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clearscope：用于亚细胞分辨率成像的完全集成的光片theta显微镜，没有横向大小约束Matthew G. Fay 1，
1 MBF Bioscience, Williston, VT 05495, USA 2 Department of Biomedical Engineering, Columbia University, New York, NY 10027, USA 3 Department of Biological Sciences, Columbia University, New York, NY 10027, USA 4 Neuroscience Institute, New York University Langone Health, New York, NY 10016, USA 5 Department of Neuroscience and Physiology, New York University Grossman School医学；纽约市，10016，美国6纽约大学格罗斯曼医学院精神病学系；纽约市，美国10016。7纽约大学神经科学中心，纽约，纽约10003，美国8综合癫痫中心，纽约大学格罗斯曼医学院神经病学系；纽约市，10016，美国9纽约大学格罗斯曼医学院神经外科系；纽约市，10016，美国，摘要的三维（3D）在动物模型的完整大脑以及大型人类和非人类和非人类灵长类动物大脑标本的整体化成像对于理解生理神经网络连接模式及其病理学改变的病理学改变而言至关重要。灯页显微镜已成为一种高效的成像方式，用于对大型清除样品的快速高分辨率成像。但是，光显微镜中照明和检测光学的正交布置限制了可以成像的样品的大小。最近开发的光片theta显微镜（LSTM）技术通过利用两个照明光路径的独特布置倾斜到检测光路径，同时允许检测光路相对于试样表面的垂直排列。在这里，我们报告了下一代，完全集成和用户友好的LSTM系统的开发，以在整个大型标本中均匀地均匀地下分辨率成像，而不会约束横向（XY）大小。此外，我们为图像获取，数据存储，预处理和后处理，增强和定量分析提供了无缝集成的工作流程。我们通过完整的小鼠大脑和人脑样品的高分辨率3D成像以及完整的数据分析（包括数字神经元追踪，血管重建和基于设计的立体分析）在3D中证明了系统性能。这种技术增强和用户友好的LSTM实现将在不同类型的非常大的样本中快速对分子和细胞特征的分子和细胞特征进行快速定量映射。关键字：轻度显微镜，轻纸theta显微镜，连接组学，神经科学：0009-0009-0009-2439-8045（M.F.），0009-0007-1876-4104（P.L.），0009-0006-4374-3711（D.D.），0009-0000-5928-8692（N.OC。），0009-0005-0168-9190（B.H.），0009-0004-0565-9872（J.B.1），0009-0003-7441-9496（N.R.），0009-0004-3698-1784（A.W.），0009- 0004-5284-1087（S.A.），0009-0009-8144-0115（P.A.），0000-0002-7559-0936（J.B.2），0000-0003-4350-0569（T.B.），0000-0002-0026-2006（C.G.），0000-0003-0044-4632（O.D.），0000-0002-7559-0936（J.B.），0000-0002-4229-2860（R.T.），0000-0003-4463-207X（J.G.）（Y.B.1，Jeffrey Blaisdell）。
使用倾斜校正的透射透射电子显微镜，用于厚样品的剂量效率的冷冻电子显微镜，在细胞和单个颗粒上证明
该预印本版的版权持有人于2024年8月15日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.04.22.590491 doi：Biorxiv Preprint
terahertz控制和透射电子显微镜中的时间相关性
超快电子显微镜提供了一种类似电影和时间的材料结构动力学的访问，但是到目前为止，基本原子运动或电子动力学的速度太快而无法解决。在这里，我们通过激光生成的Terahertz光的单光周期报告了透射电子显微镜中电子脉冲的全光控制，压缩和表征。这个概念提供了孤立的电子脉冲，并将透射电子显微镜的空间分辨率与通过激光光周期提供的时间分辨率合并。我们还报告了多电子状态的全光控制，并在时域中找到了实质性的两电子和三电子反相关。这些结果开辟了可能性原子和电子运动的可能性，以及它们在时空中基本维度上的量子相关性。
医学中的定量显微镜
1。F. Bray等。，2018年全球癌症统计：Globocan在185个国家 /地区的36个癌症全球发病率和死亡率的估计。 CA：临床医生68，394-424（2018）的癌症杂志。 2。 E. Francini等。 ，新系统性疗法对基于医院的注册表中耐cast割前列腺癌患者的总体生存的影响。 前列腺癌和前列腺疾病22，420-427（2019）。 3。 M. de Santis等。 ，niraparib加上阿比罗酮乙酸酯酸盐和其他一线聚ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案对BRCA1/2突变阳性转移性抗性castration-抗性前列腺癌的患者的可行性。 治疗的进步（2024）。 4。 S. T. Tagawa等。 ，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。 