fi g u r e 1有丝分裂组的覆盖范围是由(a)单个苍蝇,(b)蝇池或(c)leeches的个体或水池池产生的。虚线表示整个基因组的10 bp平均值。绘图旁边的苍蝇或水ech图像表示使用了独特的颜色/形状组合以及是否使用了单个提取物或池。(d)从GenBank的91个灵长类有丝分裂基因组和由苍蝇,水ches或蝇池产生的高质量有丝分裂基因组的比对来推断出的最大可能性系统发育。提出的系统发育是有助于解释的,但是完整的树包括有关节点和分支长度的其他信息。至少需要10×覆盖范围才能为这些有丝分裂基因组拨打基础,阈值为95%的身份,以调用底座。出现在> 95%的bootstrap复制中显示为实线的节点。量表显示每个位置的核苷酸取代。
18。在不同地区和生产系统上缺乏足够的研究,这意味着了解特定农业实践对土壤生物多样性的影响仍然很斑驳。广泛地说,看来耕作和不当灌溉实践可能会对土壤生态系统的功能产生负面影响。农药对土壤微生物组具有破坏性作用,但是结果是可变的,在某些情况下,微生物组已证明能够适应。地上生物多样性影响地下生物多样性,并且已经发现长期作物单养殖对土壤生物多样性的各种成分产生负面影响。潜在治疗的风险和益处,例如向土壤中添加生物炭和噬菌体的使用尚不清楚,需要进一步研究。
我们提出并研究了一条特定的绝热途径,以准备那些张张量的网络状态,这些张量状态是有限晶格的少数身体汉密尔顿人的独特基态,其中包括正常的张量网络状态以及其他相关的非正常状态。此路径保证了有限系统的差距,并允许有效的数值模拟。在一个维度上,我们从数值上研究了具有不同相关长度和一维的af af af af af-kennedy-lieb-tasaki(aklt)状态的状态家族的制备,并表明,基于顺序制备,绝热制剂可以比标准方法快得多。我们还将该方法应用于六边形晶格上的二维二二二二链AKLT状态,为此,不知道基于顺序制备的方法,并表明它可以非常有效地用于相对较大的晶格。
Alpine River Biotiverity在冰川撤退中受到快速变暖驱动的冰川撤退的威胁,但是我们预测专业冷水物种的未来分布的能力目前有23个限制。在这里,我们将未来的冰川预测,水文路由方法和物种24分布模型联系起来,以量化冰川对整个欧洲阿尔卑斯山的15 25阿尔卑斯河无脊椎动物物种的人口分布的变化,从2020年到2100年。冰川26对河流的影响预计将稳步下降,河网的河流以每十年1%的速度扩展为27个海拔。物种预计将经历上游分布的变化28,其中冰川持续存在,但在功能上灭绝了冰川完全消失。预计有几个29个高山集水区为冷水专家提供气候避难。但是,当今的30个受保护区网络提供了对这些未来避难所的相对较差的覆盖范围,31表明高山保护策略必须改变以适应32个全球变暖的未来影响。33
昆虫识别和保存代金券标本是害虫诊断和监视活动不可或缺的;然而,由于捕获数量高以及样品对环境损害的敏感性,散装昆虫是诊断性的挑战。许多昆虫陷阱捕获依赖于物种鉴定的形态特征的检查,这是一项耗时且高技能的任务,因此需要更有效的分子方法。许多大量的DNA提取方法需要对样品进行破坏性采样,从而导致损坏或完全破坏的代金券标本。我们开发了一种廉价,快速,散装的DNA分离方法,该方法将标本保存为固定的保证金,该标准可以允许攻击后的形态检查和纳入昆虫参考收集中。我们的方案使用了一组暂时的昆虫来验证,这些昆虫耗时以识别大量的果蝇(双翅目:tephritidae:dacinae)。在开发我们的方法时,我们根据以下标准评估了现有方案:对形态的影响;适合大型陷阱捕捞的适用性;成本;易于处理;并应用于下游分子诊断分析,例如实时PCR和metabarcoding。我们发现,快速分离DNA提取的最佳方法是将蝇浸入NaOH:TE缓冲液在75°C中浸入10分钟,而无需蛋白酶K或洗涤剂。这种热索克方法产生了足够的高质量DNA,同时保留了适合物种水平鉴定的形态学特征,样品中最多20,000蝇。裂解物在下游分析中表现良好,例如环路介导的等温扩增(LAMP)和实时PCR应用,而对于元键块PCR,裂解物需要额外的柱纯化步骤。这种方法的开发是提高我们准确检测在散装陷阱中捕获的昆虫的能力所需的关键步骤,无论是生物多样性,生物安全还是有害生物管理目标。
