染色质是携带DNA序列的基因组的物理底物,并确保其在细胞核中的适当功能和调节。虽然在编程的细胞过程(例如开发)过程中染色质的动力学知之甚少,但染色质在经验依赖性功能中的作用仍未得到很好的定义。积累的证据表明,在脑细胞中,环境刺激可以触发可能影响未来转录程序的染色质结构和三维(3D)组织的长期变化。本综述描述了最新发现,表明染色质在细胞记忆中起着重要作用,尤其是在维持大脑中先前活性痕迹中。受到免疫和上皮细胞发现的启发,我们讨论了潜在的机制及其对健康和疾病中经验依赖性转录调控的影响。我们通过提出染色质的整体观点作为分子底物的整体观点,以整合和同化环境信息,这可能构成未来研究的概念基础。
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后唑启动子富集于次级DNA结构形成基序中,例如G-四链体(G4S)。在这里,我们描述了“ G4Access”,这是一种通过核酸酶消化与开放染色质相关的分离和序列G4的方法。g4Access是抗体和交联的非依赖性和富集的计算预测G4S(PG4S),其中大多数在体外得到了证实。使用人和小鼠细胞中的G4ACCESS,我们鉴定出与核小体排除和启动子转录相关的细胞类型的G4富集。G4ACCESS允许测量G4配体处理后G4曲目使用的变化,HDAC和G4解旋酶抑制剂。将G4ACCESS应用于来自相互杂交小鼠交叉的细胞表明G4在控制活动印迹区域中的作用。一致地,我们还观察到G4ACCESS峰是未甲基化的,而PG4S的甲基化与DNA上的核小体重新定位相关。总体而言,我们的研究为研究细胞动力学的G4提供了一种新工具,并突出了它们与开放染色质,转录及其对DNA甲基化的拮抗作用的关联。
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“我们能够跟踪对灰尘中铁浓度的意外反应,” ICCP主任兼研究合着者Axel Timmermann教授说。铁是藻类的关键营养素,但在某些地区,例如南大洋和东部热带太平洋地区,其自然丰度非常低。取决于小行星的铁含量以及被炸入平流层的陆地材料的铁含量,原本营养的耗尽的区域可能会用生物利用铁富含营养,从而触发前所未有的藻类。
带有评论[PZ1]:也许从转录调节到重组的过渡更加顺利,您可以写出,这种“本地招聘”不仅导致了基因的转录,而且还会影响减数分裂的交叉形成
1。S. Iyer,R。M。Gaikwad,V。Subba-Rao,C。D。Woodworth和I. Sokolov,“原子力显微镜检测到正常和癌细胞表面刷的差异”,NAT。纳米技术。4(6),389–393(2009)。2。H. Knecht和S. Mai,“端粒和核结构的3D成像:基于3D纳米形态的诊断的新兴工具”,J。单元格。生理学。226(4),859–867(2011)。3。H. Subramanian,P。Pradhan,Y。Liu,I。R. Capoglu,X。Li,J。D. Rogers,A。Heifetz,A。Heifetz,D。Kunte,H。K. Roy,A。Taflove,A。Taflove和V. Backman,“用于检测组织学无效的纳米级后果的光学方法论,对生物学细胞进行了遗传替代。natl。学院。SCI。 U.S.A. 105(51),20118–20123(2008)。 4。 H. Subramanian, H. K. Roy, P. Pradhan, M. J. Goldberg, J. Muldoon, R. E. Brand, C. Sturgis, T. Hensing, D. Ray, A. Bogojevic, J. Mohammed, J. S. Chang, and V. Backman, “Nanoscale cellular changes in field carcinogenesis detected by partial wave spectroscopy,” Cancer Res. 69(13),5357–5363(2009)。 5。 R。K. Bista,T。A. Brentnall,M。P. Bronner,C。J. Langmead,R。E. Brand和Y. Liu,“使用非直肠直肠上皮细胞的光学标志物来鉴定患有溃疡性结肠炎相关的肿瘤的患者,” 肠dis。 17(12),2427–2435(2011)。 6。 K。J. Chalut,J。H. Ostrander,M。G. Giacomelli和A. Wax,“亚细胞结构的光散射测量可提供化学疗法诱导的凋亡的无创早期检测”,癌症Res。SCI。U.S.A. 105(51),20118–20123(2008)。 4。 H. Subramanian, H. K. Roy, P. Pradhan, M. J. Goldberg, J. Muldoon, R. E. Brand, C. Sturgis, T. Hensing, D. Ray, A. Bogojevic, J. Mohammed, J. S. Chang, and V. Backman, “Nanoscale cellular changes in field carcinogenesis detected by partial wave spectroscopy,” Cancer Res. 69(13),5357–5363(2009)。 