在水生生态系统的水下是一个充满生命的微观宇宙,在维持这些环境的微妙平衡中起着至关重要的作用。水生微生物学探讨了各种水体中微生物的多样性和功能,从广阔的海洋到最小的淡水池塘。在水生环境中,最丰富,最多样化的微生物群是营养循环的关键参与者。例如,硝基瘤和硝化细菌参与硝化过程,将氨转化为氮气中的硝酸盐。一些细菌也有助于有机物的降解,在营养回收中起重要作用。从微观浮游植物到较大的宏观形式,藻类是带有光合作用的阳光的主要生产者。硅藻,鞭毛藻和绿藻是水生食物网的重要贡献者,通过生产有机化合物为各种生物提供了能量。这些单细胞真核生物是水生生态系统中重要的消费者。鞭毛,纤毛和变形虫在调节细菌种群,回收养分以及作为较高营养水平的食物方面起着作用。病毒虽然不是严格归类为生物体,但在水生环境中很丰富,并影响微生物种群。噬菌体,感染细菌的病毒可以调节细菌群落,影响养分循环和微生物多样性。水生微生物对于包括碳,氮和磷循环在内的营养循环过程至关重要。细菌和藻类有助于释放有机物的细分,从而释放出其他生物可以利用的营养。藻类和蓝细菌进行光合作用,将阳光转化为化学能。这个过程不仅支持这些微生物的生长,而且还为其他水生的能源提供了主要的能量
Engineering, manufacturing and assembly Installation and multi-phases commissioning PP-H low-pressure piping, Skids in SS316 Technologies: MMF, RO, EDI, UV, IEX, UF filtration and membrane degassers 2 x 100% redundancy for all technologies Advanced parameters monitoring (TOC, particles, resistivity,…) UPW loop capacity of 40 m3/h with production flexibility from 25 to销售服务后的100%,包括网站的预防维护
公共卫生领域。教学和学习课程将每周开会两个小时。水生环境的详细课程内容性质。供水的微生物学,表面和地下水的微生物菌群。水处理,供水和公共卫生。常规和先进的水处理以及在农业灌溉,鱼类文化,工业和市政目的中使用废水;污水和污水处理;水管理的微生物方面;富营养化和生物修复。海洋环境的进化,生态和多样性;海洋中生命的起源以及海洋化石床建议的进化模式;在每个环境中的动植物的多样性及其适应性的不同条件。课程内容测序周第一周水生环境的性质。供水的微生物学,表面和地下水的微生物菌群。第2-3周的水处理,供水和公共卫生。常规和先进的水处理以及在农业灌溉,鱼类文化,工业和市政目的中使用废水;第4周连续评估1周5污水和污水处理;水管理的微生物方面
蛤蜊是带壳的海洋或淡水软体动物,属于双壳纲。它们是无脊椎动物,壳分为两部分,称为瓣。它们是蛋白质和矿物质(尤其是钙)的丰富来源,建议孕妇和蛋白质缺乏症患者食用。它们栖息在淡水水体或流速缓慢的水域底部。淡水是指溶解盐或其他杂质含量低于千分之零点五的水,存在于淡水湖泊、沼泽和一些河流中。水体中垃圾、底物和其他粪便物质的沉积导致水中病原微生物(细菌)的积聚,给包括蛤蜊在内的水生生物带来沉重的负担。水体中细菌的浓度随季节而变化。因此,本研究旨在了解与蛤蜊有关的淡水中存在的细菌和真菌的类型和密度,并确定微生物在淡水生态系统中十个月内对蛤蜊营养价值的影响。用于分析的样品是伊图河的水,标记为样品 A,样品 B 是用于冲洗蛤蜊的水,样品 C 是均质蛤蜊肠,样品 D 是均质蛤蜊体。使用连续稀释和平板法确定微生物负荷。使用不同的标准生化测试对微生物分离物进行表征和鉴定,以确定:菌落形态、革兰氏染色反应、孢子染色、运动性、糖发酵、吲哚、凝固酶和过氧化氢酶的产生。使用官方分析化学协会概述的方法进行物理化学和营养分析,以测试水分含量、灰分含量、粗蛋白、纤维、脂肪和矿物质元素。各项分析结果表明,在十个月的采样期内,四个样品的微生物总数在二月份最高,样品 C 的微生物总数最高,为 1.2 X 105 cfu/mL,其次是样品 D,为 7.0 X 104 cfu / mL,样品 B 的微生物总数为 5.8 X 104 cfu / mL,而样品 A 的微生物总数最低,为 4.4 X 104 cfu / mL。