对植物物种的快速准确鉴定越来越多地寻求采用分子技术。ITS2区域在DNA条形码中高度评价,因为它的短长度和易于测序,使其成为物种识别的理想候选者。在这项研究中,通过对广泛植物分类群的底漆序列进行细致的分析和比较,我们策划了一系列具有证明普遍性的底漆,能够有效地扩大不同植物物种的ITS2区域。为了验证识别引物的普遍性,我们均采用了硅和体外方法。在计算机分析中涉及生物信息学工具,以评估公共数据库中可用的大量植物DNA序列的底漆结合位点。随后,使用从各种植物标本中提取的DNA样品进行了体外实验,以验证引物的扩增成功。通过这个全面的验证过程,我们确保了选定的引物用于DNA键编码目的的可靠性和适用性。我们发现的重要性在于使用ITS2区域建立了标准化的DNA栏编码方法,这有助于准确而有效的植物物种识别。通过为研究人员提供一组普遍适用的底漆,我们旨在简化底漆选择过程,从而减少实验设计所涉及的时间和精力。该标准化协议促进了DNA条形码研究中的一致性和可重复性,最终促进了我们对植物生物多样性的理解并有助于保护工作。
1 ppg在生物科学中,隆德纳PR,leshibatta@gmail.com; 2北部州立大学帕拉纳大学教授-PR,dhiego@uenp.edu.br; 3可持续发展顾问Auren,le_celestino@aurenenergia.com.br; 4可持续发展经理Auren,jarbas.souza@aurenenergia.com.br; 5 Londrina-pr州立大学教授,oscar.shibatta@gmail.com。
*上课迟到5分钟即为迟到 参与度 (5%) 经常参与 (4) 参与度一般 (2-3) 很少参与 (1) 从不参与 (0) 2 作业 (15%) 按时提交作业 (1%)
图1无脊椎动物和水产养殖软体动物中受过比较训练的免疫反应模型。该图说明了在无脊椎动物和海洋软体动物中观察到的训练反应的多样性。训练诱导后的免疫反应(主要反应)和挑战(次要反应)。 文献中描述的不同响应模式由不同颜色的曲线表示。 传说指示观察到不同模式的物种:训练时诱导的持续反应,没有消光期,直到次级响应(深蓝色线);免疫移位显示出定性不同的主要和次要反应,涉及不同的基因集(浅蓝色和深绿色线);具有主要响应的公差响应,但没有次级响应(浅蓝色线)。 双相反应,命名为召回响应,其主要响应随后是灭绝阶段,以及对后续挑战(浅绿线)的相似或更强大,更快,更快的次要响应。训练诱导后的免疫反应(主要反应)和挑战(次要反应)。文献中描述的不同响应模式由不同颜色的曲线表示。传说指示观察到不同模式的物种:训练时诱导的持续反应,没有消光期,直到次级响应(深蓝色线);免疫移位显示出定性不同的主要和次要反应,涉及不同的基因集(浅蓝色和深绿色线);具有主要响应的公差响应,但没有次级响应(浅蓝色线)。双相反应,命名为召回响应,其主要响应随后是灭绝阶段,以及对后续挑战(浅绿线)的相似或更强大,更快,更快的次要响应。
摘要。马蹄蟹或咪咪(Misshoe Crab),通常被称为马蹄蟹是一种古老的动物,可以生存到现在为止,因此被称为活化石。马杜拉(Madura)可以找到马匹螃蟹,但还没有全面的数据。需要关于马蹄蟹物种的准确数据来确定这种古老动物的潜力,尤其是从马杜拉岛的水域中。仍然需要仔细的收集,分类和识别物种以及描述新物种的过程,以可持续地管理马杜拉沿海资源的潜力。物种识别是最耗时,困难的,并且通常会造成数据收集和分析的障碍。可以根据马蹄蟹形态来识别马蹄蟹物种,但需要一种可靠,有效的方法是非常复杂的。当前正在发展的马蹄蟹鉴定方法之一是使用DNA条形码的分子分析。这项研究是使用DNA条形码分子分析来识别物种的首次尝试,以研究Madura岛作为马蹄蟹遗传多样性的来源,并有望可用于管理马蹄蟹资源。这项研究的目的是找出马杜拉岛上的条形码马蹄蟹物种的DNA。线粒体基因组DNA(mtDNA)的遗传标记物细胞色素氧化酶I用于分析遗传多样性。通过使用软件Mega X进行系统发育树和遗传多样性的重建。研究结果表明,样本与癌圆形圆形葡萄干99%密切相关。
