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真核生物可能在坟墓疾病的肠道微生物中起重要的生态作用
在过去的几十年中，全球自身免疫性疾病的流行迅速增长。越来越多的证据将肠道营养不良与各种自身免疫性疾病的发作联系起来。由于高吞吐量测序技术的显着进步，肠道微生物组研究的数量有所增加。但是，它们主要集中在细菌上，因此我们对人肠道微生物生态系统中真核微生物的作用和意义的理解仍然非常有限。在这里，我们选择了Graves疾病（GD）作为一种自身免疫性疾病模型，并研究了肠道多杀伤力（细菌，真菌和生物学家）从健康控制，患病和药物治疗的康复患者中的微生物群落。结果表明，GD中的生理变化增加了细菌社区组装的分散过程，并增加了真核社区组装的均匀选择过程。恢复的患者与健康对照组具有相似的细菌和原生动物，但没有真菌的社区组装过程。此外，与细菌相比，真核生物（真菌和生物学家）在肠道生态系统功能中起着更重要的作用。总体而言，这项研究简要了解了真核生物对人类肠道和免疫稳态的潜在贡献及其对治疗干预措施的潜在影响。
一个高质量的基因组和两个针对新的梅托纳斯种类的转录组数据集，这是一个深部的真核生物
mantamonads被认为代表了真核生物树中的“孤儿”谱系，可能在真核生物根部最常假定的位置附近分支。最近的系统基因分析将它们与“ crums”超组的一部分以及胶状果糖和核纤维相同。这个超组似乎是在氨甲基底部分支的，这对于理解真核生物的深层进化历史至关重要。但是，缺乏代表性物种和与之相关的完整基因组数据阻碍了其生物学和进化的研究。在这里，我们隔离并描述了两种新的Mantamonads，Mantamonas vickermani sp。nov。和mantamonas sphyraenae sp。nov。，对于我们生成的转录组序列数据以及后者的高质量基因组。Sphyraenae基因组的估计尺寸为25 MB；我们的从头组装似乎是高度连续的，并具有9,416个预测的蛋白质编码基因。这个近染色体规模的基因组组装是CRUMS超级组的第一个描述。
Au（iii），pt（iv），pd（ii）和rh的吸附（... ） 全局PM2.5暴露和不平等 通过机器学习技术对某些图形结构的模糊和清晰的计算分析 颈动脉血运重建可改善颈动脉狭窄患者的认知 关于公共支持AI安全监督的调查证据 向量选择，矢量惊喜 抗体官能化基于MXENE的电化学生物传感器，用于维生素D缺乏症的护理点检测 后代种植 真核生物中自动发光成像的改进途径 缺氧对成人和新生犬心室心肌的细胞电活活性的影响 有效的隐式约束处理方法用于约束优化问题 世界视图 胸腺真菌孢子 前期
这项研究研究了使用市售活性炭（AC）同时回收贵金离子。在通过微波辐射增强的封闭批处理反应器中进行吸附，从而产生高压和高温条件。检查了溶液的交流质量，过程，过程，温度，pH和离子强度的影响。高温，高压和微波辐射被证明是化学激活的有效手段，导致了近100％的吸附效率。建议微波辐射显着增加活性碳表面的局部温度，从而改变吸附机理。与没有微波支持的传统批处理反应堆相比，这种增强导致了更高的回收率。结果证明了该方法有效金属回收的重要潜力。
遍布全球海洋的原核生物病毒编码的辅助代谢基因
©作者2024。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http://creativecommons.org/licenses/4.0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//creativecom- mons.org/publicdomain/zero/zero/1.0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
使用基因序列作为原核生物命名的类型
a 洛桑大学和大学医院中心微生物研究所细胞内细菌研究中心，Bugnon 48, 1011，洛桑，瑞士 b 马里兰大学牙科学院微生物发病机制系，美国马里兰州巴尔的摩 c 苏黎世大学兽医学院兽医病理学研究所病理生物学系，Winterthurerstrasse 268, CH-8057，苏黎世，瑞士 d 华盛顿大学全球健康系，美国华盛顿州西雅图 e 加州大学旧金山分校医学院医学和儿科系，美国加利福尼亚州奥克兰 f 堪萨斯大学分子生物科学系，美国堪萨斯州劳伦斯 g 维也纳大学微生物学和环境系统科学中心，1090，维也纳，奥地利 h 自由大学医学中心医学微生物学和感染控制系免疫遗传学实验室，荷兰阿姆斯特丹 i 公共卫生研究所健康基因组学 (IPHG)，遗传学和细胞生物学系，研究学院 GROW (肿瘤学和发育生物学学院)，马斯特里赫特大学健康、医学和生命科学学院，荷兰马斯特里赫特 j 荷兰沙眼衣原体参考实验室，医学微生物学和感染控制系，自由大学医学中心，荷兰阿姆斯特丹 k 内布拉斯加大学医学中心病理学和微生物学系，美国内布拉斯加州奥马哈 l 阿姆斯特丹大学阿姆斯特丹 UMC 医学微生物学系，荷兰阿姆斯特丹 m 赫尔辛基大学和赫尔辛基大学医院病毒学系，芬兰赫尔辛基 n 基因学研究中心，阳光海岸大学，昆士兰州，澳大利亚 o 杜克大学分子遗传学和微生物学系，北卡罗来纳州达勒姆，27710，美国 p 根特大学生物科学工程学院动物科学与水生生态学系，Coupure Links 653, B-9000, 根特, 比利时
