番茄果实成熟是由关键基因的脱甲基触发的,这会改变其转录水平,从而启动和传播一系列的生理事件。未知的是,当使用后票后实践成熟水果以扩展保质期时,这些过程如何改变,因为这些实践通常会降低水果的质量。为了解决这个问题,评估了处理后处理诱导的果实DNA甲基甲基和转录组的变化,以及它们如何与成熟速度相关,并评估了乙烯,脱甲酸和类胡萝卜素等成熟指标。这项研究通过动态分子变化全面连接生理事件的变化。成熟的果实在20℃,12.5℃或5℃冷却后达到“转动”(t),将其与新鲜的水果“ FHT”进行了比较。储存在12.5℃的水果具有最大的表观遗传标记和基因表达的改变,超过了后冷却后引起的变化。果实生理和年代年龄在12.5℃下取消耦合,因为成熟时间是最长的。成熟到12.5℃的果实成熟并不是最新的。没有呼吸道或乙烯爆发,而是脱落酸含量很高。在甲基化组和转录组中明显明显的后脱水和“ FHT”之间的明显差异。在“ FHT”果实中光合基因和叶绿素水平的较高表达表现为光明,因为它影响了果实成熟的分子变化。最后,对由DNA甲基化调节的基因的 - 组数据的相关分析。总体而言,这些数据改善了我们对番茄果实成熟方式如何通过后票后实践改变的解释,并且期望长期有助于提高水果质量。
虽然抗生素仍然是治疗微生物感染的主要基础,但负责社区或医院获得感染的微生物正在不断突变并发展出对最佳和最有效的抗生素的抗性[1,2]。微生物耐药性的由此产生的负担包括财务损失,由于治疗失败而导致的延长住院,慢性疾病(癌症和糖尿病等)的风险增加等。),生产率降低和死亡率提高[3]。微生物多抗耐药性和新传染病药物的出现因产品开发管道中有希望的化合物数量少而恶化。因此,迫切需要具有针对抗生素耐药性的显着活性的新型和活性抗菌化合物,或者是针对该疾病的抗生素的补充[4-6]。植物衍生的化合物,因为它们的化学多样性在治疗和预防感染中都起着重要作用[7,8]。这些
该属葱属属于植物科amaryllidaceae,其中包括经济上重要的农作物,例如洋葱,大蒜,洋葱和韭菜,用作蔬菜,香料和传统药物。大小的葱基因组妨碍了农艺上重要的特征和分子育种的遗传解剖。随着基因组,重新配置,转录组和表型数据的增长,对综合葱属数据库的需求正在增加。在这里,我们提出了一个用户友好的数据库AlliumDB(https://allium.qau.edu.cn),作为一个功能性基因组中心,集成了公共和内部数据。数据库包含所有目前可用于葱物种的核和细胞器基因组,基因基于基因本体论(GO)(GO)和基因和基因组(KEGG)分析,正直学,基因家族,蛋白质家族(PFAM)以及非编码RNA(RNA rna flose)的基因(KEGG)分析(KEGG)分析(KEGG)分析。转录组和变化轮廓被整合到动态可视化工具中。我们拍摄了表型照片并为全球收集的数百种葱属种系产生了特质记录,这些记录包含在数据库中。我们将JBROWSE纳入了基因结构,RNA测序数据和变异数据的可视化。分析工具,例如基本的局部比对搜索工具(BLAST),序列获取,富集和基序分析,可用于探索潜在的基因功能。该数据库结合了综合的葱基因型和表型数据集。我们预计AlliumDB数据库将成为研究葱属作物的关键资源。由于社区组装了新的基因组并生成了针对葱生殖的重新陈述数据,因此数据库将得到改进,并通过这些多摩管数据和比较基因组研究来不断更新。
肠道微生物群社区是影响家禽营养和健康状况的重要因素,其平衡对于改善家禽的整体健康至关重要。这项研究旨在研究饮食补充剂在84天的喂养实验中用尿素提取物(GUE),乳杆菌(GUE),乳杆菌(LAC)(LAC)(LAC)及其组合(GL)对肉体中生长性能和肠道健康的影响。补充0.1%GUE和4.5×10 7 CFU/G LAC显着提高了平均每日增益(ADG),而GL(0.1%GUE和4.5×10 7 CFU/G PAR)增加了ADG和平均每日饲料摄入量(ADFI),并降低了29至84 d和84 d和84 d和84 d的肉鸡饲料转换率(FCR)。饮食GUE,LAC和GL增加了超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活性,并降低了肉体粘膜中的牛un含量(MDA)含量,并增加了分泌Iga(SIGA)(SIGA)含量的84 d。