黑色素瘤是最致命的皮肤癌,全球发病率不断上升。尽管黑色素瘤患者的诊断和治疗方法有很大改进,但该疾病仍然是一个严重的临床问题。因此,新的可用药物靶点成为研究的重点。EZH2 是 PRC2 蛋白复合物的组成部分,可介导靶基因的表观遗传沉默。在黑色素瘤中已发现几种激活 EZH2 的突变,这会导致肿瘤进展过程中的异常基因沉默。新出现的证据表明,长链非编码 RNA (lncRNA) 是 EZH2 沉默特异性的分子“地址代码”,靶向 lncRNA-EZH2 相互作用可能会减缓包括黑色素瘤在内的许多实体癌的进展。本综述总结了目前关于 lncRNA 参与 EZH2 介导的黑色素瘤基因沉默的知识。本文还简要讨论了阻断黑色素瘤中的 lncRNA-EZH2 相互作用作为一种新治疗选择的可能性,以及这种方法可能存在的争议和缺点。
图 1 JoinTRV 的设计,这是一种基于具有兼容来源的微型 T-DNA 载体的 TRV 表达系统。(A) 烟草脆裂病毒 (TRV) 的基因组组织。(B) TRV RNA2 工程用于序列克隆和表达。pLX-TRV2 的克隆盒图与 Bsa I 识别位点和 Bsa I 产生的突出端一起显示(底部)。LacZ 报告基因允许可视化选择重组载体;插入物的植物表达由豌豆早褐病毒 (PEBV) 外壳蛋白 (CP) 启动子驱动。(C) VIGS (pTRV2) 和 VIGE (pRNA2.PEBV) 中描述的 pLX-TRV2 和 TRV RNA2 载体的尺寸比较。(D) JoinTRV 系统图。两个 T-DNA 载体被多路复用到单个农杆菌细胞中,以同时递送 TRV 基因组成分。 pLX-TRV2 是 pLX-B2 衍生物,具有 pBBR1 来源和卡那霉素抗性基因 (npt I),pLX-TRV1 是 pLX-Z4 衍生物,具有 RK2 来源和庆大霉素抗性基因 (aac C1);由于这两个 T-DNA 载体具有兼容的来源和独立的抗生素选择机制,因此可以同时寄宿在同一细菌细胞中
转录因子 (TF) 介导的基因调控通常在致癌过程中被破坏。TF 结合位点的 DNA 甲基化状态可能决定相应基因的转录活性。研究表明,芪类多酚,如紫檀芪 (PTS),可通过重塑 DNA 甲基化和基因表达发挥抗癌作用。然而,这些影响背后的机制仍不清楚。本文探讨了 PTS 处理的 MCF10CA1a 侵袭性乳腺癌细胞中致癌 TF OCT1 结合与从头 DNA 甲基转移酶 DNMT3B 结合之间的动态关系。使用染色质免疫沉淀 (ChIP) 和下一代测序,我们确定了 47 个基因调控区,这些区域在 PTS 作用下 OCT1 结合减少,DNMT3B 结合丰富。大多数这些基因被发现具有致癌功能。我们选择了三个候选基因 PRKCA、TNNT2 和 DANT2,以进一步研究机制,同时考虑 PRKCA
简介亨廷顿舞蹈症 (HD) 是由亨廷顿基因 ( HTT) 第一个外显子上的 CAG 三核苷酸重复序列扩增引起的 (1)。CAG 重复序列大于 35 会导致患者出现特征性运动症状,且发病年龄与重复序列长度呈负相关 (2)。总体而言,CAG 重复序列扩增的大小以完全显性方式解释了约 60% 的发病年龄差异 (3),而无法解释的差异与各种基因位点有关 (4, 5)。这表明,亨廷顿舞蹈症的发病率主要由 CAG 重复序列的大小决定,并受其他基因的进一步影响 (5)。尽管亨廷顿舞蹈症的病因已被人们所知 25 多年 (1),但尚未开发出有效的治疗方法,这可能是因为亨廷顿舞蹈症的潜在疾病生物学原理复杂。
分享种族主义的个人经历时,边缘化社区的成员是否在社交媒体上沉默?在这里,我们研究了算法,人类和平台准则在抑制种族歧视披露的作用。在对基于邻里的社交媒体平台的实际帖子的研究中,我们发现,当用户谈论他们作为种族主义目标的经历时,他们的帖子会过多地浮动,以使五个广泛使用的节制算法从主要的在线平台上(包括最近的大型语言)(包括最新的大型语言)(包括最新的大型语言)删除。我们表明,人类用户也不成比例地进行这些披露以删除。接下来,在一项后续实验中,我们证明,仅仅目睹这种抑制会对黑人美国人如何看待社区及其在其中的位置产生负面影响。最后,为了应对在线空间中的公平和包容性的这些挑战,我们引入了一种缓解策略:一种指导原则的干预措施,可有效减少整个政治范围内的沉默行为。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 9 月 9 日发布。;https://doi.org/10.1101/2024.09.09.612111 doi:bioRxiv 预印本
