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受新食物来源影响的嗜热链球菌和保加利亚乳杆菌的益生菌特征
摘要：目前的研究旨在评估乳豆乳肌，Dioon Mejiae和Amanita caesarea对嗜热链球菌和Delbrueckii subsp的潜在影响。保加利亚的生存和暴露于不同恶劣条件（例如胆汁，酸，胃汁和溶菌酶）之后的表现，以模仿从口腔到肠道的消化系统。益生菌蛋白酶活性以评估蛋白水解系统。益生菌是在与植物材料混合的肉汤中培养的，并且在孵育后，将结果与对照样品进行了比较。因此，获得了植物材料的总酚类化合物，总类胡萝卜素化合物，抗氧化活性，糖含量和酸性，以讨论它们对益生菌存活的影响。结果表明，在胆汁耐受性测试中，阿甘那核对益生菌的生存产生了负面影响，并在蛋白酶活性测试中对保加利亚乳酸乳杆菌产生了积极影响。否则，与不同测试中的对照相比，其他植物材料并没有显着改变结果（p> 0.05）。因此，Solanum Mammosum和Dioon Mejiae在增加益生菌存活中没有显着作用（P> 0.05）。
乳酸杆菌对某些细菌的抗菌活性......
乳酸菌 (LAB) 又称乳酸杆菌目，属于革兰氏阳性菌目，具有耐酸性、发酵性强、不呼吸、不产孢的特点，呈杆状/或球形。它们喜欢厌氧条件，缺乏细胞色素。它们通常产生乳酸，本质上不产孢，并且不会移动。乳酸菌具有将碳水化合物发酵成乳酸的能力，这种特性在食品工业中得到了广泛的利用。气球菌、链球菌、乳酸菌、肠球菌、小球菌、乳酸杆菌、棒状杆菌和迷走球菌是适应在各种环境条件下生长的乳酸菌种的几个例子。它们可以在某些植物表面、土壤、乳制品、贝类和某些动物消化道中发现（Gatesoupe，1998 年）。尽管乳酸菌并不构成正常肠道微生物群中大多数物种，但人们已经进行了大量努力来人为地提高它们的优势地位（Verschuere 等人，2000 年）。根据它们分解碳水化合物的方式，乳酸菌分为两组。同型发酵组使用 Embden-Meyerhof-Parnas（糖酵解）途径将碳源主要转化为乳酸。通过使用磷酸酮醇酶
野生乳酸杆菌菌株的基因组表征揭示了较低的多样性，但典型性
摘要：研究给定物种的多样性可以为自动启动培养物的发展提供线索。然而，很少有研究集中在乳酸杆菌delbrueckii菌株的种内多样性上，这是一种对乳制品行业技术上重要的乳酸细菌。出于这个原因，分离并表征了来自圣尼克尔保护的原产地名称（PDO）区域的乳酸杆菌菌株。遗传多样性是基于核心基因组系统发育重建和pangenome分析确定的，而表型评估涵盖了蛋白水解和挥发性复合生产潜力。总共15 L. delbrueckii ssp。乳酸化获得了独特的新菌株。遗传分析和进一步的蛋白水解活性测量表明，这些圣奈克菌株之间的变异性较低，而在Delbrueckii SSP中观察到了实质性的遗传变异性。乳酸亚种的整体。菌株之间的挥发性化合物纤维略有不同，一些菌株产生的挥发性化合物可能会引起奶酪伏鸟的发育特别感兴趣。与总体亚种的多样性相比，圣奈克菌株之间的遗传多样性相对较小，它们的独特特征和与公开可用的基因组的明显分化将其定位为开发自卫星启动培养奶酪生产的有前途的候选者。
基于CRISPR的检测，结核分枝杆菌复杂谱系的鉴定和分类
摘要临床样品中基于聚合酶链反应（PCR）的检测是基于结核分枝杆菌（M.结核病）复合物（M. toberculosis）复合物（MTC），是一种诊断临床微生物学实验室中结核病的第一线方法。在这项研究中，使用繁荣的3,156个分枝杆菌基因组的全基因组培养确定了CRISPR-CSM4基因作为MTB的特定。实时（RT）-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列，对20 MTC和5个无效的分枝杆菌进行了测试，并确认了20个MTC分离株，而未检测到5个无效的分离株。此外，有65个剩余的临床样本，包括25个GenExpert阳性和40个GenExpert阴性样品，用于评估在临床微生物实验室环境中CRISPR-CSM4-MTB分析的评估，在每种情况下都会产生预期的预期结果，从而进一步允许M. tonberculculsis M. tonbercijing Lineage。rt-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列可以植入临床微生物学实验室，以补充当前使用的测定法，并有可能增加负责结核病的MTC病原体的规范。