5。 R。K. Bista,T。A. Brentnall,M。P. Bronner,C。J. Langmead,R。E. Brand和Y. Liu,“使用非直肠直肠上皮细胞的光学标志物来鉴定患有溃疡性结肠炎相关的肿瘤的患者,” 肠dis。 17(12),2427–2435(2011)。 6。 K。J. Chalut,J。H. Ostrander,M。G. Giacomelli和A. Wax,“亚细胞结构的光散射测量可提供化学疗法诱导的凋亡的无创早期检测”,癌症Res。U.S.A. 105(51),20118–20123(2008)。4。H. Subramanian, H. K. Roy, P. Pradhan, M. J. Goldberg, J. Muldoon, R. E. Brand, C. Sturgis, T. Hensing, D. Ray, A. Bogojevic, J. Mohammed, J. S. Chang, and V. Backman, “Nanoscale cellular changes in field carcinogenesis detected by partial wave spectroscopy,” Cancer Res.69(13),5357–5363(2009)。5。R。K. Bista,T。A. Brentnall,M。P. Bronner,C。J. Langmead,R。E. Brand和Y. Liu,“使用非直肠直肠上皮细胞的光学标志物来鉴定患有溃疡性结肠炎相关的肿瘤的患者,”肠dis。17(12),2427–2435(2011)。6。K。J. Chalut,J。H. Ostrander,M。G. Giacomelli和A. Wax,“亚细胞结构的光散射测量可提供化学疗法诱导的凋亡的无创早期检测”,癌症Res。69(3),1199–1204(2009)。7。I. Itzkan,L。Qiu,H。Fang,M。M. Zaman,E。Vitkin,I。C. Ghiran,S。Salahuddin,M。Modell,C。Andersson,L。M. Kimerer,P。B. Cipolloni,P。B. Cipolloni,K。H. H. Lim,S。D. Freedman,S。D. Freedman,I.Bigio,I.Bigio,I.B.Sachs,E。B. Sachs,E。B. Hanlon,L.Hanlon,l. t. t. t. t. t. t. pering and L. T.光谱显微镜在没有外源标签的活细胞中监测细胞器”。natl。学院。SCI。 U.S.A. 104(44),17255–17260(2007)。 8。 Z. Wang,K。Tangella,A。Balla和G. Popescu,“组织折射率为疾病标志”,J。Biomed。 选择。 16(11),116017(2011)。 9。 G. Popescu,细胞和组织的定量相成像,McGraw-Hill Biophotonics(McGraw-Hill,2011年),pp。 xx,362 p。SCI。U.S.A. 104(44),17255–17260(2007)。 8。 Z. Wang,K。Tangella,A。Balla和G. Popescu,“组织折射率为疾病标志”,J。Biomed。 选择。 16(11),116017(2011)。 9。 G. Popescu,细胞和组织的定量相成像,McGraw-Hill Biophotonics(McGraw-Hill,2011年),pp。 xx,362 p。U.S.A. 104(44),17255–17260(2007)。8。Z. Wang,K。Tangella,A。Balla和G. Popescu,“组织折射率为疾病标志”,J。Biomed。 选择。 16(11),116017(2011)。 9。 G. Popescu,细胞和组织的定量相成像,McGraw-Hill Biophotonics(McGraw-Hill,2011年),pp。 xx,362 p。Z. Wang,K。Tangella,A。Balla和G. Popescu,“组织折射率为疾病标志”,J。Biomed。选择。16(11),116017(2011)。9。G. Popescu,细胞和组织的定量相成像,McGraw-Hill Biophotonics(McGraw-Hill,2011年),pp。xx,362 p。
光的本质或有时是显微镜的设计,在图像采集过程中引入了偏见和系统错误。取决于分析的类型,因此有必要通过产生与不同荧光团同时标记的探针和/或产生颜色交换的探针(两组交换荧光团的探针)来评估诸如色差等误差(请参阅第3.4.5节)。这比简单地对安装介质中的荧光标记的珠子进行想象更准确,因为对照和实际实验环境之间的光路相同。在基于划痕的探针的情况下,可以用不同的荧光团标记一个探针的1.2-1.7 kb片段,即在6-碎片场景和3色鱼实验中,一种碎片1和4的颜色,另一种用于片段2和5的颜色,另一种颜色再次用于片段3和6。对于寡头,可以使用与主要的荧光团标记的次级寡聚。[图1附近]