CriMCE:一种通过 CRISPR 介导的盒式交换引入和分离精确无标记编辑的方法 Ioanna Morianou 1、Andrea Crisanti 1,2、Tony Nolan 3、Andrew M. Hammond 1,4,5 * * 通讯作者 作者隶属关系: 1 伦敦帝国理工学院生命科学系,伦敦,英国 2 帕多瓦大学分子医学系,帕多瓦,意大利 3 利物浦热带医学院媒介生物学系,利物浦,英国 4 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院分子微生物学和免疫学系,巴尔的摩,马里兰州,美国 5 Biocentis,Ltd.,伦敦,英国 标题:基于 CRISPR 的无标记编辑方法 关键词:CRISPR;基因组编辑;盒式交换;无标记编辑;基因驱动。摘要 在昆虫基因组中引入小的、未标记的编辑对于研究重要生物学特性(例如抗杀虫剂和遗传控制策略)的分子基础至关重要。CRISPR 基因组工程的进步使这成为可能,但由于编辑率低和缺乏可选择的标记,大多数实验室都难以做到这一点。为了促进精确的无标记编辑的生成和分离,我们开发了一种两步方法,该方法基于 CRISPR 介导的盒式交换 (CriMCE),将标记的占位符用于感兴趣的变体。与以前的方法相比,此策略可用于引入更广泛的潜在编辑,同时整合工作流程。我们通过将三种 SNP 变体设计到冈比亚按蚊的基因组中,提出了原理证明,证明 CriMCE 是一种强大的工具,其编辑率比同源定向修复或主要编辑高 5-41 倍。
图像采集多相ASL协议是我们机构中最常用的序列,具有最佳的图像质量。因此,我们将系列限制在接受该方案的人中,以确保研究人群的可能性。我们应用了以下参数:TR/TE¼5871/11.0 ms;平均数¼1;截面厚度¼6毫米;切片数¼26 - 28;读数¼4螺旋臂640个样品; FOV¼240240毫米3;矩阵¼128128;和体素分辨率¼3.83.8 6.0毫米。在上一个报告中描述了用于获取多相ASL图像的技术的详细信息。12与ASL一起使用T2 Star - 加权血管造影(天鹅)检查所有患者。天鹅参数为TE¼21.5ms; Tr¼37.3ms;翻盖角¼300°;厚度¼1.2毫米;矩阵¼416256; FOV¼220220;切片数¼120。DSA是在Innova IGS 630(GE Healthcare)系统或Alluraclarity(Philips Healthcare)上进行的。进行了股动脉的穿刺和5F动脉鞘的插入后,进行了主要的椎动脉的选择性导管插入和双侧颈内动脉。通过对比度输送系统以5-6 mL/s的注射速率注入7 - 9 mL的对比介质。图像获得的频率分为3个阶段:前3秒钟每秒4帧,然后在接下来的3秒内每秒2帧,然后每秒1帧(随后的alluraclarity中为0.5帧)。
摘要 仙人掌属植物(Opuntia ficus-indica (L.) Mill.)是能够耐受恶劣环境条件的最知名农作物之一。南非是少数拥有大量仙人掌种质资源的国家之一,这些种质资源代表了移地保护种群。然而,人们对该种群的遗传多样性知之甚少。此外,一些基因型在形态上不明显,因此,对于新手农民和研究人员来说,识别种质资源中的样本是一项挑战。本研究旨在使用八个简单序列重复 (SSR) 标记来区分和测量代表南非仙人掌种质资源的 44 个栽培品种的遗传多样性。显然,这些品种具有中等水平的多样性(平均多态性信息含量 PIC = 0.37,Nei 无偏基因多样性 = 0.42),可区分 90% 的品种。使用算术平均数 (UPGMA) 的非加权配对法对品种进行分析,发现主要分为三个聚类,而主坐标分析 (PCoA) 则显示,根据品种在农业中的用途,其聚类不明显。
摘要。这项研究的建立是为了探索甲状腺激素和甲状腺敏感性指数在内的甲状腺激素和慢性肾脏疾病(CKD)在2型糖尿病患者(T2D)中的关联。CKD标记是通过基于血清肌酐(SCR)(EGFRCR)的估计肾小球过滤率(EGFR)定义的,EGFR基于Cystatin C(Cys C)(Cys C)(EGFRCYS)和尿蛋白与蛋白蛋白与crEATININANINE的比例(UACR)。甲状腺参数,包括三碘甲醇(FT3),游离甲状腺素(FT4),甲状腺刺激激素(TSH),FT3/FT4比,TSH INDEX(TSHI)和甲状腺营养性TSH INDEX(TSHI)和THYROTROPH T4抗T4抗性指数(TT4RI),测量。EGFRCYS,EGFRCR和UACR定义的CKD的患病率分别为19.9%,14.1%和50.6%。EGFRCYS和EGFRCR水平随着FT3和FT3/FT4三位数的增加而增加,而UACR水平随着FT3三分线的降低而增加。