临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。 5。 D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。 癌症82，2256-2261（1998）。 6。 D. A. Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。 7。 O. Sartor等。 8。 9。，2018年全球癌症统计：Globocan在185个国家 /地区的36个癌症全球发病率和死亡率的估计。CA：临床医生68，394-424（2018）的癌症杂志。 2。 E. Francini等。 ，新系统性疗法对基于医院的注册表中耐cast割前列腺癌患者的总体生存的影响。 前列腺癌和前列腺疾病22，420-427（2019）。 3。 M. de Santis等。 ，niraparib加上阿比罗酮乙酸酯酸盐和其他一线聚ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案对BRCA1/2突变阳性转移性抗性castration-抗性前列腺癌的患者的可行性。 治疗的进步（2024）。 4。 S. T. Tagawa等。 ，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。 临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。 5。 D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。 癌症82，2256-2261（1998）。 6。 D. A. Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。 7。 O. Sartor等。 8。 9。CA：临床医生68，394-424（2018）的癌症杂志。2。E. Francini等。 ，新系统性疗法对基于医院的注册表中耐cast割前列腺癌患者的总体生存的影响。 前列腺癌和前列腺疾病22，420-427（2019）。 3。 M. de Santis等。 ，niraparib加上阿比罗酮乙酸酯酸盐和其他一线聚ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案对BRCA1/2突变阳性转移性抗性castration-抗性前列腺癌的患者的可行性。 治疗的进步（2024）。 4。 S. T. Tagawa等。 ，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。 临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。 5。 D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。 癌症82，2256-2261（1998）。 6。 D. A. Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。 7。 O. Sartor等。 8。 9。E. Francini等。，新系统性疗法对基于医院的注册表中耐cast割前列腺癌患者的总体生存的影响。前列腺癌和前列腺疾病22，420-427（2019）。3。M. de Santis等。 ，niraparib加上阿比罗酮乙酸酯酸盐和其他一线聚ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案对BRCA1/2突变阳性转移性抗性castration-抗性前列腺癌的患者的可行性。 治疗的进步（2024）。 4。 S. T. Tagawa等。 ，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。 临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。 5。 D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。 癌症82，2256-2261（1998）。 6。 D. A. Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。 7。 O. Sartor等。 8。 9。M. de Santis等。，niraparib加上阿比罗酮乙酸酯酸盐和其他一线聚ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案对BRCA1/2突变阳性转移性抗性castration-抗性前列腺癌的患者的可行性。治疗的进步（2024）。4。S. T. Tagawa等。 ，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。 临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。 5。 D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。 癌症82，2256-2261（1998）。 6。 D. A. Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。 7。 O. Sartor等。 8。 9。S. T. Tagawa等。，前列腺特异性膜抗原靶向α发射极通过抗体递送，用于转移性cast割 - 耐抑制前列腺癌：（225）AC-J591的I期I剂量降低研究。