了解CNC@PDA@Zn 2+诱导的NSLTP2定位变化的功能意义,我们测试了NSLTP2的抗病毒功能。虽然NBLTP1在TMV感染中的作用得到很好的特征,但我们系统地探索了NSLTP2在TMV感染中的作用。应力表达分析表明,在2 dpi的接种叶中,NSLTP2的表达与TMV-GFP显着增加,其表达在6 dpi的全身性叶片中也显着升高(图S7),这表明NSLTP2在抗病毒防御中的潜在作用。接下来,我们利用烟草病毒(TRV) - 介导的基因沉默来分析NSLTP2在TMV抗性中的作用。随后,本尼亚氏菌叶具有TRV1 + TRV2(TRV:00)或TRV1 + TRV2:NSLTP2:NSLTP2(TRV:NSLTP2)12天,RT- qPCR分析显示,NSLTP2在TRV中的NSLTP2表达显着 5b)。 然后,我们用TMV-GFP机械地接种了第6和7叶,并观察到在2、4和6 DPI下紫外线下的GFP运动以跟踪TMV分布。 如图所示 5A,在接种叶片的接种叶片中观察到GFP荧光信号,而QPCR分析表明,沉默的植物中TMV-GFP核酸水平明显高于对照组(图5b)。然后,我们用TMV-GFP机械地接种了第6和7叶,并观察到在2、4和6 DPI下紫外线下的GFP运动以跟踪TMV分布。如图5A,在接种叶片的接种叶片中观察到GFP荧光信号,而QPCR分析表明,沉默的植物中TMV-GFP核酸水平明显高于对照组(图5C)。 在4 DPI时,GFP信号出现在沉默的植物的全身叶子中,而在控制植物的全身叶子中未检测到GFP信号。病毒核酸的QPCR分析产生了相似的结果(图 5d)。 5e)。5C)。在4 DPI时,GFP信号出现在沉默的植物的全身叶子中,而在控制植物的全身叶子中未检测到GFP信号。病毒核酸的QPCR分析产生了相似的结果(图5d)。5e)。通过6 DPI,GFP信号在沉默的植物中更为明显,TMV-GFP在其全身叶片中显着积累(图这些结果表明NSLTP2沉默促进了TMV-GFP感染。随后,我们比较了
随着基因沉默和基因驱动等新基因技术的出现,开发更多杂草管理工具的努力正在获得巨大的发展势头。这些技术有望为开发可持续杂草控制方案提供新方法,因为基因沉默可以关闭介导适应性的基因(例如生长、除草剂抗性),而基因驱动可用于传播改良性状并设计适应性降低的野生种群。然而,应用基因沉默和/或基因驱动预计本质上是复杂的,因为它们的应用受到多种方法和技术困难的限制。在这篇评论中,我们探讨了这些技术的挑战,并讨论了加速开发基于基因技术的杂草管理工具的策略和资源。我们还重点介绍了如何将基因技术整合到现有的管理策略(例如传统的生物防治)中,以及它们可能的相互作用。
多梳抑制复合物 1 和 2 (PRC1 和 2) 是发育基因可遗传抑制所必需的。导致哺乳动物多梳抑制表观遗传的顺式和反式因子尚不完全清楚。本文表明,在人类细胞中,异位诱导的最初活跃的发育基因的多梳沉默,而不是普遍表达的管家基因附近,在许多细胞分裂中是可遗传的。出乎意料的是,沉默在 PRC2 的胚胎外胚层发育 (EED) 亚基的 H3K27me3 结合口袋发生突变的细胞中是可遗传的,已知突变会破坏 H3K27me3 识别并导致 H3K27me3 丢失。这种遗传模式不太稳定,需要完整的 PRC2 和 PRC1 对 H2AK119ub1 的识别。我们的研究结果表明,Polycomb 沉默的维持对局部基因组环境敏感,并且可以由 PRC1 依赖的 H2AK119ub1 和 PRC2 介导,而不依赖于 H3K27me3 识别。
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