Spearman的分析表明,FT3和FT3/FT4与EGFRCYS和EGFRCR呈正相关,并与UACR负相关。在逻辑回归分析中,与最低的ft3三位数(≤4.12pmol/l)相比,ckd的调整ORS(egfrcys <60 ml/min/min/1.73 m 2)中ft3中间ft3 tertile(4.12-4.74 pmol/l)(4.12-4.74 pmol/l)和较高的ft3 tertile(> 4.74 pmol/l),调整后,未观察到甲状腺参数与EGRFCR <60 mL/min/1.73 m 2和UACR的显着关联。线性回归分析表明,在调整后的模型中,EGFRCYS与EGFRCR或UACR更强烈。在正常范围内的T2D,FT3的甲状腺功能比例中,是与CKD最密切相关的独立因素。此外,EGFRCYS而不是EGFRCR或UACR是与FT3最相关的CKD标记。
术语Theranostics显然已成为流行语。在很大程度上,这是由于前列腺特异性内存抗原(PSMA) - 靶向放射线的成功所致。这些配体可以用正电子或g的同位素标记,用于成像,或用B-或A -A -SETINT型同位素进行治疗。诊断或治疗性靶向配体是相同或相似的。以PSMA为目标的成像和治疗已迅速成为前10 Y前列腺癌管理的新临床标准,并且正在研究其他疾病中的应用。会议通常在PSMA成像和非PSMA成像之间进行分开,并且已经批准了几种PSMA放射性体进行成像和治疗前列腺癌或正在晚期发育。在这些临床成功之后,已经成立了许多新的生物技术公司,旨在开发新的Theranotic剂。但是,什么使PSMA Theranostics如此成功?在本社论中,我们试图回答这个问题,并反映出在其他核医学其他领域重复PSMA Theranostics成功的必要条件。这样做,我们认为治疗学的意见不应局限于肿瘤学,而是在神经病学,心脏病学以及动态和感染性疾病中的核医学应用中同样或更成功。作为起点,我们将疗法分子定义为分子靶向成像和疗法的组合,其中成像可起到可行的信息,从而实现新的或更有效的疗法。Feinstein等。Feinstein等。这种定义比常用的疗法定义是放射性核素成像疗法的组合,该疗法使用了相同的(类似)靶向分子的(类似)的成像和疗法的组合,这些组合是使用相同的分子靶标的,即基于PSMA基于基于PSMA基于基于PSMA的Terranotostics(1)。neverthe,我们认为它仍然足够具体,可以使疗法学与其他常见的医学成像用途区分开。实际上,大多数用于肿瘤分期的肿瘤学成像不符合我们对疗法成像的定义。这些成像研究可以更好地分层,但不能改善预后,因为它们仅将患者从一个预后组转移到另一个预后组。Feinstein等人描述了这个阶段的迁移。在1985年(2),并为纪念幽默主义者 - 哲学家威尔·罗杰斯(Will Rogers)称为威尔·罗杰斯现象。威尔·罗杰斯(Will Rogers)于1879年出生于俄克拉荷马州,他曾经说过:“当Okies离开俄克拉荷马州并搬到加利福尼亚时,他们提高了两个州的平均情报水平。”威尔·罗杰斯(Will Rogers)指的是1930年代大萧条期间的OKIES出埃及。观察到
半胱氨酸 (Cys) 和蛋氨酸 (Met) 对陆地 S 循环至关重要,因为它们是植物营养和微生物生长所需的碳 (C)、氮 (N) 和硫 (S) 来源。然而,土壤微生物预计会争夺这些 S-氨基酸中的 C、N 和 S。我们假设,由于植物的 C 输入较低,植物生产力低的土壤中的微生物竞争会更激烈。在这里,我们将 14 C 标记的 Cys 和 Met 添加到从海拔驱动的原始草地生产力梯度收集的 5 种土壤中,然后我们用离心排水程序在 60 分钟内测量微生物吸收,然后用 NaOH 捕集器在 48 小时内测量随后的矿化。我们的结果表明,Cys 和 Met 都被土壤微生物迅速吸收,半衰期从 0.34 到 2.14 分钟不等,比通过测量 14 CO 2 释放确定的半衰期快一个数量级(或更多)。微生物从土壤溶液中去除 14 C 和随后释放 14 CO 2 之间存在相当大的延迟,这表明草原土壤中 Cys 和 Met 的降解主要通过生物过程发生。土壤微生物对 Cys 和 Met 的吸收主要由高亲和力运输系统 (0.01 – 0.1 mM) 控制,而亲和力较低的运输系统在较高底物浓度 (1 – 100 mM) 下变得更为重要。此外,在生产力较低、海拔较高的地区,Cys 和 Met 的微生物吸收和矿化率下降,这表明有机 N 和 S 的周转以及随后植物吸收的有效性可能受土壤肥力控制。我们得出结论,尽管 Cys 和 Met 可能代表土壤中 DON 和 DOS 库的小部分,但由于它们在草原土壤中的快速周转和补充率,它们对土壤微生物和植物营养的重要性可能被低估了。
东非医学杂志卷。100号2023年1月1日,使用ITS2和RBCL标记物用于茄科种类识别的DNA条形码kathryn Wanjiku Nderitu,Nairobi大学科学与技术学院生物化学系,P。O.box 30197-00100肯尼亚,精灵阿格尔,科学技术学院,内罗毕大学科学技术学院,P。O。box 30197- 00100,肯尼亚,以西结·梅查(Ezekiel Mecha),内罗毕大学科学技术学院生物化学系框30197- 00100肯尼亚,阿顿nyachieo,灵长类动物研究所,Karen -Nairobi,P。O.框24481- 00502,肯尼亚。通讯作者:内罗毕大学生物化学系Kathryn Wanjiku Nderitu,P。O.框30197 -00100,肯尼亚内罗毕。电子邮件:knderitu276@gmail.com
单域抗体片段 (sdAbs) 是靶向 a 粒子治疗的理想选择,尤其是使用 211 At 时,因为它们在肿瘤中快速积累并从正常组织中清除。在这里,我们评估了这种策略的治疗潜力,使用 5F7 和 VHH_1028 — 2 个 sdAbs,它们以高亲和力结合人类表皮生长因子受体 2 型 (HER2) 的结构域 IV。方法:使用 N-琥珀酰亚胺基-3-211 At-astato-5-胍基甲基苯甲酸酯 (iso-211 At-SAGMB) 标记 HER2 特异性 sdAbs 和 HER2 无关的 VHH_2001。比较了 iso-211 At-SAGMB-5F7 和 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001 对 HER2 表达的 BT474 乳腺癌细胞的细胞毒性。在皮下移植 BT474 异种移植瘤的小鼠中进行了三项实验,以评估单剂量 iso-211 At-SAGMB-5F7(0.7 – 3.0 MBq)、iso-211 At-SAGMB-VHH_1028(1.0 – 3.0 MBq)以及 iso-211 At-SAGMB-VHH_1028 和 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001(1.0 MBq)的治疗效果。结果:暴露于 iso-211 At-SAGMB-5F7(D 0 5 1.313 kBq/mL)后,BT474 细胞的克隆形成存活率降低,而 iso-211 At-SAGMB-VHH_2001 无效。使用 211 At 标记的 HER2 特异性 5F7 和 VHH_1028 观察到剂量依赖性肿瘤生长抑制,但使用 HER2 无关的 VHH_2001 则未观察到。在 3.0 MBq 剂量下,使用 iso-211 At-SAGMB-5F7 治疗的 4 只小鼠中有 3 只出现肿瘤完全消退,使用 iso-211 At-SAGMB-VHH_1028 治疗的 11 只小鼠中有 8 只出现肿瘤完全消退;中位生存期分别延长了 495% 和 414%。结论:将快速内化、高亲和力的 HER2 靶向 sdAb 与 iso-211 At-SAGMB 残留修复剂相结合,是一种针对 HER2 表达癌症的靶向 α 粒子治疗的有前途的策略。
摘要:将化疗药物特异性地递送至癌细胞可提高肿瘤局部药物剂量,从而杀死更多癌细胞,同时减少对其他组织的副作用,进而改善肿瘤学和生活质量。立方体是一种液晶脂质纳米颗粒,是递送化疗药物的潜在载体,具有生物相容性、稳定封装和疏水性或亲水性药物高载药量等优势。然而,与被动积累相比,载药立方体主动靶向癌细胞仍相对未被充分探索。我们配制并表征了装载潜在抗癌药物铜乙酰丙酮的立方体,并使用点击化学偶联透明质酸 (HA)(细胞表面受体 CD44 的配体)对其表面进行功能化。CD44 在包括乳腺癌和结直肠癌在内的多种癌症类型中过度表达。 HA 标记、载有铜乙酰丙酮的立方体的平均流体动力学直径为 152 nm,内部纳米结构基于空间群 Im3m。这些立方体被两种表达 CD44 的癌细胞系(MDA-MB-231 和 HT29,代表乳腺癌和结肠癌)有效吸收,但未被两种 CD44 阴性细胞系(MCF-7 乳腺癌和 HEK-293 肾细胞)吸收。HA 标记的立方体在 CD44 阳性细胞中引起的细胞死亡明显多于未靶向的立方体,证明了靶向的价值。CD44 阴性细胞对两者的相对抵抗力相同,证明了靶向的特异性。细胞死亡被描述为凋亡。在 2D 培养和 3D 球体中均明显存在特异性靶向和细胞死亡。我们得出结论,HA 标记、载有铜乙酰丙酮的立方体具有作为选择性靶向表达 CD44 的肿瘤的有效治疗方法的巨大潜力。关键词:立方体、CD44 受体、透明质酸、液晶脂质纳米颗粒、肿瘤球体 ■ 简介