摘要:Ikan Betok(Anabas testudineus,Bloch 1792)是FISHES之一,是Anabantidae家族的成员。Betok是Riau省的一种地方性鱼。关于Betok Fish的DNA条形码的科学研究仍然很少。这项研究旨在分析Betok Fish上细胞色素C氧化酶I(COI)的DNA条形码序列。方法,例如采样,总DNA提取,PCR,电泳,测序和数据分析。所研究的COI序列的大小为694 bp。BLASTN分析表明,Betok Fish的相似性最高为99.7%,而A. cobojinus的testudineus和最低的93.00%。有一个核苷酸基于COI序列(即核苷酸编号309)。这项研究可能会丰富Genebank中Betok Fish的DNA条形码数据库。关键字:Anabas testudineus,Betok Fish,COI,DNA条形码,RIAU。pendahuluan
针对政策关注的生物和组织(BOPCO)的条形码设施(BOPCO)提供了一个专业知识论坛,以促进比利时和欧洲识别政策关注的生物学样本。Bopco由比利时科学政策办公室(BELSPO)资助。被引入欧洲的非本地物种,无论是偶然的还是故意的,都可能引起政策关注,因为其中一些可以在新的领土上迅速繁殖和散布,建立可行的人群,甚至是胜过本地物种。由于它们的存在,自然和托管的生态系统可能会受到破坏,庄稼和牲畜影响,并且可能引入媒介传播的疾病或寄生虫,从而影响人类健康和社会经济活动。引起这种不良反应的非本地物种称为侵入性外星物种(IAS)。为了保护本地生物多样性和生态系统,并减轻对人类健康和社会经济活动的潜在影响,欧盟第1143/2014/2014号欧洲议会和理事会解决了IAS问题。IAS法规规定了在所有成员国中采取的一系列措施。定期更新工会关注的侵入性外星物种清单。但是,要实施拟议的动作,遇到可疑的生物材料时需要进行准确的物种识别方法。因为基于形态的物种鉴定并不总是可能的(例如结果将结果显示为使用公开可用的DNA序列数据和从各种来源汇总的信息编制的情况表(一个)。[1]。隐秘的物种,痕量物质,早期生命阶段),本工作的目的是调查和评估DNA序列数据的有用性,以识别欧盟调节中包含的每一个IAS。每个事实表都由两个主要部分组成:(i)对特定IAS的简短介绍,并提供有关其分类法和当前发生/分布在欧洲的信息,(ii)对公开可用的DNA序列的有用性进行调查,以确定该IAS的实用性,以确定DNA barcods在EUU列表中列出的分类级别。有关应用方法背后的推理以及有关材料和方法的详细信息的更多信息,请参见下文和Smitz等。有关Bopco的更多信息,请访问https://bopco.be或通过bopco@naturalsciences.be与我们联系。有关http://ec.europa.eu/environment/nature/invasivealien/index_en.htm的欧盟法规的更多信息。
