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World File Search System标记物
通过定量和分子标记物在格里亚·奥特瓦（Grewia optiva）中的遗传差异研究
通过使用RAPD（随机扩增的多态性DNA）和ISSR（简单序列重复序列重复序列）进行了10种不同的Grewia optiva家族之间的多样性分析。Grewia Optiva家族是由从喜马al邦（印度）的各个地区收集的种子养育的，并根据形态学参数选择。分别使用15个RAPD和20个ISSR引物和9个RAPD和12个ISSR引物显示放大。9个RAPD引物显示出68.96％的多态性，12个ISSR引物显示出71.25％的多态性。使用NTSYSPC Ver.2.02H的Sahn模块生成相似性矩阵和树状图。jaccard的相似性矩阵显示了与RAPD引物之间的“ SO-7”和“ SO-3”之间的最大相似性系数为0.88。对于ISSR，系数值范围为0.52至0.80。树状图在更大程度上也揭示了相似的结果，在Grewia Optiva收集的10个家族中发现的最大相似性在“ SO-7”和“ SO-3”的RAPD引物之间为88％，与ISSR的“ SO-7”和“ SO-3”之间的“ SO-7”和80％。RAPD和ISSR在10种不同基因型的Grewia optiva中有效揭示了多态性。根据地理分布和遗传构造，RAPD和ISSR的基于UPGMA的树状图证实了不同基因型将不同的基因型放置在不同的簇和子集群中。Family SH-7与RAPD和ISSR研究所揭示的那样发出了Outliner。
揭开簇分化 (CD) 系统的神秘面纱和临床病理学意义
分化簇 (CD) 是一种命名系统，用于识别和分类各种免疫和非免疫细胞细胞表面上的抗原。CD 标记物是细胞表面蛋白，通常用于确定各种细胞类型的身份。流式细胞术和免疫组织化学等应用可以根据独特 CD 标记物的表达对细胞进行表型表征。CD 标记物也是研究白细胞和淋巴细胞亚群分化和成熟的有用工具。HLDA（人类白细胞分化抗原）研讨会于 1982 年成立，制定了 CD 命名法，并从那时起一直维护着 CD 标记物列表。自发现以来，CD 标记物的数量不断增加，并已扩展到白细胞以外的其他细胞类型。如今，人类中已描述了 370 多个 CD 簇。CD 分子具有多种功能，通常充当受体或配体，一些 CD 蛋白在细胞信号传导、细胞粘附、细胞抑制和细胞活化中发挥作用。 CD 标记物越来越多地用于血液系统恶性肿瘤、自身免疫性疾病、免疫缺陷的诊断和随访、癌症免疫疗法的监测以及干细胞生物学研究。评估 CD 标记物不仅在疾病发作时具有诊断价值，而且可作为预后和预测标记物，有助于治疗疾病并预测其复发。
PDF：使用DNA标记物在面包小麦（Triticum aestivum L.）品种中确定蚜虫抗性基因
俄罗斯小麦蚜虫（RWA； Diuraphis noxia [kurdjumov]）是世界上最重要的和侵入性的小麦，大麦和其他谷物的害虫之一，并且对全球秋季小麦有至关重要的经济影响。抗性品种的发展可能会导致有力控制RWA控制的新RWA生物型的连续出现，从而强调了确定新的抗性来源的需求。用全身性杀虫剂控制RWA在经济上昂贵，对环境和人类健康危害。因此，控制RWA的最有效方法是确定和开发具有耐药基因的小麦品种。提出的研究试图确定25种小麦品种的DN基因，其中包括乌兹别克斯坦小麦育种计划的19种品种和俄罗斯育种的6种品种。PCR筛选进行了六个（XGWM44，XGWM111，XGWM635，XGWM337，XGWM337，XGWM642和XGWM473）SSR标记与DN基因相关的SSR标记，以识别小麦植物中的遗传多态性。结果帮助研究人员参与了育种计划，遗传改善和有害生物管理，这有助于小麦养殖的经济可行性。反过来，它通过提高小麦产量并最大程度地减少损失来增强粮食安全并促进区域和国家一级的财务稳定。
使用语音生物标记物对成年远程医疗呼叫者的自杀风险进行分类：回顾性观察研究
