EMA。欧洲药品局ERK。细胞外信号相关激酶FDA。美国食品和药物管理局GHM。生病的ICER的同质群体。增量成本效益比,在医学经济语言IMC中的成本效益的翻译。体重指数IV。静脉注射有限责任公司。慢性淋巴白血病LNH。非霍奇金的淋巴瘤。生命年,在医学经济语言图中赢得了生命年的翻译。有丝分裂原激活的蛋白激酶MEK。有丝分裂原激活的细胞外信号再添加激酶UV。超紫色的黄金。优势比PUVA。coralene和RCP的超紫罗兰。多学科咨询会议TDM。TEP上固定测定法。正电子发射断层扫描
组蛋白去乙酰化酶抑制剂已被研究作为癌症和其他疾病的潜在治疗剂。已知 HDI 可促进组蛋白乙酰化,从而导致开放染色质构象并通常增加基因表达。在之前的研究中,我们报告了一组基因,特别是那些由超级增强子调控的基因,可以被 HDAC 抑制剂拉格唑抑制。为了阐明拉格唑抑制基因的分子机制,我们进行了转座酶可及染色质测序、ChIP-seq 和 RNA-seq 研究。我们的研究结果表明,虽然拉格唑治疗通常会增强染色质的可及性,但它会选择性地降低一组超级增强子区域的可及性。这些基因组区域在拉格唑存在下表现出最显著的变化,富含 SP1、BRD4、CTCF 和 YY1 的转录因子结合基序。 ChIP-seq 分析证实 BRD4 和 SP1 在染色质上各自位点的结合减少,特别是在调节基因(如 ID1、c-Myc 和 MCM)的超级增强子上。拉格唑通过抑制 DNA 复制、RNA 加工和细胞周期进程发挥作用,部分是通过抑制 SP1 表达来实现的。shRNA 消耗 SP1 可模拟拉格唑的几种关键生物学效应并增加细胞对该药物的敏感性。针对细胞周期调控,我们证明拉格唑通过干扰中期染色体排列来破坏 G/M 转换,这种表型在 SP1 消耗时也观察到。我们的结果表明,拉格唑通过抑制超级增强子上的 BRD4 和 SP1 发挥其生长抑制作用,导致细胞抑制反应和有丝分裂功能障碍。
染色体隔离需要在动型蛋白复合物和有丝分裂纺锤体之间进行协调,这对于两个子细胞之间的遗传分裂至关重要。动力学是一种蛋白质复合物,位于姐妹染色单体的丝粒上。在有丝分裂过程中,观察到的动物学实际上将姐妹染色质朝着用有丝分裂纺锤体的指南伸向细胞的相反两极。有人提出,stu1是一种小动物络合物中的小蛋白,有助于延迟酿酒酵母的萌芽酵母中的后期,直到每个染色体都附着在有丝分裂的纺锤体上。也有人建议Stu1与纺锤体相互作用,并在拉长时同步移动。已经提出,磷酸化可以调节Stu1的功能,并且熔体是其他动力学蛋白中已知的磷酸化位点,因此,在称为sTu1上的称为熔融基序的磷酸化位点上除去苏氨酸氨基酸在Stu1上的磷酸化位点可能会影响姐妹染色体的能力,这可能会导致姐姐的正确性,这可能会使YEAST YEAST降低。熔体是真菌中保存良好的序列,是其他动力学蛋白中的已知磷酸化位点,是STU1的同源物。利用CRISPR-CAS9酶,我们将在发芽的酵母菌Stu1基因中引入磷酸无效突变,以用熔体序列替代苏氨酸719密码子。到目前为止,我们已经成功克隆了含有引导RNA和Cas9酶基因的质粒。我们假设该突变将在Stu1中产生故障,这可能会阻碍其协调纺锤体和动孔附着的能力,并在有丝分裂过程中完全防止染色体分离。下一步将是用质粒和我们的模板DNA转化酵母,该模板DNA代码在Stu1中的719密码子上编码Valine,这种组合将完全激活酵母中的CRISPR CAS CAS 9基因组编辑系统。
