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World File Search System沉淀
W 中的协同晶界偏析和沉淀
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使用蛋白质沉淀的DNA提取高产DNA
2 nd part (protein precipitation), done on: ___/___/___ Add 100 µl Protein Precipitation Solution to the cell lysate mixture.涡流有力。离心机为10分钟13000 rpm。如果颗粒不紧绷，请重复。将1000 µl 100％ETOH添加到新的1.5 ml管中。将上清液（=>包含您的DNA）倒入该管中。通过轻轻反转50次混合。离心机在13000 rpm处离心10分钟。小心地倒出上清液，请确保保持颗粒（这是您的DNA）。加入1000 µL 70％EtOH，然后将管子倒几次以洗涤颗粒。离心13000 rpm持续10分钟。小心地倒出上清液，请确保保持颗粒（这是您的DNA）。空调10分钟，使所有EtoH蒸发。一些液体可能会停留，但希望这是30％的水。不要过分，因为颗粒将很难洗脱。加入30 µL的1x TE或DDH20。在室温下孵育过夜过夜，以使所有DNA洗脱。存储。
干湿循环温泉模拟室中的二氧化硅沉淀
摘要：陆地温泉已成为可能促进生命起源的地点的有力竞争者。干湿条件之间的循环是这些系统的一个关键特征，它可以在原始细胞物质中产生结构和化学复杂性。二氧化硅沉淀是陆地温泉中的常见现象，与现代系统中的生命密切相关。二氧化硅不仅保存了温泉生命的证据，还可以通过紫外线保护帮助其在生命过程中存活，这一因素在早期地球上尤其重要。然而，确定现代温泉系统中温泉的哪些物理和化学成分是生命的结果，哪些是非生命的结果是一项艰巨的任务，因为这些环境中的生命非常普遍。使用模型温泉模拟室，我们展示了一种简单而有效的方法来沉淀二氧化硅，无论有无生命存在。该系统可能对进一步研究生命出现之前二氧化硅沉淀在古代陆地温泉环境中的可能作用，以及它在保护地球免受早期地球可能存在的高表面紫外线条件影响方面的潜在作用很有价值。
溶剂诱导蛋白质沉淀用于蛋白质组学规模的药物靶标发现
摘要：高通量药物发现高度依赖于可用的靶标，以加速候选药物的筛选过程。传统的化学蛋白质组学方法用于筛选药物靶标，通常需要固定/修饰药物分子以拉下相互作用的蛋白质。最近，基于能量学的蛋白质组学方法提供了一种研究药物 - 蛋白质相互作用的替代方法，即直接使用复杂的细胞裂解物，而无需对药物进行任何修饰。在本研究中，我们开发了一种新的基于能量学的蛋白质组学策略，即溶剂诱导蛋白质沉淀 (SIP) 方法，通过使用定量蛋白质组学来分析药物与其靶蛋白的相互作用。该方法适用于任何使用丙酮、乙醇和乙酸等常见化学试剂的实验室。SIP 方法能够识别细胞裂解物中众所周知的甲氨蝶呤、SNS-032 和星形孢菌素的泛激酶抑制剂的蛋白质靶标。我们进一步应用此方法发现格尔德霉素的靶标。成功鉴定了 HSP90 家族的三个已知蛋白质靶标，并首次鉴定了包括 NADH 脱氢酶亚基 NDUFV1 和 NDUFAB1 在内的几个潜在靶标，并使用蛋白质印迹法验证了 NDUFV1。此外，此方法能够评估药物 - 靶标相互作用的亲和力。这些数据共同证明我们的方法为药物靶标发现提供了一个强大的平台。
金属和合金中沉淀物的晶体学
本章和以下各章描述了金属和合金中第二相沉淀颗粒的晶体学。本章的重点放在分析其晶体结构，组成和晶体取向与基质之间的技术方面。在技术上嵌入固体基质中的细质沉淀物的表征在技术上很困难。来自矩阵的信号始终阻碍来自沉淀物的信号。尽管即使是最先进的特征技术仍然不完整，但要评估与沉淀物晶体相关的经典理论中涉及的假设的有效性变得有可能。例如，最近的实验研究表明，成核过程中其晶体结构的演变似乎与所谓的经典成核理论相矛盾，而大小和组成的波动。最近的研究还表明，它们与基质的晶体取向关系通常不同于与界面晶格不匹配相关的能量考虑因素预测的晶体取向。此外，发现与基质的晶体取向关系是控制降水硬化大小的因素，与基于连续弹性理论计算的常规Orowan的强化模型相反，而无需考虑结晶学。
定量顺序染色质免疫沉淀，一种分析体内基因组区域蛋白共占蛋白的共占者的方法
顺序染色质免疫沉淀（SEQCHIP）是一种程序，其中甲醛交联，来自活细胞的蛋白质– DNA复合物受到了两个具有不同特异性抗体的顺序免疫侵蚀。seqchip已被定性地解决，是否可以同时在体内同时同时同时同时占领DNA。在这里，我们扩展了早期的工作，并描述了以定量方式执行和解释Seqchip实验的理论和实际考虑因素。我们提供了一个详细的实验程序，用于设计和执行SEQCHIP实验以及这三个可能结果的实验示例：完全共同占领，没有共占领和部分共同占领。在某些部分共同占领的情况下，Seqchip中免疫沉淀的顺序会强烈影响结果。我们在实验上确认了一个定量参数，该参数提供了在给定DNA区域上两种蛋白的同居量的度量，并提供了有关如何解释Seqchip实验结果的信息。我们对Seqchip数据的定量处理大大扩展了该技术在体内阐明分子机械的实用性。
管状沉淀和冒泡模板上的氧化还原梯度
由降水所产生的在自然界中比比皆是，从热液通风口的烟囱到洞穴中的苏打水。 它们的形成受到预言发生的化学梯度的控制，定义了模板生长结构的表面。 我们报告了一种自组织的周期性模板，在铁 - 硫酸盐溶液中用电化学产生肾小管结构；铁氧化物沉淀在气泡表面，这些气泡在管缘上徘徊，然后脱离，然后留下一圈材料。 通过氨从气泡扩散到溶液中，酸 - 碱和氧化还原梯度自发产生，在管壁内组织径向构成分层，这是一种通过含有凝胶含量的摄氏4的氨基氧化物形成的复杂的液体氧化物模式在更大范围内研究的机制。 当壁内形成磁铁矿时，管可能会在外部磁场中弯曲。 在speleothem形成中与自由边缘问题的联系被强调。 产生管状结构的 t繁殖过程跨越了大量的尺度和机制。 在一个极端处是铁硫化物的烟囱，高于水热通风孔（1），在上升，酸性，酸性，热，富含矿物质的液体和较冷的海水周围的碱性，碱性，富含矿物质的液体和更冷的海水之间形成。 有毫米尺度的空心''botryoidal'（类似葡萄的）簇和硫化铁硫化铁的烟囱的化石证据（2）。 管状化石的“藻类结构”，可能是生物源，在带状铁的沉积层中发现（3）。 1）。在自然界中比比皆是，从热液通风口的烟囱到洞穴中的苏打水。它们的形成受到预言发生的化学梯度的控制，定义了模板生长结构的表面。我们报告了一种自组织的周期性模板，在铁 - 硫酸盐溶液中用电化学产生肾小管结构；铁氧化物沉淀在气泡表面，这些气泡在管缘上徘徊，然后脱离，然后留下一圈材料。通过氨从气泡扩散到溶液中，酸 - 碱和氧化还原梯度自发产生，在管壁内组织径向构成分层，这是一种通过含有凝胶含量的摄氏4的氨基氧化物形成的复杂的液体氧化物模式在更大范围内研究的机制。当壁内形成磁铁矿时，管可能会在外部磁场中弯曲。在speleothem形成中与自由边缘问题的联系被强调。t繁殖过程跨越了大量的尺度和机制。在一个极端处是铁硫化物的烟囱，高于水热通风孔（1），在上升，酸性，酸性，热，富含矿物质的液体和较冷的海水周围的碱性，碱性，富含矿物质的液体和更冷的海水之间形成。有毫米尺度的空心''botryoidal'（类似葡萄的）簇和硫化铁硫化铁的烟囱的化石证据（2）。管状化石的“藻类结构”，可能是生物源，在带状铁的沉积层中发现（3）。1）。生物源例子包括软体动物贝壳，部分形成，部分是由于通过地幔中的泵送机制维持的化学梯度（4）和某些细菌，以及某些细菌，该阴离子多糖鞘的鞘吸引并吸引金属阳离子，可以产生由生物体细胞体（5）产生的管状结构（5）。最近的工作还确定，从微生物中挤出的多糖链可以充当氧化铁氧化铁沉淀的模板（6），并且细菌细胞的细丝甚至可以用作合成矿化的模板（7）。石灰石洞穴中的Speleothem形成提供了另一种相关的检查。当水向下流动，并徘徊在吊坠下，溶解的二氧化碳量大，提高pH值，并在滴下碳酸钙沉淀。掉落的脱落留下了一块附着在生长管上的材料环；重复此过程会产生直接的“苏打水”或弯曲的‘helictites'（8）。在电气沉积中也证明了气泡上的降水膜形成（9）。最后，树状“硅酸盐花园”（10-12）生长在硅酸钠溶液中，含有金属离子盐，可能来自硅酸盐凝胶膜上的渗透胁迫，现在可以以非常控制的方式研究（13）。我们在这里描述了一个自组织的过程，该过程是根据气泡的模板作用而生长的（图在电化学细胞的阴极生产，这些气泡支持在气体溶液界面形成的沉淀膜。气泡的脱离留下了延伸试管的物质环，过程继续。从机械上讲，这是洞穴中苏打水的增长的相位版本。，气泡以一到几秒钟的间隔脱离，这些
沉淀热处理或人工时效曲线...
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