背景：人工智能有可能革新目前用于检测自杀迫在眉睫的风险的做法，并解决传统评估方法的缺陷。目标：在本文中，我们试图根据澳大利亚 2 家远程医疗咨询服务机构拨打的大量（n=281）电话，将短片段（40 毫秒）的语音根据自杀低风险和迫在眉睫的风险自动分类。方法：本研究纳入了来自澳大利亚 On The Line（n=266，94.7%）和堪培拉 000 紧急服务（n=15，5.3%）的共 281 条帮助热线电话录音。当呼叫者确认意图、计划和手段的可用性时，对迫在眉睫的自杀风险进行编码；风险级别由响应咨询师评估，并由临床研究团队使用哥伦比亚自杀严重程度评定量表（=5/6）重新评估。低自杀风险在没有意图、计划和手段的情况下通过哥伦比亚自杀严重程度量表评分（=1/2）进行编码。预处理包括语音信号的标准化和预强调，而语音生物特征则使用统计语言 r 提取。使用套索回归确定候选预测因子。使用带有样条函数以解释非线性的广义加性混合效应模型将每种语音生物标记物评估为自杀风险的预测因子。最后，使用逐个分量的梯度增强模型根据预编码的自杀风险评级对每通通话记录进行分类。结果：总共将 77 个迫在眉睫的风险呼叫与 204 个低风险呼叫进行了比较。此外，从每个语音帧中提取了 36 个语音生物标记物。呼叫者性别是一个显着的调节因素（β =–.84，95% CI –0.85，-0.84；t =6.59，P <.001）。候选生物标记物减少到 11 个主要标记物，并为男性和女性开发了不同的模型。使用留一交叉验证，确保没有一个呼叫者的语音帧同时出现在训练和测试数据集中，精度或召回曲线下面积达到 0.985（95% CI 0.97, 1.0）。gamboost 分类模型正确分类了 469,332/470,032（99.85%）个语音帧。结论：本研究展示了在生态有效环境中对即将发生的自杀风险进行客观、有效和经济的评估，并可能应用于实时评估和响应。试验注册：澳大利亚新西兰临床试验注册中心 ACTRN12622000486729；https://www.anzctr.org.au/ACTRN12622000486729.aspx
CB&CDx2024
新鲜与创新：了解 ADC 中的 CDx、LDT 的最新动态、生成式 AI 和无监督学习模型。此外，我们将探索变革性液体生物标记物、非侵入性数字生物标记物和非肿瘤生物标记物。这些见解将使您能够在产品线中实施重大变革，从而为所有患者提供精准医疗。
肾细胞癌的生物标志物及其靶向治疗：综述
肾细胞癌 (RCC) 是最危及生命的泌尿系统恶性肿瘤之一，对放疗和化疗反应不佳。尽管近年来针对 RCC 的靶向治疗取得了巨大进展，但它仍然是最致命的泌尿生殖系统癌症，5 年生存率约为 76%。及时诊断仍然是防止 RCC 进展到转移阶段以及治疗的关键。但由于缺乏针对 RCC 的明确和特异性诊断生物标记物，并且其早期无症状，因此诊断变得非常困难。可靠而独特的分子标记物不仅可以完善诊断，还可以将肿瘤分为亚型，从而为患者提供后续管理和可能的治疗。潜在的生物标记物可以对受 RCC 影响的患者进行更大程度的分层，并有助于制定新的靶向疗法。本综述总结了最有前景的表观遗传学 [DNA 甲基化、microRNA (miRNA；miR) 和长链非编码 RNA (lncRNA)] 和蛋白质生物标记物，这些标记物已知与 RCC 的诊断、癌症进展和转移密切相关，从而强调了它们作为 RCC 非侵入性分子标记物的用途。此外，还将讨论新型分子靶向药物和免疫治疗药物 [如酪氨酸激酶抑制剂和免疫检查点抑制剂 (ICI)] 作为潜在 RCC 治疗药物的原理和开发，以及这些生物标记物在预测靶向治疗反应方面的拟议意义。
针对肝细胞癌的新型尿液游离 DNA 甲基化标记
开发了一种优化的针对肝细胞癌 (HCC) 的甲基化下一代测序检测方法，可直接从尿液中发现与 HCC 相关的甲基化标记物，以进行 HCC 筛查。从 31 名非 HCC 和 30 名 HCC 患者的发现队列中分离的尿液无细胞 DNA (ucfDNA) 用于生物标志物发现，鉴定出 29 个具有差异甲基化区域 (DMR) 的基因。开发了甲基化特异性 qPCR (MSqPCR) 检测方法以验证对应于 8 个基因 (GRASP、CCND2、HOXA9、BMP4、VIM、EMX1、SFRP1 和 ECE) 的选定 DMR。使用存档的 ucfDNA，发现 HCC 患者和非 HCC 患者的 GRASP、HOXA9、BMP4 和 ECE1 的甲基化存在显著差异 (p < 0.05)。