基因组 PCR 是分子生物学的基础,包括两个关键步骤:DNA 提取和扩增。酵母 DNA 提取的主要挑战是细胞壁的破坏,这直接影响提取效率。在本研究中,我们使用了文献中报道的几种酵母基因组提取方法,例如玻璃珠法 [7] 、LiAc [8] 和 NaOH 法 [9] 。NaOH 法利用强碱性环境溶解和变性蛋白质,破坏细胞和核膜,并使核酸酶失活,从而无需影响其一级结构即可释放 DNA。另一方面,LiAc 法使用 LiAc 和 SDS 暂时透化酵母细胞,使 DNA 自由通过。SDS 是一种阴离子洗涤剂,可去除污染蛋白质,而乙醇可沉淀和浓缩 DNA。LiCl 遵循与 LiAc 类似的原理。玻璃珠法是一种物理方法,通过高速摇晃过程中的机械摩擦破坏细胞壁。本研究还测试了一种能够水解真菌细胞壁的酶 Lyticase,并优化了直接基因组提取的方案。
编码层粘连蛋白A和C(层粘连蛋白A/C)的LMNA基因(核层层的主要成分)会导致包括扩张心肌病(DCM)在内的椎板病,但尚未完全阐明潜在的分子机制。在此,通过利用单细胞RNA测序(RNA-SEQ),使用测序(ATAC-SEQ),蛋白质阵列和电子显微镜分析来实现转疗酶 - 可访问的染色质测定,我们表明,通过转疗法造成型号的结构成熟,不足在核膜上,Q353R -LMNA - 相关DCM的发病机理是基础的。抑制河马途径可挽救TEAD1在LMNA突变体心肌细胞中通过TEAD1挽救心脏发育基因的失调。来自DCM患者具有LMNA突变的患者心脏组织的单细胞RNA-Seq,证实了TEAD1靶基因的表达失调。我们的结果提出了一种用于转录失调作为LMNA相关DCM的潜在治疗方法的信息。
对于各种类型的听力损失,但当前的治疗方案仍主要限于声音放大和人工耳蜗(Muller&Barr-Gillespie,2015; Schilder等,2018)。SYNE4中的变体(含有核包膜家族成员4)的变体会导致以色列,英国和土耳其个人的常染色体隐性进行性,高调听力损失(Panelapp。; Horn等人,2013年; Masterson等人,2018年)。syne4代码为蛋白质Nesprin-4编码,核骨骼和细胞骨架(LINC)复合物的接头成员(Roux等,2009)。Nesprins位于外部核膜上,它们与内部核膜太阳蛋白相互作用,并与细胞质细胞骨架元素(如肌动蛋白和中间丝)以及运动蛋白以及诸如驱动蛋白(Cartwright&KarakakeSogoglou,2014年)等运动蛋白。缺乏SYNE4或SUN1的小鼠表现出渐进的听力损失,让人联想到DFNB76;在SYNE4基因敲除小鼠(SYNE4 /)中,毛细胞正常发展,但外毛细胞(OHC)核逐渐失去其基础位置,导致随后的OHC变性(Horn等,2013)。在动物模型中的初步结果确定腺相关病毒(AAV)是聋哑基因治疗的有前途的候选者(Landegger等,2017; Akil等,2019; Isgrig et al,2019; Isgrig et al,2019; Nist-Lund等,2019)。AAV似乎很少引起免疫反应,重组AAVs以非常低的速率整合到宿主中,从而降低了遗传毒性的风险(Nakai等,2001)。天然AAV血清型的初始特征表明内耳细胞类型的转移率相对较低,尤其是OHC(Kilpatrick等,2011)。然而,最近开发的合成AAV Capsids似乎已经克服了这一障碍。已显示AAV9-PHP.B在小鼠和非人类灵长类动物中以高速率转导内毛细胞和外毛细胞(Gyorgy等,2019; Ivanchenko等,2020; Lee等,2020)。在这项研究中,我们将SYNE4 /小鼠用作DFNB76隐性耳聋的模型,以开发基于AAV9-PHP.B的这种形式的人类耳聋的基因治疗作为向量。为转导OHC的形态恢复加上形态恢复,我们观察到了增强的OHC存活,改善了听觉的脑干反应(ABR)以及恢复的失真产物耳声发射(DPOAE)。此外,我们证明了内耳的功能恢复足以驱动
