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靶向多胺生物合成刺激斑马鱼β细胞再生
摘要 1 型糖尿病 (T1D) 是一种以破坏产生胰岛素的 β 细胞为特征的疾病。目前，我们在如何逆转或预防 1 型糖尿病患者的 β 细胞损失方面仍然存在重大差距。之前对小鼠的研究发现，使用二氟甲基鸟氨酸 (DFMO) 药物抑制多胺生物合成可保留 β 细胞功能和质量。同样，用酪氨酸激酶抑制剂甲磺酸伊马替尼治疗非肥胖糖尿病小鼠可逆转糖尿病。这些动物研究的有希望的发现促成了两项独立临床试验的启动，这两项试验将重新利用 DFMO (NCT02384889) 或伊马替尼 (NCT01781975) 并确定对糖尿病结果的影响；然而，这些药物是否直接刺激 β 细胞生长仍然未知。为了解决这个问题，我们使用了斑马鱼模型系统来确定药理学对 β 细胞再生的影响。在诱导β细胞死亡后，用DFMO或伊马替尼处理斑马鱼胚胎。两种药物均未改变全身生长或外分泌胰腺长度。用伊马替尼处理的胚胎对β细胞再生没有影响；然而，令人兴奋的是，DFMO增强了β细胞再生。这些数据表明，药物抑制多胺生物合成可能是刺激糖尿病环境中β细胞再生的一种有前途的治疗选择。
审查 - 环境科学斑马鱼作为生态毒理学研究和测试的替代动物模型
摘要：人为干预对环境健康产生了损害，增强了生态系统的降解，以及释放到自然的化学污染物的数量。因此，环境评估范围内的研究领域和监测（例如生态毒理学）有助于确定污染物的毒性潜力。一种被称为斑马鱼（Danio rerio）的小型塞普林剂，其使用呈指数成长，是科学研究的替代脊椎动物模型，主要用于评估环境风险。该物种在实验室中表现出几个优势，除了表现出多生物毒性的多种标志物外。因此，本综述旨在提出与该物种合作的主要特征和优势，并显示与涉及斑马鱼毒性生物标志物的生态毒理学有关的研究。结果表明，在环境风险分析中采用该物种的渐进趋势，在评估一系列化学污染物的毒性水平中，这是一种越来越推荐的物种。未来技术的发展必须有助于科学进步，从而使该模型生物的潜在应用变得更加广泛，这无疑将有助于弥合各个研究领域的知识差距。
马俊恒 (助理教授)
造血：脊椎动物正常造血的基因调控和人类血液系统恶性肿瘤的分子基础，特别是利用斑马鱼模型对新的造血基因或疾病相关基因突变进行功能评估。 斑马鱼疾病模型：建立人类遗传疾病（包括血液系统恶性肿瘤和先天性疾病）的斑马鱼模型，旨在建立一个全面的斑马鱼平台，用于高通量疾病建模以及大规模筛选新型治疗药物，实现转化医学。开发包括体内基因组编辑、转基因和高分辨率成像在内的先进研究技术。 自噬与细胞衰老：利用斑马鱼模型研究胚胎发育过程中的自噬，特别是自噬在造血和细胞衰老中的复杂作用。
受伤后参与成年斑马鱼和哺乳动物脑修复的细胞机制
摘要：成人神经发生是所有脊椎动物中发生的进化保守过程。然而，考虑到构成和损伤引起的条件下的神经源性壁ni，神经干细胞（NSC）身份，神经干细胞（NSC）身份以及大脑可塑性之间观察到明显的差异。斑马鱼已成为研究成人神经发生涉及的分子和细胞机制的流行模型。与哺乳动物相比，成年斑马鱼显示出大脑分布在整个大脑中的大量神经源性壁ni。此外，它表现出强大的再生能力，没有疤痕形成或任何明显的残疾。在这篇综述中，我们将首先讨论有关（i）成年斑马鱼和哺乳动物（主要是小鼠）和（ii）主脑脑脑壁iches中神经干细胞的性质的神经源性壁ches的分布。在第二部分中，我们将描述斑马鱼和小鼠端脑损伤后发生的一系列细胞事件。我们的研究清楚地表明，大多数早期事件发生在斑马鱼和小鼠之间，包括细胞死亡，小胶质细胞和少突胶质细胞募集，以及损伤引起的神经发生。在哺乳动物中，受伤后的后果之一是形成了持续存在的神经胶质疤痕。在斑马鱼中不是这种情况，这可能是斑马鱼表现出更高再生能力的主要原因之一。
基于系统的基于图像的基于斑马鱼幼虫中复杂性状的遗传筛选