在这种分析和讨论活动中,学生了解干细胞,细胞分化以及表观遗传变化和转录因子如何有助于细胞分化。当学生分析人体如何制作红细胞时,引入了这些概念。在此活动中,学生会回顾转录和翻译,有丝分裂以及细胞器功能的各个方面。在开始这项活动之前,学生应该对细胞器,有丝分裂以及转录和翻译有基本的了解。To introduce or review transcription and translation, you may want to use the hands-on activity, "From Gene to Protein – Transcription and Translation" ( https://serendipstudio.org/sci_edu/waldron/#trans ) or the analysis and discussion activity, "From Gene to Protein via Transcription and Translation ( https://serendipstudio.org/exchange/bioactivities/trans)根据下一代科学标准学习目标2:•学生将了解纪律核心思想LS1.B:成长和
Machine learning prediction of enzyme optimum pH Japheth E. Gado, 1,2,3,4 Matthew Knotts, 4 Ada Y. Shaw, 4 Debora Marks, 4,5 Nicholas P. Gauthier, 4,6 Chris Sander, 4,5 Gregg T. Beckham 1,2,3* 1 Renewable Resources and Enabling Sciences Center, National Renewable Energy Laboratory, Golden, CO,美国2瓶财团,美国加利福尼亚州埃默里维尔的敏捷生物基础,美国4个系统生物学系,美国马萨诸塞州波士顿,哈佛医学院。5哈佛大学和麻省理工学院,美国马萨诸塞州剑桥市6数据科学系,达纳 - 法伯癌症研究所,美国马萨诸塞州波士顿 *通信:gregg.beckham@nrel.gov摘要pH和酶催化活性之间的关系,尤其是最佳pH(phopt),eNzyme ph(phopt)的关系至关重要。因此,预测PHOPT的计算方法将通过促进准确鉴定在特定pH水平上最佳起作用的酶,并阐明序列 - 功能功能关系,从而增强酶的发现和设计。在这项研究中,我们提出并评估了预测PHOPT,进行广泛的超参数优化以及培训11,000多个模型实例的各种机器学习方法。我们的结果表明,利用语言模型嵌入的模型在预测PHOPT时明显超过其他方法。我们提出了预测PHOPT的表现最好的模型Ephod,这使研究人员公开使用。从序列数据中,以ephod直接学习与PHOPT相关的结构和生物物理特征,包括残基与催化中心的接近度以及溶剂分子的可及性。总体而言,Ephod提出了PHOPT预测的有希望的进步,并有可能加快酶技术的发展。引言酶活性受反应环境的pH值的显着影响,通常由于催化失活和结构不稳定而超出特定pH范围的活性下降。1,2虽然大多数特征性的酶具有最佳的活性pH值(PHOPT)接近7.0的中性值,但某些酶在极度酸性或碱性条件下最佳起作用,酸性或碱性PHOPT值分别低至1.0或高达1.0或高至12.5。3–5在工业生物化学过程中,酶经常被使用或希望使用,远离其PHOPT,从而大大减少了活性。结果,人们对发现和工程酶具有增强的pH耐受性,以克服这些限制。