真核和原核生物微生物群的相互作用
摘要：近年来，越来越多地探索了构成宿主体内微生物和宿主体内微生物社区之间关系的性质。微生物，包括细菌，古细菌，病毒，寄生虫和真菌，经常与宿主共同发展。在人类中，微生物群的结构和多样性根据宿主的免疫力，饮食，环境，年龄，生理和代谢状况，医学实践（例如抗生素治疗），气候，季节和宿主遗传学而有所不同。最近下一代测序（NGS）技术的出现增强了观察能力，并可以更好地理解微生物群中不同微生物之间的关系。宿主与其微生物群之间的相互作用已成为对公共卫生应用具有治疗和预防兴趣的微生物研究领域。本综述旨在评估原核生物和真核群落之间相互作用的当前知识。在分析了研究中使用的元基因组方法的简要描述后，我们总结了可用出版物的发现，描述了细菌群落与原生动物，蠕虫，蠕虫和真菌之间的相互作用，在实验模型中或在人类中或在人类中。总体而言，我们观察到在某些微生物可以改善宿主的健康状况的情况下，有益的影响存在，而其他微生物的存在与病理学有关，从而导致对人类健康的不利影响。
原核生物中温度和营养限制的全局DNA签名
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年1月13日。 https://doi.org/10.1101/2025.01.13.632720 doi：Biorxiv Preprint
真核生物FES解放酶的综合结构方法
silvia.onesti@elettra.eu解旋酶是必不可少的，无处不在的酶，在各种细胞过程中起着关键作用，从DNA复制到修复，重组以及RNA翻译和运输。由于它们在病毒，细菌和真核细胞中的重要作用，它们正成为一类新的抗菌，抗病毒和蚂蚁癌药物靶标。通过解决/重塑各种非典型的DNA结构（例如G-四链体，Triplexe，holliday连接器，以及流离失所环（D-ROOPS和R-Loops））来发挥专业和特定功能：在这些主要作用中，有两个家族由Helicases of Helicases of Helicases of Helicases of Helicases formals of Family，扮演的是helicase of Helicases famessemass famesse formals formemase forme of Helicase，Floop femers of Helicases，Floops。含有FES群体的解旋酶无处不在，但其确切的作用机理知之甚少。特别是，对于FANCJ，DDX11和RTEL1，没有任何与医学上的与医学上的成员相关的结构信息。固有构象柔韧性，FES群集的稳定性和大小的结合使它们具有挑战性的结构生物学目标。
从复杂的陆地栖息地恢复高度连续的基因组，揭示了超过 15,000 种新的原核生物物种，并扩大了对土壤和沉积物微生物群落的表征
基因组对于理解微生物生态学和进化至关重要。高通量、长读长 DNA 测序的出现使得从环境样本中大规模恢复微生物基因组成为可能。然而，由于这些环境极其复杂，扩大土壤和沉积物的微生物基因组目录一直具有挑战性。在这里，我们对在丹麦收集的 154 个土壤和沉积物样本进行了深度、长读长纳米孔测序，并通过优化的生物信息学流程恢复了 15,314 个新微生物物种的基因组，其中包括 4,757 个高质量基因组。恢复的微生物基因组涵盖 1,086 个新属，并为 612 个先前已知的属提供了第一个高质量参考基因组，将原核生物生命树的系统发育多样性扩大了 8%。长读长组装体还能够恢复数千个完整的 rRNA 24 操纵子、生物合成基因簇和 CRISPR-Cas 系统，而这些系统在之前的陆地基因组目录中都未被充分代表且高度碎片化。此外，将恢复的 MAG 整合到公共基因组数据库中可显著提高土壤和沉积物宏基因组数据集的物种级分类率，从而增强陆地微生物组表征。通过这项研究，我们证明了长读长 29 测序和优化的生物信息学能够以经济高效的方式从高度复杂的生态系统中恢复高质量的微生物 30 基因组，而生态系统仍然是最大的未开发生物多样性来源，可用于扩展基因组数据库和填补生命之树的空白。32
对疟原虫传播所必需的生育基因进行系统性筛查，揭示了不同真核生物性别的保守方面
Claire Sayers，1、2、3 Vikash Pandey，1、2 Arjun Balakrishnan，1、2 Katharine Michie，4 Dennis Svedberg，5、7 Mirjam Hunziker，1、2 Mercedes Pardo，6 Jyoti Choudhary，6 Ronnie Berntsson，5、7 和 Oliver Billker 1、2、8、* 1 瑞典分子感染医学实验室，于默奥大学，于默奥，瑞典 2 于默奥大学分子生物学系，于默奥，瑞典 3 新南威尔士大学生物医学学院，悉尼，新南威尔士州，澳大利亚 4 新南威尔士大学 Mark Wainwright 分析中心，悉尼，新南威尔士州，澳大利亚 5 于默奥大学医学生物化学和生物物理学系，于默奥，瑞典 6 癌症研究所研究，英国伦敦 Chester Beatty 实验室 7 瑞典于默奥大学瓦伦堡分子医学中心 8 主要联系人 *通信地址：oliver.billker@umu.se https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.10.008