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LncRNA PTENP1/miR-21/PTEN 轴调节癌症中的 EMT 和耐药性：DNA 损伤反应中细胞命运的动态布尔模型
摘要：众所周知，microRNA-21 (miR-21) 靶向磷酸酶和张力蛋白同源物 (PTEN)，促进癌症的上皮-间质转化 (EMT) 和耐药性。最近的证据表明，PTEN 激活其假基因衍生的长链非编码 RNA PTENP1，进而抑制 miR-21。然而，PTEN、miR-21 和 PTENP1 在 DNA 损伤反应 (DDR) 中的动态仍不清楚。因此，我们通过整合来自各种癌症的已发表文献提出了一个动态布尔网络模型。我们的模型与乳腺癌、肝细胞癌 (HCC) 和口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的实验结果显示出良好的一致性，阐明了 DDR 激活如何从 S 期过渡到 G2 检查点，从而导致一系列细胞反应，例如细胞周期停滞、衰老、自噬、细胞凋亡、耐药性和 EMT。模型验证强调了 PTENP1、miR-21 和 PTEN 在调节 EMT 和耐药性方面的作用。此外，我们的分析揭示了九个新的反馈回路，其中八个是正反馈回路，一个是负反馈回路，由 PTEN 介导，与 DDR 细胞命运决定有关，包括与耐药性和 EMT 相关的通路。我们的工作为研究 DDR 后的细胞反应提供了一个全面的框架，强调了在癌症治疗中靶向 PTEN、miR-21 和 PTENP1 的治疗潜力。
重度抑郁症中负面认知偏差的神经机制理论
由 Aaron Beck 提出的抑郁症认知理论得到广泛认可，该理论关注的是信息处理的偏见，强调情感和概念信息的消极方面。当前，人们试图发现这种认知和情感偏见的神经机制，并成功地确定了与情绪、注意力、沉思和抑制控制等几种偏见功能相关的各个大脑区域。然而，抑郁症患者如何发展出这种选择性消极处理的神经生物学机制仍存在疑问。本文介绍了一个以额叶边缘回路为中心的神经学框架，具体分析和综合了杏仁核、海马和内侧前额叶皮质内的活动和功能连接。首先，建立了正反馈回路如何在自动水平上导致抑郁症患者杏仁核持续过度活跃的可能解释。在此基础上，提出了两个假设：假设 1 围绕双向杏仁核海马投射，促进负面情绪和记忆的放大，同时阻碍海马吸引子网络中对立信息的检索。假设 2 强调腹内侧前额叶皮层通过与杏仁核和海马一起概括概念和情感信息，参与建立负面认知框架。本研究的主要目的是改进和补充现有的抑郁症病理模型，推动情感障碍神经科学当前理解的前沿，并最终有助于成功康复令人衰弱的情感障碍。
2020; 16(16): 3149-3162. doi: 10.7150/ijbs.46645 研究论文鉴定促进癌症进展的新型癌症干细胞亚群
背景：癌症干细胞 (CSC) 的生物学特征是自我更新、多向分化和无限增殖，诱导抗肿瘤药物耐药性和转移。在本研究中，我们试图描绘 CSC 介导的生物学特性的基线景观，了解它对于肿瘤进化、抗肿瘤药物选择和对致命恶性肿瘤的耐药性至关重要。方法：我们对来自一对原发性和转移性集合管肾细胞癌 (CDRCC) 部位的 15208 个细胞进行了单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 分析。通过 t-SNE、RNA 速度、单片和其他计算方法识别和表征细胞亚群。