野生生菜(Lactuca Aff。Canadensis L.)属于Asteraceae家族,是在巴西进行的,可能起源于非洲,亚洲,欧洲和北美。普遍称为加拿大生菜,是一种非常规的绿叶蔬菜。对该物种的研究在巴西很少,其科学名称在专家之间进行了辩论。它具有很高的形态变异性和有争议的植物分类。这项研究表征了气孔,组织了核型,并确定了四种野生生菜形态型的核DNA含量,以促进正确的分类。使用的遗传物质是从UFLA中的非规定蔬菜种质中获取的。野生生菜形态型的叶子是最不受欢迎的,在弱点表皮中有更多的气孔。在形态型(绿色和紫色)之间以及光滑的紫色类型(狭窄的叶子和宽叶)之间存在相似之处。在四种形态型中的染色体数量(2n = 18)或DNA含量中没有发现变化。野生生菜的形态的分离与形态学分类或核学数据不符。评估的四种形态型被放置在同一物种下,与其他研究相比,获得的结果导致我们推断出野生乳酸的四种形态型属于该物种L. indica l。进一步的研究可以提供对该物种进化史的见解。
背景:体细胞染色体嵌合体是指个体中存在染色体组(例如正常和异常)不同的细胞群。染色体嵌合体与多种疾病状况和衰老有关。研究表明,体细胞基因组变异的染色体异常细胞数量可能不稳定。因此,嵌合率在个体发育过程中会动态变化。此外,疾病严重程度和嵌合率之间似乎存在相关性。高嵌合率通常与严重的疾病表型有关,而低水平嵌合通常见于较轻的疾病表型或可能未受影响的个体。在此,我们假设体细胞染色体嵌合体的动态性质可能是由遗传-环境相互作用引起的,从而为相关疾病和衰老创造了治疗机会。结论:遗传-环境相互作用似乎促成了体细胞嵌合体的动态性质。因此,对细胞群的外部影响可能会改变核型正常和异常细胞的比例,有利于增加没有染色体重排的细胞数量。考虑到体细胞染色体嵌合体在健康和疾病中的作用,我们假设人为改变体细胞嵌合体率可能对患有相关疾病和/或行为或生殖问题的个体有益。此外,此类治疗程序可能有助于抗衰老策略(即通过降低染色体嵌合体水平来实现年轻化),从而延长寿命。最后,该假设似乎适用于任何类型的体细胞嵌合体。
摘要背景/目的:染色体不稳定性是不同类型癌症(包括结直肠癌)进展的一个众所周知的因素。染色体不稳定性导致严重的核型重排和非整倍体。四倍体构成了致癌过程中多倍体/非整倍体级联的中间阶段,四倍体细胞对化疗特别有抵抗力。抑制有丝分裂蛋白 polo 样激酶 1 (PLK1) 是否会阻止四倍体结肠癌细胞的存活尚不清楚。方法:用 siPLK1 转染二倍体和四倍体细胞或用 PLK1 抑制剂 Bi2536 与纺锤体毒药联合处理。通过结晶紫染色和克隆形成测定评估细胞毒性。流式细胞术评估分析了许多细胞凋亡参数和细胞周期阶段。使用 CompuSyn 软件计算了 Bi2536 与紫杉醇、长春新碱或秋水仙碱之间的协同作用。结果:抑制或消除 PLK1 可阻止结肠癌细胞(特别是四倍体细胞)的存活。PLK 抑制引起的细胞死亡是由于有丝分裂滑移,随后激活了细胞凋亡的内在途径。我们进一步证明,用 PLK1 抑制剂和微管聚合抑制剂长春新碱或秋水仙碱(而不是微管解聚抑制剂紫杉醇)联合治疗四倍体结肠癌细胞会产生致命的协同效应。结论:PLK1 抑制与微管靶向化学物质相结合,可作为针对四倍体癌细胞的有效治疗策略。
