。具体而言，沿盐度梯度的土壤pH值和电导率（EC）是调节微生物群落结构从而调节SOC启动的主要变量（通过基于距离的多元分析和路径分析估计）。通过采用双向正交投影到潜在结构（O2PLS），将启动效应与特定的微生物类群联系起来；例如，变形菌门（Luteimonas、Hoeflea 和 Stenotrophomonas）是归因于底物诱导的启动效应的核心微生物属。在这里，我们强调盐度的增加降低了微生物群落的多样性，并转移了优势微生物（放线菌和 Pro-
盐胁迫对水稻根际土壤细菌群落的影响
盐分是限制沿海滩涂土地利用的首要因素，根际微生物在增强作物抗逆性方面发挥着至关重要的作用，对环境变化高度敏感。水稻（Oryza sativa L.）是盐渍土改良的首选作物。本研究通过高通量测序技术，对不同盐胁迫处理下水稻根际土壤微生物群落进行了研究。研究发现，盐胁迫改变了水稻根际土壤细菌群落多样性、结构和功能。盐胁迫显著降低了水稻根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。盐胁迫下，细菌群落中绿弯菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高，厚壁菌门、酸杆菌门和粘球菌门相对丰度降低，拟杆菌门和蓝藻门相对丰度增加。水稻根际土壤细菌群落功能主要有化学异养、好氧_化学异养、光能营养等，其中化学异养和好氧_化学异养NS3（基土中添加3‰NaCl溶液）处理显著高于NS6（基土中添加6‰NaCl溶液）处理。本研究为开发水稻专用耐盐微生物菌剂提供了理论基础，为利用有益微生物改善滨海盐渍土土壤环境提供了可行的策略。
多组学分析揭示了胎羊肠道中存在微生物组
摘要 目的 微生物暴露对新生儿和婴儿的发育、生长和免疫至关重要。然而，胎儿出生前肠道中是否存在微生物组仍存在争议。本研究以足月无菌子宫切除术分娩的羔羊为动物模型，使用多组学方法研究产前肠道中微生物组的存在。设计 羔羊在无菌剖腹产后立即安乐死，并在无菌条件下获取其盲肠内容物和脐带血样本。使用宏基因组学和宏转录组测序评估盲肠内容物样本，以表征任何现有的微生物组。两种样本类型都使用代谢组学进行分析，以检测微生物代谢物。结果 我们在产前胎儿肠道中检测到了低多样性和低生物量的微生物组，主要由属于变形菌门、放线菌门和厚壁菌门的细菌组成。大肠杆菌是胎儿肠道中最丰富的菌种。我们还检测到多种微生物代谢物，包括短链脂肪酸、脱氧野尻霉素、丝裂霉素和妥布霉素，进一步表明存在代谢活跃的微生物群。此外，在胎儿肠道中检测到噬菌体 phiX174 和 Orf 病毒以及抗生素抗性基因，这表明携带抗生素抗性基因的噬菌体、病毒和细菌可以在妊娠期间从母亲传播给胎儿。结论这项研究提供了强有力的证据，表明胎儿肠道中存在微生物群，并且胎儿肠道的微生物定植始于子宫内。
出生后一个月的母体饮食指数和后代微生物群：来自地中海出生队列 MAMI 的见解
摘要：背景：母亲怀孕期间的饮食可能通过母亲的微生物群影响婴儿的健康状况。我们评估了地中海地区母亲饮食指数 (MDI-med) 与婴儿 1 个月大时肠道微生物群的关联。方法：MAMI 研究是地中海地区的一个纵向出生队列。在这项工作中，进行了一项横断面研究，包括 120 对母婴对，他们有 1 个月大时的母亲饮食和婴儿微生物群数据。美国开发的 MDI (MDI-US) 已针对 MAMI 队列 (MDI-med) 进行了调整。基于极值进行分层（平均值“较低”的 MDI-med 组有 22 个，平均值“较高”的组有 23 个）。比较了各组之间的相对微生物丰度和 alpha（微生物丰富度和多样性指数）和 beta 多样性（Bray-Curtis 距离矩阵）。结果：母亲每日蔬菜摄入量较高、红肉摄入量较低是 MDI-med 评分较高组的特征。与 MDI-med 评分较低组相比，“上层”组的微生物多样性（Shannon 和 InvSimpson 指数（p = 0.01））明显较低，但丰富度（Chao1 指数）和 β 多样性（使用 Bray-Curtis 距离）没有变化。双歧杆菌属（放线菌门）的相对丰度较高与母亲每日蔬菜和酸奶摄入量有关。结论：1 月龄婴儿微生物多样性降低与 MDI-med 评分较高有关。母亲蔬菜和酸奶摄入量较高与婴儿肠道中双歧杆菌属的相对丰度较高有关。需要进一步研究来了解孕期饮食、婴儿微生物群和健康结果之间的联系。
16S rRNA ngs粪便细菌菌群的测序...
