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EPSRC工业博士学位景观奖（IDLA）
EPSRC工业博士学位景观奖（IDLA）：使用配方科学和流变学的结构化液体的数值模型的开发和验证：净零可持续产品。Mark Simmons教授和Alessio Alexiadis化学工程学院博士，伯明翰联合利华大学，阳光港口税收税收津贴19,795英镑，每年5,000英镑的工业增长津贴，以及支付的费用。项目描述：联合利华集团是家庭，个人护理和食品的国际制造商，目的是使可持续的生活司空见惯。该公司拥有400多个品牌，这些品牌在190多个国家/地区出售，每年的营业额在2022年为600亿欧元。包含复杂结构液体的产品是该产品组合的关键组成部分，例如洗发水和头发护发剂（鸽子，lux，sunsilk）。要满足英国气候目标，迫切需要采用新颖的科学方法来实现产品和工艺的快速重新重新制定，以减少制造和使用过程中的温室气体（GHG）排放和水。联合利华已承诺从2039年到销售点从其所有产品中实现零净排放。由于越来越多的成分转移到可持续的原料，以及制造此类成分所需的碳足迹所需的碳足迹，因此需要实现这种创新率。最初的焦点将放在含有层状凝胶网络（LGN）的浓缩产品上。这些结构建立了粘度，并有助于对消费者满意的产品的整体感觉和流动。学生将这个博士学位项目通过测试和开发新的数值框架来促进这一目标，该框架可以在计算机实验中进行测试，以测试新的配方及其针对实验的微观结构，以减少时间和浪费的最终目标，从而将新的配方带给市场。Composed of surfactants and long chain fatty alcohols, the structural features of LGNs are built over three orders of magnitude, from self-assembled repeat-unit bilayer structures at the nanometre- scale, to stacking of these into intermediate mesostructures to form higher order sheet-like agglomerates with dimensions in the order of tens to hundreds of micrometres, which twist, fold and interlock with other sheets.该项目旨在通过模拟（在计算机中）和实验室（体外）实验的组合使用无网状数值方法来验证和进一步开发微观结构的初步模型。候选人将熟悉它们，并在配方和模拟中提出低复杂性实验，以创建能够预测复杂液体的流变特性的能力，并着重于层状凝胶网络。学生将从S＆T护发能计划中与联合利华队的互动中受益，并将在其博士项目中练习项目管理，并通过常规团队和更广泛的社区更新来介绍他们的工作。
通过显式能量景观优化进行蛋白质序列设计
摘要蛋白质设计问题是确定折叠成所需结构的氨基酸序列。鉴于安芬森的折叠热力学假设，这可以改写为找到一个氨基酸序列，其中最低能量构象是该结构。由于这种计算不仅涉及所有可能的氨基酸序列，还涉及所有可能的结构，因此大多数当前方法都侧重于更易处理的问题，即为所需结构找到最低能量的氨基酸序列，通常在第二步通过蛋白质结构预测检查所需结构确实是设计序列的最低能量构象，并丢弃在许多情况下并非如此的大部分设计序列。这里我们表明，通过将梯度通过 trRosetta 结构预测网络从所需结构反向传播到输入氨基酸序列，我们可以直接优化所有可能的氨基酸序列和所有可能的结构，并在一次计算中明确设计预测折叠成所需结构而不是任何其他结构的氨基酸序列。我们发现，考虑了完整构象景观的 trRosetta 计算比 Rosetta 单点能量估计更能有效地预测从头设计蛋白质的折叠和稳定性。我们将通过景观优化进行的序列设计与 Rosetta 中的标准固定骨架序列设计方法进行了比较，并表明前者的结果对竞争低位状态的存在很敏感，而后者则不然。我们进一步表明，通过结合这两种方法的优势，可以设计出更具漏斗形的能量景观：低分辨率 trRosetta 模型用于排除替代状态，高分辨率 Rosetta 模型用于在设计目标结构处创建深度能量最小值。意义计算蛋白质设计主要侧重于寻找在目标设计结构中能量非常低的序列。然而，在折叠过程中最相关的不是折叠状态的绝对能量，而是折叠状态与最低位替代状态之间的能量差。我们描述了一种可以捕捉整个折叠景观的深度学习方法，并表明它可以增强当前的蛋白质设计方法。
通过量化景观美度改善可再生能源资源评估
实现经济高效且可持续的能源转型需要可靠的可再生能源分布信息。我们利用来自 Scenic-Or-Not 的约 200,000 张带地理标记的照片的 150 多万个风景评级来量化英国陆上风能设施可能位于的景观的美学价值。对规划申请的分析提供了定量证据，表明在风景更优美的地区提出的陆上风电项目更有可能被拒绝。利用包括 OpenStreetMap 在内的更多开放数据源，我们基于这些发现对英国陆上风电的可行潜力和成本进行了新的估计，我们发现这两个数字分别约为 1700 TWh 和 2800 亿英镑。我们还发现风景和风能资源质量之间存在很强的空间相关性，这意味着成本效率和公众接受度之间不可避免地存在权衡。
当前的光遗传学景观用于增强养子T细胞治疗