摘要具有数以千计的基因组关联研究对复杂特征鉴定的基因座，需要在体内模型系统中可靠，迅速推断大量候选基因的作用。基于F 0斑马鱼中的基于CRISPR/CAS9的功能屏幕代表这样的系统。然而，到目前为止使用的负面对照 - 包括加扰的指南RNA（GRNA），灭活的CAS9和假注射 - 不会引起与CRISPR/CAS9相同的细胞和有机反应，并且可能会加剧结论。在这里，我们表明，靶向KITA促进了成功的诱变，更高质量的成像数据以及病例和对照的有效分类的有效的光学预筛查。我们鉴定并测试了两个靶向具有类似高诱变效率和对色素作用的kita的GRNA，并且没有对心脏代谢性状的脱靶效应或主要影响。我们提出了几种方法，这些方法将得出有效的，公正的结论。
利用成像方法研究斑马鱼脑部疾病的病理生理机制
1 欧洲非线性光谱实验室，Via Nello Carrara 1, 50019 Sesto Fiorentino，意大利； turrini@lens.unifi.it (LT)； roschi@lens.unifi.it (LR); devito@lens.unifi.it (GdV)； francesco.pavone@unifi.it (FSP) 2 佛罗伦萨大学神经科学、心理学、药物研究和儿童健康系，Viale Gaetano Pieraccini 6, 50139 佛罗伦萨，意大利 3 佛罗伦萨大学复杂动力学研究中心，Via Giovanni Sansone 1, 50019 Sesto Fiorentino，意大利 4 佛罗伦萨大学物理和天文学系，Via Giovanni Sansone 1, 50019 Sesto Fiorentino，意大利 5 国家研究委员会国家光学研究所，Via Nello Carrara 1, 50019 Sesto Fiorentino，意大利 6 佛罗伦萨大学生物系，Via Madonna del Piano 6, 50019 Sesto Fiorentino，意大利 * 通讯地址：francesco.vanzi@unifi.it
记住对手：斑马鱼中与社交记忆相关的神经元激活
1个神经社会记忆的实验室，生理学研究所，分子生物学和神经性研究（ifibyne），Conicet，fceyn-uba，4个布宜诺斯艾利斯，阿根廷。 div>5 2生物多样性与实验和应用生物学研究所（IBBEA-Conicet），布宜诺斯艾利斯，阿根廷6 3 3 3社会行为神经内分泌学实验室，生理学，分子生物学和神经科学研究所（Ifibyne）（ifibyne），7 Conicet，Fceyn-buba，ficeyn-uba，buenestina，buenentina，buenentina，buenentina，buenentina，buenentina 89 *9 *
影响肌肉发育的斑马鱼突变体的全转录组数据分析
骨骼肌收缩肌纤维的形成是一个复杂过程，若受到干扰则会导致肌营养不良。在此，我们提供了三种不同斑马鱼突变体的 mRNAseq 数据集，这些突变体在胚胎发生过程中影响肌肉组织。这些突变体包括肌球蛋白折叠伴侣 unc45b (unc45b/)、热休克蛋白 90aa1.1 (hsp90aa1.1/) 和乙酰胆碱酯酶 (ache/) 基因。在受精后 72 小时 (hpf) 对这三个突变体进行了重复实验中的转录组分析，并对 unc45b/ 进行了另外两个发育时间 (24 hpf 和 48 hpf)。通过层次聚类分析了总共 20 个样本以查找差异基因表达。本研究的数据支持 Etard 等人的观察结果。 (2015) [1] ( http://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0825-8 ) 肌球蛋白折叠失败会激活骨骼肌中独特的转录程序，该程序与应激肌肉细胞中诱导的程序不同。 & 2016 作者。由 Elsevier Inc. 出版。这是一篇根据 CC BY 许可协议开放获取的文章 ( http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ )。
