技术背后的概念相似。它将荧光核苷酸一一添加到DNA模板螺纹中,该螺纹在NGS和Sanger序列中生长DNA聚合酶(也称为二氧基或CAPS电泳序列)。由每个添加的核滴荧光标签定义。
使用sanger of Life of Life HMW DNA碎片剪切的DNA:DIAGENODEMEGAUPTOR®3用于PACBIO HIFI协议,使用0.6倍Ampure PB珠与DNA体积的比例。对于使用生命的Sanger树剪切的DNA HMW DNA碎片:DIAGENODEMEGAUPTOR®3用于LI PACBIO协议,使用1倍Ampure Pb珠与DNA体积的比例。对于使用生命的Sanger树剪切的DNA HMW DNA碎片:用于ULI PACBIO协议的G-Tube,使用0.6倍AMPURE PB珠与DNA体积的比例。为了允许执行QC并满足Sanger进行测序的内部需求,在步骤13中添加了49 µL的EB(3 µl为QC,45.4 µL用于测序),但是可以使用任何数量的EB缓冲液来洗脱剪切的DNA。
本协议描述了通过生命HMW DNA提取方案制备的样品中的HMW DNA的离心介导的HMW DNA片段化。该协议使用Covaris g-tube产生8–10 kb尺寸范围的片段。剪切的DNA适用于下游长读取测序,包括超低输入(ULI)库制备后的PACBIO测序。这个过程对于生命树计划中所有分类学组的DNA提取物非常有效。该协议的输出是剪切的DNA,可以使用手动或自动SPRI协议将其针对碎片的DNA清除。
该方案描述了从多种不同物种的多个不同组织样品中手动提取HMW DNA,不包括植物和真菌,用于使用Qiagen MagAttract HMW DNA提取试剂盒进行长阅读测序。此过程对于生命之树计划所涵盖的各种分类群体都是有效的。该方案对于组织可用性有限的样品特别有用,因为它始终从这些较小的样品中产生的DNA比等效的自动化方法更多。The output of this protocol is HMW DNA, which depending upon yield and the genome size of the species, can be directed towards HMW DNA Pooling, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI HiFi, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI PacBio or HMW DNA Fragmentation: g-Tube for ULI PacBio.
该协议描述了使用diaganodeMegaruptor®3的植物Magattract v.3或植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract V.4植物Magattract v.4使用iaganodeMegaruptor®3的生命HMW DNA提取方案的片段化。此过程对于从生命之树计划所涵盖的所有分类组中的DNA提取物中清除和较短的片段去除非常有效,DNA剪切成平均片段大小范围为12-20 kb。但是,高度浓缩或粘性样品具有挑战性。该协议的输出是剪切的DNA,可以用手动或自动化的SPRI协议针对碎片的DNA清除。该协议改编自Sanger Life Tree HMW DNA片段:Pacbio Hifi的diaganodeMegaruptor®3,以处理由Sanger Life Tree HMW DNA提取的样本HMW DNA提取:自动化MagAttract v.2,自动化植物Magattract V.3,自动化工厂Magattract V.3和自动化工厂Magattrack V.4协议。
6 天前 — 6 申请程序。 (1) 需提交的文件。 A. 国防部人事考试申请表 (1 份) (照片:4.0cm x 3.0cm) B. 个人简历 (市售) (照片:4.0cm x 3.0cm) 附上)。 *照片标准:申请前 6 个月内...