在大多数生物中,整个基因组在整个生命周期中都保持不变。然而,也有一些物种例外,它们的基因组在发育过程中会通过一种称为程序性 DNA 消除 (PDE) 的过程减少。在人类和猪的寄生虫蛔虫中,PDE 发生在胚胎发生的 4 到 16 个细胞阶段,此时生殖系染色体碎裂,特定 DNA 序列在所有体细胞中可重复丢失。PDE 是在 120 多年前在蛔虫中发现的,但直到最近人们才对其分子细节知之甚少。基因组测序显示,蛔虫中大约 1,000 个生殖系表达基因被消除,这表明 PDE 是一种基因沉默机制。在 PDE 期间,所有生殖系染色体末端都会被去除和重塑。此外,PDE 通过分裂许多生殖系染色体来增加体细胞基因组中的染色体数量。比较基因组学表明这些生殖系染色体源自融合事件。PDE 在融合位点将这些染色体分开。这些观察结果表明 PDE 在染色体核型和进化中发挥作用。此外,对其他寄生和自由生活线虫中 PDE 的比较分析表明 PDE 具有保守的特征,表明它具有重要的生物学意义。我们总结了关于蛔虫及其亲属中 PDE 的已知信息。我们还讨论了这些人类和兽医动物寄生虫中 PDE 的其他潜在功能、机制和进化。
摘要:髓母细胞瘤是一种儿童脑恶性肿瘤,由四个转录亚型组成。结构和数值非整倍性在所有亚型中都很常见,尽管它们在第 3 组和第 4 组髓母细胞瘤以及 SHH 髓母细胞瘤亚型 SHH α 中尤为明显。这表明染色体不稳定性 (CIN),即导致非整倍性的过程,是髓母细胞瘤病理生理学中的重要因素。然而,尚不清楚髓母细胞瘤中是否存在持续的 CIN,或者 CIN 是否会影响发育中的小脑并促进肿瘤形成。为了研究这一点,我们对单个髓母细胞瘤细胞进行了核型分析,并证明了存在具有独特拷贝数变异的不同肿瘤细胞克隆,这表明存在持续的 CIN。我们还发现,在 SHH 髓母细胞瘤和推测的肿瘤细胞谱系的高度增殖区中,与 DNA 复制、修复和有丝分裂相关的过程丰富,后者也对基因毒性应激敏感。然而,当使用转基因小鼠模型用诱导 CIN 的遗传病变挑战这些肿瘤细胞源时,我们没有发现小脑中存在大染色体畸变或髓母细胞瘤形成的证据。因此,我们得出结论,如果没有特定基因突变的背景,CIN 在体内发育中的小脑中是不可接受的,因此,CIN 本身不足以引发髓母细胞瘤。
间充质干细胞(MSC)是具有分化为其他类型细胞的成年干细胞。此外,MSC可以调节免疫反应并促进组织修复。由于其性质,主要MSC在治疗各种疾病方面具有显着的应用潜力。然而,主要MSC还具有限制寿命,供体变异性,源限制和异质性等局限性,这阻碍了临床前应用中主要MSC的利用。这些约束可以通过永生化来克服。细胞永生技术可以建立保留正常生理学的新细胞模型,表现出最小的细胞异质性并获得不确定的寿命。在这项研究中,我们通过稳定表达人端粒酶逆转录酶(HTERT)基因在正常的人类原发性骨髓 - 衍生的间充质干细胞(BM-MSC)中产生了一个永生的克隆细胞系。这种永生的细胞系已培养超过200天,并继续繁殖超过120个人口加倍。永生的BM-MSC表现出正常的核型,并且与父母原代细胞具有相似的细胞生长曲线和细胞的两倍时间。永生的BM-MSC对CD73,CD90和CD105呈阳性,对于CD14,CD34和CD45为阴性。在这项研究中,我们还研究了这些永生的BM-MSC的脂肪生成,成骨和软骨分化能力。总而言之,永生的BM-MSC提出了一种新的细胞模型,该模型避免了原代细胞的局限性,可以用作细胞和基因治疗的有价值的工具。
