尽管有几种备受瞩目的最先进的方法可用,但分析批量RNA-Seq数据仍在面临重大挑战。最近的研究的证据表明,流行的差异表达(DE)工具(例如EDGER和DESEQ2)容易受到惊人的错误发现率(FDR)的影响。这些研究表明,在这些模型中观察到的FDR通货膨胀可能归因于诸如违反参数假设的问题或无法有效处理数据中的异常值。在这里,我们认为群体异质性也可以促进这一提升的FDR,这一现象在很大程度上被研究界忽略了。我们介绍了一种新型的统计模型Robseq,该模型旨在在差异分析中有效的每种功能建模,当时是当群均均一的假设未得到满足时。Robseq利用了稳健的统计文献中建立的统计机制,包括M估计量来稳健地估计基因表达水平变化和Huber-Cameron方差估计器来计算异性设置中的鲁棒标准误差。此外,出于推理目的,它还结合了Welch T统计量的自由度调整,有效地解决了RNA-Seq差异表达中FDR通胀的问题。通过详细的模拟和全面的基准测试,我们表明Robseq成功地将错误的发现和I型错误率保持在名义级别,同时与众所周知的DE方法相比保留了高统计能力。对种群级RNA-seq数据的分析进一步表明,Robseq能够鉴定出与复杂人类疾病有关的具有生物学上重要的信号和途径,这些信号和途径涉及复杂的人类疾病,否则这些信号和途径否则无法通过已发表的方法揭示。Robseq的实现可在https://github.com/schatterjee30/robseq上公开提供。
罗马 - 所有证据表明,微生物组是一个新兴的概念,指的是由细菌和其他微生物组成的复杂生态系统,对与人,植物和行星健康有关的问题具有强大的解释价值。为了促进科学辩论,并刺激和指导更多的是联合国粮食和农业组织的专家(FAO)(FAO)产生了四个新的出版物,其中一项侧重于土壤健康,以及三项有关微型塑料,农药残留物和兽医药物如何影响我们食品供应安全的科学评论。“关于农药和兽药的评论以及微型塑料的评论表明,从方法论的角度来看,仍然需要做很多事情,以加强和系统化研究的结构方式,以便我们能够塑造出我们塑造食品标准的方式。”从广义上讲,微生物组是细菌,真菌,古细菌和其他微生物及其活动剧院的社区,其中包括彼此之间的互动以及各自的环境。微生物组都存在于所有生态系统内部和植物,动物,土壤,森林,海洋以及人类中重要的。在组成和功能以及时间和时间上都有很大的不同,但是在基因组测序方面的技术进步的帮助下,研究表明,某些广泛的模式可能与健康或宿主生态系统的健康或功能障碍相关。建立因果关系是难以捉摸的,尤其是在任何给定的栖息地或肠道中,微生物群的许多领域和功能尚不清楚。越来越多的证据表明,肠道微生物组可能与许多健康和营养成果有关,包括儿童发育迟缓,肥胖和超重,认知功能,免疫功能等。新的粮农组织报告的一个共同主题是微生物组研究需要一个更加协调的框架。FAO食品安全专家Carmen Diaz-Amigo说,评论建议与风险评估者和多学科微生物组专家组织一系列会议,以达成定义并建立研究标准和知识差距。农药残留
多发性骨髓瘤 (MM) 约占血液系统恶性肿瘤的 10%,是第二大常见血液系统疾病。激酶抑制剂被广泛使用,其治疗癌症的功效也已得到证实。在此,为了鉴定对 MM 治疗有潜在治疗价值的激酶,我们研究了大型患者群体中激酶组表达谱的预后影响。我们鉴定了 36 个与 MM 预后价值显著相关的激酶组相关基因,并根据它们的表达建立了激酶组指数。激酶组指数 (KI) 与 MM 的预后、增殖、分化和复发有关。然后,我们在人骨髓瘤细胞系中测试了针对七种已鉴定蛋白激酶 (PBK、SRPK1、CDC7-DBF4、MELK、CHK1、PLK4、MPS1/TTK) 的抑制剂。所有测试的抑制剂均显著降低了骨髓瘤细胞系的活力,我们证实了其中三种抑制剂对患者原发性骨髓瘤细胞的潜在临床意义。此外,我们还证明了它们能够潜在地降低常规治疗(包括美法仑和来那度胺)的毒性。这凸显了它们在骨髓瘤治疗中的潜在有益作用。三种激酶抑制剂(CHK1i、MELKi 和 PBKi)克服了对来那度胺的耐药性,而 CHK1、PBK 和 DBF4 抑制剂使美法仑耐药细胞系重新对这种常规治疗药物敏感。总之,我们证明了激酶抑制剂可能具有治疗意义,尤其是对于 KI 定义的高风险骨髓瘤患者。 CHEK1、MELK、PLK4、SRPK1、CDC7-DBF4、MPS1/TTK 和 PBK 抑制剂单独使用或与美法仑或 IMiD 联合使用可为难治性/复发性骨髓瘤患者提供新的治疗选择。