肠双歧杆菌微生物组的年龄依赖性模式
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人于2025年2月11日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.10.637477 doi：Biorxiv Preprint
在下呼吸道微生物群中检测甲烷摩托杆菌史密斯和甲烷摩布杆菌口腔
摘要：甲烷的甲烷产生甲烷的甲烷，是人类厌氧微生物群中常见的古细菌。甲烷植物作为与营养不良相关的机会病原体的出现，并且在厌氧脓肿中也被检测和培养。他们在呼吸道中的存在尚不清楚。是对908个呼吸道样品的前瞻性研究，使用多重指导方法结合了PCR测序，实时PCR，原位杂交（FISH）和甲烷植物培养。在21 /527（3.9％）痰样品中检测到甲烷摩托杆菌史密斯和甲烷素的口腔DNA序列，2/188（1.06％）支气管肺泡灌洗，也没有193个Tracheo-Bronchial ChialChialChialChial Chial Chial Chial Chial Chipations。此外，在三个痰液中检测到的荧光原位杂交检测到了用棍子形态的样品研究的标本，暗示了M. oralis，而在另一种支气管肺泡灌洗样本中，研究了次生斑的形态，提示Smithii M. Smithii。这些观察结果将已知的甲烷植物领土扩展到呼吸道，并在任何以后从支气管肺泡灌洗和肺部隔离的情况下进一步解释其检测为病原体。
产生大肠杆菌素的大肠杆菌通过促进上皮-间质转化和癌症干细胞出现来增强对化疗药物的耐药性
摘要 人类结直肠癌 (CRC) 很容易被产生大肠杆菌素的大肠杆菌 (CoPEC) 定殖。CoPEC 会诱发 DNA 双链断裂、DNA 突变、基因组不稳定性和细胞衰老。受感染的细胞会产生衰老相关分泌表型 (SASP)，这与在感染 CoPEC 的 CRC 小鼠模型中观察到的肿瘤发生率增加有关。本研究调查了 CoPEC 以及源自 CoPEC 感染细胞的 SASP 是否影响化疗耐药性。用 CoPEC 临床 11G5 菌株或其同源突变体感染人类肠上皮细胞，后者无法产生大肠杆菌素。在体外和异种移植小鼠模型中评估了化疗耐药性。研究了受感染细胞中癌症干细胞 (CSC) 标志物的表达。使用 CRC 小鼠模型和人类临床样本验证数据。 11G5 感染细胞和与 11G5 感染细胞产生的 SASP 一起孵育的未感染细胞均在体内和体外表现出对化疗药物的抵抗力增强。这一发现与上皮-间质转化 (EMT) 的诱导相关，这导致出现具有 CSC 特征的细胞。它们在超低附着平板上生长，在软琼脂中形成菌落，并过度表达几种 CSC 标志物（例如 CD133、OCT-3/4 和 NANOG）。与这些结果一致的是，与缺乏 CoPEC 的活检相比，被 CoPEC 定植的小鼠和人类 CRC 活检显示出更高的 OCT-3/4 和 NANOG 表达水平。结论：CoPEC 可能通过诱导对化疗具有高度抵抗力的癌症干细胞的出现来加重 CRC。
抗菌消耗对大肠杆菌耐药性的影响：使用动态回归模型在法国大学医院（2014- 2019年）进行评估和预测
2。方法2.1。研究设计和设置使用Consores软件（一种用于监视法国公共卫生机构提供的AMC和AMR数据的工具），在2014年1月至2019年12月之间进行了法国教学医院的回顾性生态研究。Nimes University医院有1773张病床，包括46张病床，有24张床，用于血液学，235张手术，长期为190。在研究期间，每年接受41 300至50 100个住院患者，住院时间为55 200天/月，每年增加到2019年的57 500天/月。2.2。细菌样品分析了研究期间收集的大肠杆菌阳性的所有微生物样品。从门诊病人获得的样本，或在急诊室或在入院48小时内收集的样本，除非患者
