。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该预印本版本的版权持有人,该版本发布于2025年2月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636647 doi:Biorxiv Preprint
基因组基础模型具有精确医学,药物发现和理解复杂生物系统的变革潜力。然而,现有模型通常效率低下,受到次优的令牌化和建筑设计的约束,并偏向参考基因组,限制了它们在稀有生物圈中对低丰度,未培养的微生物的表示。为了应对这些挑战,我们开发了Genomeocean,这是一个40亿参数的基因组基础模型,该模型对超过600 GBP的高质量重叠群进行了训练,这些基础是从地球生态系统中各种栖息地收集的220 TB元基因组数据集的高质量重叠群。基因瘤的一项关键创新是直接对元基因组样品的大规模共组合进行培训,从而增强了稀有微生物物种的表示,并提高了以基因组为中心方法的概括性。我们实施了基因组序列产生的字节对编码(BPE)代币化策略,以及建筑优化,实现高达150倍的更快序列产生,同时保持高生物学保真度。Genomeocean在代表微生物物种和产生受进化原理约束的蛋白质编码基因方面表现出色。此外,其微调模型还展示了在天然基因组中发现新型生物合成基因簇(BGC)的能力,并执行生物化学上完全合理的完整BGC的零拍合成。Genomeocean为元基因组研究,自然产品发现和合成生物学设定了一个新的基准,为这些领域提供了强大的基础。
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人工智能的计算和能源成本的爆炸性增长引起了人们对传统电子处理器的替代计算方式的兴趣。使用光子代替电子的光子处理器承诺具有超低潜伏期和功耗的光学神经网络。但是,现有的光神经网络受其设计的限制,尚未达到现代电子神经网络的识别精度。在这项工作中,我们通过将并行的光学计算嵌入到平面相机光学器件中,在捕获过程中执行神经网络计算,然后在传感器上记录之前。我们利用大型内核,并提出了通过低维度重新聚体化学到的空间变化的卷积网络。我们使用具有角度依赖性响应的纳米光子阵列在相机镜头内实例化。与大约2K参数的轻质电子后端结合使用,我们可重新配置的纳米含量神经网络可在CIFAR-10上获得72.76%的精度,超过Alexnet(72.64%)(72.64%),并将光学神经网络推进到深度学习时代。
人工智能的计算和能源成本的爆炸性增长引起了人们对传统电子处理器的替代计算方式的兴趣。使用光子代替电子的光子处理器承诺具有超低潜伏期和功耗的光学神经网络。但是,现有的光神经网络受其设计的限制,尚未达到现代电子神经网络的识别精度。在这项工作中,我们通过将并行的光学计算嵌入到平面相机光学器件中,在捕获过程中执行神经网络计算,然后在传感器上记录之前。我们利用大型内核,并提出了通过低维度重新聚体化学到的空间变化的卷积网络。我们使用具有角度依赖性响应的纳米光子阵列在相机镜头内实例化。与大约2K参数的轻质电子后端结合使用,我们可重新配置的纳米含量神经网络可在CIFAR-10上获得72.76%的精度,超过Alexnet(72.64%)(72.64%),并将光学神经网络推进到深度学习时代。
是由最近发现的高t c双层镍超导体LA 3 ni 2 O 7的动机,我们通过使用Lanczos方法对不同的电子密度n进行了全面研究BiLayer 2×2×2群集。我们还采用随机相近似来量化第一个磁不稳定性,而哈伯德耦合强度的提高也有所不同。基于自旋结构因子s(q),我们在固定的hund耦合下定义的平面中获得了丰富的磁相图,其中u是Hubbard的强度和W带宽。我们观察到许多状态,例如A-AFM,条纹,G-AFM和C-AFM。在半填充,n = 2(每个Ni位点,对应于n = 16个电子)时,规范的近方交互作用导致具有抗firomagnetic Couplings的稳健的G-AFM状态(π,π,π,π),均带有内在的层和层之间。通过增加或降低电子密度,从“半空”和“半满”机制中出现铁磁趋势,从而导致许多其他有趣的磁趋势。另外,与半完成相比,在孔或电子掺杂区域中,自旋旋转相关性在较弱。n = 1。5(或n = 12),密度对应于La 3 Ni 2 O 7,我们获得了“条纹2”基态(抗铁磁耦合在一个平面方向上,另一个面积为非磁磁耦合,另一个耦合的铁磁耦合,沿Z AxiS沿2×2×2×2 Cluster沿Z AxiS沿Z Axiis沿Z AxiS)。另外,我们获得了沿Z轴的AFM耦合要比XY平面中的磁耦合要强得多。此外,具有q /π=(0。< /div>的状态6,0。随机相近似的计算具有不同的n的结果,即使这两种技术都是基于完全不同的程序,但n的结果与兰斯佐斯的结果非常相似。6,1)在我们的RPA计算中发现了靠近电子期波形,通过将填充略微降低到n = 1,可以找到。25,可能负责在实验中观察到的电子期SDW。我们的预测可以通过化学掺杂LA 3 Ni 2 O 7来测试。
所有时间均为美国东部时间 上午 10:05 欢迎和会议概述 上午 10:10 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的信:联邦研究与开发的价值和重要性 上午 10:40 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的报告:审查网络和信息技术研究与开发 (NITRD) 计划 上午 11:40 休息 上午 11:55 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的报告:改善美国的地下水安全 下午 12:55 公众意见 请于 2024 年 10 月 25 日美国东部时间中午 12:00 之前向 PCAST@ostp.eop.gov 提交书面或口头意见请求。 下午 1:05 结束意见 下午 1:10 休会
所有时间均为美国东部时间 上午 9:35 欢迎和会议概述 上午 9:40 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的信:联邦研究与开发的价值和重要性 上午 10:10 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的报告:审查网络和信息技术研究与开发 (NITRD) 计划 上午 11:10 休息 上午 11:20 讨论并考虑批准 PCAST 致总统的报告:改善美国的地下水安全 下午 12:20 公众意见 请于 2024 年 10 月 25 日美国东部时间中午 12:00 之前向 PCAST@ostp.eop.gov 提交书面或口头意见请求。 下午 12:30 结束意见 下午 12:30 休会
Rachael Nealer,能源与交通联合办公室 Zachary Kolodin,州长办公室 Whitmer,密歇根州基础设施办公室 Nathaniel Ford,杰克逊维尔交通管理局 12:45 PM 休息 2:25 PM 创新带来机遇:演讲与讨论 演讲者:
12:30 PM 欢迎和会议概述 12:35 PM 国家研究目的:演示和讨论小组演示:David Goldston(麻省理工学院华盛顿办公室)Lisa Margonelli(科学和技术问题) 1:50 PM 休息 2:35 PM 大学新兴研究模式:演示和讨论小组演示: