基于测序的微生物群落分析的方法容易受到污染,这可能掩盖生物信号或产生人为的信号。通常使用控制硅净化方法的方法,但不会最佳地使用跨样品共享的信息,并且不能处理仅部分源自生物材料污染或泄漏到控制中的分类单元。在这里,我们提出了磨砂膏(微生物中污染去除的源跟踪),这是一种硅氧净化方法中的概率,该方法在多个样品和控件上合并了共享信息,以精确识别和去除污染。我们验证了在多个数据驱动的模拟和实验中验证磨砂膏的准确性,包括诱导的污染,并证明它的表现平均比最先进的方法平均高出15-20倍。我们展示了跨多个生态系统,数据类型和测序深度的磨砂膏的鲁棒性。证明其适用于微生物组研究,磨砂膏促进了宿主表型的预测,最值得注意的是使用肿瘤肿瘤微生物组数据的黑色素瘤患者对治疗反应的预测。
摘要:肠球菌spp。是动物肠道中存在的常见细菌,并用作水生环境中的粪便指标。另一方面,肠球菌也称为机会性病原体。阐明其在家畜的肠道中的组成可以帮助估计水生环境中粪便污染的来源。然而,仍然缺乏有关动物宿主中肠球菌物种和组成的信息(人类除外)。在这项研究中,使用选择性培养基从牛,猪,鸟类和人类的粪便中分离出肠球菌。使用质谱技术鉴定肠球菌物种,每个宿主的特征都以多样性和聚类分析为特征。最主要的物种是牛中的海埃拉,鸟类中的粪肠球菌和猪和人类的粪肠球菌。牛的α多样性最高,个体间和牲畜的多样性高。猪和人类中的主要肠球菌物种是相同的,聚类分析表明,两个宿主物种中的大多数聚集在一起。
三国同意推动“晴空战略”,制定泰国、老挝和缅甸三国联合行动计划,解决跨境雾霾问题。在这方面,泰国愿意提供学术知识,利用卫星技术监测和测量热点,并与老挝和缅甸分享管理高原农业的经验。
医院环境是通过手部与硬表面和纺织品的直接和间接接触传播医疗保健相关感染的重要介质。在本研究中,使用微生物培养方法和 16S rDNA 测序对瑞典两个护理病房中频繁接触部位(包括纺织品和硬表面)的细菌进行了鉴定。在一项横断面研究中,鉴定了 176 个频繁接触的硬表面和纺织品,并使用微生物培养进一步分析以量化总需氧菌、金黄色葡萄球菌、艰难梭菌和肠杆菌。使用 16S rDNA 测序进一步分析了 26 个样本的细菌种群结构。研究显示,与硬表面(每小时 2.2 次)相比,手部与纺织品直接接触的频率更高(每小时 36 次)。硬表面符合需氧菌 5 CFU/cm 2 和链球菌 1 CFU/cm 2 的推荐标准。金黄色葡萄球菌(分别为53%和35%)的发生率高于纺织品(分别为19%和30%)(P=0.0488)。纺织品上的细菌属数量高于硬表面。纺织品中最具代表性的菌属是葡萄球菌(30.4%)和棒状杆菌(10.9%),而硬表面中最具代表性的菌属是链球菌(13.3%)。很大一部分纺织品不符合清洁度标准,再加上与硬表面相比细菌多样性更高,这些都表明纺织品是细菌的储存器和细菌传播的潜在风险媒介。然而,由于研究中发现的大多数细菌属于正常菌群,因此不能得出纺织品和硬表面是医院相关感染来源的结论。
b" 对限制或提供雨水控制机会的场地特征和条件进行叙述性分析或描述。包括土壤类型(包括自然资源保护局 (NRCS) 定义的水文土壤组)、场地坡度和地下水深度。对保护自然资源的场地设计特征进行叙述性描述。对场地设计特征、建筑特征和路面选择进行叙述性描述和/或制表,以尽量减少场地的不透水性。对 DMA 进行制表和大小计算,包括自处理区、自保留区、排水至自保留区的区域以及排水至雨水管理设施的区域。详细信息和描述表明有足够的水头将径流引导到、流经和流出每个雨水管理设施到批准的排放点。已识别污染源的表格,以及针对每个污染源,用于最大程度减少污染物的源头控制措施。视情况而定,请参阅市政府关于垃圾围栏和装卸码头的标准计划,以及消防喷淋试验水排放指南。上述市政府网站上提供了此信息的链接。雨水管理设施中所选植物种类的清单以及选择这些植物种类的原因。包括如何灌溉植物以尽量减少用水量并确保植物存活的说明。请参阅上述市政府关于植物选择、间隔和灌溉的指南。提供了如何防止垃圾和杂物进入市政雨水排水系统的说明和详细信息。上述市政府网站上提供了已获批准的完整垃圾收集设备清单。所有雨水管理设施的一般维护要求。所有雨水管理设施的维护通道说明。设施维护和更换的资金来源和永久实施方式。识别与规范或要求的任何冲突,或实施雨水控制计划的其他预期障碍。土木工程师、建筑师和景观设计师的认证。适用时,附录:湾区水文模型表明符合水文改造管理标准。适用时,附录:描述在拆除活动期间如何管理含 PCB 的建筑材料。有关更多信息,请参阅此网页:https://dublin.ca.gov/2113。"