呼吸道感染,尤其是病毒感染以及其他外部环境因素,已显示出深远影响肺中巨噬细胞种群。尤其是,肺泡巨噬细胞(AMS)是呼吸道感染期间重要的前哨,其消失为招募的单核细胞(MOS)开辟了一个细分市场,以区分居民巨噬细胞。尽管这个话题仍然是激烈辩论的重点,但AMS的表型和功能在炎症性侮辱后重新殖民地殖民地的殖民地(例如感染)似乎部分取决于其起源,但也取决于局部和/或系统的变化,这些变化可能在表观遗传学水平上被划界。呼吸道感染后的表型改变具有长期塑造肺免疫力的潜力,从而导致有益的反应,例如保护过敏性气道侵入或对其他感染的保护,但与免疫病理发展相关时也有害反应。本综述报告了病毒诱导的肺巨噬细胞功能改变的持续性,并讨论了这种烙印在解释个体间和终生免疫变化中的重要性。
监督的机器学习模型依赖于具有正面(目标类)和负面示例的培训数据集。因此,培训数据集的组成对模型性能有直接影响。具体来说,关于不代表目标类别的样品的负样本选择偏见,在诸如文本分类和蛋白质 - 蛋白质相互作用预测等范围内提出了挑战。基于机器学习的免疫治疗设计是一个越来越重要的研究领域,重点是设计抗体或T细胞受体(TCR),可以与其具有高特异性和亲和力的靶标分子结合。鉴于免疫治疗药物的生物医学重要性,有必要解决负面训练集成分如何影响模型概括和生物学规则发现以实现合理和安全的药物设计的尚未解决的问题。我们着手在抗体 - 抗原结合预测问题的背景下通过改变负面类别,包括结合亲和力梯度来研究这个问题。我们的研究基于提供基于地面真理结构抗体 - 抗原结合数据的大型合成数据集,从而使结合界面上的残基结合能访问了残基的结合能。我们发现,分布式概括和绑定规则发现都取决于所使用的负数据集的类型。重要的是,我们发现模型学习正数据集的绑定规则的能力并不是其分类精度的微不足道相关性。我们通过现实世界中相关的实验数据确认了我们的发现。我们的工作强调了考虑培训数据集组成在基于机器学习的研究中实现最佳分布性能和规则学习的重要性。
此预印本版的版权持有人于2024年6月29日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.29.601316 doi:Biorxiv Preprint
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在这里,我们介绍了TrackPlot,这是一个Python软件包,用于通过可编程和基于互动的Web方法生成出版物质量可视化。与生成实地的程序的现有范围相比,TrackPlot提供了一个多功能平台,可在各种来源中视觉解释基因组数据,包括具有功能域映射,同种型,同种型的基因注释,而没有通过SCRNA-SECRED和长期访问的范围以及杂色的范围,以及任何杂色的访问范围,并提供了透明度的范围,以及杂色的范围。符合主要期刊要求的输出文件。TrackPlot软件包是一种开源软件,可以在Bioconda(https://anaconda.org/bioconda/trackplot)上免费获得,Docker(https://hub.docker.com/r/r/r/r/ygidtu/trackplot) (https://github.com/ygidtu/trackplot),还提供了用于本地部署的内置Web服务器。
基于先前工作中开发的热模型,并在参考文献中呈现。[4],已经确定,由于预热,可以将奥氏体阶段保留在激光处理过程中的整个存款步骤中。基于计算的材料点历史,在样品,LPF1和LPF2的制造中也实现了相同的结果。因此,在最后冷却阶段关闭激光器后,马氏体转化才发生。这样的转化产生了扩张菌株,可以促进沉积物内“拉伸”残留应力。但同时,冷却阶段本身会导致样品内收缩。现在考虑参考的工作。[5],取决于关键马氏体转化点(MS和MF)的位置,可能会出现“热”残留应力的暂时放松,这是由于所谓的超塑性效应在Martensite Transformation的时刻出现。在LFP2样品中获得的较高热量积累(见图7C)以及同一样品中较高的同质性水平可以被认为是该样品中获得的更好的超塑性效应的原因,从而避免了随后的冷裂裂纹现象,从而避免了更好的压力缓解。这些条件在CP和LFP1的两个样本中都无法存在,因此导致它们随后的冷裂。