摘要:对用新型烟酰胺衍生物 (DT-8) 处理的 MCF-7 细胞系进行了基于 1 H-NMR 的代谢组学研究,并与两种具有明确作用机制的药物进行了比较,即 DNA 金属化药物顺铂 (顺式二氨二氯铂 (II),CDDP) 和抗有丝分裂药物长春花碱 (长春花碱,VIN)。通过细胞裂解物的 1 H-NMR 和光谱数据的多变量分析 (MVA),研究了这三种化合物(每种化合物的浓度对应于 IC 50 值)相对于对照组 (K) 的影响。发现不同治疗组的代谢特征与对照组存在相关差异。DT-8 与 K 和 VIN 与 K 的代谢特征有很大的重叠,表明生物反应和作用机制相似,与 CDDP 相比有显著差异。另一方面,DT8 似乎通过一种暗示蛋氨酸耗竭和/或 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 限制的机制,扰乱有丝分裂纺锤体并最终阻止细胞分裂。
胰岛素是兰格汉胰岛的B细胞中产生的多肽激素,对几乎所有组织中的代谢具有多方面的作用。胰岛素促进葡萄糖进入细胞,刺激肝脏和肌肉中的糖原形成,并增强脂肪和蛋白质合成(1)。胰岛素也具有有丝分裂功能,刺激细胞生长和增殖(2)。通过跨越血脑屏障,胰岛素可以通过中枢神经系统机制影响和认知(3)。胰岛素与其受体酪氨酸激酶(RTK)的结合触发信号转导,与细胞底物(IRS)的磷酸化以及磷酸酰氨基辛醇3-激酶(PI3K)的激活,从而启动了直接参与代谢和MITogenic效应的事件的事件(1),1,4。第二个途径涉及激活有丝分裂原激活的蛋白激酶(MAPK),该蛋白激酶在控制胰岛素的有丝分裂作用中起主要作用(5)。IRS/ PI3K途径的破坏导致组织对胰岛素代谢作用的敏感性降低 - 一种胰岛素抵抗状态(IR),这是2型糖尿病(T2D),肥胖和动脉高血压患者的特征(6,7)。肾素 - 血管紧张素系统(RAS)有助于IR的病理生理 - 因此,血管紧张素II(AngII)通过促进胰岛素受体和IRS-1和PI3K的磷酸化来破坏胰岛素信号传导,从而影响其功能(8-11)。鉴于这些信号系统之间的密切关系,我们假设胰岛素本身可能会影响RAS并调节其功能。我们还讨论了由于与IR和糖尿病并发症相关的胰岛素信号传导受损而导致的RAS功能障碍的可能病理后果。
抽象的肾脏肥大的特征是细胞大小和蛋白质含量的增加,并具有最小的增生。尚未确定控制这种细胞生长模式的机制。目前的研究检查了由BSC-1肾上皮细胞(GI)阐述的生长抑制剂(GI)是否具有与转化生长因子 /3(TGF-FI)几乎相同的生物学特性,可以将有丝分裂的刺激转化为在原始培养的兔肾管近端细胞中的绩效刺激。胰岛素(10,ug/ml)加上氢化可的松(50 nm)增加了每个细胞的蛋白质量,细胞体积和[3Hjthymidine掺入这些细胞中的24和48小时。gi/tgf-f8(10个单位/ml)导致[3H〜-胸苷incorporation的最小刺激。与胰岛素加材料可添加在一起时,GI/TGF-J8抑制了这些有丝分裂剂对[3H]胸苷掺入的刺激作用,但并未阻止细胞和细胞体积I.e。蛋白质的增加,细胞受到了肥大。这种模式持续了48小时,表明GI/TGF-/3对有丝分裂刺激的DNA合成产生了延长的抑制作用,而不是延迟其发作。对Amiloride敏感的Na+摄取(指示Na+/H+止痛活性)与每个细胞和细胞体积的蛋白质相关,而不是与DNA合成。这些研究表明,对细胞大小的控制可能是由阐述生长抑制因子介导的自分泌机制来调节的,这些抑制因子改变了生长对有丝分裂剂的模式。p60从近端管状细胞携带的条件培养基的凝胶色谱分馏产生了抑制的馏分[BSC-1细胞中的3Hjthymidine掺入和CCL 64细胞;这些细胞系和色谱行为的相对抑制活性与GI/TGF-FI观察到的相似。
