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World File Search System根际
追踪分子生物学的根*
本系列[1]中的第一篇文章讨论了“细胞The-Ory”的起源。该理论将细胞确定为所有动物和植物的基础，到1850年代在生物学研究人员中广为人知。但是，配子的细胞分裂或产生的过程或它们在遗传生物特征的遗传传播中的作用仍然未知。格雷戈尔·约翰·孟德尔（Gregor Johann Mendel）于1865年根据他对花园豌豆的精心计划和执行的实验，在1865年提供了第一个确定的法律制定法律。然而，门德尔的出色发现在他的一生中仍然是完全未知的，在此期间对细胞的强烈研究和生物学进化。例如，有机避免的开拓者，例如J。B. Lamarck提出了“使用和使用”理论来修饰物种字符的特征，后来独立地提出了自然选择小型变化的Ory的Charles Darwin和Alfred Wallace，几乎没有理解生物学本机制。在门德尔（Mendel）在1900年发布的继承定律与其重新发现之间的35年中，细胞分裂和配子生产得到了极大的理解。但是，由于跨话有限，细胞学家和育种者（动植物）在很大程度上仍然不知道其他领域的发展。
Aquincola agrisoli sp. nov.，从茄子根际土壤中分离，并通过计算机基因组挖掘预测生物合成基因簇
作者隶属关系：1 韩国京畿道安城市中央大学生物技术与自然资源学院食品与营养系，邮编 17546；2 孟加拉国贾肖尔科技大学遗传工程与生物技术系，邮编 7408；3 孟加拉国库什蒂亚-7003 伊斯兰大学生物科学学院生物技术与遗传工程系。 *通讯作者：Md. Amdadul Huq，amdadbge100@cau.ac.kr；amdadbge@gmail.com 关键词：Aquincola agrisoli；数字 DNA-DNA 杂交；基因组序列；计算机基因组挖掘；次级代谢产物。缩写：ANI，平均核苷酸同一性；BGC，生物合成基因簇；dDDH，数字 DNA-DNA 杂交；GBDP，基因组爆炸距离系统发育； ML，最大似然法；MLSA，多位点序列分析；MP，最大简约法；NJ，邻接法；RAST，使用子系统技术进行快速注释。菌株 MAHUQ-54 T 的 16S rRNA 基因和草图基因组序列的 NCBI GenBank 登录号分别为 MT514502 和 JAZIBG000000000。本文的在线版本提供了六个补充图和四个补充表。006355 © 2024 作者
代表性的Paenibacillus polymyxa，Cereus芽孢杆菌，Fictibacillus sp。和Brevibacillus agri菌株的基因组序列草案序列草案序列。
此处介绍的菌株先前是在2016年从ADE土壤和两个不同的普通豆品种的实验中分离出来的，表现出对土壤传播病原体的抗氧体的抗性水平。该实验是在圣保罗大学农业核能中心进行的（22°42'27.60“ S，47°38'41.17” W）（4）。植物，并摇动根以去除松散的粘附土壤。用无菌刷子收集牢固的土壤，并被认为是根际土壤。用于微生物分离，将1 g根际土壤与9 ml盐水溶液（8.5 g L-1 NaCl）混合。串行稀释液（10 -1至10 -6），然后转移到国王中板上（5）。在25°C孵育48小时后，使用条纹板法分离了菌落。从分离株中提取总DNA。
物种内部和跨物种的发育时机-MPG.PURE
关于根特征的最新研究表明，有两个轴解释了地下的特征变化：与菌根合作伙伴的协作轴和保护和保护（“快速 - 慢”）轴。然而，这些特征轴是否影响土壤传播真菌的组装尚不清楚。我们期望腐生性真菌与根特征的保护轴相连，而致病性和羊膜菌根真菌真菌与协作轴的链接相反，但在相反的方向上，如弧形菌根菌根真菌可能提供致病原的保护。为了检验这些假设，我们测序了根际真菌群落和25种草地植物物种的单一培养物中的根特征，年龄不同。在真菌公会中，我们评估了真菌物种的丰富度，相对丰度和社区组成。与我们的假设相反，真菌多样性和相对丰度与根特征轴没有密切相关。然而，腐生真菌群落组成受到菌群梯度的保护梯度和致病群落组成的影响。根际AMF社区组成并未沿协作梯度发生变化，即使根性状轴与根菌根菌落定殖速率一致。总体而言，我们的结果表明，从长远来看，根特性轴与真菌群落组成有关。
多环芳烃降解的人工混合微生物系统
植物生长促进性根瘤菌（PGPR）是居住在根际的细菌，并定居于根环境。这些生物可用于改善植物的生长和在不利环境下农业生产的可持续性。根际微生物可以产生细胞外化学信号，有助于在宿主和微生物之间建立复杂的信号网络。PGPR殖民植物根，启发植物生长，并减少昆虫引起的疾病或损伤。目前已经对PGPR进行了丰富的研究工作，其中许多正在用于农作物中。pgpr可以用作在压力环境下改善植物健康和产量的生物肥料。生物施肥被认为是全球不同作物植物的主要氮来源。同样，PGPR负责增加豆类中的N-固定，促进自由生活的N-固定细菌，并改善根际中补充营养素的可用性和分布（Daniel等，2022）。他们还负责植物激素的产生，因此在植物正常生长和发育中起着至关重要的作用。PGPR降低了根际根部病原体和其他有害微生物的居民，从而促进植物的生长。微生物参与宿主植物代谢组途径的改变，从而有助于植物的全身耐药性。它们有助于上调压力响应性的继发代谢产物，从而有助于调节细胞代谢活性。）。但是，更好地了解其作用机理以及它们在植物生长和发展中的主演作用对于农业生产和研究至关重要。已经研究了Rhodopseudomonas palustris菌株PS3增强了番茄植物的生长和产量。菌株还显着改善了土壤养分含量和番茄果实的质量。这些有利的细菌群落有效地有助于改善结果，产量和土壤健康（Lee等人。
... 叶际真菌组合的结构
致谢本论文工作是无数次合作和会议的结果，因此很难感谢所有人，但我会尽力而为。我首先要感谢 Marie-Laure Desprez-Loustau，她对我的监督同时给了我几乎完全的自由。他的乐观、他的观点以及我们无数次的讨论让我的思想更加成熟，并不断改进我的工作。接下来，我要感谢 Corinne Vacher，感谢她在这三年里给予我的不懈支持。我们几乎每天的互动在各个方面都给我带来了很多。我还要感谢 Cécile Robin，感谢她的及时帮助以及她始终相关且有效的校对。感谢 Aurore Coince、Emmanuel Defossez、Marc Buée、Benoit Marçais、Georges Kunstler 在 BACCARA 项目框架内的合作。非常感谢 Xavier Capdevielle，感谢他在该领域的宝贵帮助以及我们在 Pierrefite 或比利牛斯山脚下进行的不那么严肃的讨论。还要感谢 Olivier Fabreguettes、Martine Martin 和 Gilles Saint-Jean 在真菌学和分子生物学实验室中提供的帮助。感谢 Nicolas Feau、Benoit Barrès、Virgil Fievet 和 Cyril Dutech 在咖啡角或乒乓球桌上进行的各种讨论。最后，感谢我的朋友和家人这三年来的支持。