XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System杆菌
基于多模式的基于机器学习模型，用于区分非结核分枝杆菌与结核分枝杆菌
结果：基于临床数据的模型包含年龄，性别和IL-6，而RandomForest算法则达到了最佳学习模型。确定了CT图像的两个关键放射线特征，然后用于建立放射线模型，发现Logistic算法的模型是最佳的。多模型模型包含年龄，IL-6和2个放射线特征，最佳模型来自LightGBM算法。与最佳的临床或放射线学模型相比，最佳的多模型模型具有最高的AUC值，准确性，灵敏度和负预测值，并且在外部测试数据集中还验证了其“优惠性能”（准确性= 0.745，敏感性= 0.900）。此外，多模型模型的性能优于放射科医生，NGS检测和现有机器学习模型的性能，其精度分别为26％，4和6％。
发生，埃塞俄比亚中部家禽和人类的弯曲杆菌的危险因素和抗菌素抗性：一种健康方法
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予MedRxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
在连续培养中进化的大肠杆菌菌株甲酸属依赖型的遗传和生物催化基础
Valley Delmech，Nadia Perthat，Oriane Monet，外国Marion，Darii Ecataria和Al。插入Methabolia，2022，72，pp.200-214。10.1016/j.ymben.2022.03.010。
甲烷摩托杆菌的质量和锥虫杆菌Piscolens共生说明了Transkingdom Symbiosis
摘要：在口服微生物毒素中，甲烷抗素的质量（M. assiliense）的研究次数少于良好的特征和培养的甲烷素甲烷素的Oralis和甲烷抗素的甲烷素化剂。M. assiliense与不同的口服病理相关，并与一种严重的牙周炎中与Synergistetes细菌Permidobacter Piscolens（P. piscolens）共隔离。在这里，报道另外两个坏死性纸浆病例，有机会表征两个共培养的M. assiliense分离株，均为P. piscolens，均为p. piscolens，为非运动，1-2- µ m长，0.6-0.8- µm-m-m宽gram-lam-wide gram-strosity coccobaccilli，它们在420 nmms中自动燃料。两个整个基因组序列具有31.3％的GC含量，无间隙为1,834,388-Base Pair染色体，表现为85.9％的编码率，编码甲酸甲酸盐脱氢酶，促进M. assiliense M. assiliense M. assiliense M. assiliense生长，而无需GG培养基中的氢。这些数据为理解与P. piscolens及其在口腔病理中的作用的共生性，跨性别的关联铺平了道路。
大肠杆菌高效生产功能性溶菌酶
摘要 Proaerolysin 是由嗜水气单胞菌产生的一种细菌毒素，它特异性地与质膜上的 GPI 锚定蛋白结合，形成跨膜孔，导致细胞在几个小时内死亡。利用这种独特的特性，proaerolysin 被广泛用于阵发性睡眠性血红蛋白尿症 (PNH) 的诊断测试，这是一种由 PIGA 基因体细胞突变引起的疾病，该基因参与 GPI 锚的生物合成。此外，proaerolysin 还可作为基因操作中的反选择剂。尽管之前已经报道过 proaerolysin 的细菌表达和纯化，但由于缺乏对蛋白质稳定性至关重要的内部二硫键，产量较低。在这里，我们证明使用 Shuffle E. coli 菌株（它促进细胞质中二硫键的形成）可显著提高 proaerolysin 的溶解度和正确折叠。我们实现了高产量的 proaerolysin，从 50 ml 细菌培养物中可获得约 3 mg，纯度超过 99%。通过在小鼠胚胎干细胞 (mESC) 中进行测试，证实了重组 proaerolysin 的功能性，表明这种高产量生产方法为广泛的生物技术应用提供了可靠且经济高效的功能性 proaerolysin 来源。
通过克隆和质粒介导的Blaoxa-48基因在法国南部的胸腔和质粒介导的传播中，在胸腔肿瘤单元中爆发了甲状腺苯甲酸的肠杆菌
碳青霉烯是广谱抗生素，在治疗由革兰氏阴性细菌引起的严重感染中起主要作用。碳青霉烯型肠杆菌科的全球传播正在成为一个公共卫生问题（Jamal等，2020）。肠杆菌科中碳青霉烯耐药性的升高主要是由于获得了碳青霉烯 - 氢化酶（Carbapenemases）（Tilahun等，2021）。编码碳青霉酶的基因可以掺入细菌染色体中，但主要位于移动元素上，例如在细菌菌株和物种之间可转移的质粒或转座子（San Millan，2018年）。因此，临床暴发通常很复杂，涉及克隆，质粒或转座子的基因传播的各种因素（Brehony等，2019）。碳青霉素型OXA-48首次出现在2000年代中期，此后在许多欧洲国家和世界各地都发现了（Hidalgo等，2019）。在法国，它是产生甲状腺素酶的肠杆菌科（CPE）中最常见的酶（Emeraud等，2020）。BLA OXA-48基因被认为源自环境Shewanella菌株的染色体（Tacão等，2018）。它在物种之间的快速传播是由于其在转座子中筑巢（TN 1999），该转座主要由含有/M型质粒携带（Shankar等，2020）。控制医院病房中的暴发是必要的，以限制多药耐药细菌的传播。CPE对患者的定殖可以干扰适当的护理。fmt是CPE定殖也可能影响癌症患者化学疗法的开始，因为它与接受诱导化疗的患者的存活率较低有关（Ballo等，2019）。因此，已经实施了一种恢复健康的肠道菌群并消除CPE储层（例如粪便菌群移植（FMT））的策略。
