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World File Search System果蝇
暑期课堂上通过视觉选择对果蝇进行 CRISPR/Cas9 基因编辑
(A) 顶部：将目标 Gal4（深蓝色，顶部构建体）与编码 Cas9 的版本 2 (V2) 供体菌株杂交，该菌株由 X 上的 vasa 启动子控制（未显示），而 CyO 上的供体构建体则包含 T2A。LexA 由 floxed 3xP3-RFP、黄色+ 盒标记，两侧是 Gal4 同源臂和 U6 驱动的向导 RNA（CyOHACKy.V2,y +、RFP +）。从上往下第三行：得到的 HACKed 染色体，其中 Gal4 ORF 已被破坏并由 T2A.LexA 替换，由视觉标记黄色+和 RFP+标记。底部：与 hs- Cre 杂交后，黄色 +、RFP + 盒被移除。
使用果蝇淀粉样蛋白毒性模型研究阿尔茨海默氏病
下降，尽管它可能涉及言语和视觉空间处理的损害（Knopman等，2021）。疾病进展的特征是总体下降，其中最终丢失了步行，吞咽和说话等基本身体功能的能力。患者平均诊断后的8年生活，但可以在疾病的末期（阿尔茨海默氏症协会，2020年）居住20年。在全球范围内，2019年，痴呆症的成本估计为2.8万亿美元（Nandi等，2022）。由于AD与衰老过程密切相关，因为由于医疗保健的发展，全球预期寿命持续上升，因此AD的患病率有望相应地增加，到2050年，案件几乎三倍（Nichols等人，2019年）。在英国国王，痴呆症和AD是2022年的大多数死亡（死亡注册摘要统计数据，英格兰和威尔士，2022年）。具体来说，他们造成65,967人死亡。当前，尽管最近的临床试验表现出一些最初的希望，但目前尚无可用的治疗策略可以阻止疾病的进展或扭转其进展。
果蝇的效用作为真菌感染模型
机会性真菌感染的全球影响很长一段时间（1）。然而，随着慢性和免疫抑制健康状况的增加，包括艾滋病毒/艾滋病，癌症，囊性纤维化和糖尿病，抗菌治疗和侵入性程序，使个人容易受到机会性感染的影响，这些感染的影响变得更加明显（1，2）。真菌通过直接感染宿主或通过其继发代谢产物，霉菌毒素，可能污染环境，食品和空气的颜料引起疾病（3）。这种疾病负担从超级到侵入性真菌感染范围，估计每年为100亿患者，每年死亡> 150万人死亡（2，4）。这些感染是由长期识别的病原体（如曲霉和白色念珠菌）（5-7）引起的，如Eumyycetoma（8、9）等被忽视的热带疾病以及新出现的病原体，例如念珠菌（10，11）。随着晚期分子和细胞生物学技术的发展，正在更详细地研究真菌致病性和毒力因子（12-14）。然而，随着新颖有效的抗真菌疗法的发展仍然不足，真菌威胁继续增长（15、16）。在2022年，世卫组织发布了WHO
果蝇幼虫大脑中高度不稳定的mRNA编码了动态调节的转录因子
每种 RNA 的水平取决于其产生率和衰变率之间的平衡。尽管先前的研究已经测量了组织培养和单细胞生物中整个基因组的 RNA 衰变，但很少有实验是在完整的复杂组织和器官中进行的。因此，尚不清楚在培养细胞中发现的 RNA 衰变决定因素是否在完整组织中保留，以及它们在邻近细胞类型之间是否不同以及在发育过程中是否受到调节。为了解决这些问题，我们通过使用 4-硫尿苷对整个培养的果蝇幼虫大脑进行代谢标记，测量了全基因组的 RNA 合成和衰变率。我们的分析表明，衰变率范围超过 100 倍，并且 RNA 稳定性与基因功能有关，编码转录因子的 mRNA 比参与核心代谢功能的 mRNA 稳定性低得多。令人惊讶的是，在转录因子 mRNA 中，更广泛使用的转录因子与在发育过程中仅短暂表达的转录因子之间存在明显的界限。编码瞬时转录因子的 mRNA 是大脑中最不稳定的。这些 mRNA 的特点是大多数细胞类型中的表观遗传沉默，如其富含组蛋白修饰 H3K27me3 所示。我们的数据表明存在针对这些瞬时表达的转录因子的 mRNA 不稳定机制，从而可以快速高精度地调节它们的水平。我们的研究还展示了一种测量完整器官或组织中 mRNA 转录和衰减率的通用方法，为了解 mRNA 稳定性在调节复杂发育程序中的作用提供了见解。
IFT88通过沿果蝇cilia 的定位信号蛋白来维持感觉函数 内皮细胞在心脏损伤期间采用促徒期免疫反应症 t细胞分化驱动致病性线粒体DNA变体的负选择 rb损失通过捕获PAR抑制后，将细胞敏感到与复制相关的DNA损伤 在径向神经胶质生物学和脑发育中了解葡萄糖代谢 辅酶A前体哑氨酸增强了肉瘤中的抗肿瘤免疫力 人Rad52刺激RAD51介导的同源搜索 增强子突变调节化学疗法诱导的骨髓抑制的严重程度 时空DNA甲基化动力学形状巨型级甲基甲基景观 细胞锌状态改变染色质的可及性和p53与DNA 的结合 异常的DNA甲基化扭曲了非典型Teratoid/burtabdoid肿瘤中的发育轨迹 defa1a3 DNA基因剂量调节上尿路感染期间肾脏先天免疫反应 在干细胞衍生的神经元中，在神经发育过程中的脂肪型获取
睫状缺陷引起几种纤毛病，其中一些纤毛发作迟到，这表明cilia被积极维持。仍然，我们对维护的机制的理解很糟糕。在这里，我们显示了果蝇黑色素果ift88（DM IFT88/nompb）继续沿着完全形成的感觉纤毛移动。我们进一步识别无活跃的，果蝇听力和负性持续性行为的TRPV通道亚基，以及尚未表征的果蝇鸟叶尼犬环酶2D（DM GUCY2D/ CG34357）作为DM IFT88货物。我们还显示了DM IFT88与循环酶的细胞内部分的结合，该部分在几种退化性视网膜疾病中是进化保守和突变的，对于DM GUCY2D的纤毛定位而言是不可能的。最后，成年纤维中DM IFT88和DM GUCY2D的急性敲低导致纤毛功能的维持，障碍和刺激性刺激性的行为导致缺陷，但并未显着影响睫状超结构。我们得出的结论是，成人范围内听力的感觉睫状功能涉及DM IFT88及其至少两个信号传导跨膜货物，DM GuCy2D和无效的主动维护程序。
扩展果蝇工具包，用于双重控制基因表达的Jonathan Zirin 1，*，Barbara Jusiak 2，†，Raphael Lopes 1，†，Ben Ewen-campen 1
扩展果蝇工具包，以双重控制基因表达的乔纳森·齐林1，*，芭芭拉·朱西亚克2，†，拉斐尔·洛佩斯1，†，本·埃文（Ben Ewen）校园1，贾斯汀·A·博斯奇1，贾斯汀·A·博世（Justin A.马萨诸塞州波士顿，哈佛医学院，哈佛医学院2）生理学与生物物理学系，加利福尼亚大学，欧文，加利福尼亚州3）霍华德·休斯医学院，马萨诸塞州波士顿 *相应的作者†这些作者对这项工作的摘要同样贡献了在两种不同的组织中，在同一动物中进行了两种不同的组织，尤其是在同一动物中，尤其是一项阶级。通过结合GAL4/UAS和第二个二元表达系统（例如Lexa-System或QF系统）的技术使这种研究成为可能。在这里，我们描述了一种试剂资源，该试剂促进了在各种果蝇组织中综合使用GAL4/UAS和第二个二元系统。