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TCR 敲除 Jurkat 细胞系
描述 TCR 敲除 Jurkat 细胞系是通过 CRISPR/Cas9 基因组编辑生成的，以去除 TCRα 和 β 链的 TRAC（T 细胞受体 Alpha 常数）和 TRBC1（T 细胞受体 β 常数 1）结构域。背景 T 细胞受体 (TCR) 位于 T 细胞表面，负责识别与 MHC（主要组织相容性复合体）分子结合的抗原。TCR 的参与会启动下游 NFAT 信号传导，从而导致 T 细胞活化。TCR 由两种不同蛋白质链的异二聚体组成，其中 alpha（α）和 beta（β）链是主要链。CRISPR/Cas9 基因组编辑用于去除 α 和 β 链的 TRAC（T 细胞受体 Alpha 常数）和 TRBC1（T 细胞受体 β 常数 1）区域，导致 TCR 表达丧失。应用 在生成或表征 CAR-T 细胞时用作对照 提供的材料
甲藻基因敲除策略
摘要：甲藻是单细胞原生生物，具有不寻常的核特征，例如基因组大、染色体浓缩和以串联基因阵列形式组织的多个基因拷贝。人们认为遗传调控是在翻译水平而非转录水平上控制的。这一过程中的一个重要参与者是起始因子 eIF4E，它与 mRNA 5' 端的 7-甲基鸟苷帽结构 (m7G) 结合。对 11 种甲藻物种的转录组分析表明，每种物种编码 8 到 15 个 eIF4E 家族成员。确定 eIF4E 家族成员在基因表达中的作用需要一种抑制其表达的方法。在其他真核生物中，这可以使用与 RNA 互补链结合的翻译阻断吗啉来实现，从而抑制 mRNA 加工。以前，未经修饰的吗啉缺乏穿过细胞膜的能力，但是肽基试剂已被用于通过内吞介导的过程将物质递送到细胞的细胞质中，而不会损坏细胞膜。我们已成功使用特定的细胞穿透肽将荧光标记的吗啉递送到 Amphidinium carterae 的细胞质中，目标是靶向 eIF4e-1a 序列以抑制翻译。特定的 eIF4e 敲除成功率（高达 42%）已通过显微镜和蛋白质印迹分析进行鉴定。
CRISPR/Cas9 敲除质粒
CRISPR/Cas 系统是一种适应性免疫防御机制，古细菌和细菌利用该系统降解外来遗传物质。在这些生物体中，噬菌体的外来遗传物质被获取并整合到 CRISPR 基因座中 (1,2)。这种新物质也称为间隔物，可产生序列特异性片段，用于未来抵抗噬菌体感染。这些序列特异性片段被翻译成短 CRISPR RNA (crRNA)，并通过 CRISPR 相关 (Cas) 蛋白的核酸酶活性引导互补入侵 DNA 的切割，该蛋白也由 CRISPR 基因座编码 (1,2)。II 型 CRISPR 系统的 Cas9 核酸酶具有 RNA 结合域、α 螺旋识别叶 (REC)、包括用于 DNA 切割的 RuvC 和 HNH 的核酸酶叶以及原间隔物相邻基序 (PAM) 相互作用位点 (1,2)。 crRNA 通过与 REC 叶内的桥螺旋结合与 Cas9 核酸酶形成复合物，并与 crRNA 的骨架形成多个盐桥 (1,2,3)。
CRISPR 基因敲除试剂盒
注 1：如何进行双等位基因敲除：如果您只有单等位基因敲除（杂合子）并且想要获得双等位基因敲除（纯合子），您可以订购另一个包含不同哺乳动物选择标记（如杀稻瘟素或新霉素抗性标记）的供体载体。OriGene 拥有两种功能性盒。您可以使用新的供体载体再次进行敲除程序以靶向第二个等位基因，因为一个等位基因已被靶向并被 GFP-puro 盒替换。或者，您可以使用 Cre（SKU GE100018）从您编辑的细胞中去除 puro 盒，并使用相同的供体载体靶向第二个等位基因。
CRISPR/... 敲除 lncRNA XLOC_005950 的影响
