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World File Search System敦宏
伦纳德敦的专员
YouTube - www.youtube.com/c/townofleonardtown与会者：Daniel W. Burris，市长J. Maguire Mattingly IV，副总裁Nick Colvin，副总裁Nick Colvin，理事会成员Heather M. Earhart，理事会成员Christy Hollander，理事会成员Mary Maday Slade，理事会成员Mary Maday Slade，laschelle McKkay，Town consitance town comminance;执行秘书Teri Dimsey；迈克·贝利（Mike Bailey），计划；威尔·莫尔黑德，JustTech； LVFD Roger Mattingly的主要街道经理Emily Stagner；劳拉·克拉克（Laura Clarke），克拉克咨询公司（Clarke Consulting）； somdnews;参与者的完整名单在市政厅备案。市长伯里斯（Burris）要求理事会成员科尔文（Colvin）提出援引，迪姆西女士（Dimsey）领导效忠承诺。批准会议纪要伯里斯（Burris）招待了一项动议，批准了2024年8月12日的会议记录。议员Mattingly提出了批准2024年8月12日的会议记录；由议员科尔文（Colvin）借调；运动一致通过。司库报告 - Laschelle McKay McKay女士报告说，我们仍在结束财政年度陈述的结束。今天，我们确实有一个新的财务主管Sharon Strand女士的介绍，他将监督包括Post女士和Graves女士在内的财务部门。Strand女士表示，她很高兴能与该镇合作，并感谢所有人的热烈欢迎。我们已重新安排了9月23日这一周的审计师在办公室。计划和分区报告 - 迈克·贝利（Mike Bailey）贝利先生报告说，我们在9月16日星期一的议程中没有任何项目，因此会议已被取消，下一次会议将于2024年10月21日星期一举行。
amplicon宏基因组学
Amplicon宏基因组学是基于微生物RRNA基因的NGS测序。由于ngs读取长度受到限制，因此只能放大和测序rRNA基因的一部分。对于原核生物，该分析靶向16S rRNA基因的高变量区域（V1-9），而对于真菌，内部转录的间隔区域（ITS）用于分类分析（见图1）。理想的底漆系统应该足够通用，以涵盖广泛的分类群体，而随之而来的扩增子必须提供足够的分类信息来进行可靠的分类学分类。根据我们的经验和16S/ITS分析管道的验证，我们建议表1中显示的引物系统。我们的服务不仅限于显示的标记基因和底漆系统，还限于其他系统发育标记基因（例如，细胞色素C氧化酶I）和底漆系统可以使用。试点研究对于为您的特定研究问题找到最佳的底漆系统非常有帮助。
宏基因组学的表现
肺部感染每年在世界范围内造成大量发病率和死亡率，并导致脓胸、胸腔积液和肺脓肿等各种并发症 ( Magill et al., 2014)。肺部感染是由各种微生物病原体引起的免疫介导的肺部疾病，包括真菌、细菌、病毒、非典型病原体和寄生虫。及早识别和验证病原体并使用适当的抗生素治疗对于改善肺部感染的预后至关重要。相反，延误可能会导致病情恶化和更大的死亡风险。长期以来，病原菌的检测主要依赖于常规检查 (CE)，例如涂片、培养、免疫学测试和聚合酶链反应 (PCR)。痰样本、纤维支气管镜刷活检、支气管肺泡灌洗液 (BALF) 和支气管内活检是最常见的呼吸道标本类型。然而，检测病原体的一个问题是传统的病原体检测方法非常耗时，因为一种传染病可能由多种病原体引起，必须对每种病原体进行单独检查。另一个限制是抗生素治疗显著降低了培养的诊断效果，而且一些传染病的病原体无法被检测到。此外，鉴于CE的显著缺点，治疗决策很大程度上更加经验性，特别是混合感染和多重耐药细菌的出现，使进一步治疗变得困难。因此，迫切需要一种新的病原体检测方法来提高检测率和精准治疗。宏基因组新一代测序（mNGS）技术已被用于通过高通量测序来识别感染的病因和潜在的病原体，包括病毒、寄生虫、细菌和真菌，而无需分离和培养单个分离株。在临床微生物学领域，与 CE 方法相比，mNGS 表现出显著的优势，包括无偏检测、高通量测序和相对较快的周转时间；基本 NGS 工作流程（包括样本/文库制备、测序、数据分析和报告）仅需大约 24 小时。