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898 弹药中队 (AFGSC) - 科特兰空军基地
纹章。在天蓝色的圆盘上，整个圆盘呈黄色，边缘为黑色，横带上方为红色倒置等边三角形，边缘为第三条，第二条的侧面为闪电，指向底部，第一条有翼，底部两侧为一对垂直于第三条的导弹，顶部为相同的原子符号；所有都在狭窄的黑色边框内。圆盘下方附有黄色卷轴，边缘为黑色，用黑色字母刻有“898 TH MUNITIONS SQ”。意义。群青和空军黄色是空军的颜色。蓝色暗示天空，空军作战的主要战场。黄色代表太阳和空军人员所需的卓越品质。红色是传统上与弹药活动相关的颜色。大三角形代表美国的三位一体防御概念。大三角形内的四个小三角形代表中队的四座曼萨诺山。任何两个黄色三角形周围的黑色轮廓象征着该部队的一般功能。原子符号表示该部队对美国空军核威慑力量的贡献。徽章中心的闪电和翅膀指的是中队在空军中的作用以及对空军任务的支持。
非小细胞肺癌中 BRAF 激活的演变
非小细胞肺癌（NSCLC）是最常见的肺癌亚型，其中约4％具有BRAF激活，可选择靶向治疗。BRAF激活包括V600和非V600突变，融合，重排，框内缺失，插入和共突变。此外，BRAF原发性激活和继发性激活具有不同的生物学表型，医学意义和后续治疗。BRAF原发性激活作为NSCLC的驱动基因在增殖和转移中起着关键作用，而继发性激活介导对其他靶向治疗的获得性耐药，尤其是表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI）。针对不同BRAF激活的治疗选择多种多样。靶向治疗，尤其是双药联合治疗，是一种重要的选择。此外，免疫检查点抑制剂（ICI）将是另一种选择，因为BRAF激活将是ICI治疗的肿瘤反应的阳性生物标志物。目前尚无高级别证据支持将靶向治疗或免疫治疗作为优先推荐。靶向治疗后，BRAF 的进化包括激活 BRAF 的上游、下游和旁路通路。本文将讨论 BRAF 的治疗方式和治疗后进化通路，并提出未来的研究方向。
多种抗原表位的计算预测
摘要。由于密码子字母的高变性，从密码子到氨基酸的映射是溢出的，这表明密码子空间可能具有更高的信息含量。嵌入密码子语言模型最近在各种下游任务中表现出成功。然而，磷酸化位点的预测模型，可以说是研究最多的翻译后修饰（PTM）和PTM位点，主要依赖于氨基酸级表示。这项工作引入了一种新的方法，通过通过近来开发的密码子语言模型的嵌入来预测磷酸化位点，该方法专门培训了蛋白质编码DNA序列。蛋白质序列首先精心映射到可靠的编码序列，并使用此编码器编码以生成密码子感知的嵌入。然后将这些嵌入与通过早期融合策略从蛋白质语言模型获得的氨基酸感知的嵌入整合。随后，从定义的窗框内的融合嵌入式形成了感兴趣的位点的窗口级表示。Convbigru网络提取物具有捕获窗口内近端残基之间的时空相关性，然后是基于高斯（Dog）小波范围函数的衍生物的Kolmogorov-Arnold网络（KAN），以产生该站点的预测推断。我们将整体模型配音为Calmphoskan。在独立测试中使用丝氨酸 - 硫代氨酸（合并）和酪氨酸测试集，Calmphoskan优于现有方法。此外，我们证明了该模型在预测蛋白质内在无序区域内的位点的有效性。总体而言，Calmphoskan成为蛋白质中一般磷酸材料的强大预测指标。Calmphoskan将很快公开发布。
语音回忆过程中脑电图回忆间隔的估计
图4显示了使用20倍交叉验证估计每个受试者的回忆间隔的结果。在图 4 中，横轴是时间，纵轴是来自 5 个受试者的 200 个样本（总共 1000 个样本）的准确率。红框内是语音回忆部分。前文研究 [2] 中的方法（图 4 中的蓝线）的准确率在语音回忆片段之间下降到 0.2，而本文提出的方法（图 4 中的橙线）则达到了 0.8 的稳定准确率。 从这些结果可以看出，可以说所提出的方法对于估计回忆间隔是有效的。然而，当我们观察所提出的方法在语音回忆部分之外的准确度时，我们发现与以前的研究相比，该方法将语音回忆部分之外的部分估计为回忆率的情况更为常见。这被认为是由于大脑中噪音的影响。因此，我们旨在通过将增加的 10 个样本应用于所提出的方法来减少这种噪音。结果就是图4中的绿线。在保持回忆部分的准确度的同时，非回忆部分的准确度得到了提高。基于这些结果，我们研究了所提出方法的最佳添加次数。结果如图5所示。图 5 显示了所有受试者对每个加法数字的准确率。蓝线表示整个时间内的平均准确率，橙线表示回忆期间的最大准确率。横轴是添加的样本数量，纵轴是准确率。通过添加 sigma，回忆部分的准确率得到了提高，达到了约 90%。另外，10 次添加等于 1 个样本。
377后勤准备的血统和荣誉历史......
