“基因敲除”或“敲除”是一种使基因功能失活的突变。这些突变对于经典的遗传研究以及包括功能基因组学在内的现代技术非常有用。过去,细菌基因的敲除通常是通过转座子诱变做出的。在这种情况下,需要费力的屏幕才能找到感兴趣的基因的淘汰赛。传统上,首先使用体外基因工程来修改质粒或细菌性人工染色体(BAC)的基因,然后将这些修饰的构建体移至细胞培养技术感兴趣的生物。利用基因工程和体内同源重组的组合的其他方法充其量效率低下。重新组合提供了一种直接在细菌染色体上产生基因敲除突变的新方法,或者将体内任何质粒或BAC修改为在其他生物体中敲除的前奏。构造设计为基础对,
每个专注于细胞和基因疗法的公司都采用自己的差异化科学策略,从而导致独特的工作流,这些工作流涵盖基因编辑,构造设计,生物处理,体外和体内测试。随着研发团队的成熟科学或选择新的方向,这些工作流程通常会随着时间而变化。因此,确保您的数字基础可以支持整个研发生命周期的现代细胞和基因疗法的广度和复杂性变得至关重要。Benchling在从早期发现到IND及以后的计划中,已经支持了数百家细胞和基因治疗公司。下面的工作流代表了R&D通常结构的高级抽象,我们将基本功能映射到您经常遇到它们的地方。
重组腺相关病毒(RAAV)载体目前是通过基因疗法治疗眼科疾病的唯一经过验证的车辆。目前正在采用针对眼部疾病的广泛基因治疗计划。将近20年的研究已经增强了靶向视网膜组织并改善转基因对特定细胞类型的效率。工程化的AAV CAPSID,AAV2.7M8目前是玻璃体内(IVT)注射后转导视网膜的最佳衣壳之一。然而,在视网膜在临床试验中施用AAV2.7M8载体后,已经报道了包括眼内炎症在内的不良反应。此外,我们一直观察到AAV2.7M8表现出低包装滴度,而与矢量构造设计无关。在本报告中,我们发现AAV2.7M8包装矢量基因组具有比AAV2更高的程度。我们还发现,基因组加载的AAV2.7M8刺激了IVT给药后小鼠视网膜中小胶质细胞的纤维化,而对基因组负载的AAV2和空的AAV2.7M8 capsids的反应产生了很多较轻的响应。这个发现表明,IVT施用AAV2.7M8载体可能会刺激视网膜免疫反应,部分原因是它偏爱包装和提供非单位长度基因组。