•染色质网络凝结,螺纹变短,更厚,可见为染色体。•同源染色体成对排列,以使每对的两个染色体并排躺在交叉过程中形成二价。•每个同源染色体都可以看到,因为两种染色单体由丝粒连接。单个染色体的这些相同的染色单体称为姐妹染色质被。•交叉发生在同源染色体之间。同源染色体并排躺在。他们的非姐姐染色质酸重叠并在称为chiasmata(单数:chiasma)的点上触摸。染色单体片段分解并在chiasmata上交换。以这种方式,遗传物质在同源染色体之间交换以形成重组染色质被。•跨越跨性别物质和父亲染色体之间的遗传物质通过改组或重组来引入遗传变异。•核仁和核膜消失。•在动物细胞中,中心体分裂和成对的中心元素移至细胞的相对极。•纺锤体纤维之间会在中心纤维之间形成纺锤体。
•染色质网络凝结,螺纹变短,更厚,可见为染色体。•同源染色体成对排列,以使每对的两个染色体并排躺在交叉过程中形成二价。•每个同源染色体都可以看到,因为两种染色单体由丝粒连接。单个染色体的这些相同的染色单体称为姐妹染色质被。•交叉发生在同源染色体之间。同源染色体并排躺在。他们的非姐姐染色质酸重叠并在称为chiasmata(单数:chiasma)的点上触摸。染色单体片段分解并在chiasmata上交换。以这种方式,遗传物质在同源染色体之间交换以形成重组染色质被。•跨越跨性别物质和父亲染色体之间的遗传物质通过改组或重组来引入遗传变异。•核仁和核膜消失。•在动物细胞中,中心体分裂和成对的中心元素移至细胞的相对极。•纺锤体纤维之间会在中心纤维之间形成纺锤体。
单个粒子冷冻EM可以通过将嵌入在纳米厚的玻璃体冰中的几百万个纯化的蛋白质颗粒可视化到几百万纯化的蛋白质颗粒,从而重建蛋白质的接近原子或什至原子分辨率3D蛋白质。这对应于纯化蛋白质的皮克图,这些蛋白质可以从几千个细胞中分离出来。因此,Cryo-Em具有最敏感的分析方法之一,该方法提供了高分辨率蛋白质结构作为读数。实际上,准备低温EM网格需要超过一百万倍的起始生物材料。为了缩小差距,我们开发了一种微分离(MISO)方法,该方法将基于微流体的蛋白质纯化与冷冻EM网格制剂相结合。我们验证了可溶性细菌和真核膜蛋白的方法。我们表明,Miso可以从一个微克的靶蛋白微克开始,并在几个小时内从细胞到冷冻EM网格。这将纯化缩短了几百到几千倍,并为迄今无法访问的蛋白质的结构表征打开了可能性。
无论人类腺病毒 (HAdV) 感染对健康人群的临床影响以及在免疫抑制患者的高发病率如何,目前仍无特定的治疗方法。在本研究中,我们筛选了 CM1407 COST Action 的化学库,其中包含 1,233 种天然产物,以鉴定限制 HAdV 感染的化合物。其中,我们鉴定出鱼藤醇酮,它是一种显著抑制 HAdV 感染的化合物。接下来,我们选择了四种与鱼藤醇酮结构相关的异黄酮类化合物(例如鱼藤酮、鱼藤素、小米酮和特弗罗辛),即鱼藤类化合物,以评估和体外表征它们对 HAdV 和人类巨细胞病毒 (HCMV) 的抗病毒活性。它们对 HAdV 的 IC 50 值范围从鱼藤酮的 0.0039 µM 到 tephrosin 的 0.07 µM,选择性指数范围从鱼藤酮的 164.1 到 deguelin 的 2,429.3。此外,在斑块测定中每种化合物获得的 IC 50 浓度的两倍下,HCMV 复制的抑制范围为 50% 到 92.1%。我们的结果表明,鱼藤酮、deguelin 和 tephrosin 的作用机制涉及 HAdV 复制周期的后期阶段。然而,鱼藤酮的抗病毒作用机制似乎涉及微管聚合的改变,从而阻止 HAdV 颗粒到达细胞的核膜。这些异黄酮类化合物在纳摩尔浓度下对 HAdV 表现出高抗病毒活性,可被视为开发新型广谱抗病毒药物的有力候选药物。