抽象免疫疗法是宿主对更好地抗击病原体或疾病的免疫反应的药物调节，近几十年来改变了癌症治疗。t细胞是自适应免疫系统的重要组成部分，对治疗成功是最重要的。最近的免疫治疗方式更频繁地针对癌症治疗和其他病理的T细胞，称为收养T细胞（ATC）疗法。ATC疗法的特征是各种类型的免疫疗法，但主要属于三种ESTAB租赁的技术：肿瘤浸润淋巴细胞，嵌合抗原受体T细胞和工程T细胞受体疗法。尽管有希望的临床结果，但所有ATC治疗类型都在提供长期持续肿瘤清除率的同时对实体瘤尤其无效，旨在了解和防止ATC治疗的典型缺点。光遗传学是一个相对较新的发展，将光敏蛋白质结构域纳入感兴趣的细胞或组织中，以调整特定于特定的生物学过程。免疫功能的光遗传学操纵正在迅速成为免疫学的研究工具，现在使用光敏系统来优化许多细胞治疗方法和ATC疗法。本综述着重于目前如何利用光遗传学方法来改善临床环境中的ATC疗法，通过加深我们对治疗方法背后的分子原理的理解。此外，这篇综述进一步批评了当前的免疫原性系统，并推测了最近发展的扩展，从而增强了当前基于ATC的治疗方式，以铺平临床进度的道路。
神经科学的不断发展的景观
神经科学在20世纪成为一门独特的学科，从那时起就经历了快速扩张。但是，仍然缺乏对其不断发展的景观的全面分析。本研究提供了神经科学研究的大规模，数据驱动的映射。利用大型语言模型和聚类技术来分析1999年至2023年之间发表的461,316篇文章，这项研究揭示了该领域的结构组织，并突出了主题的主要主题。引用网络分析发现了塑造更广泛研究景观的令人惊讶的整合图像和关键的智力枢纽。对研究群体如何与预定的维度保持一致的分析表明，实验的重点，广泛依赖于微观理论以及对应用和翻译研究的越来越重视。同时，基础研究有下降的风险，而理论工作和跨尺度整合仍然有限。本研究提供了一个理解神经科学轨迹的框架，并确定了加强领域的潜在途径。
系统的元蛋白质组学映射揭示了人肠道微生物群对治疗药物的功能和生态景观
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.13.637346 doi：Biorxiv Preprint
环境和可持续性科学与景观建筑，BS
海洋与环境科学系与景观建筑计划中的计划为基础环境和可持续性科学以及与景观建筑有关的学科提供了教育。这个组合的专业为学生提供了获得基本科学背景和实践培训，以解决与环境和景观有关的问题。该计划旨在为学生准备高级研究或城市规划，城市设计，可持续发展，环境咨询和/或其他领域的职业，重点介绍了景观，建筑环境，人类社会和整体气候影响的互动。
虚拟联合现场活动：一个合成景观的框架，以评估多尺度测量水存储方法
1 Institute of Environmental Science and Geography, University of Potsdam, Karl-Liebknecht-Straße 24–25, 14476 Potsdam, Germany 2 Agrosphere Institutes (IBG-3), Research Center Jülich GmbH, 52425 Jülich, Germany 3 geo information in Environmental Planning Lab, Technical University Berlin, 10623 Berlin, Germany 4 Physical海德堡大学研究所，位于德国Neuenheimer Feld 226，69120 Heidelberg，5 GFZ-德国地球科学研究中心，水文学部分，电视台，14473 Potsdam，德国6日6地理研究所，Intrain和Intrain 52f，6020，6020，Auttract，6020，intranopic （HYWA），自然资源与生命科学大学（BOKU），Muthgasse 18，1190，维也纳，奥地利，奥地利8 UFZ -Helmholtz环境研究中心GmbH，监测与勘探技术部，Permoserstr。 15，04318莱比锡，德国1 Institute of Environmental Science and Geography, University of Potsdam, Karl-Liebknecht-Straße 24–25, 14476 Potsdam, Germany 2 Agrosphere Institutes (IBG-3), Research Center Jülich GmbH, 52425 Jülich, Germany 3 geo information in Environmental Planning Lab, Technical University Berlin, 10623 Berlin, Germany 4 Physical海德堡大学研究所，位于德国Neuenheimer Feld 226，69120 Heidelberg，5 GFZ-德国地球科学研究中心，水文学部分，电视台，14473 Potsdam，德国6日6地理研究所，Intrain和Intrain 52f，6020，6020，Auttract，6020，intranopic （HYWA），自然资源与生命科学大学（BOKU），Muthgasse 18，1190，维也纳，奥地利，奥地利8 UFZ -Helmholtz环境研究中心GmbH，监测与勘探技术部，Permoserstr。15，04318莱比锡，德国