专注于具有良好特征的GAL4表达模式的基因，我们通过CRISPR敲击产生了一组40多个Lexa-Gad和QF2插入，并验证了它们在幼虫中的组织特异性。我们还构建了单个向量中编码QF2和Lexa-GAD转录因子的构造。成功地集成了该构建体中的蝇基因组后，使用FLP/FRT重组来隔离仅表达QF2或Lexa-GAD的飞行线。最后，使用新的兼容shRNA矢量，我们评估了Lexa和QF系统用于体内基因敲低，并正在生成此类RNAi飞行线的库作为社区资源。2007;珀金斯等。 2015）。2007;珀金斯等。2015）。一起，这些Lexa和QF系统向量和飞行线将为需要以同一动物以正交方式激活或抑制两个不同基因的研究人员提供一组新的工具。简介组合二进制系统使用RNAi或CRISPR的功能丧失（LOF）和功能增长（GOF）研究的大多数试剂依赖于GAL4/UAS介导的表达（Brand and Perrimon 1993; Dietzl等人。2015; Zirin等。2020;港口和布特罗斯2022）。但是，一些研究，例如对细胞间或器官间通信的研究，需要同时使用两个独立的二元转录系统。例如，双重表达系统已被用来研究果蝇胰岛素样肽如何与大脑释放以控制器官生长（Colombani等人。2015），分析从嗅觉神经元到血细胞的信号传导（Shim等人2013），独立操纵配体产生和配体接收细胞（Yagi等2010），并可视化组织中克隆细胞种群之间的相互作用（Bosch等人基于需要同时操纵给定组织中不同细胞的集合，Lexa/Lexaop系统（Lai and Lee 2006）和QF/Quas System（Potter等人2010; Potter and Luo 2011）已开发。没有系统的研究比较这两个系统，只有轶事证据支持一个系统。
基因组DNA从果蝇引入
简介：RBC是人体中最丰富的血细胞类型，约占成人血液量的40-45％。RBC很重要，因为它们将氧气从肺部携带到身体的其余部分，并将二氧化碳转移回肺部以进行呼气。进行总红细胞（RBC）计数的目的是测量给定血液体积中的红细胞数量。测量RBC是诊断和监测许多医疗状况的重要组成部分。低的RBC计数可能表明贫血，这种情况没有足够的红细胞来充分地在整个体内运输氧气。升高的RBC计数可能表明多发性疾病，一种红细胞过多的疾病，导致血液增厚和血液凝块的风险增加。
Sox21b是果蝇物种之间新型男性生殖器结构的快速多样化
然而，关于新结构演变的遗传基础和其多样化的机制的遗传基础知之甚少。雄性生殖器的膀胱后叶是特定果蝇物种的新颖性。10–13裂片抓住雌性的产卵剂，并在腹部ter骨之间插入，因此对于交配和物种识别很重要。10–12,14–17后叶可能是从后螺旋中心10的同事演变而来的，此后在D. Simulans crade中的形态学上已经分散，尤其是在过去的240,000年中，在过去的240，000年中，由性选择驱动。18–21这种多样化的遗传基础是多基因的，但据我们所知，尚未鉴定出一个病因基因。22–30确定这些次要性结构多样化的基因对于理解对交配和物种识别的进化影响至关重要。在这里，我们表明SOX21B负调节后叶大小。这与D. Mauritiana中的Sox21b表达扩展是一致的，D. Mauritiana的后叶比D. simulans更小。我们通过产生相互的半合子来测试这一点，并确认了Sox21b的变化后叶下叶的后叶的演化。更重要的是，我们发现后叶大小差异是由Sox21b的特异性等位基因引起的，显着影响交配持续时间。综上所述，我们的研究揭示了新型形态结构及其对共管行为的功能影响的性别驱动驱动的多样化的遗传基础。
