DNA条形码是加速物种鉴定和补充物种划界的绝佳工具。此外,DNA条形码参考文献是生物多样性监测,保护或生态学中任何元法编码研究的决定性主链特征。但是,在某些分类单元中,DNA条形码不能以令人满意的成功率产生,因此这些群体将在任何基于条形码的物种清单中都在很大程度上缺少。在这里,我们为eurytomidae(膜翅目,沙尔西多德亚)提供了定制的DNA条形码向前底漆,将高质量DNA条形码的成功率从33%提高到88%。eurytomidae是一种严重研究的,分类学上具有挑战性的,物种丰富的群,主要是寄生的黄蜂。较高的物种数量,多样化的生态作用以及广泛和共同存在确定Eurytomidae是陆地生态系统中众多关键家庭之一。现在可以在研究和监测陆地动物区系时包括eurytomidae,强调基于条形码的方法将需要定期使用不同的引物来避免其数据和推论中的偏见。新的DNA条形码方案也是我们对小组的综合分类研究的先决条件,旨在划界和表征Central
This Study •There are unconfirmed speculations that rays are being used to replace chapínin turnovers.•Detect the presence of Nurse Shark, as protected from fishing, possession, and sale , in shark fillets and shark processed products•A recent study found that nurse sharks were sold to local fish markets (Franqui-Rivera, 2020)•Demonstrates seafood fraud as the prohibited take and sale of a protected species
在过去的几十年里,非法砍伐对热带非洲森林生态系统的完整性和生物多样性保护构成了严重威胁。尽管已经实施了减少非法砍伐的国际条约和监管计划,但大部分木材都是从热带非洲森林地区非法砍伐和交易的。因此,开发和应用分析工具来提高木材和相关产品的可追溯性和识别性对于执行国际法规至关重要。在现有技术中,DNA 条形码是一种很有前途的植物物种分子鉴定方法。然而,虽然它已成功用于区分动物物种,但还没有一套可用于普遍识别植物物种的遗传标记。在这项工作中,我们首先使用基因组略读方法表征了 17 种非洲高价值木材物种的遗传多样性,这些物种来自五个属(Afzelia、Guibourtia、Leplea、Milicia、Tieghemella),分布在西非和中非的范围内,以便重建它们的叶绿体基因组和核糖体 DNA。接下来,我们确定了单核苷酸多态性 (SNP),以区分近亲物种。通过这种方式,我们成功开发并测试了用于物种识别的新型物种特异性遗传条形码。
抽象的cormorant(Pelecaniformes)在全球范围内广泛分布,是内陆水域和海洋环境中的沿海鸟类,并且与某些水生寄生虫的传播有关。因此,本工作的目的是研究心脏脑头核苷(Digenea:Strigeidae)的发生和形态变化,这是伟大的cormorant phalacrocorax carbo的寄生虫。从维多利亚湖从Mwanza Gulf收集的大cormorant的肠道中获得了用于分子分析(DNA条形码(COX 1)区域)的心脏脑标本(COX 1)区域。心脏脑头像标本的形态检查表明,属于心脏脑脑属的四个形态摩托克可能存在。然而,对COX 1序列,系统发育和单倍型的分析表明,所有四个形态摩托物都属于心脏脑脑的单个未知物种。本文提供了有关较棒的毛叠曲局碳纤维碳纤维的第一份报告,该报告是淡水系统中心脏脑的确定宿主。调查结果还表明,非洲心脏脑的多样性比以前报道的要高。此外,它强调了在坦桑尼亚进行更多研究的必要性,以泄露蜗牛和与水生环境中鸟类和其他脊椎动物的生命周期有关的蜗牛物种。关键字:digenean trematodes;斯特里吉德; Phalacrocorax Carbo;心脑头;考克斯1。简介
热水弹簧是中介,热剂和热层的独特区域。它们是嗜热物多样性的来源,主要属于古细菌和细菌域。嗜热剂的多样性概述了可以用于工业应用的巨大生物学潜力。为此,这项研究的目的是隔离和表征来自塔塔帕尼(Tatapani)的热水春天未探索的嗜热水弹,泰赫西尔(Tehsil&Distrapani),泰赫西尔(Tehsil&Tehsil&District)kotli ajk,pakistan,巴基斯坦。使用形态学,生化,生理和分子属性鉴定出大约10个细菌分离株。对分离株的16S rDNA基因进行了爆炸搜索的测序表明,菌株MBT008与kamchatkensis的anoxybacillus 100%相似。MBT012与蒙古曲霉的相似性为99.57%,MBT014与A. tengchongensis相关,MBT009的相似性为99.43%,MBT009与A. gonensis和Mbt018,98.70%相似的MBT009与A. karvacharenensis相似。在一个共同来源中,所有这些微生物多样性的存在至关重要,与一般的环境和工业方面有关,从这些热疗法中提取热稳定酶,特异性地在工业
北冰洋(AO)环境恶劣,温度低、冰盖大、海冰周期性冻结和融化,为微生物提供了多样化的栖息地。前期研究主要基于环境DNA对北冰洋上层水体或海冰中的微真核生物群落进行研究,而对北冰洋多样化环境中活跃微真核生物的组成成分则知之甚少。本研究通过对共提取的DNA和RNA进行高通量测序,对北冰洋从雪冰到1670 m深度海水范围内的微真核生物群落进行了垂直评估。与DNA提取物相比,RNA提取物能更准确地描述微真核生物群落结构和类群间相关性,对环境条件的反应也更为敏感。使用RNA:DNA比率作为主要分类群相对活性的代表,确定了主要微真核生物群落沿深度方向的代谢活性。共现网络分析表明,深海中的 Syndiniales 和甲藻/纤毛虫之间的寄生关系可能很重要。这项研究增加了我们对活跃微真核生物群落多样性的认识,并强调了使用基于 RNA 的测序而非基于 DNA 的测序来研究微真核生物群落与微真核生物对 AO 环境变量的反应之间的关系的重要性。