临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志42，842-851（2024）。5。D. G. Bostwick，A。Pacelli，M。Blute，P。Roche，G。P。Murphy，前列腺上皮内肿瘤和腺癌中的前列腺特异性膜抗原表达：一项研究184例。癌症82，2256-2261（1998）。6。D. A.Silver，I。Pellicer，W。R. Fair，W。D. Heston，C。Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原表达在正常和恶性的人体组织中。7。O. Sartor等。8。9。临床癌症研究：美国癌症研究协会官方杂志3，81-85（1997）。，lutetium-177-PSMA-617，用于转移性cast割前列腺癌。新英格兰医学杂志385，1091-1103（2021）。M. S. Hofman等。 ，[（177）lu-psma-617与Cabazitaxel在转移性cast割的前列腺癌（治疗）患者中：一项随机，开放标签，第2期试验。 柳叶刀（英国伦敦）397，797-804（2021）。 J.-C。 Olivo-Marin，使用多尺度产品在生物图像中提取斑点。 模式识别35，1989-1996（2002）。 10。 V. Caselles，R。Kimmel，G。Sapiro，Geodesic Active Contours。 国际计算机视觉杂志22，61-79（1997）。 11。 F. Meyer，地形距离和分水岭。 信号处理38，113-125（1994）。M. S. Hofman等。，[（177）lu-psma-617与Cabazitaxel在转移性cast割的前列腺癌（治疗）患者中：一项随机，开放标签，第2期试验。柳叶刀（英国伦敦）397，797-804（2021）。J.-C。 Olivo-Marin，使用多尺度产品在生物图像中提取斑点。 模式识别35，1989-1996（2002）。 10。 V. Caselles，R。Kimmel，G。Sapiro，Geodesic Active Contours。 国际计算机视觉杂志22，61-79（1997）。 11。 F. Meyer，地形距离和分水岭。 信号处理38，113-125（1994）。J.-C。 Olivo-Marin，使用多尺度产品在生物图像中提取斑点。模式识别35，1989-1996（2002）。10。V. Caselles，R。Kimmel，G。Sapiro，Geodesic Active Contours。国际计算机视觉杂志22，61-79（1997）。11。F. Meyer，地形距离和分水岭。信号处理38，113-125（1994）。
超显微光纤尖端3D微粒光热干涉气体传感器
光纤维传感器由于其高灵敏度，远程能力和对电磁干扰的免疫力而成为一种非常有前途的痕量检测技术。然而，状态或艺术的气体传感器通常使用冗长的光学纤维作为气体吸收细胞或功能材料的涂层来实现更敏感的气体检测，这带来了挑战，例如缓慢的响应和/或较差的选择性，以及对它们在填充空间中使用的限制。在这里，据报道，通过据报道，通过直接的3D微印Fabry-Pérot腔的直接3D微印刷在标准单模光学纤维的末端，通过直接的3D微印。它不仅可以在纤维输出处进行光和气体分子之间的直接相互作用，还可以通过干涉读取方案进行远程询问。长度为66 µm的小插曲，噪声当量等效浓度为160亿亿亿乙炔气体，超快速响应时间为0.5 s。如此小的高性能光热气体传感器是一种方法，可以远程检测痕量气体，用于从反应器监测到医学诊断的无数应用。长度为66 µm的小插曲，噪声当量等效浓度为160亿亿亿乙炔气体，超快速响应时间为0.5 s。如此小的高性能光热气体传感器是一种方法，可以远程检测痕量气体，用于从反应器监测到医学诊断的无数应用。
皮肤：多任务循环生成的对抗网络，用于无监督的自动细胞识别，这是在体内反射率的共聚焦显微镜上i
方法：在RCM图像上自动定位的表皮细胞（称为角质形成细胞）进行了两次尝试：第一个基于旋转符号误差函数掩码，第二个基于细胞形态特征。在这里，我们提出了一个双任务网络，以自动识别RCM图像上的角质形成细胞。每个任务都由一个周期生成的对抗网络组成。第一个任务旨在将真实的RCM图像转换为二进制图像，从而学习RCM图像的噪声和纹理模型，而第二个任务将Gabor滤波的RCM图像映射到二进制图像中，学习在RCM图像上可见的表皮结构。这两个任务的组合允许一个任务限制另一个任务的解决方案空间，从而改善了总体结果。我们通过应用预先训练的Stardist算法来检测恒星凸形形状，从而完善细胞识别，从而关闭任何不完整的膜并分离相邻的细胞。
低温扫描探针显微镜（LTSPM）博士/博士后职位
• Sessi 等人，拓扑手性半金属 PdGa 两种对映体中手性相关的准粒子干涉。自然通讯 11 ，3507 (2020) https://doi.org/10.1038/s41467-020-17261-x • Zhang 等人，拓扑超导异质结构中的竞争能级。纳米快报 21 ，2758-2765，(2021)。https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.0c04648 • Chang 等人，SnTe/PbTe 单层横向异质结构中的涡旋取向铁电畴。先进材料，33 ，2102267 (2021)。 https://doi.org/10.1002/adma.202102267 • Küster 等人，将约瑟夫森超电流和 Shiba 态与非常规耦合到超导体的量子自旋关联起来。《自然通讯》12，1108 (2021)。