图1。T(14; 19)(Q11.2; Q13.3)在T8ML-1中的基因组特征。 (a)光谱核分型(天空)描绘了来自T8ML-1核型的G带,未加工和伪色彩的染色体图像,显示了多个PLE改变。 红色和绿色箭头分别表示DER(14)和DER(19)易位伙伴;白色箭头显示非参与者断点。 天空揭示了与持续存在的患者衍生的亚克隆一致的异质但稳定的克隆下结构。 (b)G频段显示了14Q11.2和19Q13.3的T(14; 19)的断点。 (c/d)14q11.2(c)和19q13.3(d)的Cytoscan图显示了基因组拷贝数图。 图插图显示了使用Tilepath克隆以及映射BAC(C)和Fosmid(D)克隆的映射数据的荧光原位杂交(FISH)。 请注意基于鱼图像的断点分配,描绘了14q11.2和19q13.3分别位于Tra@ dowr@下游增强子和下游短形式PVRL2的断点。 差异信号强度符合焦点扩增,如两个基因座的拷贝数图所示。 如前所述,进行了鱼类和基因组阵列。 使用HISKY系统(Applied Spectral Imaging,Edingen,Germany)捕获了细胞遗传学图像,该系统配置为AxioImager D1 Micro-Scope(Zeiss,Jena,Germany)。 如参考文献中所述,Siebert Lab友好地捐赠了克隆。 10,或从美国加利福尼亚州奥克兰市的BACPAC资源,儿童医院购买,并由Nick Translation用Dutp Fluors Dy495(绿色),DY590(RED)和DY547(黄色)(黄色)(黄色)购买。T(14; 19)(Q11.2; Q13.3)在T8ML-1中的基因组特征。(a)光谱核分型(天空)描绘了来自T8ML-1核型的G带,未加工和伪色彩的染色体图像,显示了多个PLE改变。红色和绿色箭头分别表示DER(14)和DER(19)易位伙伴;白色箭头显示非参与者断点。天空揭示了与持续存在的患者衍生的亚克隆一致的异质但稳定的克隆下结构。(b)G频段显示了14Q11.2和19Q13.3的T(14; 19)的断点。(c/d)14q11.2(c)和19q13.3(d)的Cytoscan图显示了基因组拷贝数图。图插图显示了使用Tilepath克隆以及映射BAC(C)和Fosmid(D)克隆的映射数据的荧光原位杂交(FISH)。请注意基于鱼图像的断点分配,描绘了14q11.2和19q13.3分别位于Tra@ dowr@下游增强子和下游短形式PVRL2的断点。差异信号强度符合焦点扩增,如两个基因座的拷贝数图所示。鱼类和基因组阵列。使用HISKY系统(Applied Spectral Imaging,Edingen,Germany)捕获了细胞遗传学图像,该系统配置为AxioImager D1 Micro-Scope(Zeiss,Jena,Germany)。如参考文献中所述,Siebert Lab友好地捐赠了克隆。10,或从美国加利福尼亚州奥克兰市的BACPAC资源,儿童医院购买,并由Nick Translation用Dutp Fluors Dy495(绿色),DY590(RED)和DY547(黄色)(黄色)(黄色)购买。基因组阵列数据由Cytoscan高密度基因组阵列(Affymetrix,Thermo Fischer,Darmstadt,Germany)提供。
分离染色体的流式细胞术是细胞遗传学的一种新方法,可快速测量单个中期染色体。在这种方法中,用适当的荧光染料染色的水悬浮液中的染色体被限制在激发染料的窄激光束中高速流动。发射的荧光通过光度法测量,累积的数据形成染色体荧光的频率分布。该频率分布的峰值归因于单个染色体或具有相似荧光的染色体组;峰值平均值与染色体荧光成正比,峰值面积与染色体出现频率成正比。因此,频率分布可作为核型(1、2)。此外,流式分选可根据染色体的染色特性分离染色体(3、4),这与传统的中期染色体纯化方法不同,后者依赖于速度或等密度沉降、区域离心或选择性过滤(5)。纯化单个中期染色体很重要,原因如下。