多发性骨髓瘤 (MM) 约占血液系统恶性肿瘤的 10%,是第二大常见血液系统疾病。激酶抑制剂被广泛使用,其治疗癌症的功效也已得到证实。在此,为了鉴定对 MM 治疗有潜在治疗价值的激酶,我们研究了大型患者群体中激酶组表达谱的预后影响。我们鉴定了 36 个与 MM 预后价值显著相关的激酶组相关基因,并根据它们的表达建立了激酶组指数。激酶组指数 (KI) 与 MM 的预后、增殖、分化和复发有关。然后,我们在人骨髓瘤细胞系中测试了针对七种已鉴定蛋白激酶 (PBK、SRPK1、CDC7-DBF4、MELK、CHK1、PLK4、MPS1/TTK) 的抑制剂。所有测试的抑制剂均显著降低了骨髓瘤细胞系的活力,我们证实了其中三种抑制剂对患者原发性骨髓瘤细胞的潜在临床意义。此外,我们还证明了它们能够潜在地降低常规治疗(包括美法仑和来那度胺)的毒性。这凸显了它们在骨髓瘤治疗中的潜在有益作用。三种激酶抑制剂(CHK1i、MELKi 和 PBKi)克服了对来那度胺的耐药性,而 CHK1、PBK 和 DBF4 抑制剂使美法仑耐药细胞系重新对这种常规治疗药物敏感。总之,我们证明了激酶抑制剂可能具有治疗意义,尤其是对于 KI 定义的高风险骨髓瘤患者。 CHEK1、MELK、PLK4、SRPK1、CDC7-DBF4、MPS1/TTK 和 PBK 抑制剂单独使用或与美法仑或 IMiD 联合使用可为难治性/复发性骨髓瘤患者提供新的治疗选择。
本演示文稿包含有关未来结果,绩效和成就的前瞻性陈述,这些陈述受风险和不确定性的影响,并反映了由可用信息形成的管理层的观点和假设。历史事实陈述以外的所有陈述都是可以认为是前瞻性陈述的陈述。在此文档中使用时,诸如“预期”,“相信”,“估计”,“期望”,“打算”,“五月”,“计划”,“项目”或“应该”和类似表达式(与佳能相关的表达)之类的词,旨在识别前瞻性陈述。Many factors could cause the actual results, performance or achievements of Canon to be materially different from any future results, performance or achievements that may be expressed or implied by such forward-looking statements, including, among others, changes in general economic and business conditions, changes in currency exchange rates and interest rates, introduction of competing products by other companies, lack of acceptance of new products or services by Canon's targeted customers, inability to meet efficiency and cost reduction objectives, changes in business strategy and various其他因素,均在本演讲中引用和未引用。应实现一个或多个风险或不确定性,或者基本假设证明不正确,实际结果可能与本文所述的结果有很大不同。佳能不打算或承担更新这些前瞻性语句的任何义务。