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研究...
在聚合物中，在单个水平和链之间的链条折叠和聚集之间的竞争可以确定此类材料的机械，热和导电性能。了解折叠和聚集的相互作用为开发和发现具有量身定制性能和功能的聚合物材料提供了重要的机会。对于常规共价聚合物的非共价对应物也是如此，即，超分子聚合物（SPS）。sps有望用作新型刺激响应性聚合物材料的实际应用。大多数SPS具有单调的一维线性结构，该结构倾向于引起链链聚集，但是很少有SPS的报道可以通过主链折叠形成各种高阶结构。既展示了内部折叠和链链聚合的SP的开发，将为创建新型SP材料提供新的指南，其特性可以由高阶结构控制。最近发表在2024年7月25日在美国化学学会杂志上发表的一项研究报告了一种新的折叠SP，该SP自发进行链链聚集并转化为结晶骨料。借助原子力显微镜（AFM），研究小组证明了展开与聚集之间的关系。这项研究是由Chiba University的Shiki Yagai教授领导的，他是Chiba University科学与工程研究生院的博士课程学生Kenta Tamaki，是第一作者。 “最初，我们发现了一种单体结构，该结构以螺旋形形状聚合。这次，我们部分改变了驱动单体聚合以研究单体聚合物关系的单位结构。令我们惊讶的是，我们观察到了一种现象，螺旋自发地展开，而不同的链条捆在一起。然后，我们合并了一个可相关的分子，以便通过光线通过“任意时机”出现这种“自发”现象，这为我们的研究提供了背景，” Yagai教授说，这项研究背后的灵感。为设计新系统，该团队选择了可扭曲的二苯基和光反应偶氮苯单元作为核心，将其自组装到所需的SPS中。最初以折叠状态形成的SP慢慢地以内部分子顺序进行重排超过半天，并汇总到结晶状态。将偶氮苯单元纳入SPS导致了光诱导的展开，这通过松动折叠环之间的内部稳定来显着加速了这一过程。研究人员观察到，当将折叠的SP溶液保持在20 O C下几天时，聚合物会自发进行结构过渡并沉淀。使用AFM可视化沉淀物时，他们观察到了独特的中间状态，在通往统一的直纤维结构的途中，似乎是弯曲链的结合。这个有趣的图像使研究人员想起了蛋白质折叠不折叠的生物系统中经常观察到的链链聚集，从而导致淀粉样蛋白纤维形成。此外，该团队揭示了这种结构转型背后的原因。这包括由于双苯基单元的构象变化而导致的分子内顺序
2009年计算结构生物信息学研讨会
2009年的计算结构生物信息学研讨会11月1日，华盛顿特区http://www.cs.nmsu.edu.edu/~dsi/~dsi/~dsi/~dse/bioworkshop09该节目8-8：15 AM海报设置8:15 - 15-15-15-10am seess 1 am 1 am 1 am seccort 1 am everal：ableviciary kepress/ableviciary Room，ableviciary Room，phromist y 8月8日，8点; 1。“具有稀疏精确距离数据的蛋白质结构测定的有效的几何堆积算法” Robert Davis，Claus Ernst和Di Wu 2。“追踪蛋白质的构象变化” Nurit Haspel，Mark Moll，Matthew Baker，Wah Chiu和Lydia Kavraki 3。“使用序列曲线中心的GAMC方法对蛋白质长距离接触的预测” Peng Chen和Jinyan li 4。“用于蛋白质波动动力学和构象的通用弹簧张量模型变化” tu-liang lin和guang歌曲5。“一种用于寻找蛋白质分子构象的人造骨架” Carlile Lavor，Antonio Mucherino，Leo Liberti和Nelson Maculan 10：00-10：00-10：15 AM咖啡休息10:15-115-115-12:15 PM Sessight 2 pm Sessight 2 pm sessect 2 pm，每位演讲者：18分钟 + 2 -Minute Talks + 2 Minte “ Sidechain各向异性对残留接触确定的影响” Weitao Sun和Jing He 7。 “蛋白质蛋白质相互作用的计算测试” Ataur Katebi，Andrzej Kloczkowski和Robert Jernigan 8。 “嗜热和嗜嗜蛋白的歧视” Todd Taylor9。 “基于序列的B细胞表位通过使用抗体 - 抗原结构复合物中的关联” Liang Zhao和Jinyan li10。 “匹配观察到的α螺旋长度与预测的二级结构” Brian Cloteaux和Nadezhda Serova11。“ Sidechain各向异性对残留接触确定的影响” Weitao Sun和Jing He 7。“蛋白质蛋白质相互作用的计算测试” Ataur Katebi，Andrzej Kloczkowski和Robert Jernigan 8。“嗜热和嗜嗜蛋白的歧视” Todd Taylor9。“基于序列的B细胞表位通过使用抗体 - 抗原结构复合物中的关联” Liang Zhao和Jinyan li10。“匹配观察到的α螺旋长度与预测的二级结构” Brian Cloteaux和Nadezhda Serova11。“与核小体DNA相关的周期性如何反映其内在曲率？”Murlidharan Nair 12：15-1：15pm午餐休息时间1：15-2：15pm海报会议2：15-3：55 PM会议3（内阁/司法室，每个20分钟，每个）12。“使用质谱数据的多项式二硫键确定” William Murad，Rahul Singh和Ten-Yang Yen13。“使用迭代TM得分的蛋白质结构的密度分类” David Hoksza和Jakub Galgonek 14。“用于蛋白质表面对齐的全球优化算法” Paola Bertolazzi，Concettina Guerra和Giampaolo Liuzzi 15。“ FCC-HP蛋白模型中折叠的上限” Abu Dayem Ullah和Kathleen Steinhofel 16。“氨基酸相互作用网络中的节点分布” Omar Gaci和Stefan Balev 3:55 PM关闭言论
刺痛和抑制剂研究的概况
sting构象变化，并启动了从ER到高尔基体的刺激易位。During the translocation process, STING recruits TANK binding kinase 1 (TBK1) and interferon regulatory factor 3 (IRF3), which then translocate into the nucleus, inducing the expression of type I IFN (IFN-I) response, NF-kB activation, and other in fl ammatory cytokines, unleashing innate immune responses and establishing a ubiquitous and effective surveillance system against组织损伤和病原体入侵（Chen and Xu，2023）。激活刺激可以诱导针对病原体感染和癌症的有效免疫反应，而这种途径的失衡可能会导致各种人类疾病，包括感染性疾病，自身免疫性疾病，肿瘤，器官纤维化和新疾病（Hopfner and Hornung and Hornung and Hornung，Hopfner and Hornung，2020; Dvorkin et al Al dvorkin et al an and 2020;在过去的十年中，与Sting相关的研究领域经历了快速发展，引起了许多学者的广泛关注。随着CGAS刺的细胞和病理生理机制的逐渐阐明，Sting在许多疾病中的作用已得到明确表达。随后，已经开发了针对刺激调节的新的免疫治疗方法，例如使用刺激器和抑制剂。