亲脂蛋白受体通过降低果蝇脑的PSN表达降低引起的神经变性
Presenilin（PSEN）基因中的突变是早期发作家族性阿尔茨海默氏病（FAD）的最常见原因。在细胞培养，体外生化系统和敲除小鼠中的研究表明，PSEN突变是功能丧失突变，损害了γ-泌尿酶活性。小鼠遗传分析强调了presenilin（PS）在学习和记忆，突触可塑性和神经递质释放以及神经元存活中的重要性，而果蝇研究进一步证明了PS在老化过程中PS在神经元存活中的进化作用。然而，在神经元存活中与PS相互作用的分子途径尚不清楚。为了调节PS依赖性神经元存活的遗传修饰符，我们开发了一种新的果蝇PSN模型，该模型表现出年龄依赖性神经变性和凋亡的增加。经过生物信息学分析，我们使用PSN KD模型中的两个独立的RNAi系在神经元中的每个基因的选择性敲低（KD）测试了排名最高的候选基因。有趣的是，在脂质转运和代谢中，增强PSN KD蝇中神经退行性的9个基因中有4个。具体而言，LPR1和LPR2的神经元特异性KD急剧恶化了PSN KD蝇中的神经退行性，LPR1或LPR2的过表达不会减轻PSN KD KD诱导的神经变性。此外，仅LPR1或LPR2 KD也会导致神经退行性，凋亡增加，攀爬缺陷和寿命缩短。这些发现表明，LPRS调节了依赖PSN的神经元存活，对于衰老大脑的神经元完整性至关重要。最后，LPR1和LPR2的杂合缺失或LPR1或LPR2的纯合缺失类似导致PSN KD Flies中的年龄依赖性神经变性，并进一步加剧神经变性。
在果蝇的寿命上，丙硫酸磷酸果实，甜叶菊提取物和僧侣果实的比较影响
非纤维甜味剂（NNS），非热甜味设备，已被广泛商业化以减少糖消耗。这种意图与健康益处相关联，尽管报告与这些替代品与非传染性疾病的消费相关。缺乏对这些相互作用的更广泛含义（例如对寿命）的更广泛含义的研究，例如缺乏研究。这项研究的目的是比较三个最近经FDA批准的NNS-Acesulfame-Potassium（ACE-K），Stevia和Monk Fruit的影响，对Drosophila Melanogaster的生存，这是一种寿命研究的模型，用于寿命研究，以发现对人类寿命的可能影响，并进一步影响了人类的使用，并具有对他们的使用，以及他们的用途。可以假设，如果将D. melanogaster喂食这三个NN，则用ACE-K喂养的人将具有最低的生存率，因为ACE-K与微生物失调有关，这与寿命降低有关。将15个男性和女性同步蝇分配给含有甜味剂的小瓶中，并以蔗糖作为对照为基础饮食。幸存者每三到四天记录32天。每种饮食的存活率显着低于对照，并且使用ACE-K，χ2（9，n = 240）= 244.2，p ﹤.00001最明显。试验期一半（第15天）之间的饮食之间的生存也有显着差异，χ2（3，n = 240）= 78.3，p ﹤.00001。11葡萄糖控制，胰岛素反应和具有长期健康影响的代谢受到饮食选择的严重影响。ace-k对D. melanogaster的寿命产生了不利影响，这表明这种甜味剂在人类中的潜在并行作用。引言不健康的饮食是美国发病率的主要危险因素，在2017年，国际上有1100万人死亡是营养因素不良的结果，例如食用热浓密的食物。12，例如，糖消耗的流行率与代谢综合征的发展，包括2型糖尿病，肥胖，高血压和心血管疾病有关。19糖的摄入还可能通过产生炎症性细胞因子而导致慢性炎症，这可以进一步增加对非传染性疾病的敏感性。3在2017 - 2018年，美国人平均每天消耗17茶匙糖，超过了世界卫生组织提供的最大摄入量建议。19