所有单细胞测序数据的统计分析均在 R 和 Python 中进行。结果：识别和表征了一个由 1068 个细胞组成的 CSC 群体，显示出优异的分化和自我更新特性。这些CSCs处于分化过程的中心，在空间和时间上依次转化为CDRCC原发细胞和转移细胞，并在骨转移微环境中通过正反馈回路在促进骨破坏过程中起着重要作用。此外，CSC特异性标志基因BIRC5、PTTG1、CENPF和CDKN3与CDRCC预后不良相关。最后，我们指出PARP、PIGF、HDAC2和FGFR抑制剂能够有效靶向CSC，可能是CDRCC的潜在治疗策略。结论：本研究结果可能为CSC的鉴定提供新的思路，有助于进一步了解人类CDRCC的耐药、分化和转移机制。
关于温带行星硅酸盐风化的岩性控制
在行星表面的硅酸盐岩石的风化可以从大气中划出CO 2，以最终在行星内部埋葬和长期存储。这个过程被认为是对碳酸盐硅酸盐循环（碳循环）的基本负反馈，以维持地球上的克莱门特气候和潜在的温带系外行星。我们实施热力学，以确定风化速率是表面岩性（岩石类型）的函数。这些速率提供了上限，允许估计调节气候的最大风化速率。该建模表明，在给定岩石而非单个矿物质中矿物组合的风化对于确定行星表面上的风化速率至关重要。通过实施流体传输控制方法，我们进一步模拟了化学动力学和热力学，以确定受地球大陆和海洋壳构造及其上层岩石的启发的三种岩石的风化速率。我们发现，类似大陆壳的岩性的热力学风化速率比海洋壳的岩性特征低约一到两个数量级。我们表明，当CO 2二压压力降低或表面温度升高时，热力学而不是动力学会对风化产生强大的控制。在动力学和热力学上有限的风化状态取决于岩性，而供应限制的风化与岩性无关。我们的结果表明，热力学有限的硅酸盐风化的温度敏感性可能会激发对碳循环的正反馈，在这种情况下，随着表面温度的增加，风化速率降低。
初步计划
本小组包括四篇论文，它们为能源政策如何通过选举、政治交流、社区参与和地方经济变化等机制影响政治的问题提供了定性和定量证据。三篇论文探讨了美国清洁能源投资的政治影响。在“‘降低通胀’能否减少两极分化？评估美国绿色产业政策的反馈”一文中，Bergquist 研究了联邦清洁能源投资是否为清洁能源转型产生了扩张动力（正反馈）或反作用力、惯性力（负反馈）。在“通胀降低法案繁荣城镇”（Carley 等人）和“克服宾夕法尼亚州公平中期转型的协调障碍”（Constantino 和 Caggiano）中，作者重点关注与联邦清洁能源投资相关的分配和程序正义问题。在第四篇论文《供应侧能源转型对选举的影响》中，马丁内斯-阿尔瓦雷斯和罗斯研究了墨西哥清洁能源政策在选举中遭遇的强烈反对，该国两大政党对是否以及如何逐步淘汰化石燃料持截然不同的立场。四篇论文共同阐明了能源政策的实施、传播和公众体验；研究了公众对能源政策体验的不均衡分布；并展示了这些公众体验如何在政治体系中产生反响。这些论文还为能源转型以外的政治提供了重要见解，例如，加深了对与大规模经济变化相关的分配考虑的理解；完善了政策反馈发生的范围条件；并通过阐明开采量下降（而不是增加）的影响来扩展对资源诅咒的理解。
模拟电子学（REC3C001）
