背景:核苷(酸)类似物 (NA) 作为慢性乙型肝炎 (CHB) 的一线抗病毒治疗策略之一,既可以有效抑制几乎所有患者的乙型肝炎病毒 (HBV) 复制,又可以改善肝纤维化的发展。1,2 然而,NA 疗法很少导致功能性治愈(即 HBsAg 消失),因为 NA 对共价闭合环状 DNA (cccDNA) 的作用有限,而 cccDNA 被认为是病毒持续存在的主要原因。3 因此,停止 NA 常常伴有各种病毒和临床复发的发生。4 – 6 尽管治疗结束时 (EOT) 的肝内 cccDNA 水平可能是 CHB 患者对抗病毒治疗持续反应的有力预测指标,但肝活检和缺乏标准测试进展限制了其在临床实践中的应用。寻找预测持续病毒反应的替代标志物的研究正在进行中。作为 HBV cccDNA 转录活性的替代指标,血清乙肝表面抗原 (HBsAg) 已被提倡作为监测 CHB 患者治疗反应的新型血清标志物,而 HBsAg 清除被视为 CHB 抗病毒治疗的最终目标。所有主要的国际 CHB 感染指南都推荐 HBsAg 消失(无论有无 HBsAg 抗体 (anti-HBs))作为 CHB 患者,尤其是乙肝 e 抗原 (HBeAg) 阴性患者的 NA 治疗的最佳终点。1,2,7 在最近的一项荟萃分析 8 中,EOT HBsAg 水平 < 100 IU/mL 被建议作为停止 NA 治疗的最佳临界值,无论是 HBeAg 阳性还是 HBeAg 阴性 CHB 患者。还发现血清 HBV RNA(由 cccDNA 转录而成)与 cccDNA 的存在相关,并与对 NA 的反应相关。9 – 12 因此,HBV RNA 可能是长期 NA 治疗后肝内 cccDNA 水平的另一种临床替代标志物,可用于
作者贡献:构思和设计实验:A.L.,B.H.A.,V.A.,R.T.D进行了实验:Y.H.,S.S.S.S.D分析了数据:Y.H.,S.S.S.S.S.,P.E. J.J.,B.H.A.,V.A.,R.T.D。在其他作者的贡献中,竞争利益声明:作者声明没有竞争利益。分类:生物科学:生物化学;物理科学:生物物理学和计算生物学关键词:组蛋白;晶体结构;核小体;染色质;核苷此文件包括:
挑战/需求:水果、蔬菜、坚果和油等食物和植物中少量的生物活性化合物因其在预防慢性疾病方面的潜力而备受关注。这些化合物包括多酚、类胡萝卜素、维生素、ω-3 脂肪酸、有机酸、核苷、核苷酸和植物固醇,因其促进健康的功效而日益受到认可。随着消费者寻求通过个性化营养来提高生活质量的天然和可持续解决方案,生物活性化合物正成为有前途的疾病预防和治疗替代品。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年1月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.01.09.574896 doi:Biorxiv Preprint
摘要 微生物组的药物代谢会影响抗癌治疗的成功。我们之前提出,具有抗菌活性的化疗可以选择细菌药物代谢中的适应性,从而无意中影响宿主的化学耐药性。我们证明,对氟嘧啶化疗的进化耐药性降低了其在以药物进化细菌为食的蠕虫中的疗效(Rosener 等人,2020 年)。在这里,我们研究了一个模型系统,该系统可以捕捉肿瘤微环境中可能发生的局部相互作用。定植于胰腺肿瘤的伽马变形菌可以降解核苷类似物化疗药物吉西他滨,从而增加肿瘤的化学耐药性。利用大肠杆菌中的基因筛选,我们绘制了所有导致吉西他滨耐药的功能丧失突变。令人惊讶的是,我们推断三分之一的顶级耐药突变会增加或减少细菌药物的分解,因此可以降低或增加局部环境中的吉西他滨负荷。在三种大肠杆菌菌株中进行的实验表明,进化的适应性趋于核苷通透酶 NupC 的失活,这种适应性增加了共培养癌细胞的药物负担。这两项研究通过表明细菌-药物相互作用可以对药物活性产生局部和系统性影响,为微生物组适应化疗的潜在影响提供了互补的见解。
摘要 背景 免疫检查点抑制剂 (ICI) 已被证明是一种有前途且有效的乙肝病毒 (HBV) 相关肝细胞癌 (HCC) 治疗方法。然而,缺乏基于证据的数据证明 ICI 对接受核苷(酸)类似物 (NA) 治疗的 HBV-HCC 患者 HBV DNA 水平的影响以及 HBV DNA 变异对患者生存的影响。在本研究中,我们旨在调查现实世界中的这个问题。方法 在这项单中心回顾性研究中,我们回顾了 182 名接受 ICI 和预先 NA 治疗的基线乙肝表面抗原 (HBsAg) 阳性 HBV-HCC 患者。研究了人口统计学特征、肿瘤状态、治疗、HBV DNA、HBsAg、肝功能、抗肿瘤反应和患者生存期。主要终点为病毒学突破(VB)率、HBV再激活(HBVr)率、长期HBV DNA控制率;次要终点为总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。结果(1)患者VB发生率为18.1%(33/182),HBVr发生率为4.4%(8/182),中位发生时间为3.9个月(范围:0.7~16.0个月)和8.0个月(范围:3.0~16.0个月)。VB组24周和48周HBV DNA转阴率分别为26.1%和0,HBVr组24周和48周HBV DNA转阴率分别为12.5%和0。基线 HBsAg 水平≥200 IU/mL 是 VB 的唯一危险因素(OR 9.9,95% CI 2.2 至 45.2,p=0.003);(2)有 VB 的患者的中位 OS 和中位 PFS 比无 VB 的患者短得多(12.3 个月 vs 18.1 个月,p=0.035;4.5 个月 vs 7.5 个月,p=0.011)。结论在接受 ICI 和预防性 NA 治疗的 HBsAg 阳性 HBV-HCC 患者(长期 HBV DNA 控制不佳)中,发生 VB 的风险很高,发生 HBVr 的风险中等。VB 的唯一危险因素是治疗前的 HBsAg 水平。此外,VB 可能被视为预测患者 OS 和 PFS 较差的临床生物标志物。