https://doi.org/10.1038/s41467-021-21347-5 • Küster 等人，与超导凝聚态耦合的局部自旋之间的长距离和高度可调相互作用。《自然通讯》12，6722 (2021)。https://doi.org/10.1038/s41467-021-26802-x • Brinker 等人，原子制作的量子磁体的异常激发。《科学进展》8，eabi7291 (2022)。 DOI:10.1126/sciadv.abi7291 • Küster 等人，稀疏自旋链中的非马约拉纳模式接近超导体。美国国家科学院院刊 119，e2210589119 (2022)。https://doi.org/10.1073/pnas.2210589119 • Soldini 等人，二维 Shiba 晶格作为晶体拓扑超导的可能平台。自然物理学 19，1848–1854 (2023)。https://doi.org/10.1038/s41567-023-02104-5 • Wagner 等人，Designer-Supraleiter nehmen Form an。物理学家时代 (2024) https://doi.org/10.1002/piuz.202401701
课程计划：我们周围的微生物（没有显微镜）
课程计划：我们周围的微生物（无显微镜）的课程计划日期创建：2024-06-10课程计划日期上次编辑：2024-06-10实施的课程计划日期：创建的课程计划：Danielle Condry，PhD受众/年级：中学：中学（6-8年级） - 可以将其转移到K-5或9-1-12或9-12或NOTE。主题：我们各地的微生物：环境科学目标：本课程计划旨在让学生参与动手科学，并更深入地了解影响我们日常生活的微生物世界。步骤1目标（我希望我的听众/学生在本课后能够做什么？）：学生将：1。描述微生物在环境中的无处不在。2。练习环境抽样方法来收集微生物。3。观察微生物生长的结果，并推断出在各种环境中微生物的存在。4。讨论微生物对健康和环境的影响。第2步评估计划（我将如何知道我的听众/学生实现目标？）：直接评估： - 学生将创建并提交一份实验室报告，详细介绍他们在所选环境中有关微生物存在的抽样方法，观察结果和结论。- 参与有关他们发现的小组讨论和演讲。间接评估： - 活动期间的非正式观察，以衡量学生的参与和理解。- 学生自我反思和反馈形式，涉及他们对微生物的了解。第3步活动（我将如何帮助我的听众/学生实现目标？）：材料： - 无菌拭子 - 带琼脂（预先准备）的培养皿 - 永久标记 - parafilm条封闭板
医学中的定量显微镜
1. F. Bray 等人，2018 年全球癌症统计：GLOBOCAN 对 185 个国家/地区 36 种癌症的发病率和死亡率的估计。CA：临床医生癌症杂志 68，394-424 (2018)。2. E. Francini 等人，基于医院登记的新型全身疗法对转移性去势抵抗性前列腺癌患者总体生存率的影响。前列腺癌与前列腺疾病 22，420-427 (2019)。3. M. De Santis 等人，对于 BRCA1/2 突变阳性转移性去势抵抗性前列腺癌患者，尼拉帕尼联合醋酸阿比特龙与其他一线聚 ADP-核糖聚合酶抑制剂治疗方案进行间接治疗比较的可行性。治疗进展 (2024)。 4. ST Tagawa 等，通过抗体递送前列腺特异性膜抗原靶向 Alpha 发射体治疗转移性去势抵抗性前列腺癌：(225)Ac-J591 的 I 期剂量递增研究。临床肿瘤学杂志：美国临床肿瘤学会官方杂志 42，842-851（2024 年）。5. DG Bostwick、A. Pacelli、M. Blute、P. Roche、GP Murphy，前列腺特异性膜抗原在前列腺上皮内瘤变和腺癌中的表达：184 例病例的研究。癌症 82，2256-2261（1998 年）。6. DA Silver、I. Pellicer、WR Fair、WD Heston、C. Cordon-Cardo，前列腺特异性膜抗原在正常和恶性人体组织中的表达。临床癌症研究：美国癌症研究协会官方杂志 3 , 81-85 (1997)。7. O. Sartor 等人，镥-177-PSMA-617 治疗转移性去势抵抗性前列腺癌。新英格兰医学杂志 385 , 1091-1103 (2021)。8. MS Hofman 等人，[(177)Lu]Lu-PSMA-617 与卡巴他赛在转移性去势抵抗性前列腺癌患者中的比较 (TheraP)：一项随机、开放标签、2 期试验。柳叶刀 (伦敦，英国) 397 , 797-804 (2021)。9. J.-C. Olivo-Marin，使用多尺度乘积提取生物图像中的斑点。模式识别 35 , 1989-1996 (2002)。 10. V. Caselles、R. Kimmel、G. Sapiro，《测地线活动轮廓》。《国际计算机视觉杂志》22，61-79（1997 年）。11. F. Meyer，《地形距离和分水岭线》。《信号处理》38，113-125（1994 年）。
基于计算的时间分辨多光谱荧光显微镜
多光谱成像和时间分辨成像是荧光显微镜中的两个常见采集方案，它们的组合可能有益于提高特异性。数据集（时空，时间和光谱）的多维性引入了一些挑战，例如获取大数据集和较长的测量时间。在这项工作中，我们提出了一个时间分辨的多光谱荧光显微镜系统，其测量时间短，通过基于单像素摄像机（SPC）方案利用压缩感（CS）来实现。带有高分辨率摄像头的数据融合（DF）使我们能够解决典型的SPC的低空间分辨率问题。集成了硬件和算法的SPC，CS和DF的联合使用代表了一个计算成像框架，以减少在保留信息内容的同时减少测量的数量。这种方法已被利用以演示缩放功能而无需移动光学系统。我们在空间，光谱和时间特性方面描述和表征系统，以及对细胞样品的验证。