模块 — I（12 小时） MOS 场效应晶体管：FET 和 MOSFET 的原理和操作；P 沟道和 N 沟道 MOSFET；互补 MOS；E- MOSFET 和 DMOSFET 的 VI 特性；MOSFET 作为放大器和开关。BJT 的偏置：负载线（交流和直流）；工作点；固定偏置和自偏置、带电压反馈的直流偏置；偏置稳定；示例。FET 和 MOSFET 的偏置：固定偏置配置和自偏置配置、分压器偏置和设计模块 — II（12 小时）BJT 的小信号分析：小信号等效电路模型；CE、CC、CB 放大器的小信号分析。Rs 和 RL 对 CE 放大器操作的影响、射极跟随器；级联放大器、达林顿连接和电流镜电路。 FET 的小信号分析：小信号等效电路模型、CS、CD、CG 放大器的小信号分析。CS 放大器上的 RsiG 和 RL 的匹配；源极跟随器和级联系统。模块 —III（8 小时）FET 和 BJT 的高频响应：BM 和 FET 的高频等效模型和频率响应；CS 放大器的频率响应、CE 放大器的频率响应。模块 —IV（6 小时）反馈放大器和振荡器：负反馈和正反馈的概念；四种基本反馈拓扑、实用反馈电路、正弦振荡器原理、WeinBridge、相移和晶体振荡器电路、功率放大器（A、B、AB、C 类）。模块 — V（7 小时）运算放大器：理想运算放大器、差分放大器、运算放大器参数、非反相配置、开环和闭环增益、微分器和积分器、仪表放大器。书籍：
具有高CMRR和PSRR
摘要 - 在本文中，通过在每个阶段选择和优化合适的结构，我们设计了一个多功能低噪声斩波器放大器。具有高CMRR和PSRR的拟议的神经斩波器放大器适用于EEG，LFP和AP信号，而NEF较低。为了最大程度地减少噪声并增加带宽，选择了单阶段的电流重复使用放大器，并选择了抗伪式的共同模式反馈，而在第二阶段实现了一个简单的完全差异放大器，以提供高摆动。具有活性RC积分器的DC伺服回路旨在阻止电极的直流偏移，并使用正反馈回路来增加输入阻抗。最后，使用了区域和功能效率的纹章减少技术和切碎的尖峰过滤器，以具有清晰的信号。设计的电路在市售的0中模拟。18 µm CMOS技术。3。7 µA电流来自±0。6 V供应。总带宽从50 MHz到10 kHz，而该带宽中的总输入引用噪声为2。9 µV RM，中带增益约为40 dB。设计的放大器可以忍受高达60 mV的DC电极偏移量，并且积极反馈回路的放大器输入阻抗为17mΩ，而切碎频率为20 kHz。随着设计的连锁降低，由于在切碎频率下的上调噪声，输入引用的噪声中只有一个可忽略不计的峰。为了证明设计电路的性能，进行了500个蒙特卡洛分析以进行过程和不匹配。CMRR和PSRR的平均值分别为94和80 dB。索引项 - 仪器放大器，高CMRR，交叉耦合OTA，电流reuse ota。
氧化应激和全身炎症在...
氧化应激和全身性炎症是相互联系的过程，可以相互影响和扩大彼此，从而导致各种疾病和健康状况。氧化应激可以激活免疫细胞，例如巨噬细胞，中性粒细胞和单核细胞，以释放促炎分子。这些活化的免疫细胞可以作为防御机制的一部分产生活性氧（ROS）。相反，ROS可以刺激促炎细胞因子的产生，例如白介素6（IL-6）和肿瘤坏死因子-Alpha（TNF- A）。这些细胞因子反过来又可以触发更多ROS的产生，从而在氧化应激和炎症之间形成正反馈环。此循环可以维持慢性炎症，并导致各种器官的组织损伤。氧化应激和全身性炎症重叠的许多危险因素。肥胖症与慢性炎症相关，也与由于代谢活性增加而与氧化应激有关。毫不奇怪，氧化应激与全身性炎症之间的关系是复杂且双向的。他们可以协同促进各种慢性疾病的发展和发展，包括心血管疾病，糖尿病，神经退行性疾病和某些癌症。解决导致氧化应激和炎症的生活方式因素对于维持整体健康和降低这些慢性病的风险至关重要。在深入评论中（Wei等人这个研究主题旨在并强调了我们目前对炎症和氧化应激之间这种双向关系的理解，以及它们在糖尿病和糖尿病和CKD的病理生理学和治疗中的作用。），作者专注于低氧诱导因子-1 A（HIF-1 A）的下游靶标，这是一种感受细胞氧状态的关键转录调节剂，并在肾纤维化的发病机理中起着至关重要的作用。作者详细介绍了与HIF -1 A诱导的调控相关的分子基础，并阐明了潜在的治疗途径，以抵消或改善肾脏纤维化。