纹章。在一个黑色的圆盘上，一只老虎蹲伏在一个天蓝色边缘和银色流苏的地球仪上，陆地为垂直边缘，第三块为流苏，地球仪底部有十九个小圆盘向右弯曲，六个小圆盘向左弯曲；老虎的左爪，四个爪子刮过地球仪的金边银色标记；所有标记都在一个狭窄的黄色边框内。圆盘上方附有黑色卷轴，边缘为黄色窄边框，并用黄色字母刻有“SUSTINENDUM VICTORIAM”。圆盘下方附有黑色卷轴，边缘为黄色窄边框，并用黄色字母刻有“377 TH LOGISTICS READINESS SQ”。意义。群青和空军黄色是空军的颜色。蓝色暗指天空，即空军作战的主要战场。黄色指的是太阳和空军人员所需的优秀品质。蹲伏在地球仪上方的老虎象征着中队对其上级指挥部以及保卫美国的全球使命的骄傲。四个爪形标记代表中队的四个飞行队：部署和配送、车辆管理、燃料和补给。地球仪底部的小白色圆盘代表 1966 年，即该部队成立的年份，也是中队从越南最早开始的历史和传统。拉丁文座右铭“SUSTINENDUM VICTORIAM”翻译成英文是“维持胜利”。
生物学方法杂志| 2020 |卷。 7（4）| E140 doi：10.14440/jbm.2020.343快速基因组的简化CRISPR/CAS9方法
toxoplasma gondii（t。gondii）和besnoitia besnoiti（b。besnoiti）是属于Apicomplexa的紧密相关的球虫寄生虫，其中包括许多其他重要的人类和牲畜病原体。t。gondii被认为是一种模型生物体，用于研究APICOMPLEXA的细胞生物学，这主要是由于各种宿主细胞的易于传播以及多种遗传工具的可用性。相反，b。besnoiti在体外培养系统中目前仅存在于感染的急性阶段，而遗传操纵被证明更具挑战性。近年来，可编程CRISPR相关（CAS）9酶对染色体DNA的有针对性编辑极大地提高了t中基因操作的范围和准确性。gondii和相关的寄生虫，但仍在b。besnoiti。CRISPR/CAS9技术可以引入单点和插入/缺失突变，与以前的方法相比，基因的精确整合，框内表位标签的精确整合以及基因的删除。t中的CRISPR介导的基因组编辑的当前方案。gondii依赖于cas9的本构或瞬态表达以及在转染的质粒载体上分别编码或一起编码的特定sGRNA。组成型表达的CAS9具有毒性的风险，而瞬态方法是费力且容易出错的。在这里，我们提出了使用化学合成和修饰的SGRNA的质粒载体独立基因组编辑的方案。Gondii和B. Besnoiti。该方案允许快速且具有成本效益的t突变细胞系的生成。
使用 AAV 介导的原位基因标记可视化哺乳动物大脑中的 Arc 蛋白动力学和定位
活性调节的细胞骨架相关 (Arc) 蛋白对于突触可塑性和记忆形成至关重要。Arc 基因含有结构 GAG 逆转录转座子序列的残余，它产生的蛋白质可自组装成含有 Arc mRNA 的衣壳状结构。从神经元释放的 Arc 衣壳已被提议作为一种新的 mRNA 传递细胞间机制。尽管如此，仍然缺乏 Arc 在哺乳动物大脑中细胞间运输的证据。为了能够在体内追踪来自单个神经元的 Arc 分子，我们设计了一种腺相关病毒 (AAV) 介导的方法，使用 CRISPR/Cas9 同源独立靶向整合 (HITI) 将荧光报告基因标记到小鼠 Arc 蛋白的 N 端。我们表明，编码 mCherry 的序列可以成功敲入 Arc 开放阅读框的 5′ 端。虽然 Arc 起始密码子周围有 9 个 spCas9 基因编辑位点，但编辑的准确性高度依赖于序列，只有一个靶标导致框内报告基因整合。在海马中诱导长期增强 (LTP) 时，我们观察到 Arc 蛋白的增加与荧光强度和 mCherry 阳性细胞数量的增加高度相关。通过邻近连接分析 (PLA)，我们证明 mCherry-Arc 融合蛋白通过与突触后棘中的跨膜蛋白 stargazin 相互作用而保留了 Arc 功能。最后，我们在靠近编辑神经元的 mCherry 阳性棘的 mCherry 阴性周围神经元中记录了 mCherry-Arc 与突触前蛋白 Bassoon 的相互作用。这是第一项为哺乳动物大脑中 Arc 的神经元间体内转移提供支持的研究。
审查 - 急性髓样白血病中同种异体移植的指示