因此，mNGS 技术在快速识别病原体和同时检测多种病原体方面表现出明显的临床应用优势。它被广泛用于补充 CE 方法，并越来越多地应用于临床和公共卫生领域。NGS 技术日益发展，不同的测序平台已应用于临床样本的 mNGS。在众多可用的测序平台中，最常用的是第二代测序技术，例如Illumina和北京基因组研究所（BGI）提供的平台（Jerome等，2019年；Zhou等，2019年；Chen L等，2020年；Chen P等，2020 ; Yan 等，2020 ; Liu 等，2021 ; Zhao 等，2021）。然而，很少有研究确定选择不同的测序平台是否会显著影响临床诊断；因此，选择合适的测序平台仍然是临床实验室和临床医生面临的挑战。先前的研究报告称，各种测序平台在检测
宏基因组学-Toolkit
对具有数千个数据集的复杂环境的元基因组分析，例如序列读取存档中可用的数据集，需要巨大的计算资源才能在可接受的时间范围内完成计算工作。这样的大规模分析要求有效地使用基础基础结构。此外，任何分析都应完全可复制，并且必须公开使用工作流程，以允许其他研究人员了解计算结果背后的推理。在这里，我们介绍了可扩展的数据不可吻合的工作流程的宏基因组学-Toolkit，该工作流程分别自动化了从Illumina或Oxford Nanopore技术设备获得的简短和长元基因组读取。宏基因组学-ToolKit不仅提供元基因组工作流程中预期的标准功能，例如质量控制，组装，套件和注释，还提供独特的特征，例如基于各种工具的质粒识别，恢复无组成的微生物社区成员的恢复以及通过互联网模型的相互依赖模型的恢复，并发现了一个元素，并依赖于基本模型，并进行互联网组合。此外，元基因组学 - 库尔基特包括一个机器学习优化的组装步骤，该步骤量身定制元素组装程序要求的峰值RAM值以符合实际要求，从而最大程度地减少对专用高音硬件的依赖性。虽然可以在用户工作站上执行Metagenomics-Toolkit，但它还为有效的基于云的集群执行提供了多种优化。Metagenomics-Toolkit是开源的，可在https://github.com/metagenomics/metagenomics-tk上获得。我们将宏基因组学 - toolkit与五个常用的宏基因组工作流进行了比较，并通过在757 Metagenome数据集中从污水处理样本中执行元基因组学 - 静电库来证明其能力，以研究可能的污水核心微生物组。
詹姆斯敦峡谷病毒
什么是詹姆斯敦峡谷病毒？詹姆斯敦峡谷病毒 (JCV) 是一种罕见的病毒感染，由蚊子传播。人们是如何感染 JCV 的？JCV 由虫媒病毒引起，通过蚊子传播给人。如果蚊子叮咬了感染 JCV 的动物，蚊子就会通过叮咬将病毒传播给人。JCV 遍布北美温带地区，主要在鹿和蚊子种群中传播。JCV 有多常见？尽管 JCV 的地理分布范围很广，但自 2004 年 JCV 成为全国报告的疾病以来，美国只有不到 20 人感染了 JCV。病例主要发生在中西部和东北部。JCV 是什么时候发现的？JCV 感染最初在 20 世纪 70 年代初被描述为引起轻微发烧的疾病。JCV 感染可能发生在 5 月到夏末的任何时候。谁最容易感染 JCV？任何居住在受影响地区并被蚊子叮咬的人都可能接触到詹姆斯敦峡谷病毒，但
博士穆罕默德·多尔敦库
专业服务活动 会议/研讨会服务 • 秘书 2023 年 6 月至今 ASME（美国机械工程师学会）航空结构、结构动力学和材料会议（SSDM）“结构”技术委员会。 • 主席和组织者 2023 年 6 月 19-21 日 “复合结构的冲击、疲劳、损伤和断裂”会议，作为 ASME（美国机械工程师学会）航空结构、结构动力学和材料会议（SSDM23）的一部分，美国加利福尼亚州圣地亚哥。 • 联合组织者 2021 年 8 月 18-20 日 第二届工程材料塑性、损伤和断裂国际研讨会（IW-PDF2021），土耳其安卡拉。 • 组织委员会成员 2019 年 10 月 8-10 日 第 19 届疲劳和断裂新趋势国际会议• 科学委员会成员 2019 年 8 月 22-23 日，第一届工程材料塑性、损伤和断裂国际研讨会（IW-PDF2019），土耳其安卡拉。 • 科学委员会成员 2019 年 6 月 11-14 日，第九届航空航天技术最新进展国际会议（RAST2019），土耳其伊斯坦布尔。