简介:细胞周期处于检查点的监视下,以修复各个相之间的细胞过渡之前的任何损坏。WEE1和MYT1激酶通过在CDK1上添加抑制性磷酸化来监测G2/M检查点,以防止过早进入有丝分裂。WEE1在各种肿瘤中过表达,而MK-1775(WEE1小分子抑制剂)目前正在I/II期癌症临床试验中。尽管显示了MK-1775可以增强其他遗传毒性疗法的作用,但临床抗性却朝向其抗性。在检查MK-1775介导的细胞毒性的机理时,我们将MYT1确定为抗性因子。新兴证据表明,MYT1是重要的癌症治疗靶点。因此,我们正在研究一种新型的MYT1激酶小分子抑制剂RP-6306与MK-1775结合使用,作为潜在的合成致死性癌症治疗。aim:。我们假设MK-1775和RP-6306的组合是针对两个部分冗余激酶对适应遗传毒性应激很重要的抑制剂,将实现合成的致死性,同时绕过单一层次的耐药性发育问题。使用的模型系统:1)宫颈癌细胞系,是四环素可诱导的MyT1表达; 2)通过上调myt1,对MK-1775具有抗性的癌细胞系(乳房和颈椎)。方法:我们使用标准的晶体紫罗兰色生存力测定法在一组肿瘤和非肿瘤细胞系中建立了RP-6306的IC50。之后,我们使用协同效力模型在上面列出的模型细胞系中测试了MK-1775和RP-6306的组合效应。使用克隆生成测定法评估了组合处理对克隆原性的影响。对高含量成像系统上的时间段显微镜用于确定RP-6306和MK-1775对有丝分裂持续时间和细胞命运的影响。结果:我们发现MK-1775和RP-6306组合处理表明,癌细胞系中的协同细胞杀死。WEE1抑制作用显示了通过MYT1抑制的协同细胞杀死,尤其是在诱导的MYT1过表达细胞中。 WEE1和MYT1结合抑制作用可抵抗癌细胞瞬时过表达MYT1的克隆发育潜力的增加。 RP-6306和MK-1775组合治疗促进有丝分裂停滞,导致MYT1过表达细胞的细胞死亡。 我们还发现,用联合处理处理的细胞中细胞死亡的机理是丝粒碎片化导致有丝分裂灾难。 结论:合并的WEE1和MYT1抑制导致合成致死性。 因此,我们的发现强烈表明,MK-1775和RP-6306的组合治疗具有减轻MK-1775耐药性的潜力。 我们的研究有助于开发新型的潜在组合疗法,同时优化和提高MK-1775治疗的潜在临床用途的功效。WEE1抑制作用显示了通过MYT1抑制的协同细胞杀死,尤其是在诱导的MYT1过表达细胞中。WEE1和MYT1结合抑制作用可抵抗癌细胞瞬时过表达MYT1的克隆发育潜力的增加。RP-6306和MK-1775组合治疗促进有丝分裂停滞,导致MYT1过表达细胞的细胞死亡。我们还发现,用联合处理处理的细胞中细胞死亡的机理是丝粒碎片化导致有丝分裂灾难。结论:合并的WEE1和MYT1抑制导致合成致死性。因此,我们的发现强烈表明,MK-1775和RP-6306的组合治疗具有减轻MK-1775耐药性的潜力。我们的研究有助于开发新型的潜在组合疗法,同时优化和提高MK-1775治疗的潜在临床用途的功效。
细胞周期蛋白D1充当有丝分裂传感器,该传感器特异性结合与CDK4/6,从而整合了外部有丝分裂输入和细胞周期进程。Cyclin D1与转录因子相互作用,并调节各种重要的细胞过程,包括分化,增殖,凋亡和DNA修复。因此,其失调有助于致癌。细胞周期蛋白D1在乳头状甲状腺癌(PTC)中高度表达。然而,对异常的细胞周期蛋白D1表达引起PTC的特定细胞机制知之甚少。揭示了细胞周期蛋白D1的调节机制及其在PTC中的功能可能有助于确定临床有效的策略,并为进一步的研究提供了更好的机会,从而开发了新型PTC方案,这些方案在临床上有效。本评论探讨了PTC中细胞周期蛋白D1过表达的机制。此外,我们通过与其他调节元件的相互作用来讨论Cyclin D1在PTC肿瘤发生中的作用。最后,研究并总结了针对PTC中细胞周期蛋白D1的治疗选择的最新进展。