yap/taz驱动器agrin-matrix金属蛋白酶12-
细胞外基质的宏观丧失会导致皮肤伤口愈合的慢性缺陷，但是细胞外基质的补充有望促进伤口闭合，尤其是在糖尿病伤口愈合中。最近我们表明，细胞外基质蛋白聚糖蛋白通过改善迁移角质形成细胞的机械手术来加速皮肤伤口愈合，并允许它们通过基质金属蛋白酶12（MMP12）通过基质金属蛋白酶12（MMP12）对质量响应。RNA - 序列分析表明，除了杂乱无章的细胞外基质外，阿格林耗尽的皮肤细胞还损害了YAP/TAZ转录结果，导致我们假设YAP/TAZ作为中央机械传感器，作为中央机械传感器，驱动Agrin E MMP12信号在切素性伤口修复过程中的功能。在这项研究中，我们证明了Agrin在角膜细胞迁移期间在体外和体内受伤后激活YAP/ TAZ。从机械上讲，YAP/TAZ在通过正反馈受伤后迁移过程中持续agrin和MMP12蛋白表达。yap/taz沉默废除了agrin e mmp12 e介导的力识别和几何约束。重要的是，通过参与MMP12 E YAP，溶解性Agrin治疗可加速糖尿病小鼠模型中的伤口闭合。由于糖尿病足溃疡和伤口愈合受损的患者与与YAP/TAZ失活有关的Agrin E MMP12的表达降低，因此我们建议通过可溶性的Agrin治疗及时激活YAP/TAZ，可以使机械生物学的微观环境使机械生物学微环境促进伤口的机械性微环境，并有效地治愈了正常情况和抑郁症。
DNMT3a 促进 LUAD 细胞增殖和转移...
背景：DNA甲基化模式的变化与肿瘤的发生发展密切相关，其中DNA甲基转移酶3α（DNMT3a）起着重要作用。但DNMT3a在肺腺癌（LUAD）中的作用和机制尚不清楚。本研究旨在探讨DNMT3a对LUAD细胞增殖和转移的潜在影响并探索其潜在的分子机制。方法：采用免疫组化和Kaplan-Meier生存分析方法探讨DNMT3a和组蛋白去乙酰化酶7（HDAC7）的表达与患者生存、预后及临床病理特征的关系。在体内和体外研究DNMT3a对LUAD细胞增殖和转移的影响。本研究采用重组慢病毒介导的体外基因过表达或敲减、蛋白质印迹法、定量实时聚合酶链式反应（qRT-PCR）等方法，阐明DNMT3a促进LUAD细胞增殖和转移的潜在分子机制。结果：DNMT3a或HDAC7高表达与LUAD患者预后不良、AJCC第8版分期高、肿瘤分化差呈正相关，DNMT3a/HDAC7共同低表达的LUAD患者预后最差。DNMT3a上调可以通过上调HDAC7，进一步激活下游介质ZEB1和c-Myc的表达，促进LUAD细胞增殖和转移。相反，HDAC7 的过表达逆转了由 DNMT3a 下调介导的肿瘤生长和转移的减弱以及 c-Myc 和 ZEB1 表达的抑制，进一步表明 LUAD 中 DNMT3a 和 HDAC7 之间存在正反馈调节。结论：我们的研究结果首次证实，DNMT3a 通过上调 HDAC7 并进一步诱导 ZEB1 和 c-Myc 上调，充当诱导 LUAD 恶性进展的肿瘤启动子。靶向 DNMT3a 和 HDAC7 可能是 LUAD 的一种有前途的治疗策略。