激动剂一直是癌症免疫疗法的新兴策略（Minlin等，2020; Cai等，2023; Chen Y.等，2024; Wang J.等，2024）。除了抗肿瘤治疗外，刺激动力学家还用于抗感染治疗和疫苗发育（Skouboe等，2018a; Humphries et al。，2021a; Zhang Y.等，2023; Liu et al。，2024）。通过靶向抗原细胞，例如树突状细胞（DCS）和巨噬细胞，刺痛激动剂不仅激活了先天的免疫反应，而且还激活了T细胞免疫，因此在临床和促精液研究中表现出了有效的免疫激活和抗肿瘤效应。越来越多的证据表明，CGAS刺激途径的异常激活与自身免疫性疾病（AID）（Liu and Pu，2023），非酒精性脂肪肝疾病（NAFLD），慢性炎症，parkinson疾病，帕金斯疾病和心脏疾病（parkineavinease）（parkineavinease）（parkineavinease and Cardiovancural Diseases）（Oduro andease eal）（Oduro and Al oduro and e oduro ance）。抑制剂还具有这些疾病的潜在治疗价值（Shen等，2022； Liu and Pu，2023）。文献计量分析应用统计方法和数学模型来分析书目数据，包括出版物，引用和其他学术通信。它用于评估研究人员，机构和国家 /地区的生产率（Anton等，2022）。此外，它为制定准则，决策和治疗疾病提供了宝贵的见解（Wilson等，2021）。分析出版趋势，纪律前沿，热门内容，协作关系以及学术工作的影响因素（Romanelli等，2021）。文献计量研究可以揭示特定领域的学术重点的时间动态，捕获新兴研究领域的标志，确定学术研究中的前沿问题，调整科学资助的方向，更重要的是，为文学评论提供了显着的参考资源。因此，必须对刺痛激动剂/抑制剂进行文献计量分析，以评估这种新兴治疗和药物策略的当前状态，探索领域内的研究范围和内容，并合理地假设未来的发展方向。在这项研究中，我们
生物学Pogil蛋白合成的中心教条
弗朗西斯·克里克（Francis Crick）的分子生物学基本原理包括序列假设和中央教条。序列假说描述了核酸和蛋白质之间如何转移序列信息。中央教条概述了遗传信息从DNA到RNA，然后概述了蛋白质，并指出一旦该信息达到蛋白质水平，就无法检索。近年来，合成生物学对这些原则提出了挑战，提出了有关潜在违反中心教条的问题。为了解决这些问题，研究人员在蛋白质合成中的信息传递和CRISPR基因编辑之间取得了相似之处。将三部分评估方案应用于CRISPR/CAS9和CRISPR Prime编辑系统。虽然信息传递保持在中央教条的范围内，但潜在的机制表明，通过合成生物学违反了这一原理的潜在途径。这引发了人们对蛋白质衍生的信息转移系统的理论和实际意义的猜测。此外，还有一项为入门生物学学生设计的教育活动，该活动使用诸如乙烯基记录等非生物学示例来探索中心教条。学生检查真核细胞中的遗传信息流，并探索逆转录病毒感染和伤口愈合等生物学条件，从而改变了这种流动。这个主题对于对医学，医疗保健和生物医学研究感兴趣的学生至关重要，因为遗传信息流的变化可能导致疾病状态。但是，这种简化不会捕获其原始含义。分子生物学的中心教条围绕着生物系统中的遗传信息流动，通常总结为“ DNA生成RNA，RNA产生蛋白质”。弗朗西斯·克里克（Francis Crick）在1957年介绍了这一概念，在1970年重申了这一概念：“分子生物学的中心教条涉及顺序信息的详细残基传递。它指出，这种信息不能从蛋白质转移到蛋白质或核酸。”更受欢迎但不正确的版本是简单的DNA→RNA→蛋白质途径，归因于詹姆斯·沃森（James Watson）。这个两步过程与Crick的原始声明不同，该声明今天仍然有效。包含DNA，RNA和蛋白质的生物聚合物是线性聚合物，每个单体最多都连接到其他两个。他们的序列有效地编码信息，并在分子之间发生忠实的，确定性的转移。当DNA转录为RNA时，它的补充对与它。