目标。这项研究的目的是使用16S rRNA基因的下一代测序（NGS）来表征并可能区分健康和肥胖马的下肠道（粪便）细菌。方法。这项研究涉及7匹马（4匹马和3匹母马），年龄8-17岁：乌克兰鞍品种1-4匹马（马1运动马匹rebus，10 Y.O.，马匹2马匹2种马santes，15 Y.O.，15 Y.O.，15 Y.O.），重量吃水的5匹马（种马Tsyhan，8 Y.O.）和非透明马6和7（Mare Sne-Zhynka，10 Y.O.，Mare Rumba 12 Y.O.）马匹2、4、5和7是肥胖，马1、3和6是健康的。所有马匹都保留在州生物技术大学的马术中心，乌克兰教育与科学部（乌克兰哈尔基夫）。根据制造商的说明，使用Purelink微生物组DNAPuriÞ阳离子试剂盒（Invitrogen，USA）提取直肠粪便样品的总DNA。准备了细菌16S rRNA的库，我们使用了16S rRNA条形码试剂盒1-24（美国牛津纳米波尔）。为了净化所获得的库，磁性颗粒核元素清理和尺寸选择（Macherey-Nagel，德国根据推荐的快速测序放大器的建议协议 - 16S条形码（SQK-16SS024）（测序套件的手册）。这些条件基于Fujiyoshi等人（2020）中所述的16S rRNA基因扩增阳离子的标准方案，并确保细菌DNA跨各种群分类群的稳健扩增。结果。结论。细菌门的代表（Syn.肌动杆菌），纤维杆菌，小叶虫 - 螺旋杆菌（Syn.螺旋体），杆菌，富公司（Syn.芽孢杆菌），planctomycetota，verrucomicrobiota（Syn.verrucomicrobia），念珠菌Melainabacteria，kiritimatiellota和proteeobacteria（Syn.假单胞菌）。占主导地位的门是坚硬的，其份额是所有检测到的门的50％至82％。与杆菌的数量相比，健康马匹和肥胖马之间的数量差异很大。在健康马1,3和6中，这是企业和肥胖的马2,4,5和7的2.5、3.4和2.9倍，它是8.6、8.2、7.6和5.7倍。与杆菌相比，坚硬的人数在健康马匹和肥胖马之间发生了显着变化。在健康的马1、3和6中，牢固的数量分别为2.5、3.4和2.9倍，而在肥胖的马2、4、5和7中，牢固的数量分别为8.6、8.2、7.6、7.6和5.7倍。在肥胖的马匹2、4、5和7中观察到蛋白杆菌的数量增加，范围为25％至37％，而在健康运动马1、3和6中，蛋白质的水平在1.07至3.43％之间，这对于健康动物的微生物组典型。在研究的马匹粪便中检测到低水平的放线菌（分杆菌）：健康运动马3分别为0.09％，健康运动马3分别为0.09％，健康马匹6分别为0.15％。相比之下，肥胖的马2、4、5和7的水平分别从0.21％到0.48％。重要的是要注意，放线菌的门还包括BiÞ多杆菌属，在所研究的任何动物中均未检测到。在乌克兰第一次，我们对七个不同年龄，性别和品种的七匹马的下肠道（粪便材料）的细菌菌群进行了测序。在肥胖马的粪便中，细菌的细菌占主导地位（天细菌粉，粉状，裂缝），尤其是来自振荡性螺丝素和lachnospileceae的家族，并伴随着细菌的降低细菌（fcylumberimteroidota）（FC-fcbe）（FC-fc-
B细胞恶性肿瘤的正向和反向遗传学
背景：绿叶蔬菜（GLV）含有无机硝酸盐，该阴离子对口服微生物组具有潜在的益生元作用。然而，尚不清楚GLV和药理学补充[硝酸钾（PN）是否具有硝酸盐盐会引起对口腔微生物组的类似作用。目标：本研究旨在将GLV与PN补充对高血压个体中口腔微生物组组成和唾液生物标志物的影响进行比较。方法：将70个人随机分配给3个不同的组，以进行5周的饮食干预。第1组以GLV的形式消耗300 mg/d的硝酸盐。第2组食用的药丸，含300 mg/d的PN和低硝酸盐蔬菜。第3组用氯化钾（安慰剂：PLAC）和低硝酸盐蔬菜食用的药丸。在饮食干预之前和之后分析了口腔微生物组组成和口腔健康的唾液生物标志物。结果：GLV和PN组显示出类似的微生物变化，可能依赖硝酸盐，包括奈瑟氏菌，cap虫，弯曲杆菌，弯曲杆菌的丰富度增加，以及治疗后Veillonella，Megasphaera，segasphaera，megasphaera，sectinoryces和eubacterium种类的降低。在GLV组中观察到了Rothia物种的丰度，链球菌，Prevotella，放线菌和摩菌细菌的丰度降低，这可能是硝酸盐独立的。GLV和PN处理增加了唾液pH值，但只有GLV治疗显示唾液缓冲能力和乳酸降低的增加。结论：与PN相比，GLV组中硝酸盐依赖性和独立的微生物变化的结合对改善口服健康生物标志物具有更强的作用。