为了使细胞裂解,必须分解脂质壁。洗涤剂和盐溶液可以实现这一目标。细胞壁,细胞膜和核膜也因搅拌机的作用而分解。除一种协议外,我消除了热量的使用。一些参考文献表明,需要60oC的温度来使DNAase酶变性,而DNAase酶在DNA中导致DNA剪切,而DNA则在DNA约为80oC左右。其他参考文献指出,DNA可以在60oC处变性。从我运行的所有实验中(小麦胚芽规程除外),当我使用热量时,我剪切了DNA。热量可能破坏酶以及DNA。但是,保持溶液冷却似乎会减慢酶作用。PREP溶液使用泻盐和缓冲阿司匹林进一步停用释放时降解DNA的酶并稳定DNA(酸与碱)。碳酸氢钠(小苏打)也用于缓冲溶液。肉类嫩化器具有木瓜蛋白酶,一种酶,有助于清洁可能污染其的DNA的蛋白质。木瓜汁和菠萝汁还含有此酶。最后,乙醇用于沉淀DNA。在水中,DNA可溶。 当它在乙醇中时,它会脱落和沉淀,留下其他不溶于乙醇的细胞成分。在水中,DNA可溶。当它在乙醇中时,它会脱落和沉淀,留下其他不溶于乙醇的细胞成分。
真核细胞与原核细胞(细菌、古菌)不同,具有高度复杂的内部结构。真核生物具有细胞核,细胞核由核膜包围,含有 DNA、一套复杂的膜细胞器系统:光滑内质网 (SER) 和粗面内质网 (RER)、高尔基体、内体和溶酶体(它们共同构成细胞的分泌途径)、以及线粒体、质体(植物细胞)和过氧化物酶体。由于细胞内生物膜系统的存在,决定了细胞内存在单独的区室(所谓的区室化),真核细胞能够同时且彼此靠近地进行大量不同的(通常是相反的)生化过程。传统光学显微镜的分辨率较低(0.2 μm),限制了对细胞内结构进行精确观察的可能性,因此电子显微镜常用于此类研究,其分辨率为 0.2 nm,为了解细胞器的超微结构提供了更大的可能性。这种复杂技术的替代方法是基于特定抗原抗体反应的免疫细胞化学反应,其特点是灵敏度高,能够检测到低于传统光学显微镜分辨率的信号。使用与抗体结合的各种荧光染料使得可以在这种类型的研究中使用荧光显微镜,但是这种分析通常是在固定被检查的细胞及其相当复杂的处理之后才有可能的。近年来,人们获得了许多荧光染料,它们一方面可以特异性地与某些细胞器的膜结合,从而可以确定它们在细胞中的可能位置,另一方面适合于“活体”染色。这些包括与高尔基体 (BodipyCeramide) 膜、线粒体 (Miyo-Tracker、Rhodamine 123)、光滑内质网 (ER-Tracker) 和溶酶体 (Lyso-Tracker) 膜结合的染料。
●什么是生活?生物多样性;需要分类;生命的三个领域;分类学和系统学;物种和分类层次结构的概念;二项式术语;研究分类法的工具 - 博物馆,动物园,草药,植物园。●五个王国分类:Monera的显着特征和分类; protista和真菌分为主要群体;地衣;病毒和病毒,将植物的显着特征和分类为主要群体,苔藓植物,孢子菌,裸子植物和被子植物;被子植物 - 分类为类,特征特征和示例,显着特征和动物 - 非对抗的分类,直至门水平,然后缔结级别。●动物和植物中的结构组织:形态和修饰;组织;解剖学和流动植物的不同部分的功能:根,茎,叶,渗透性 - cymose和camose和comemose,豆类,水果和种子,动物组织;昆虫(蟑螂)的不同系统(消化,循环,呼吸,神经和生殖)的形态,解剖学和功能。●细胞结构和功能:细胞理论和细胞作为生命的基本单位;原核和真核细胞的结构;植物细胞和动物细胞;细胞包膜,细胞膜,细胞壁;细胞细胞器结构和功能;内膜系统 - 肾上腺素网,高尔基体,溶酶体,液泡;线粒体,核糖体,质体,微生物;细胞骨架,纤毛,叶叶菌,中心元素(超微结构和功能);核核膜,染色质,核仁。●细胞分裂:细胞周期,有丝分裂,减数分裂及其意义。活细胞的化学成分:蛋白质,碳水化合物,脂质,核酸的生物分子结构和功能;酶类型,性质,酶作用。