PyZebrascope：用于斑马鱼全脑神经活动成像的开源平台
了解神经元如何在大脑中相互作用以控制动物行为是神经科学的核心目标之一。荧光显微镜和基因编码钙指示剂的最新发展促成了斑马鱼全脑成像方法的建立，该方法以单细胞分辨率记录整个大脑体积的神经活动。全脑成像的开创性研究使用了定制的光片显微镜，其操作依赖于全球不可用的商业开发和维护的软件。因此，在研究界传播和开发这项技术一直具有挑战性。在这里，我们介绍了 PyZebrascope，这是一个开源 Python 平台，旨在使用光片显微镜对斑马鱼的神经活动进行成像。PyZebrascope 具有直观的用户界面，并支持全脑成像的基本功能，例如两个正交激发光束和眼睛损伤预防。其相机模块可以处理从相机采集到文件写入高达 800 MB/s 的图像数据吞吐量，同时保持稳定的 CPU 和内存使用率。其模块化架构允许包含用于显微镜控制和图像处理的高级算法。作为概念验证，我们实施了一种新颖的自动算法，通过将激发光束精确对准图像焦平面来最大化大脑中的图像分辨率。PyZebrascope 可以在虚拟现实环境中对鱼类行为进行全脑神经活动成像。因此，PyZebrascope 将有助于在神经科学界传播和开发光片显微镜技术，并加深我们对动物行为过程中全脑神经动力学的理解。
甲基parathion暴露诱导斑马鱼胚胎的发育毒性和心脏毒性
摘要：甲基parathion（MP）已被广泛用作食品保存和害虫管理的有机磷农药，导致其在水生环境中的积累。，MP对非目标物种的早期发育毒性，尤其是水生脊椎动物，尚未得到彻底研究。 在这项研究中，用2.5、5或10 mg/l的MP溶液处理斑马鱼胚胎，直到施肥后72小时（HPF）。 结果表明，MP暴露降低了斑马鱼胚胎的自发运动，孵化和存活率，并降低了诱导的降低异常异常，例如身体长度缩短，蛋黄水肿和脊柱曲率。 值得注意的是，发现MP会诱导心脏异常，包括心包水肿和心率降低。 暴露于MP会导致活性氧（ROS）的积累，超氧化物歧化酶（SOD）活性降低，过氧化氢酶（CAT）活性增加，丙二醛（MDA）水平升高，并导致Zebrafifififiahyde（MDA）水平并引起心脏凋亡。 此外，MP影响了与心脏发育相关基因的转录（VMHC，SOX9B，NPPA，TNNT2，BMP2B，BMP4）和与凋亡相关的基因（P53，BAX，BCL2）。 astaxanthin可以通过下调氧化应激来挽救MP诱导的心脏发育缺陷。 这些发现表明MP诱导心脏发育毒性，并提供了MP对水生生物的毒性的其他证据。，MP对非目标物种的早期发育毒性，尤其是水生脊椎动物，尚未得到彻底研究。在这项研究中，用2.5、5或10 mg/l的MP溶液处理斑马鱼胚胎，直到施肥后72小时（HPF）。结果表明，MP暴露降低了斑马鱼胚胎的自发运动，孵化和存活率，并降低了诱导的降低异常异常，例如身体长度缩短，蛋黄水肿和脊柱曲率。值得注意的是，发现MP会诱导心脏异常，包括心包水肿和心率降低。暴露于MP会导致活性氧（ROS）的积累，超氧化物歧化酶（SOD）活性降低，过氧化氢酶（CAT）活性增加，丙二醛（MDA）水平升高，并导致Zebrafifififiahyde（MDA）水平并引起心脏凋亡。此外，MP影响了与心脏发育相关基因的转录（VMHC，SOX9B，NPPA，TNNT2，BMP2B，BMP4）和与凋亡相关的基因（P53，BAX，BCL2）。astaxanthin可以通过下调氧化应激来挽救MP诱导的心脏发育缺陷。这些发现表明MP诱导心脏发育毒性，并提供了MP对水生生物的毒性的其他证据。