东非医学杂志卷。100号2023年1月1日,使用ITS2和RBCL标记物用于茄科种类识别的DNA条形码kathryn Wanjiku Nderitu,Nairobi大学科学与技术学院生物化学系,P。O.box 30197-00100肯尼亚,精灵阿格尔,科学技术学院,内罗毕大学科学技术学院,P。O。box 30197- 00100,肯尼亚,以西结·梅查(Ezekiel Mecha),内罗毕大学科学技术学院生物化学系框30197- 00100肯尼亚,阿顿nyachieo,灵长类动物研究所,Karen -Nairobi,P。O.框24481- 00502,肯尼亚。通讯作者:内罗毕大学生物化学系Kathryn Wanjiku Nderitu,P。O.框30197 -00100,肯尼亚内罗毕。电子邮件:knderitu276@gmail.com
DNA条形码和分子分类法的进步5与分类法相关的程序发展简介其应用和未来的DNA技术在物种识别中的应用和未来的方向Gulab Khedkar1和S. bijoy Nandan2 1Paul Heber dna dna barcoding and Biodortity研究中心电子邮件:gkhedkar.phcdbs@bamu.ac.in 2海洋生物学和生物化学系海洋科学学院,科萨,喀拉拉邦,科萨,喀拉基。电子邮件:bijoynandan@cusat.ac.c.在远古时代命名“事物”的命名史是人类交流的一部分,这是通过单词和相关语言的一部分。人们认识到他们的经历的对象,这是日常分类学不可或缺的一部分。基于对象的相似性和差异,观察者组识别,命名和分类。使用名称的使用,作为嵌入不同语言的许多不同种类的名词,将命名法连接到理论语言学,而人类的方式与单词含义和经验相关的是与语言哲学有关的方式。这种做法进一步发展到了诸如“ nomastics”之类的结构化过程中,(研究专有名称,其起源以及文化领域),人类学象征性(与人类名称有关),替代名称(对地名的研究)和词源(历史和使用)(历史和使用),如比较和描述性语言所示。对自然世界命名对象的简单,稳定和国际接受系统的科学需求产生了许多正式的命名系统。可能是这些命名自然系统中最著名的是管理有机体的拉丁语科学名称的五个生物命名法。拉丁语术语nenclatura是指名称列表,命名词词组也可以指示提供商或名称的播音员。DNA条形码和分子分类学的进步6命名法中的文化关注点不太清楚,构成和命名法之间的区别并不清楚:对大多数人来说,Onomastics是一种不熟悉的纪律,并且在学术意义上使用命名词也不是通常的。尽管两个字段集成,但命名法更涉及用于形成名称的规则和约定。由于社会,政治,宗教和文化动机,可能会给出不同名称的事物,而不同的事物可能会得到相同的名字;密切相关的类似事物可能被认为是分开的,而另一方面,事物的显着不同。名称为我们提供了一种在脑海中构造和绘制世界的方式。从某种意义上说,名称代表了我们经验的对象。阐明名词和名词之间的联系,含义,以及我们感知世界为普通人提供了丰富的研究领域。这种本能已诞生了术语“ Folk分类学”。民间分类学现代科学分类学被描述为“基本上是民间分类原理的文艺复兴时期的编纂”。科学命名和分类的形式系统以生物分类为例。所有分类系统都是出于目的的。科学分类系统将每个生物体锚定在国际接受分类类别的嵌套层次结构中。该系统的维护涉及正式的命名规则和
摘要:基线生物多样性数据是生态和进化研究的关键,并且与印度洋的马尔代夫群岛等地区特别相关,印度洋可以充当分布广泛的海洋物种的垫脚石。我们通过浮潜和水肺潜水调查了Faafu和Malé环礁的岛屿和礁石,收集了两个腹足类亚类,Heterobranchia和Vetigastropoda。我们的库存包括104种活着拍摄的物种,以创建标识指南。我们还为大多数物种提供COI条形码,并为马尔代夫Malacofauna添加了新的序列数据。我们一半的物种代表了马尔代夫的新记录,强调要发现多少多样性。物种分布反映生态稀有性,仅在一个地点发现了近60%的分类单元。我们还根据文献记录编制了马尔代夫的异源和vetigastropods的全面清单,导致了320种,这些物种与条形码数据一起表明了印度 - 普基菌中的几种潜在的隐性物种。描述了六种新物种,裸叶兰德拉·埃文尼(Limenandra evanescenti n)。sp。,Eubranchus putnami n。sp。,Sakuraeolis Marhe n。sp。,Moridilla Maldivensis n。sp。,tergiposacacca perspicua n。sp。和sacoglossan costasiella fridae n。 sp。
结果 PCR 扩增:共进行了 32 次扩增;28S 8 次、CO1 8 次、CO2 16 次(分为两个独立试验,每次试验 8 次扩增)。 28S rRNA 基因: • 100% 的扩增成功,但 25% 的扩增显示轻微错误引导,37.5% 的扩增显示严重错误引导(表 2)。 • 在可用的 28S 序列中,37.5% 可组装为共识序列。 CO1 基因: • 100% 的扩增成功,但 12.5% 的扩增显示严重错误引导。 • CO1 序列被证明是最成功的,在创建共识序列方面的成功率为 75%。 CO2 基因: • CO2 基因的前 8 次扩增显示 0% 的成功率,因此修改了 PCR 方案。 • CO2 扩增被证明是最不成功的,第二轮扩增成功率为 75%,其中 66.7% 出现严重错误引导。• 未生成 CO2 序列。