此外,GUE,LAC和GL提高了Cecal微生物的丰富性和多样性,并调节了微生物群落的组成。GUE和LAC均在28 d时降低了有害细菌,腹膜杆菌,Helicobacter和H. pullorum,proteeobacteria和proteeobacteria,Escherichia和E.Coli和大肠杆菌在84 d时,而LAC和GL则增加了有益的细菌乳杆菌和Gallinarum l. gallinarum at 28 d。与单个补充相比,GL显着增加了SOD活性和SIGA含量,并减少了螺旋杆菌和螺旋杆菌。总而言之,Gue和乳杆菌作为饲料添加剂有益于生长性能和肠道健康,并且它们的合并用途在肉鸡中显示出更加积极的作用。
在成熟激活的番茄E8启动子的控制下以番茄果实表达的ATMYB12转录因子基因会导致苯基丙烷生物合成途径中多个基因表达的增加(Luo等,2008)。有关这些途径中基因表达增加的图形表示,请参见图1。The result is accumulation of flavonol derivatives–primarily rutin and kaempferol rutinoside–and caffeoyl quinic acids–mainly caffeoylquinic acid (also known as chlorogenic acid; already the most prevalent soluble phenolic in Solanaceous species), dicaffeoylquinic acid, and tricaffeoylquinic acid (see Figure 2 for a产生的途径和化合物的图)。果实中的这些升高的酶基因表达水平,以及果实中各种多酚化合物的水平增强,在果实中产生黄色或橙色(见图3)。ATMYB12番茄没有其他表型。
实际上,在应用遗传修饰之前很久就存在了无种子水果。无种子水果产生的机制是在受精后开发果实,或者在受精后流产的胚胎,在水果内留下流产的种子的痕迹。在这些植物中可能需要也可能不需要授粉,以诱导激素的合成,从而导致卵巢壁扩张和发展果实。实际上,无种子的果实自然出现,例如香蕉,菠萝,鳄梨和一些葡萄。无种子水果也可以通过文化实践诱导(见图1)。一个例子是植物生长调节剂的应用,可以诱导不受精肉的果实发育,因此形成没有种子的水果,例如无籽的柑橘类水果和一些葡萄。另一个例子是通过交叉育种生产无种子西瓜,形成不产生可行的生殖细胞的西瓜,因此无法正确形成种子(见图2)。
使用遗传转化方法评估在果树种类中表达的基因的功能是一个漫长的过程,因为这些树木通常是对遗传转化的顽固性,并且在较长的幼年相中不能忍受果实。果实中的瞬时基因表达能够对与果实性状相关的基因进行功能分析,从而加速了果实生理的研究。在这里,通过使用最近开发的“ tsukuba系统”,我们成功地建立了收获的水果组织中有效的瞬态表达系统。“ tsukuba系统”利用了双子病毒复制系统和双终止仪的组合,从而确保了足够的转基因表达水平。我们使用蓝莓水果作为模型来表征该系统在果组织中瞬时表达的适用性。PTKB3- EGFP载体是通过浸润到几种蓝莓品种的水果组织中引入的。我们发现,果实灌注后4-6天,果实中的瞬时GFP荧光。农杆菌悬浮液很容易注入柔软的成熟果实,GFP强烈表达。然而,硬质果实无法通过农业悬浮液渗透,很少检测到GFP。然后,我们测试了开发系统对其他果树的适用性:六个家庭,17种和26种品种。GFP荧光。在蓝莓,鸟莓,甜樱桃,杏子和卫星普通话中,GFP高度表达并以很大一部分的肉体观察到。在Kiwifruit,Hardy Kiwifruits,柿子,桃子,苹果,欧洲梨和葡萄中,GFP荧光仅限于某些部分水果。最后,对蓝莓中的瞬态VCMYBA1过表达进行了测试,作为水果中基因功能分析的模型。瞬态VCMYBA1过表达诱导肉中的红色色素沉着,这表明VCMYBA1表达引起花青素的积累。这项研究为在水果中表达的基因的快速评估提供了技术基础,这对于长期幼年阶段的水果作物的基因功能评估研究非常有用。