Justicia Beddomei(C.B.clarke)Bennet已在传统的医疗系统中使用了多年。这项研究旨在促进J. Beddomei的识别(C.B.clarke)使用TRNH - PSBA DNA条形码区域,NCBI数据库以及植物部分的药物认知特征。基因组DNA,并进行了聚合酶链反应放大,并进行了DNA序列测定。使用相似性基本搜索方法BLASTN分析重叠群DNA序列319 bp。TRNH - 319 bp重叠群序列的PSBA条形码区域与J. Beddomei的标准序列100%相似,登录号MK347214.1来自NCBI数据库。 植物不同部分的微观研究有助于J. Beddomei与其形态相似和令人困惑的植物Justicia adhatoda L. justicia Beddomei的识别和分化,可以通过花和花序排列轻松识别。 其他鉴定特征是叶片的叶肉区域中存在囊状,以及粉末显微镜分析中有色含量和晶体的存在。 目前对J. Beddomei茎,叶和花的详细微观研究的结果在鉴定粉末状样品及其掺假剂方面具有很大价值。MK347214.1来自NCBI数据库。植物不同部分的微观研究有助于J. Beddomei与其形态相似和令人困惑的植物Justicia adhatoda L. justicia Beddomei的识别和分化,可以通过花和花序排列轻松识别。其他鉴定特征是叶片的叶肉区域中存在囊状,以及粉末显微镜分析中有色含量和晶体的存在。目前对J. Beddomei茎,叶和花的详细微观研究的结果在鉴定粉末状样品及其掺假剂方面具有很大价值。
Carassius Gibelio(普鲁士鲤鱼)是加拿大新鲜水域的最新入侵者,有报道称其在艾伯塔省和萨斯喀彻温省。与引入的Auratus(金鱼)和推出的(但可能被误认为)C。Carassius(Crucian Carp)的形态相似性使得在没有仔细检查的情况下很难区分这些物种。线粒体细胞色素C氧化酶I(COI)基因的DNA条形码是一种潜在的工具,可以识别Carassius个体,但公开序列的不正确注释可能会混淆物种鉴定的尝试。在这里,我们使用形态和DNA条形码来识别从艾伯塔省的两个地点收集的假定的C. gibelio标本,这些标本构成了该省的新记录。在形态上,标本与C. gibelio一致,但在C. gibelio和C. auratus的范围内。从遗传上讲,我们的样品无法鉴定为物种水平,与多种卡拉西修斯物种相匹配。单倍型网络与统计分析一致,支持艾伯塔鲤鱼为C. gibelio的识别。此外,艾伯塔省的单倍型与海鲜贸易报道的一条鱼有分享,这可能是进入艾伯塔省的可能来源。因此,尽管大胆的算法表明COI基因不是对Carassius物种物种水平鉴定的有力候选者,但单倍型网络方法和对单倍型之间可变性的统计检查可以用于对物种认同做出合理的推论。由于其在加拿大的生态影响预计,对卡拉西乌斯物种的早期发现和管理至关重要; DNA条形码是物种识别的重要工具,尤其是当标本在预期的多种物种的表型范围内时。
昆虫是地球上种类最丰富的群体之一。它们构成了许多动物多样性,并在生态系统中起着至关重要的作用,包括授粉,害虫控制和分解。但是,仅描述了这种多样性的一部分。南非被认为是全球生物学上最多样化的国家之一,估计有44,000种昆虫物种。许多农作物依赖于昆虫传粉媒介,包括菜籽,苹果,橘子和向日葵。目前缺乏野生传粉媒介会威胁农作物的产量,但我们对南非昆虫多样性的了解却很少。相对于南非的生物多样性,几乎没有分类专家,用于昆虫识别的方法可能是耗时且昂贵的。DNA条形码为加速昆虫生物多样性研究提供了重要的研究工具。在这篇综述中,我们询问了公共DNA条形码粗体(生命数据系统的条形码)数据库中的“昆虫”记录,并返回了416 211个已发表的记录,分配给28239个独特的垃圾箱(条形码指数编号)。我们确定了五个分类订单,其垃圾箱比南部非洲已知的物种多(膜翅目,双翅目,thysanoptera,plecoptera和strepsiptera)。大多数条形码记录均来自豪登省,姆普马兰加和林波波的不适陷阱采样,而南非其他地区的采样仍然很差。我们建议需要进行全面的国家抽样努力,以及对分类专业知识的投资增加,以在物种遗失以灭绝之前生成有关昆虫生物多样性的关键基线数据。