使用逻辑回归模型，在 87 名非 HCC 患者和 78 名 HCC 患者的独立训练队列中，将这四种标记物与之前报道的 GSTP1 和 RASSF1A 标记物作为 6 种标记物组合进行评估。6 种标记物组合与 AFP 的 AUROC 为 0.908（95% CI，0.8656–0.9252），显著高于单独使用 AFP（AUROC 0.841（95% CI，0.778–0.904），p = 0.0026）。应用后向选择方法，发现 4 种标记物组合与 6 种标记物组合的性能相似，AFP 的敏感性为 80%，而单独使用 AFP 的敏感性为 29.5%，特异性为 85%。这项研究支持甲基化跨肾 ucfDNA 在 HCC 筛查中的潜在应用。
TruSight Oncology 综合
综合基因组分析 (CGP) 正在改变癌症诊断的面貌。随着可操作的生物标记物、获批疗法和临床试验的数量不断增加，单一生物标记物测试和靶向热点面板无法跟上步伐，从而增加了遗漏关键信息的可能性。此外，这些方法无法检测某些当前或新兴的免疫疗法反应特征，例如肿瘤突变负担 (TMB)。应对不断增加的潜在疗法和生物标记物列表挑战的一种选择是基于下一代测序 (NGS) 的 CGP。在一次测试中，CGP 提供了肿瘤遗传学的全面视图，捕获了数百种生物标记物的信息，并报告了可临床操作的结果，这些结果可导致分子匹配的治疗方案和更好的患者结果。1-6
TIM3/VISTA 检查点和 CD68 巨噬细胞相关标记物的表达与抗 PD1/PDL1 耐药性相关：免疫图谱异质性的影响
摘要 尽管免疫疗法在晚期癌症亚群中取得了显著的有益效果，但大多数患者并没有反应。我们全面评估了与泛癌症环境中的“癌症免疫循环”相关的生物标志物，以了解转移性恶性肿瘤的免疫状况以及抗 PD-1/PD-L1 抑制剂耐药机制。使用临床级 RNA 测序检测对 101 名患有不同恶性肿瘤的患者进行了 51 个癌症免疫循环标志物的检测。总体而言，免疫表型显示多个检查点的过度表达，包括 VISTA（101 名患者中的 15.8%）、PD-L2（10.9%）、TIM3（9.9%）、LAG3（8.9%）、PD-L1（6.9%）和 CTLA4（3.0%）。此外，还观察到巨噬细胞相关标志物（例如CD68 和 CSF1R；11-23%）、代谢免疫逃逸标志物（例如ADORA2A 和 IDO1；9-16%）和 T 细胞启动标志物（例如CD40、GITR、ICOS 和 OX40；4-31%）的异常表达。大多数肿瘤（87.1%，88/101）表达了不同的免疫组合，理论上可操作的生物标志物中位数为 6 种（可通过美国食品和药物管理局批准的药物 [标签内或标签外] 或临床开发中的药物进行药理学处理）。TIM-3、VISTA 和 CD68 的过度表达与抗 PD-1/PD-L1 疗法后无进展生存期 (PFS) 缩短显著相关（在 39 名接受治疗的患者中）（所有 P < .01）。总之，癌症免疫周期生物标志物评估在各种实体肿瘤中都是可行的。替代检查点 TIM-3 和 VISTA 以及巨噬细胞相关标志物 CD68 的高表达与抗 PD-1/PD-L1 疗法后 PFS 明显较差相关。大多数患者具有独特而复杂的免疫表达谱，表明需要定制免疫疗法组合。
使用预后标记物预测意义不明的单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤和多发性骨髓瘤的疾病进展和临床结果。
多发性骨髓瘤 (MM) 是一种无法治愈的浆细胞恶性肿瘤，其分子发病机制复杂且尚未完全了解。意义不明的单克隆丙种球蛋白病 (MGUS) 和冒烟型多发性骨髓瘤 (SMM) 先于 MM 出现，具有不同的风险和疾病进展速度。MM 病例持续的高复发率和死亡率促使人们研究更准确的预后标志物，以预测从 MGUS 和 SMM 进展到 MM，以及识别具有侵袭性疾病的 MM 病例，以便尽早开始有针对性和有效的治疗干预。许多研究都集中于更有效地利用当前的标志物，包括 M 蛋白、血清游离轻链比率、循环肿瘤细胞和浆细胞的免疫表型。基因表达谱和下一代测序正在成为风险分层和治疗反应预测的前沿。将预后标记物纳入并共识到患者的常规诊断检查中，将允许使用个性化的、基于生物的治疗方法，并获得更好的患者治疗效果。