XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System核苷酸
定制寡核苷酸修饰指南
寡核苷酸通过反相高效液相色谱法 (RP-HPLC) 纯化。根据客户要求，也可提供脱盐寡核苷酸（未经 HPLC 纯化）。除非另有说明，所有寡核苷酸均为冻干。根据客户要求，也可订购浓缩溶液形式的寡核苷酸。
alpha-bicyclo-DNA骨架反义寡核苷酸
主链修饰的进步正在推动具有增强的生物稳定性和耐受性谱的核酸治疗剂的发展。我们已经开发了一种基于α异源主链糖的新型7'，5'-α-BC-DNA（ABCDNA）支架，并先前证明了寡核苷酸含有这种修饰的寡核苷酸，该修饰显示了成功的靶向外显子鞋鞋。在这里，我们显示了含有AbcDNA核苷酸的Gapmer反义寡核苷酸（ASOS）的第一个生物物理和体内基因敲低功效的初步结果，而不是使用完善的2'MoE修饰碱基。
Brogidirsen 的 I/II 期临床试验：双靶向反义寡核苷酸
此预印本的版权所有者于 2024 年 8 月 30 日发布此版本。；https://doi.org/10.1101/2024.08.28.24312624 doi: medRxiv preprint
DNA修复蛋白、多核苷酸激酶和溶胶的丢失
摘要 DNA 损伤与 1 型干扰素 (T1IFN) 反应的刺激有关。本文，我们表明，DNA 修复蛋白多核苷酸激酶/磷酸酶 (PNKP) 在多种细胞系中的下调会导致 ST A T1 的强烈磷酸化、干扰素刺激基因的上调和细胞质 DNA 的持续积累，所有这些都是激活 T1IFN 反应的指标。此外，这不需要通过电离辐射诱导损伤。相反，我们的数据表明，活性氧 (ROS) 的产生与 PNKP 损失协同作用，增强 T1IFN 反应，并且 PNKP 的损失会严重损害线粒体 DNA (mtDNA) 的完整性。线粒体DNA的消耗或用ROS清除剂处理PNKP消耗的细胞可消除T1IFN反应，表明线粒体DNA是增强T1IFN反应所需的胞浆DNA的重要来源。STING信号通路是导致PNKP消耗细胞中促炎基因特征增加的原因。虽然反应依赖于ZBP1，但cGAS仅对某些细胞系的反应有贡献。我们的数据对癌症治疗具有重要意义，因为PNKP抑制剂有可能刺激免疫反应，也有可能刺激与PNKP突变相关的神经系统疾病。
DNA语言模型的核苷酸依赖性分析揭示了基因组功能元件
解密基因组中的核苷酸如何编码调节指令和分子机器是生物学的长期目标。DNA语言模型（LMS）通过对每个核苷酸的序列上下文进行建模概率来隐式捕获功能元素及其组织。但是，由于缺乏可解释的方法，使用DNA LMS发现功能基因组元素一直在挑战。在这里，我们引入了核苷酸依赖性，该核苷酸依赖性量化了一个基因组位置的核苷酸取代如何影响其他位置核苷酸的概率。我们生成了动物，真菌和细菌种类千倍体范围内成对核苷酸依赖性的全基因组图。我们表明，核苷酸依赖性比序列比对和DNA LM重建更有效地表明了人类遗传变异的有害性。调节元素在依赖图中显示为密集块，从而可以准确地对转录因子结合位点的系统识别，就像在实验结合数据上训练的模型一样准确地识别。核苷酸依赖性还突出了RNA结构内接触的基础，包括伪诺和三级结构接触，精确地。这导致发现了四个小说，实验验证的RNA结构中的大肠杆菌。最后，使用依赖图，我们通过基准测试和视觉诊断来揭示几种DNA LM体系结构和训练序列选择策略的临界局限性。完全，核苷酸依赖性分析为发现和研究功能元件及其在基因组中的相互作用开辟了新的途径。
寡核苷酸治疗药物开发的临床药理学考虑因素