治疗和管理•患有HIVºRIF的患者不应用于接受大多数抗HIV蛋白酶抑制剂(PIS)和非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTIS)的患者。RFB;可能需要调整RFB剂量以同时给予某些抗HIV PI和NNRTIS。RIF可与核苷逆转录酶抑制剂(NRTIS)一起使用。请咨询专家。• RIPE treatment regimen º Doses should not be divided º Use EMB with caution in children whose vision cannot be monitored º Discontinue EMB when susceptibility to INH and RIF is demonstrated with good clinical response º Discontinue PZA after the Initial Phase - 8 weeks ( see treatment table for number of doses ) - unless there is resistance to either INH or RIF or lack of clinical response • Drug resistance º Mono-drug resistant disease可能需要改变治疗方案。寻求专家咨询。º多药抗性疾病(对INH和RIF的抗性)需要个性化的治疗方案并延长治疗。寻求专家咨询。•对肺结核患者的痰监测º进行至少每月进行痰液监测,直到连续2种持续的痰培养物变为阴性。ºEDOH建议与结核病专家咨询,以便在初始阶段结束时仍然是痰培养阳性的任何人。 •正在进行的评估ºEDOH建议与结核病专家咨询,以便在初始阶段结束时仍然是痰培养阳性的任何人。•正在进行的评估
遗传信息的存储和转移[1,2]。 DNA甚至没有主要考虑,假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。 要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍(大部分是沃森和克里克基料配对),在糖的2'位置下没有羟基。 又花了十年的时间证明了dnazymes,单链的脱氧乙烯核苷酸(ODN),而没有体内对应物,也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。 可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体(能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6],依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐(DNTP)。 这些核苷酸是(突变)DNA 的底物遗传信息的存储和转移[1,2]。DNA甚至没有主要考虑,假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍(大部分是沃森和克里克基料配对),在糖的2'位置下没有羟基。又花了十年的时间证明了dnazymes,单链的脱氧乙烯核苷酸(ODN),而没有体内对应物,也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体(能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6],依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐(DNTP)。这些核苷酸是(突变)DNA
氨基酸对于维持细胞完整性和代谢稳态至关重要。除了蛋白质合成之外,氨基酸也是核苷酸,脂质和细胞壁成分生物合成的前体。s。金黄色葡萄球菌可以合成许多此类氨基酸,但通常会从外部环境中转移到细胞中[2]。有限的葡萄糖可用性(例如,脓肿中)代表了一个环境,其中肽或氨基酸的分解代谢对金黄色葡萄球菌的生长很重要[3]。生物启动分析揭示了启用s的几种途径。金黄色葡萄球菌可分解多种氨基酸,进而可以生成关键的中央代谢中间体,例如丙酮酸,草乙酸和2-氧化甲酸酯。反映了氨基酸在代谢中的重要性,s。金黄色葡萄球菌具有多种寡肽磁盘,游离氨基酸转运蛋白和蛋白酶以降解宿主蛋白。分析64 s。金黄色葡萄球菌菌株表明,氨基酸代谢基因与pangenome分别相关[4],表明靶向与核心氨基酸代谢相关的转运蛋白可能具有针对多样化S的更广泛的治疗潜力。金黄色葡萄球菌分离。氨基酸,肽,渗透剂和核苷摄取系统的多样性和冗余也带来了重大挑战。在USA300_FPR3757基因组中至少有292个基因,预计将编码膜转运蛋白,其中120个似乎与氨基酸,渗透剂或核苷转运有关。从历史上看,细菌膜转运的研究生物信息学工具通常有助于识别和预测固定转运蛋白的功能,但是需要实验性工作来验证按测量值运输的底物及其生理角色。
遗传信息的存储和转移[1,2]。 DNA甚至没有主要考虑,假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。 要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍(大部分是沃森和克里克基料配对),在糖的2'位置下没有羟基。 又花了十年的时间证明了dnazymes,单链的脱氧乙烯核苷酸(ODN),而没有体内对应物,也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。 可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体(能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6],依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐(DNTP)。 这些核苷酸是(突变)DNA 的底物遗传信息的存储和转移[1,2]。DNA甚至没有主要考虑,假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍(大部分是沃森和克里克基料配对),在糖的2'位置下没有羟基。又花了十年的时间证明了dnazymes,单链的脱氧乙烯核苷酸(ODN),而没有体内对应物,也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体(能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6],依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐(DNTP)。这些核苷酸是(突变)DNA