由密切包装配体形成的非孔产物。用于比较,金属 - 具有协调键和共价键的有机框架(MOF)和共价有机框架(COF),可以基于网状化学的合理设计和合成。18,19因此,它需要一种新的合成方法来控制HOF的形成并丰富它们的结构多样性。模板合成一直是构建多孔材料(例如MOF和COF)的重要策略。例如,通过合成后的金属化/脱位,20,21金属交换,22 - 24或配体交换25 - 28已被广泛用于获得具有与MOF-emplate相同结构/拓扑的靶向功能MOF。这些模板合成利用了可逆的协调键,这些键可以在合成后的修改过程中破坏和改革。可逆协调键也已用于模板COFS 29和多孔聚合物的合成。30 - 32 Yaghi及其同事证明了一个代表性的例子,这些示例使用了Cu I-苯噻吩会协调部分的可逆形成/断裂来构建具有编织结构的COF。29铜中心在COF结构内的编织上是独立的,并用作将螺纹带入编织模式的模板,而不是更常见的平行排列。可以在不破坏COF结构的情况下去除弱的cu i。这些作品激发了我们使用协调债券指导HOF的组装。要实现协调键指导的HOF合成的设计,基于弱协调键的MOF将为
许多生物学过程和机制取决于DNA中碱基配对和氢键的细节。氢键由于难以可视化氢原子位置而通过X射线晶体学和冷冻EM进行量化,但可以通过溶液中的NMR光谱探测到位点特异性,而固态的固态,后者特别适合大型,缓慢滚动的DNA复合物。最近,我们表明低温动态核极化(DNP)增强的固态NMR是在本机样条件下在各种DNA系统中区分Hoogsteen碱基对(BPS)与规范的Watson-Crick BPS的有价值工具。在此使用12型摩尔DNA双工,在Watson-Crick或Hoogsteen确认中含有两个中央腺嘌呤 - 胸腺氨酸(A-T)BPS,我们证明了DNP固态NMR测量值,这些NMR的测量值是胸腺胺N3-H3键的长度,这些长度与N-H-H-H的详细信息敏感,并允许NH-H·n-H·的n-H·n-H·的水性键合敏感。相同的DNA序列上下文。对于此DNA双链体,对于Watson-Crick A-T和HOOGSTEEN A-T和HOOGSTEEN A(SYN)-T碱基对的有效相同的TN3-H3键长的长度为1.055±0.011Å和1.060±0.011Å,相对于参考磁键长度为1.015±0.010Å,分别为N-Acety-ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl ny-acetyl,分别为watson-Crick a-t和hoogsteen a(syn)a(syn)-t碱基对。非常明显的是,在模型DNA双链体的背景下,这些结果表明,watson-Crick和Hoogsteen BP构型构象异构体之间N-H··N-t a-t氢键没有显着差异。考虑到零点运动的先前量子化学计算预测有效较长的肽n-h键长度为1.041Å,与溶液和环境温度下的肽和蛋白质的固态NMR研究一致,以促进这些早期的研究tn3-h3键长度的直接比较。 Watson-Crick A-T和Hoogsteen A(Syn)-t BPS相对于1.041Å参考肽N-H键长。更一般地,基于低温DNP固态NMR的方法对N-H键长度进行高精度测量有望促进对一系列DNA复合物和基本配对环境的氢键的详细比较分析。
尽管使用传统方法 5 或手性催化剂 6,7 或双催化 8 来实现非对映体不对称催化(DAC)的新策略仍备受关注。相反,虽然含氢键供体的双功能催化剂已经得到广泛应用,9 但是仅通过改变这种催化剂的氢键供体来控制非对映体选择性的方法还很少见。10 对于双功能叔胺催化,理论研究提出了三种工作模型,它们在催化剂的氢键供体与亲核试剂和亲电试剂的相互作用方式上有所不同(方案 1A)。11 – 15 离子对氢键模型(A 型)最初由 Wynberg 11 a 提出,并得到 Cucinotta 和 Gervasio 的理论研究支持。11 b 布朗斯台德酸-氢键模型(B 型)由 Houk 等人揭示。通过量子力学计算。12 A 型模型与 B 型模型的不同之处在于,催化剂的氢键供体分别用于激活亲电试剂和稳定亲核中间体,同时形成的烷基铵离子作为布朗斯台德酸分别与其余亲核试剂或亲电试剂相互作用。当涉及(硫)脲等双氢键供体时,反应可能通过 A 型模型的过渡态进行,其中两个 N – H 键都与亲电试剂相互作用,正如 Takemoto 通过实验研究 13 a 所建议并得到理论研究的支持,13 b – d 或通过模型 B,其中两个
一系列超分子聚氨酯(SPU)的设计并与协同的多功能氢键脂肪胺酰胺末端胶囊合成并合成。聚合物中的尿电烷,尿素和酰胺基序之间的氢键在固态的聚合物链之间具有强大的动态关联。聚氨酯的极性和极性成分的相分离也有助于增强其热和机械性能。与其他材料相比,具有双胺末端盖的超分子聚氨酯通过多种氢键通过多种氢键伴侣伴侣,并且表现出增强的拉伸和热性能。可变温度的红外光谱(VT-IR)和原子力显微镜(AFM)进行研究以研究聚合物的相形态,并揭示了相位分离的增加与最终囊泡中酰胺基序的引入之间存在相关性。这些SPU还具有出色的愈合能力,需要温度> 200℃才能恢复其物理特性。
在中央轴周围是反平行扭曲的两个多核苷酸链,形成右手双螺旋,沿顺时针方向向下旋转。这两个链通过氮碱的配对将其连接在一起。嘌呤碱(A&G)与嘧啶(T&C)碱基对。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。 在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。
A,B:Trigonelline和Dioxane停靠在TGFβ3上。Trigonelline -TGFβ3复合物用两个氢键,两个烷基键,一个盐桥和范德华稳定。它们的ΔG能量高于二恶烷-TGFβ3复合物。c,d:与Gli2结合的三角烷和二恶英。三角烯素用两个氢键和五个具有亲和力结合的烷基键为-4.9kcal/mol,而
化合物V228具有以三级亮氨酸为接头的骨架结构。对接结果表明,复合V228可以与M Pro的活性位点结合,它们的相互作用包括七个氢键(His41,ASN142,His164,his164,Glu166,his172和gln189)。与V253相比,将Tert丁基掺入化合物V228中赋予了显着的空间阻滞,从而导致对接结果中有明显的构象。附着在吡啶上的酰胺结构与His41,His164和Gln189表现出氢键相互作用,而另一种与卤代苯苯苯二苯二酰胺结构相关的氢结构与GLU166和ASN142的氢键合作。与上述化合物不同,带有环丙胺结构的V228缺乏原代胺,因此它不能与GLU166形成独特的盐桥相互作用。
结论 • DG 的近似非常粗糙;不适用于氢键、受阻旋转、柔性分子等。 • 隐式溶剂模型非常粗糙;忽略所有定向溶剂相互作用(氢键、盐桥等)。 • 溶剂熵(疏水效应等)被完全忽略。 • 该方法每次只对一个构象异构体有效,没有构象异构体采样 它居然有效,真是令人惊讶!(正如它在数千种出版物中所做的那样……)