描述肝肾功能损害对药代动力学、药效学和安全性的影响：为了解决器官功能的影响，申办方应根据现有的初步数据确定肝脏和肾脏在药物处置、消除和药物反应中的作用。这些信息应指导后期试验中受试者的招募。对于主要不是肾脏清除或不针对肝脏的药物，建议招募肝功能或肾功能范围广泛的患者。当药物主要通过肾脏清除时，建议针对严重肾功能损害采用简化的药代动力学研究设计。如果寡核苷酸治疗靶向肝脏，建议描述肝功能损害的影响。
AMX0114的临床前开发，一种反义寡核苷酸靶向CALPAIN-2
1。eb moloney和al。Neurosci Front。2014; 8：252。 2。 我的M. Neurobiol Dis 2013; 60：61-79。 3。 asakawa k和al。 SCI生活掉了。 2021; 78（10）：4453-4465。 4。 Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：12014; 8：252。2。我的M. Neurobiol Dis2013; 60：61-79。 3。 asakawa k和al。 SCI生活掉了。 2021; 78（10）：4453-4465。 4。 Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：12013; 60：61-79。3。asakawa k和al。SCI生活掉了。2021; 78（10）：4453-4465。4。Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：1Wang Y和Al。单元格2020; 9（12）：2698。5。Metwally E和Al。前兽医科学2023 9月5日; 10：10：1
致密的单核苷酸多态性测试...
法医DNA分析的领域多年来经历了显着的进步，例如DNA指纹的出现，聚合酶链反应引入了提高敏感性的聚合酶链反应，将基于短tandem重复序列的遗传标记系统的转移以及国家DNA数据库的实施。现在，随着密集的单核苷酸多态性（SNP）测试的出现，取证领域有望为另一场革命。SNP测试具有显着增强法医病例的来源归因的潜力，尤其是涉及低量或低质量样品的源。与遗传谱系和亲属分析相结合时，它可以解决无数的活性病例以及冷病例和未识别的人类遗体的病例，这受到现有法医能力的局限性，而这些法医能力无法产生可与DNA产生可行的调查铅。法医遗传谱系与全基因组测序结合的领域可以使亲戚与少数及以后的亲属联系在一起。通过利用志愿者的数据库来定位附近和遥远的亲戚，遗传家谱可以有效地缩小与犯罪现场证据相关的候选人，或帮助确定人类遗体的身份。随着DNA测序成本的降低和提高检测的敏感性，法医遗传遗传学正在扩大其能力，从而从广泛的生物学证据中产生研究。收到：2024年3月12日
寡核苷酸治疗药物研发的临床药理学考量 | FDA 行业指南
I. 引言 本指南根据《联邦食品、药品和化妆品法》第 505 节（21 USC 355）和 21 CFR 第 312 和 314 部分，为协助业界开发寡核苷酸疗法提供建议。具体而言，本指南代表了 FDA 对寡核苷酸疗法开发过程中某些评估的建议，包括：(1) 表征 QTc 间期延长的可能性，(2) 进行免疫原性风险评估，(3) 表征肝肾功能损害的影响，以及 (4) 评估药物间相互作用的可能性。本指南就何时进行这些评估以及哪些类型的评估适合解决上述主题提供了建议。寡核苷酸疗法是一种新兴的治疗方式，正在开发的药物数量不断增加。2近年来，许多反义和小干扰 RNA（siRNA）寡核苷酸疗法已获得 FDA 批准。此外，目前正在开发许多寡核苷酸疗法，用于治疗罕见和常见疾病。寡核苷酸疗法包括各种合成修饰的 RNA 或 RNA/DNA 杂交体，它们专门设计用于与靶 RNA 序列结合以改变 RNA 表达和/或下游蛋白质表达。即使在治疗方式中，寡核苷酸疗法也可能存在多种差异，包括但不限于：