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研究文章 载脂蛋白 A-I 的前八个残基介导 C 端控制螺旋束展开及其脂化
载脂蛋白 A-I (apoA1) 的 C 端缺失的晶体结构显示，蛋白质氨基一半（从残基 8 到 115）中存在较大的螺旋束结构。使用定点诱变、胍或热变性、无细胞脂质体清除和细胞 ABCA1 介导的胆固醇流出试验，我们证明当该束展开的热力学障碍降低时，可以发生 apoA1 脂化。C 端的缺失使束更难展开，导致 apoA1 脂化的丧失，这可以通过点突变（例如 Trp8Ala）和氨基端短至 8 个残基的截断来逆转，这两种方法都有助于螺旋束展开。通过二硫键锁定束会导致 apoA1 脂化的丧失。我们提出了一个模型，其中 C 端作用于 N 端，使该螺旋束不稳定。当脂质与 C 端结合时，Trp8 与 Phe57、Arg61、Leu64、Val67、Phe71 和 Trp72 相互作用时被取代，从而使该束不稳定。但是，当 C 端被删除时，Trp8 无法被取代，束无法展开，apoA1 无法被脂质化。
picln调节植物中的替代剪接和光/温度响应
[a]Martínez-Martínez等人提供的EHS的实验测量的底物滥交水平。1。[b]基于Arpigny和Jaeger分类的家族35。[C] TopScore预测的全蛋白误差估计比较模型15。[d]在Pymol中“ Alignto”确定的PDB结构的模型之间的均方根偏差；在Å。[E] EHS的催化活性残基。 [F]基于预测的H type2，EHS具有EHS的全局灵活性。 [g]基于预测的RC IJ，邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。[E] EHS的催化活性残基。[F]基于预测的H type2，EHS具有EHS的全局灵活性。 [g]基于预测的RC IJ，邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。[F]基于预测的H type2，EHS具有EHS的全局灵活性。[g]基于预测的RC IJ，邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。
一种脂肪族胺的无痕连接剂，还原后可快速定量碎裂
RSL 的一个重要应用是对蛋白质上赖氨酸残基进行可逆修饰。例如，已经开发出大量可提高蛋白质治疗效果的化合物，如 PEG 或细胞穿透肽。10 – 12 这些佐剂需要与蛋白质结合以增强蛋白质递送。赖氨酸残基在蛋白质上普遍存在，由于其高亲核性，可以在温和的水条件下轻松修饰，因此是将佐剂与蛋白质结合的有吸引力的靶标。然而，赖氨酸残基也经常对蛋白质活性至关重要，大量修饰通常会损害蛋白质活性。因此，可逆修饰赖氨酸残基的 RSL 有可能克服这一限制，从而成为一种有前途的蛋白质递送策略。13
一种脂肪族胺的无痕连接剂，还原后可快速定量碎裂
RSL 的一个重要应用是对蛋白质上赖氨酸残基进行可逆修饰。例如，已经开发出大量可提高蛋白质治疗效果的化合物，如 PEG 或细胞穿透肽。10 – 12 这些佐剂需要与蛋白质结合以增强蛋白质递送。赖氨酸残基在蛋白质上普遍存在，由于其高亲核性，可以在温和的水条件下轻松修饰，因此是将佐剂与蛋白质结合的有吸引力的靶标。然而，赖氨酸残基也经常对蛋白质活性至关重要，大量修饰通常会损害蛋白质活性。因此，可逆修饰赖氨酸残基的 RSL 有可能克服这一限制，从而成为一种有前途的蛋白质递送策略。13
抗体工程和SpyTag-SpyCatcher技术
间谍肽 - 13个氨基酸标签和间谍蛋白蛋白来自第二个免疫球蛋白样胶原蛋白粘附蛋白结构蛋白，源自pyogenes链球菌的纤连蛋白结合蛋白。胶原蛋白粘合剂结构域自然包含赖氨酸（LYS）侧链和天冬氨酸（ASP）的侧链之间的无肽内键[5,6]。通过拆分该域并进行碎片的合理工程，即肽，即包含反应性ASP残基的spytag和小蛋白质，即含有反应性Lys残基的spycatcher，是含反应性Lys残基和谷氨酸（GLU）残基所必需的，形成型催化剂时，将形成型三重时，该蛋白是键合的。间谍反应在pH，温度和缓冲液的不同条件下以高收率发生，并且自从其概念之后，这两个组件随后被优化，创建版本2和3（spytag2-spycatcher2，spytag3-spycatcher3），在该反应时间从小时缩短到5分钟[5]。
扩展数据图1. 使用RFdiffusion设计β链配对支架。为了充分利用RFdiffusion的多样化生成潜力，同时
扩展数据图 1. 使用 RFdiffusion 设计 β 链配对支架。为了充分利用 RFdiffusion 的多样化生成潜力，同时鼓励在设计输出中使用 β 链界面，我们实现了一种界面调节算法，该算法可根据简单的用户输入生成 SS/ADJ 调节张量。该模型以张量的形式理解折叠调节，这些张量标记每个残基（a，顶部和左侧）的二级结构（蓝色）以及这些二级结构块的邻接关系（a，黄色中心）。用户指定的参数指定了以下信息：结合剂界面二级结构块（在本例中为 β 链）、该块的长度（b，结合剂张量 L 中的青色块）以及结合剂块相邻的靶位残基（b，靶位张量 T 中的青色块）。根据这些预定义参数，该算法随机采样结合剂界面二级结构块在残基索引空间中的位置，同时保持与指定靶位残基的确定邻接关系（绿色）。该用户定义的调节张量将扩散输出导向β链配对的结合物-靶标界面 (c)。此前，RFdiffusion 界面设计计算可以针对指定为靶标“热点”的特定残基，以指定要结合的靶标残基。而这种新的链间 SS/ADJ 调节功能，使用户能够在结合物支架生成过程中指定“β链热点”或“ɑ-螺旋热点”。基于扩展的结合物-靶标 SS/ADJ 张量调节的结合物支架输出，支持用户指定 β 链界面类型的设计。
从可生物降解聚合物的覆盖膜开发...
塑料培养通过聚合膜提高了作物质量和产量，但由于湿度和污染，它们的处置不当会损害环境。这项研究旨在使用大豆和花生壳以及聚（丁基 - 磷酸二甲甲酸酯）（PBAT）开发可生物降解的覆盖膜（PBAT）。残基的特征是通过热重分析的特征，并通过吸水，接触角和机械性能评估覆盖膜。残基的热行为表明稳定性低于200ºC。农业浪费改善了疏水性，但将膜的吸水值提高了18.5倍（14天后PBAT/SH5）。通过扫描电子显微镜获得的显微照片表明残基颗粒的重要分布和团聚酸盐的形成，导致机械性能降低。研究发现，可以将以粉末形式的农业工业残基添加到聚合物基质中，以通过传统的加工技术产生可生物降解的覆盖膜。这种方法有可能为更可持续的生产系统做出贡献。