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通过病毒样颗粒（''nanoblades''）在永生和原代细胞中递送Cas9/sgrna核糖核蛋白复合物
Philippe E Mangeot，Laura Guiguettaz，Thibault J M Sohier，Emiliano P Ricci。通过病毒样颗粒（“纳米薄片”）在永生和原代细胞中递送Cas9/sgrna核糖核蛋白复合物。可视化实验杂志：Jove，2021，169，10.3791/62245。hal-04892096
孤立的REM睡眠行为障碍患者和帕金森氏症患者的尿液中的α-突触核蛋白骨料水平升高
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予MedRxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
细胞系多组学和药物筛选数据的统计整合
数据集成方法用于获得多个数据集的统一摘要。对于多模态数据，我们提出了一种计算工作流程来联合分析来自细胞系的数据集。该工作流程包括一种用于组学数据的新型概率数据集成方法，称为 POPLS-DA。该工作流程的动机是对突触核蛋白病的研究，其中在受影响的 LUHMES 细胞系和对照中测量转录组学、蛋白质组学和药物筛选数据。目的是突出显示与突触核蛋白病有关的潜在可用药途径和基因。首先，使用 POPLS-DA 优先考虑最能区分病例和对照的基因和蛋白质。对于这些基因，构建了一个集成的相互作用网络，其中药物筛选数据被纳入网络中以突出显示可用药的基因和途径。最后进行功能富集分析以识别保护性药物靶向的突触和溶酶体相关基因和蛋白质簇。我们发现，热休克蛋白 70 家族成员 HSPA5 是经过验证的药物（尤其是 AT1 阻滞剂）最常针对的基因之一。HSPA5 和 AT1 阻滞剂之前已被证实与 α-突触核蛋白病理和帕金森病有关，这显示了我们的发现的相关性。我们的计算工作流程确定了治疗突触核蛋白病的新方向。基于 R 和 markdown 的实现可在线免费获取。
alpha- ...
认知表现和最终痴呆症中的大量浮动是α-核核中疾病的重要特征，例如帕金森氏病和刘易体内痴呆，与皮质功能障碍有关。已经建议在患者的大脑皮层中存在错误折叠和聚集的α-核蛋白，在此过程中起着至关重要的作用。然而，A-突触核蛋白积累对体内细胞分辨率在细胞分辨率功能的功能的后果在很大程度上是未知的。在这里，我们使用野生型小鼠中的纹状体播种模型在大脑皮层中诱导了鲁棒的A-核蛋白病理。在单次注射A-突触核蛋白预构纤维的九个月后，我们观察到通过体内两光子钙在清醒小鼠中的体内两光子钙在体体皮质中的2/3层皮质神经元的功能发生了深刻的改变。我们检测到自发活性水平的提高，对搅拌和同步增加的反应增强。立体分析表明，在注射预构纤维的小鼠的体感皮层中，谷氨酸脱羧酶67阳性抑制性神经元减少。重要的是，这些发现指出了令人不安的激发/抑制平衡是电路功能障碍的相关驱动因素，这可能是α-突触性核核酸的认知变化。
来自细胞系的多组学和药物筛选数据的统计整合
数据集成方法用于获得多个数据集的统一摘要。对于多模态数据，我们提出了一种计算工作流程来联合分析来自细胞系的数据集。该工作流程包括一种用于多组学数据的新型概率数据集成方法，称为 POPLS-DA。该工作流程的动机是对突触核蛋白病的研究，其中在受影响的 LUHMES 细胞系和对照中测量转录组学、蛋白质组学和药物筛选数据。目的是突出显示与突触核蛋白病有关的潜在可用药途径和基因。首先，使用 POPLS-DA 优先考虑最能区分病例和对照的基因和蛋白质。对于这些基因，构建了一个集成的相互作用网络，其中结合了药物筛选数据以突出显示网络中的可用药基因和途径。最后，进行功能富集分析以识别保护性药物靶向的突触和溶酶体相关基因和蛋白质簇。将 POPLS-DA 与其他单组学和多组学方法进行了比较。我们发现，热休克蛋白 70 家族成员 HSPA5 是经过验证的药物（尤其是 AT1 阻滞剂）最常针对的基因之一。HSPA5 和 AT1 阻滞剂之前已被证实与 α-突触核蛋白病理和帕金森病有关，这表明我们的发现具有相关性。我们的计算工作流程确定了治疗突触核蛋白病的新方向。与其他单组学和多组学方法相比，POPLS-DA 提供了更大的可解释基因集。基于 R 和 markdown 的实现可在线免费获取。
