激活转录因子4(ATF4)是由蛋白激酶RNA样ER激酶(PERK)调节的,是一种压力诱导的转录因子,负责控制广泛的自适应基因的表达,从而使细胞能够承受压力的条件。然而,ATF4信号通路对气道再生的影响仍然鲜为人知。在这项研究中,我们使用小鼠气道上皮细胞培养模型来研究PERK/ATF4在呼吸道差异化中的作用。通过药理抑制和沉默,我们发现了PERK/ATF4在基础干细胞差异中的关键参与,从而导致分泌细胞数量减少。CHIP-SEQ分析揭示了ATF4与与成骨细胞分化和分泌细胞功能相关的基因调节元件的直接结合。我们的发现为ATF4在气道上皮分化中的作用及其潜在参与先天免疫反应和细胞适应压力的潜在参与提供了宝贵的见解。
我们在此报告了首次证明穿梭肽在恒河猴模型中将蛋白质和 ABE8e-Cas9 RNP 递送至呼吸道上皮的转化潜力。在单次气雾剂给药后,我们成功地将荧光标记的蛋白质货物递送至大气道和小气道的上皮细胞以及一些肺泡上皮。使用 S315 穿梭肽进行 ABE8e-Cas9 RNP 递送,我们在使用支气管刷回收的细胞中实现了 CCR5 基因座的显著 A 到 G 编辑。从气管和近端气道收获的上皮中 CCR5 位点的编辑效率达到 5.3%。在具有 R553X 突变的人类 CF 气道上皮中应用这种递送方法实现了类似的编辑水平并赋予 CFTR 功能的部分恢复。
抽象的shot弹枪元基因组测序有可能提供细菌应变水平的分辨率,这对于解决许多临床问题至关重要。尽管可以使用实现应变水平的生物信息学工具,但需要进行彻底的基准测试,以验证其用于较少研究和低生物质微生物组(如上呼吸道中的生物量微生物)的使用。我们分析了先前发表的数据集,这些数据集是从孟加拉国婴儿(微生物群和健康研究)和来自瑞士囊性纤维化儿童的口咽样品的新型数据集的纵向收集的鼻咽样样品。来自细菌培养物的数据用于对菌株3的参数进行基准测试,这是一种用于应变水平分辨率的生物信息学工具。此外,将菌株3的结果与从Strainge和新得出的全基因组测序数据中得出的Metage Notic组件进行了比较。优化分析参数后,我们比较了菌株3的结果与培养金标准方法,并实现了87%(链球菌肺炎链球菌),80%(莫拉氏菌Cartarrhalis),75%,75%(嗜血杆菌)和57%(57%)(57%的葡萄球菌AUREUSNASNASEFRENN),HERISN NASEFREN NASEFREN NASEFREN N.NASEFREN N.NASEFREN N. )和46%(金黄色葡萄球菌),用于260个口咽样品。比较50 s的核心基因组的系统发育树。金黄色葡萄球菌分离株,由菌株3产生的相应标记基因树发现,除三个样品外,所有除三个样品外,都有相似的相似性,表明有足够的应变分辨率。总而言之,菌株3的结果与细菌培养物的数据进行比较表明,尽管仔细优化参数以适合低生物量微生物组时,宿主DNA的含量较高,但呼吸微生物组的应变水平跟踪是可行的。
气道疾病通常伴有炎症,而炎症长期以来被认为是导致患者出现阻塞、粘液分泌过多、呼吸困难、咳嗽和其他特征性症状的原因。因此,临床干预通常针对炎症来逆转肺部病理并降低发病率。气道和肺部受神经纤维亚群的密集支配,这些神经纤维不仅受肺部炎症的影响,而且可能还是免疫细胞功能的重要调节器。这种双向神经免疫串扰由免疫细胞和气道神经纤维之间的紧密空间关系、互补的神经和免疫信号通路、局部专门的气道化学感应细胞和专用的反射回路支持。在本文中,我们回顾了有关该主题的最新文献,并介绍了支持神经免疫相互作用在气道炎症中的作用的最新证据。此外,我们扩展了这些证据,综合考虑了这些发现的临床转化,以改善呼吸道疾病患者的管理。© 2023 美国过敏、哮喘和免疫学学院。由 Elsevier Inc. 出版。保留所有权利。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年10月4日。 https://doi.org/10.1101/2023.05.26.542451 doi:Biorxiv Preprint
抽象进行性阻塞性肺部疾病继发于慢性气道感染,再加上宿主免疫,是囊性纤维化发病率和死亡率的主要原因(CF)。在患有CF(PWCF)的人的气道中发现的经典病原体包括铜绿假单胞菌,金黄色葡萄球菌,伯克霍尔德cepacia complect,Achromobacter物种和嗜血杆菌的富集。虽然传统的呼吸培养培养物集中在这种有限的病原体上,但使用综合文化和与文化无关的分子方法的使用表现出了复杂的高度个性化的微生物群落。流失细菌群落多样性和丰富性,与传统的CF病原体(如Burkholderia或pseudomonas)相对增加的分类单元相对增加,长期以来一直被认为是疾病进展的标志。这些经典病原体的获取被视为晚期疾病的预兆,并假定是由经常发生的急性肺部恶化驱动的反复和频繁的抗生素暴露驱动的。最近,CF跨膜电导调节剂(CFTR)调节仪,旨在增强或恢复蛋白质水平/功能降低的小分子,已成功开发并具有深远的影响疾病。尽管有多种临床益处,但在PWCF中持续存在结构性肺损伤和结构性慢性气道感染。在本文中,我们回顾了普华永道的微生物流行病学,重点是我们对调节剂时代中对这些感染的不断发展的理解,并确定感染监视和临床管理中未来的挑战。
原始调查|糖尿病和内分泌学关联钠 - 葡萄糖共转运蛋白2抑制剂与二肽基肽酶-4抑制剂的使用与发生阻塞性气道疾病的风险,并加剧了香港2型糖尿病患者