没有无辜的旁观者：百日咳疫苗接种体现了副百日咳杆菌和百日咳杆菌之间的进化相似性
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 6 月 21 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.06.18.599646 doi：bioRxiv 预印本
喀麦隆（中非）城市地区地下和雨水中分离出的某些芽孢杆菌菌株的抗生素敏感性以及季节变化的潜在影响
Morelle Raïsa Djiaala Tagne、Mireille Ebiane Nougang、Edith Brunelle Mouafo Tamnou、Awawou Manouore Njoya、Pierrette Ngo Bahebeck、Samuel Davy Baleng、Paul Aain Nana、Yves Yogne Poutoum、Genevieve Bricheux、Claire Stéphane Metsopkeng、Télesphore Sime-Ngando 和 Moïse Nola DOI： https://doi.org/10.22271/micro.2023.v4.i1b.72 摘要 这项研究评估了在雅温得（喀麦隆）的井和雨水样本中分离的蜡状芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌菌株的抗生素敏感性。在长旱季 (LDS)、短旱季 (SDS)、长雨季 (LRS) 和短雨季 (SRS) 期间每月收集水井水样，对于雨水则在 LRS 和 SRS 期间收集。考虑的抗生素包括亚胺培南、阿米卡星、庆大霉素、环丙沙星、氧氟沙星、磺胺甲唑和四环素。对于来自地下水的菌株，对于苏云金芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 9.13 毫米（SDS 期间的磺胺甲唑）到 32.78 毫米（LDS 期间的亚胺培南），对于蜡状芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 8.2 毫米（SDS 期间的磺胺甲唑）到 35.25 毫米（LDS 期间的亚胺培南）不等，对于枯草芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 5.05 毫米（LRS 期间的氧氟沙星）到 29.25 毫米（LDS 期间的亚胺培南）。雨水中的芽孢杆菌直径从 4.55 mm（LRS 期间使用磺胺甲唑）到 25.65mm（LRS 期间使用亚胺培南），蜡状芽孢杆菌从 2.13 mm（LRS 期间使用亚胺培南）到 20.05mm（SRS 期间使用亚胺培南），枯草芽孢杆菌从 5.03 mm（SRS 期间使用庆大霉素）到 25.15mm（SRS 期间使用四环素）。LRS 期间分离出的芽孢杆菌菌株对大多数抗生素具有多重耐药性。大多数抗生素的抑菌直径在不同季节之间存在显著差异（p<0.05）。关键词：抗生素敏感性，芽孢杆菌菌株，地下水和雨水，抑菌直径变化 1. 引言 不同国家的水消耗量差异很大。这取决于其发展、人口和资源本身。当水被污染时，水会成为许多疾病的主要传播媒介之一，而这些疾病是导致人类或动物大规模流行病的原因。污染源包括河流、水体、咸水以及雨水、露水、雪和极地冰。每种环境中的水都可能被化学物质和微生物污染，包括原生动物、病毒和细菌 [1] 。水环境中有各种细菌科。这些微生物具有各种特性。通常用于识别细菌微生物的一些特性是革兰氏染色细胞壁和产孢特性。芽孢杆菌属细菌被称为革兰氏阳性菌和产孢菌。它们存在于空气、水中或土壤中 [2] 。对于人类来说，一些芽孢杆菌种是病原体或机会性病原体，而另一些只是共生菌。然而，细菌的共生特性取决于其环境中的几个因素 [3] 。除了食物中毒外，这些细菌会引起局部和全身感染，有时会导致患者死亡 [4, 5] 。多年来，人们也认识到生物颗粒对大气过程的潜在相关性 [6, 7] 。空气中的生物颗粒作为一个整体也被称为生物气溶胶。它们可以包括细菌细胞和细胞碎片、真菌孢子和真菌