病理报告
使用Syn-OneTest®的指南是一种基于皮肤活检的测试，旨在识别位于皮肤组织中的特定病理标记，以帮助诊断神经系统疾病。合成元素的主要诊断特征是免疫荧光技术在皮肤神经中共同识别和可视化磷酸化的磷酸化的α-核蛋白，以帮助诊断核核疾病诊断，包括帕尔氏症（包括帕克森病）（pd）（pd），dllby dl bod bot themia themia dly dl bot themia dly themia bot themia themia themia bot。 （MSA），纯自主教失败（PAF）和REM睡眠行为障碍（RBD） *。鉴定磷酸化α-突触核蛋白的异常结果表明了突触核蛋白的病理学，但无法区分突触核酸的核酸酶。临床医生应使用Syn-One测试的突触核蛋白测定法以及其他临床特征的结果，以帮助做出更具体的诊断。SYN-ONE包括应用免疫荧光蛋白基因产物（PGP 9.5）染色，该染色能够定量测量epi骨内神经纤维密度（IENFD）。降低的IENFD表示神经变性，如某些神经退行性疾病和周围神经病。Syn-One包括淀粉样蛋白的刚果红色染色，作为神经病理评估的一部分。发现淀粉样蛋白沉积物可能表明表皮和自主神经病理学，广义周围神经病，自主性功能障碍以及其他多器官疾病的潜在原因，并应促使对淀粉病的原发性和次要原因进行评估。Syn-One包括苏木精和曙红（H＆E）染色，它允许评估可以模仿神经病并鉴定可能存在的其他良性和恶性皮肤异常的皮肤病学条件。H＆E结果仅与为此测试进行的组织活检有关。任何临床上明显的病变都需要皮肤科医生单独分析。稳定性数据不适合在固定剂中保存超过120小时的组织标本。尚未建立磷酸化α-核蛋白沉积的稳定性。延长的固定时间可能会导致人工降低皮肤内神经纤维密度。
斑马鱼胚胎显微注射 - NET
此方案是使用已停产的 Cas9 蛋白版本 (Alt-R Sp Cas9 Nuclease 3NLS) 开发的。目前可用的产品 (Alt-R Cas9 Nuclease V3) 具有改进的 NLS，应以相同的体积和浓度直接替换到此方案中。IDT 建议使用 Alt-R™ Sp Cas9 Nuclease V3 与 Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA 和 tracrRNA 结合使用，以生成核糖核蛋白编辑复合物，从而在大多数目标位点上实现高编辑效率。查看 Alt-R CRISPR-Cas9 用户指南，了解如何将核糖核蛋白转染哺乳动物细胞系（可在 www.idtdna.com/CRISPR 上找到）。
糖尿病患病率的社会经济不平等
SARS-COV-2大流行中的新变体更具传染性（alpha/delta），逃避中和抗体（beta）或两者（Omi-Cron）。这在疫苗开发中构成了挑战。我们设计了一种更普遍的SARS-COV-2 DNA疫苗，其中包含了Hucov-19 /WH 01，Alpha和beta变体的受体结合结构域环，结合了膜和核蛋白。疫苗诱导的尖峰抗体 - Hucov-19 /WH 01，β和三角洲峰值蛋白之间的活性，它们在体外中和Hucov-19 /WH 01，Beta，Delta和Omicron病毒。与峰值特异性T细胞不同，疫苗启动核蛋白特异性T细胞公认的BAT-COV序列。携带人ACE 2受体的疫苗保护的小鼠免受SARS-COV-2β变种的致命感染。有趣的是，单独的交叉反应性核蛋白特异性T细胞的启动是60％的表现，从人类中验证了T细胞预防致命疾病的人类的观察结果。这种SARS-COV疫苗诱导了一种独特的宽阔和功能性免疫，从而增加了当前使用的疫苗。