肠球菌的分泌组抑制结核分枝杆菌复合分枝杆菌的生长
肠球菌Mundtii是一种共生肠道细菌，可抑制某些结核分枝杆菌的生长（MTC）物种，引起人类和哺乳动物的结核病。为了进一步探索这一初步观察，我们使用标准化的定量琼脂良好的扩散测定法对五个MTC物种的五个E. mundtii菌株和七个MTC菌株代表。在10 Macfarland校准的所有五个E. mundtii菌株都抑制了所有具有各种敏感性曲线的结核分枝杆菌菌株的生长，但在较低的接种物中观察到没有抑制作用。Further, eight E. mundtii freeze-dried cell-free culture supernatants (CFCS) inhibited the growth of M. tuberculosis , Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis and Mycobacterium canettii , the most susceptible MTC species (inhibition diameter 25±1 mm), proportionally to CFCS protein concentra- tions.此处报告的数据表明，大肠杆菌的分泌组抑制了所有MTC的医疗利益物种的生长，该物种拓宽了先前报道的数据。在肠道中，大肠杆菌分泌组可能调节结核病的表达，表现出抗结核作用，在人类和动物健康中具有一些保护作用。
PKS+大肠杆菌（大肠杆菌）对结肠癌发生的贡献
摘要：结直肠癌（CRC）是全球重要的健康问题，在全球癌症中排名第二，在癌症中排名第二。虽然只有一小部分CRC病例才能归因于遗传基因突变，但由于体细胞突变，大多数出现。新兴证据表明，肠道菌群营养不良是一个因素，其中聚酮化合酶合酶阳性大肠杆菌（PKS+ E. coli）在CRC发病机理中起关键作用。pks+细菌产生共糖蛋白，这是一种遗传毒性蛋白，对宿主结肠细胞内的DNA产生有害作用。在这篇综述中，我们研究了肠道菌群在结肠癌发生中的作用，阐明了结肠癌产生细菌如何诱导DNA损伤，促进基因组不稳定性，破坏肠道上皮屏障，诱导粘膜炎症，调节宿主免疫反应并影响细胞周期细胞周期动力学。共同促进了有利于肿瘤开始和进展的微环境。了解PK+细菌介导的CRC发育的基础机制可能为大规模筛查，肿瘤的早期检测以及诸如微生物群调节，细菌靶向治疗，检查点抑制Colibactin生产和免疫调节途径等治疗策略铺平道路。
鉴定结核分枝杆菌的新CLPC1-NTD粘合剂
展出的CLPC1是针对结核病1-4的最有前途的药物靶标之一。这种AAA +进化酶与CLPP1P2蛋白酶合作起作用，是至少四种天然产物抗生素（NPA）的靶标：环粒蛋白5 - 8，Ecumicin 9，10，Lassymycin 11，12和Rufonycin 13-15。的确，艾普素，环瘤，鲁霉素和lassomycin均针对CLPC1，是最近出现的最强大的抗TB分子之一。例如，欧洲蛋白酶显示出有效的选择性抗结核活性，其MIC值比利福平或异尼氏酶低50倍，这是治疗结核病10的第一行药物。clpc1是II类AAA +蛋白质家族的成员，其中包含N末端结构域（NTD）和两个不同的ATP结合模块D1和D2。我们最近确定了CLPC1在其APO和2种不同抗生素结合状态2的全长结构2。尽管仅代表了全蛋白的一小部分，但所有NPA都被证明与CLPC1-NTD结构域结合，结合位点的高分辨率X射线结构可用于环粒蛋白，古素蛋白和rufomycin（图。1 A – C）5、9、12、13。最近，与lassomycin结合的CLPC1-NTD的X射线结构也发表了12。虽然这允许对NPA的结合口袋进行正确的映射，但仍不清楚与NTD结合如何转化为剩余蛋白质的功能障碍。
弯曲杆菌属，沙门氏菌和胚泡sp的患病率和关联。在家禽
摘要：家禽和家禽肉被认为是人类野生动物病和沙门氏菌病的最重要来源。然而，有关弯曲杆菌和沙门氏菌的发生的数据与肠道原生动物（如胚泡刺激）同时发生。在家禽中仍然非常稀缺。因此，这项研究旨在研究来自农场或埃及现场鸟类市场收集的214只鸡的粪便样品中这三种微生物之间的存在和可能相互作用。获得的结果表明弯曲杆菌属，沙门氏菌和胚泡sp。分别存在于91.6％（196/214），44.4％（95/214）和18.2％（39/214）的测试样品中，强调了这些微生物的主动循环。此外，据报道弯曲杆菌属的发生之间有显着的正相关。和胚泡sp。以及胚泡sp之间的显着负相关。和沙门氏菌属。这项研究确认了胚泡sp之间先前报道的关联。和弯曲杆菌属。在公开胚泡sp之间的关联时。和沙门氏菌属。;它还突出了需要改善对家禽肠道菌群中细菌与真核生物之间相互作用的研究的必要性。