摘要:引入非土著物种(NIS)是对欧洲沿海生态系统完整性的主要威胁之一。基于DNA的评估已越来越多地用于监视NIS。但是,基于DNA的分类学分配的准确性在很大程度上取决于DNA条形码参考库的完成和可靠性。因此,我们旨在编译和审核欧洲发生的海洋无脊椎动物NIS的DNA条形码参考库。为此,我们使用三个数据库编制了NIS列表:欧洲外星物种信息网络(EASIN),关于水生非土著和隐性物种(Aquanis)的信息系统以及引入海洋物种(WRIMS)的世界登记册。对于每个物种,我们从生命数据系统(BOLD)的条形码(BOLD)中检索了可用的细胞色素C氧化酶亚基I(COI)线粒体基因序列,并使用了条形码,审计和等级系统(BAGS)来检查形成型名称和条形码索引编号(BINS)之间的一致性。从编译的1249种物种中,大约42%的物种有BOLD的记录,其中56%是不和谐的。我们进一步分析了这些案例,以确定不一致的原因并归因于其他注释标签。成功解决了35%,这增加了元法数据集中检测到的NIS数量的12个。但是,相当数量的垃圾箱仍然不一致。参考条形码记录的可靠性在NIS的情况下尤其重要,如果不需要时,错误的识别可能会触发动作或无所作为。
为了维持一种有效,一致的数据收集和管理方法,在艾伯塔省生物多样性监测计划(ABMP)期间检测到的所有脊椎动物和无脊椎动物和无脊椎动物物种都在数据表上输入到数据表上,然后使用独特的物种代码,然后使用中央数据库。所有脊椎动物物种代码均为4个字母,通常由“共同”名称的前几个字母组成;一些变化适用。鸟类代码遵循美国鸟类学家工会和加拿大鸟类研究所使用的鸟类代码(Lepage 2005)。所有其他脊椎动物代码都与艾伯塔省环境的生物多样性物种观察数据库相似。红松鼠(RESQ)出现在哺乳动物和鸟类清单中,因为它是在繁殖鸟类调查过程中常见的物种。所有无脊椎动物物种代码均由作者根据目前用于血管和非血管植物的格式开发。无脊椎动物代码是7个字母,由该属的前四个字母组成,以及拉丁语名称的前3个字母;一些变化适用。的变化。Generally, the next letter of a species name will be used in cases for similar spellings (eg., Anurida maritima = ANURMAR and Anurida martynovae = ANURMAT) and in the case of a subspecies, letters from both species and subspecies names may be used (eg., Trhypochthoniellus setosus canadensis = TRHYSEC).代码的变化以蓝色突出显示,因此现场工作人员可以区分物种之间的差异并确保使用适当的代码。螨虫(Orbatida)物种的清单最初是从Behan-Pelletier and Eamer(2004)收集的,Springtail(Collembola)列表最初是从北美物种清单(nearCtica.com)中汇编而成的。用蓝色和大胆印刷突出显示的代码表示类似的冲突,但有不同的分类单元(即苔藓或地衣物种)。所有脊椎动物和无脊椎动物物种代码均由ABMP代码按字母顺序列出,以易于参考。与ABMP物种代码一起,该文档包括赋予所有生物多样性,科学名称和通用名称的国际认可的“自然服务”代码(存在)。本文档中发现的所有脊椎动物物种均根据2005年艾伯塔省野生物种的一般地位进行排名(艾伯塔省可持续资源开发2006年)。每个排名都方便地编码,以易于查看。在艾伯塔省的正式详细地位评估和称为“濒临灭绝”或“威胁”的正式详细地位评估和名称后,任何已知处于风险的物种处于危险中。可能处于危险中。敏感的任何没有灭绝或灭绝风险的物种,可能需要特别注意或保护以防止其处于危险之中。确保没有“有风险”,“可能有风险”或“敏感”的物种。不确定的任何物种都无法可靠地评估其一般状况,而这些物种不足。未评估任何尚未检查的物种。外来/外星人因人类活动而引入的任何物种。灭绝/灭绝的任何物种不再认为存在于艾伯塔省(灭绝)或不再被认为存在于世界任何地方(灭绝)。意外/流浪者在艾伯塔省(即在其通常的范围之外)中不经常且不可预测地发生的任何物种。