富集或纯染色体部分已进行生化分析,以提供有关 DNA 或蛋白质结构的信息(6),将遗传信息转移到整个细胞(7-9),或通过体外杂交绘制基因图谱(10)。但一般来说,传统技术无法提供足够纯度的染色体,无法进行高分辨率生物或生化研究。通过基于溴化乙锭荧光的流式分选,我们以 90% 的纯度将雄性鹿 Muntiocus muntjak (2n = 7) (4) 的每个染色体和中国仓鼠 M3-1 细胞系的 14 种染色体类型分离成 8 个染色体组 (1, 3)。在我们之前对溴化乙锭染色的人类染色体的研究中,我们仅从雄性 (2n = 46) 的 24 种染色体类型中分辨出 8 个染色体组 (2, 3)。在本研究中,使用 DNA 荧光染料 33258 Hoechst 和改进的仪器,
hiPSC 培养:来自健康受试者的 hiPSC 系来自再生医学计划,AD hiPSC 来自 Coriell。通过 Sanger 测序和液滴数字 PCR 确认存在家族性突变。在创建主细胞库和工作细胞库之前,对所有细胞进行了活力、无菌性、细胞系身份、核型和多能性标志物表达测试。hiPSC 在基质胶上培养,如 StemCell Technologies(mTeSRTM1 手册中的人类多能干细胞维护)所述,使用 mTeSR1 作为细胞培养基和温和的解离剂进行传代。如果观察到自发分化,则使用 ReLeaSer(StemCell Technologies)来维持未分化培养。 NGN2 诱导的稳定 iPSC 的生成:健康对照和 AD 供体的 hiPSC 被编码 NGN2 的慢病毒转导,并在预定浓度的抗生素选择下放置 10 天,以生成可诱导表达 NGN2 的 hiPSC 多克隆稳定池。NGN2 稳定的 iPSC 向皮质神经元的分化:将 hiPSC 重新接种为单细胞,并通过添加强力霉素诱导 NGN2 的表达,以将 iPSC 分化为神经元前体 (NPC)。单次接种和诱导 NGN2 4 天后,将 NPC 用胰蛋白酶消化并重新接种到 PLO/matrigel 包被的 96 孔板中,密度为 30,000 个细胞/cm 2 。在 NPC 接种 2 天后,用预定的最佳浓度的 Ara-C 处理培养物以防止星形胶质细胞的出现。
这项研究旨在验证急性髓样白血病(AML)的老年人的新欧洲白血病网(ELN)2022标准,并确定与三种治疗组中的相似细胞遗传学和突变特性相似的类似细胞遗传学和突变特性相关的类似细胞遗传学和突变特性的群集的群体(IC),hma hma yshylyy ande ande ande anme hamyylys hamylys andhylys andhylys andy, Venetoclax(HMA/VEN)。这项研究包括279名接受IC(n = 131),HMA(n = 76)和HMA/VEN(n = 72)的患者(≥60岁),2017年7月至2021年10月。根据ELN 2022风险分层,两组之间的存活率没有显着差异。无监督的分层聚类分析基于治疗类型,具有不同生存结果的九个基因组簇(C1-9)。例如,C4(核心结合因子-AML的主要因素)在IC组中显示出有利的预后,但在HMA或HMA/HMA/VEN组中却没有。HMA/VEN组在许多群集中的结果比HMA组更好(C1、2、3和5);但是,与单独使用C7和C9中的HMA相比,在HMA或IC中添加VEN并不能改善生存结果(-5,DEL(5Q),-7,-17,-17/ABN(17p),复杂的核型和突变的TP53)。该研究强调了AML老年人ELN Genet IC风险分层的局限性。它强调了一种更全面的方法,该方法考虑了同时发生的体细胞突变来指导AML老年人的治疗选择。