DNA代码A，G，T和C分别转移到RNA代码A，G，U和C上。蛋白质的编码是使用人类和哺乳动物的标准密码子表中的三组，称为密码子。但是，有些生命形式使用不同的翻译。信息传递的基本步骤是从DNA到DNA的复制，必须为后代细胞提供遗传物质。复杂的蛋白质组重新组合执行此复制过程。转录是将DNA信息复制到mRNA中的过程。！！！可以发生替代剪接，从而增加蛋白质多样性。酶，例如RNA聚合酶和转录因子，促进了真核细胞的过程，包括剪接和翻译进行处理。转录过程始于在前mRNA中添加5'帽和poly-a尾巴，然后进行剪接。成熟的mRNA然后向核糖体传播进行翻译。在原核生物中，转录和翻译是连接的，而在真核生物中，它们通过mRNA从核从核转移到细胞质的转运而分开。翻译涉及通过核糖体读取mRNA密码子，将氨基酰基的TRNA匹配到抗代码，并将氨基酸连接到生长的肽链中。链条开始折叠成正确的构象，最终蛋白质出现所需的其他处理。翻译以终止密码子结束，但是mRNA不包含指定成熟蛋白质所需的所有信息。处理对于正确折叠至关重要，通常涉及伴侣蛋白以及多肽链的剪接或分裂。某些蛋白质需要交联，辅因子附着或去除内部。新霉素可以增强从其他生物体分离的单链DNA模板中合成蛋白质。但是，目前尚不清楚这种翻译机制是否针对遗传密码。翻译蛋白氨基酸序列后，可以通过酶编辑它们，该过程未被中央教条明确覆盖。没有太多明确的例子，蛋白质修饰和遗传学的相关概念彼此之间有很大关系。例子包括一些抗生素。某些蛋白质是由非核糖体肽合成酶合成的，这些蛋白质可以是专门合成一种类型的肽的复杂蛋白质。这些肽通常具有环状和/或分支结构，并且可以含有非蛋白酶氨基酸，从而将其与核糖体合成蛋白区分开。inteins是蛋白质的“寄生”片段，可以从氨基酸链中从核糖体出来并用肽键重新加入其余部分。此过程改变了蛋白质的主要序列，使其可以直接编辑DNA序列并增加其可遗传的繁殖。表观遗传学是指可以显着改变基因表达水平的DNA甲基化状态的变化。当信息状态的变化不会因体细胞突变而改变时，这种表观遗传变化被认为是可遗传的。prion是具有特定氨基酸序列的蛋白质和构象，它们通过在蛋白质的其他蛋白质分子中以相同的序列但不同的构象进行构象变化来传播自身。一旦蛋白质转换，它就可以将信息传达到新的细胞中，并将该序列的更多功能分子重新配置为替代prion形式。一些科学家认为，prion介导的遗传违反了分子生物学的核心教条。prion假说与分子生物学的核心教条矛盾，该序列指出DNA序列编码蛋白质信息。詹姆斯·夏皮罗（James A.相反，它提出蛋白质可以包含其自己的遗传信息，影响其生物学功能，并可能被传递给其他分子。但是，他的批评家不相信他对克里克最初意图的解释。弗朗西斯·克里克（Francis Crick）在自传中写道，他选择“中央教条”一词，并指出他想强调其重要性和力量。后来他意识到，使用“教条”一词造成的麻烦远远超出了价值，因为它暗示了一种信念，这是无法怀疑的。Crick将该术语用作口号，但并未完全理解其正确的含义。中央教条的概念早于发现DNA的作用和结构。八月魏斯曼的种植血浆理论提出，遗传信息仅从种系细胞转向体细胞，预测了以基因为中心的生命观点，而无需直接解决分子生物学。分子生物学的中心教条，这是弗朗西斯·克里克（Francis Crick）在1950年代创造的概念，概述了遗传信息从DNA到蛋白质的流动。根据此框架，遗传信息存储在DNA分子中，并转录为RNA，然后将其转化为蛋白质。然而，随着研究人员继续探索细胞过程的复杂性，他们开始质疑中央教条的简单性。尤其是，prions的发现 - 可以改变基因表达的传染性蛋白质颗粒 - 挑战了遗传信息无法从蛋白质向后流向DNA的观念。在这种情况下，必须重新评估中心教条在现代生物学中的相关性至关重要。最近的研究进一步模糊了传统的中央教条与非编码RNA介导的基因调节的概念之间的界限。后者表明，非编码RNA可以通过充当分子“海绵”或直接与染色质重塑复合物相互作用来影响基因表达。一些科学家认为，应扩展中央教条，以包括非编码RNA的作用以及允许蛋白质影响基因表达的反馈机制。