＊频率，响应率和结果度量应通过风险类别进行报告，如果有足够的数量可用，则应通过指示的特定遗传病变。†主要基于在经过跨治疗的患者中观察到的结果。根据可测量残留疾病分析的结果，在治疗过程中可能会发生变化。•并发套件和／或FLT3基因突变不会改变风险分类。§AML被归类为不良风险。||仅影响Cebpa基本亮氨酸拉链的框内突变，无论它们是否以单相关还是双重突变的形式出现，都与有利的结果有关。¶（t （9; 11）的存在P21.3; Q23.3）优先于罕见的，并发的不良风险基因突变。#Eccluding KMT2A部分串联复制（PTD）。＊＊复合核型：在没有其他类别定义的重复遗传异常的情况下，$ 3无关的染色体异常；不包括三个或三个或多个三分之一的高二倍体核型（或多个多核），没有结构异常。††单粒核型：存在两个或更多不同的单色（（不包括X或Y（Y（Y（Y（Y））），或一个单个常染色体单子弹结合使用，与至少一个结构性染色体异常相结合，不包括核心结合因子AML）。‡‡目前，如果这些标记与有利的风险AML亚型共发生，则不应将这些标记用作不良预后标记。从参考文献6ATP53在变异等位基因部分至少为10％处的ATP53突变，与TP53等位基因状态（单或双重突变无关； TP53突变与AML与复合和单核核型显着相关。
研究 CRISPR/Cas9 基因驱动产生可预防疾病的朊病毒基因等位基因
朊病毒病是一组致命的神经退行性疾病，包括影响鹿科动物且传染性极强的慢性消耗性疾病。鉴于慢性消耗性疾病在北美某些流行地区的患病率超过 30%，并且不能排除最终会传播给其他哺乳动物物种（可能包括人类），因此必须研究除通过狩猎和/或扑杀进行种群管理之外的新控制策略。朊病毒病依赖于 Prnp 基因编码的细胞朊病毒蛋白的翻译后转化为与疾病相关的构象；消除细胞朊病毒蛋白的表达（通常耐受性良好）可完全消除朊病毒病的易感性。受到笼养蚊子物种中基因驱动演示的启发，我们旨在测试基于 CRISPR/Cas9 的基因驱动机制是否原则上可以促进无效 Prnp 等位基因在哺乳动物种群中的传播。首先，我们表明，在 RK13 细胞中，Cas9 和 Prnp 定向向导 RNA 的瞬时共表达会在 Prnp 开放阅读框内产生插入/缺失，表明 Cas9 诱导的双链断裂已通过非同源末端连接进行修复。其次，我们通过 Cas9 诱导的切割后的同源定向修复将约 1.2 kb 的供体 DNA 序列整合到 N2a 细胞的 Prnp 开放阅读框中，并证实整合在大多数情况下都准确发生。第三，我们证明，将 Cas9/向导 RNA 核糖核蛋白复合物电穿孔到受精小鼠卵母细胞中，可产生具有各种 Prnp 开放阅读框中断的幼崽，并在这项研究中获得了新的 Prnp 基因缺失小鼠同源系。然而，在雄性生殖系中获得 Cas9 表达的技术挑战阻碍了在小鼠中实现完整的基因驱动机制。
通过基因组编辑稻米核孔蛋白基因 OsCPR5.1（而非 OsCPR5.2）实现对水稻黄斑驳病毒的抗性
摘要 水稻黄斑驳病毒 (RYMV) 是非洲最严重的水稻疾病之一。RYMV 的管理具有挑战性。遗传抗性提供了最有效和最环保的控制。隐性抗性基因座 rymv2 (OsCPR5.1) 已在非洲水稻 (Oryza glaberrima) 中被鉴定，然而，渗入 Oryza sativa ssp。由于跨越障碍，粳稻和印度稻仍然具有挑战性。在这里，我们评估了两种水稻核孔蛋白旁系同源物 OsCPR5.1 (RYMV2) 和 OsCPR5.2 的 CRISPR/Cas9 基因组编辑是否可用于将 RYMV 抗性引入粳稻品种 Kitaake。两种旁系同源物均已被证实可弥补拟南芥 atcpr5 突变体的缺陷，表明存在部分冗余。尽管两种旁系同源物之间存在惊人的序列和结构相似性，但只有 o scpr5.1 功能丧失突变体完全具有抗性，而 oscpr5.2 功能丧失突变体仍然易感，这表明 OsCPR5.1 在 RYMV 易感性中起着特殊作用。值得注意的是，在 OsCPR5.1 的 N 端结构域（预计为非结构化）中存在短的框内删除或替换的编辑线对 RYMV 高度敏感。与单个拟南芥 AtCPR5 基因突变导致植物严重矮化不同，oscpr5.1 和 oscpr5.2 单敲除和双敲除突变体既没有表现出明显的生长缺陷，也没有表现出类似病变表型的症状，这可能反映了功能分化。OsCPR5.1 的特定编辑，同时保持 OsCPR5.2 活性，为在优良稻种系中产生 RYMV 抗性以及与其他 RYMV 抗性基因或其他性状有效叠加提供了一种有前途的策略。