九月份的微生物总数最低,样品 C 的微生物总数为 3.7 X 104 cfu / mL,其次是样品 D,为 2.4 X 104 cfu / mL,样品 B 的微生物总数为 8.0 X 103 cfu / mL,而样品 A 的微生物总数最低,为 4.0 X 103 cfu / mL。淡水样品和蛤蜊中存在的微生物大多是来自粪便的大肠菌群,包括:金黄色葡萄球菌、产气肠杆菌、舌螺旋体、蜡状芽孢杆菌、植物乳杆菌、大肠杆菌、水生黄杆菌和变异微球菌。我们得出结论,旱季的微生物负荷高于雨季,这可能是由于雨季水稀释和流速加快所致。结果还表明,蛤蜊的营养价值随季节和微生物负荷密度而变化。我们建议对捕捞蛤蜊的水进行适当的卫生处理,并在食用前将蛤蜊适当煮熟并去除内脏,尤其是在旱季。
摘要:蛋白质动力学和功能与发生的能量流有很强的联系。肌红蛋白(MB)及其突变是研究分子水平上振动能传递(VET)过程的理想系统。使用色氨酸(TRP)探针在不同的MB位置引入的抗stokes紫外线共振拉曼研究通过氨基酸替代提出,这表明兽医的量取决于相对于血红素组的TRP探针的位置。受到这项实验工作的启发,我们探索了非共价π相互作用的强度,以及最初由局部振动模式分析(LMA)与铁在Aquotem-MB中结合的轴向和远端配体的共价相互作用,最初是由Konkoli和Cremer开发的。研究了两组非共价相互作用:(1)水配体和TRP环之间的相互作用,以及(2)TRP与血红素基团的卟啉环之间的相互作用。我们通过特殊的局部模式力常数评估了这些非共价相互作用的强度。使用气相和QM/MM计算,研究了基态下的各种TRP模型的水结合的水结合的MB蛋白(总共6个)。我们的结果揭示了兽医确实取决于TRP探针相对于血红素组的位置,也取决于远端组氨酸的互变异群的性质。他们提供了有关如何评估利用LMA的蛋白质中非共价π相互作用以及如何使用这些数据探索兽医的新准则,更通常是蛋白质动力学和功能。1 - 3■引言肌球蛋白(MB)是球蛋白超级家族的杰出成员,在心脏和骨骼肌的众多生理功能中具有重要作用,对于脊椎动物,它负责氧气的储存。
妊娠按蚊疟疾媒介依靠化学和物理(包括微生物)线索来选择优选的产卵栖息地。这项研究的重点是评估细菌组成和栖息地代谢物对灌溉和非灌溉潜在幼虫源中疟疾媒介幼虫可用性的影响。从霍马湾县灌溉和非灌溉地区的幼虫阳性和阴性栖息地采集水样。对从水样中培养的细菌进行基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 以进行物种鉴定。从菌落中提取 DNA,并进行聚合酶链式反应 (PCR) 和测序。最后,确定幼虫阳性和阴性栖息地的代谢物组成。MALDI-TOF MS 结果显示,芽孢杆菌是从非灌溉区幼虫源中鉴定出的唯一属。在灌溉区,志贺氏菌为优势属(47%),大肠杆菌为丰富种(13/51)。在测序的分离株中,65% 为芽孢杆菌。分离出杀幼虫分离株短芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌和深小芽孢杆菌,并将其与莫哈文芽孢杆菌、特基勒芽孢杆菌、粪类芽孢杆菌和农业短芽孢杆菌归为一类。有幼虫的灌溉区与无幼虫的灌溉区相比,粗脂肪(0.01%)和蛋白质含量(0.13%)降低。在灌溉区和非灌溉区,总叶绿素含量高的栖息地(1.12 μ g/g vs 0.81 μ g/g 和 3.37 μ g/g vs 0.82)都有幼虫存在。灌溉和非灌溉地区有幼虫的水生栖息地的糖浓度高于没有幼虫的栖息地;然而,相比之下,有幼虫的非灌溉地区的糖浓度高于灌溉地区的类似栖息地。此外,在灌溉和非灌溉地区含有幼虫的水生栖息地中发现了大量锰、钙和铜的浓度。这些结果允许对潜在的杀幼虫剂或杀虫剂进行前瞻性检查。