摘要：癌细胞通过糖酵解利用葡萄糖维持肿瘤细胞增殖。然而，长链非编码RNA（lncRNA）对骨肉瘤（OS）细胞糖酵解的影响尚不清楚。本研究旨在探讨lncRNA XLOC_005950/hsa‑microRNA (miR)‑542‑3p/磷酸果糖激酶肌肉（PFKM）轴在OS进展中对葡萄糖代谢、细胞增殖和凋亡的调节作用。通过逆转录定量PCR分析检测OS组织和细胞中lncRNA XLOC_005950、hsa‑miR‑542‑3p和PFKM的表达。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除MG63细胞中的lncRNA XLOC_005950表达。通过Cell Counting Kit-8实验、流式细胞术、PFKM活性、葡萄糖和乳酸含量测定，探讨lncRNA XLOC_005950敲除和hsa-miR-542-3p过表达对OS细胞表型的影响。通过双荧光素酶报告基因检测，验证lncRNA XLOC_005950、hsa-miR-542-3p与PFKM的靶向关联。结果表明，lncRNA XLOC_005950在OS组织和细胞中的表达上调。功能实验表明，lncRNA XLOC_005950敲除降低了PFKM活性，降低了细胞内葡萄糖和乳酸含量，抑制了细胞增殖，增加了OS细胞的凋亡。此外，lncRNA XLOC_005950敲除
CRISPR-CAS9介导的SAGD基因的敲除链球菌中链霉菌酶过表达的敲除
链球菌酶是一种酶，在某些心肌梗死（心脏病发作），肺栓塞和动脉血栓栓塞症的情况下，可以分解血凝块。由于各种心脏病的发病率增加，链霉菌酶的需求在全球范围内高。链球菌酶的主要来源是来自链球菌的各种菌株。链霉菌酶在天然菌株链球菌中的表达受到限制，这是由于SAGD抑制剂基因用于生产链霉菌酶，需要将其淘汰以增加表达。然而，FASX是A组中存在的一个小RNA（SRNA），它通过在SKA mRNA的5'端结合，负责链球菌酶（SKA）基因的转录后调节。s。episimilis是β-蛋白酶蛋白产生链球菌细菌（C组），其中含有FASX的直系同源物，并且本质地表达了临床上重要的溶栓链蛋糕激酶。是为了提高mRNA的稳定性并增加链霉菌酶的表达，而链霉菌酶抑制了SAGD。与野生型相比，我们使用CRISPR-CAS9成功地从SAGD基因中淘汰，并观察到突变株中链球菌表达的相对定量的13.58倍。我们还证明了使用CRISPR-CAS9在Equisimilis中的成功靶基因敲除，可以进一步用于过表达链霉菌酶用于治疗应用。
单步生成纯合敲除/...
。CC-BY 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是由此预印本的版权持有者于 2024 年 1 月 11 日发布的。 ；https://doi.org/10.1101/2024.01.10.575120 doi：bioRxiv 预印本
基于突变独立的 CRISPR/Cas9“敲除...
视紫红质 (RHO) • 一种参与视杆细胞视觉光传导的光敏受体蛋白 • 位于视杆细胞的外节 • 大约 30%（美国和英国）的 adRP 由 RHO 显性突变引起 • 患病率：美国有 7,500 名患者，欧盟和英国有 12,100 名患者 • RHO 基因中发现的 >150 个突变导致 RHO-adRP 1
基于 CRISPR-del 的人类基因完全敲除流程 1
。CC-BY-NC 4.0 国际许可，根据 （未经同行评审认证）提供，是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2022 年 5 月 27 日发布。；https://doi.org/10.1101/2021.06.21.449335 doi：bioRxiv 预印本