• 基因编辑生物可以使废水处理更加节能、省时、省成本,并进一步降低未经处理的废水对环境造成污染和危害的风险。 • 细菌、白腐真菌和藻类是废水处理技术中基因编辑的有前途的生物,必须进一步了解它们的基因组、特性和行为。 • 围绕基因编辑的争议主要是由于缺乏对基因编辑的标准化共识,以及围绕该技术的丑闻和/或怀疑。 • 研究必须解决有关非预期脱靶基因编辑的不确定性,这将有助于澄清监管方法和安全评估程序。 • 在实施新的废水处理技术时,地方政府、联邦监管机构、受过培训的当地人员的协调和长期规划是核心。 • 进一步研究和实施废水处理中的基因编辑技术不应妨碍传统废水处理设施的建设。 • 一旦废水处理得到巩固并确定了实施和运营的能力,就应该在替代方案分析中考虑废水处理中的基因编辑技术。
PUB3H(沼泽,未固结的底部,淤泥,永久淹没) R4SBC(河流,间歇性,河床,季节性淹没) R2UB1H(河流,下层多年生,未固结的底部,鹅卵石砾石,永久淹没) PFO1C(沼泽,森林,落叶,季节性淹没) PEM1C(沼泽,涌水,持续,季节性淹没) 图 7 NWI 分类地图 爱达荷俱乐部 Trestle Creek 项目
未来,常规 eDNA 研究和监测将转向无 PCR 方法。如需全面了解环境 DNA 研究的各个方面,包括方法、挑战和应用,请参阅 Taberlet 等人 (2018) 的文章。可以说,近几十年来,很少有领域像 eDNA 一样对生态学产生如此迅速而深远的影响。如今,eDNA 作为一种生态工具已在全球范围内广受欢迎,涵盖了从微生物到大型动物群的所有生物多样性水平,以及所有陆地和水生生物群落。其应用范围广泛,从检测入侵物种(Dougherty 等人,2016 年)、饮食研究(Shehzad 等人,2012 年),到通过吸血无脊椎动物(如水蛭)中的 DNA 间接检测哺乳动物的非侵入性方法(Schnell 等人,2015 年),再到水生生态系统的监测和评估(Chariton 等人,2015 年;Laroche 等人,2016 年)。水生生态学家是最早采用基于 eDNA 的方法的先驱和人士之一(Ficetola 等人,2008 年;Deagle 等人,2009 年;Chariton 等人,2010 年;Hajibabaei 等人,2011 年)。如今,基于 eDNA 的方法正在世界各地得到常规应用(Cordier 等人,2021 年),欧盟的 DNAquaNet 就是明证,该项目旨在开发和应用基于 eDNA 的方法来监测欧洲的水生系统(Leese 等人,2016 年)。eDNA 研究最令人兴奋的方面之一是能够从同一样本中获取大量生态信息。例如,一位研究人员可能会检查水样中的微生物成分;其他人可以对同一样本进行分析以检测鱼类或获取浮游植物组成。尽管需要考虑初始研究的实验设计及其对后续解释的影响( Zinger 等人,2019 年),但从相同样本中“重新获取”生态数据的能力不仅凸显了基于 eDNA 方法的独特属性之一,而且还强调了生物银行( Jarman 等人,2018 年)和共享 eDNA 样本的必要性,在大多数情况下,这些样本都是使用公共资金收集的。鼓励这些方法不仅可以使研究人员能够重新使用样本进行回顾性分析,这对于监测人类活动对地球生物群落的影响至关重要,而且还为利用样本探索与最初收集目的完全无关的问题提供了机会。
摘要:使用固定式水下摄像机是一种现代且适应性强的方法,可提供持续且经济高效的长期解决方案来监测特别感兴趣的水下栖息地。此类监测系统的共同目标是更好地了解各种海洋生物种群的动态和状况,例如迁徙或商业相关鱼类种群。本文介绍了一种完整的处理流程,用于从固定式水下鱼类观测站 (UFO) 的立体摄像机捕获的立体视频数据中自动确定生物种群的丰度、类型和估计大小。记录系统进行了现场校准,然后使用同步记录的声纳数据进行了验证。视频数据在德国北部波罗的海入口基尔峡湾连续记录了近一年。它展示了水下生物的自然行为,因为使用被动低光摄像机代替主动照明来减弱吸引力并实现尽可能少的侵入性记录。记录的原始数据通过自适应背景估计进行预过滤,以提取具有活动的序列,然后由深度检测网络(即 Yolov5)进行处理。这提供了在两个摄像机的每个视频帧中检测到的生物的位置和类型,用于按照基本匹配方案计算立体对应关系。在后续步骤中,使用匹配的边界框的角坐标来近似所描绘生物的大小和距离。本研究中使用的 Yolov5 模型是在一个新颖的数据集上训练的,该数据集包含 10 类海洋动物的 73,144 张图像和 92,899 个边界框注释。该模型实现了 92.4% 的平均检测准确率、94.8% 的平均精度 (mAP) 和 93% 的 F1 得分。