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Optimutu：具有优化阈值的分类学意识到OTU聚类和用于元编码数据的生物信息学工作流程
要将以环境得出的元编码数据转换为社区矩阵进行生态分析，必须首先将序列聚集到操作分类单元（OTU）中。此任务对于包括大量带有不完整参考库的数据，包括大量的分类单元。OptimoTU提供了一种具有分类学意识的OTU聚类方法。它使用一组分类学识别的参考序列来选择最佳的遗传距离阈值，以将每个祖先分类群分组为最与后代分类单元最匹配的集群。然后，查询序列根据初步分类学标识和其祖先分类群的优化阈值聚类。该过程遵循分类学层次结构，从而将所有查询序列的所有查询序列完全分类为命名的分类学组以及占位符“ Pseudotaxa”，这些序列适合无法分类为相应等级的命名分类单元的序列。Optimutu聚类算法是作为R软件包实现的，在C ++中实现了速度的计算密集步骤，并合并了成对序列对齐的开源库库。距离也可以在外部计算，并且可以从UNIX管道中读取，从而允许大型数据集聚类，在该数据集中，整个距离矩阵将不方便地存储在内存中。Optimutu生物信息学管道包括一个完整的工作流程，用于配对端的Illumina测序数据，其中包含了质量过滤，DeNoising，Wratifact删除，分类学分类以及与Optimotu的OTU集群。开发了用于高性能计算簇的OptimoTU管道，并将其缩放到每个样品和数万个样本的数据集中。
供应链流程 781（BLK 781）
供应链管理的一个主要目标是通过实施跨职能流程作为协调内部和外部活动的机制来提高竞争力并获得市场优势。本课程旨在使学生了解整合关键供应链业务流程的重要性，并培养跨职能和企业孤岛分析和实施此类流程的能力。课程将考虑标准化流程定义和实践，包括战略和运营子流程以及关键绩效衡量标准。课程大纲：• 客户关系管理流程 • 供应商关系管理流程 • 客户服务管理流程 • 需求管理流程 • 订单履行流程 • 制造流程管理（计划和控制）流程 • 产品开发和商业化流程 • 退货管理流程 • 供应链管理 (SCM) 流程评估 • 实施和维持 SCM 流程 • 供应链映射方法 • 供应链绩效衡量标准
PassFlow：用于预测深部脑刺激结果的多模式工作流程
目的：深部脑刺激 (DBS) 是一种行之有效的帕金森病 (PD) 治疗方法，通常可增强运动功能。然而，DBS 后可能会出现一些不良副作用，从而降低患者的生活质量。因此，临床团队必须仔细选择要进行 DBS 的患者。在过去十年中，曾有人尝试将术前数据与 DBS 临床结果联系起来，其中大部分都集中在运动症状上。在本文中，我们提出了一种基于机器学习的方法，能够预测大量 PD 的 DBS 临床结果。方法：我们提出了一种多模式管道，称为 PassFlow，可预测 84 个临床术后临床评分。PassFlow 由一个用于压缩临床信息的人工神经网络、一种用于从 T1 成像中提取形态生物标志物的最先进的图像处理方法以及一个用于执行回归的 SVM 组成。我们在 196 名接受 DBS 的 PD 患者身上验证了 PassFlow。结果：PassFlow 的相关系数高达 0.71，能够显著预测 84 个评分中的 63 个，优于比较线性方法。还发现，利用这些术前信息预测的指标数量与可获得这些信息的患者数量相关，表明 PassFlow 方法仍在积极学习中。结论：我们提出了一种基于机器学习的新型流程，用于预测 PD 患者 DBS 术后的各种临床结果。PassFlow 考虑了来自不同数据模式的各种生物标志物，仅从术前数据中就显示出一些评分的高相关系数。这表明，DBS 的许多临床结果都可以预测，而与特定的模拟参数无关，因为 PassFlow 已在没有此类刺激相关信息的情况下得到验证。
改善工业绩效的管理流程的成熟度
在一个越来越多的活力的世界中，保持竞争力并满足客户不断增长的客户和市场的发展，对于任何努力追求卓越的公司来说，市场已成为真正的挑战。因此，采用绩效管理系统是面临意外市场变化的重要决定。因此，必须将质量投影到主要具有高度成熟度的方法和实践上，这使公司能够实现持续的流程改进并满足CUS Tomers的表达和隐性需求。但是，其他工具可以在全球定义和公司的所有等级层面上对Pundor Mance产生强大的责任感。这项工作的主要贡献是调整成熟模型，以评估受“能力成熟度模型集成CMMI”启发的制造行业的管理流程。在这项工作中，进行了在不同大小的摩洛哥行业中进行不同活动的摩洛哥行业，以定义其成熟水平及其与不同类型的工业管理的关系。
GREPore-seq：通过长距离 PCR 和纳米孔测序检测基因编辑后变化的强大工作流程
为了充分发挥基因编辑技术在临床治疗中的巨大潜力，需要彻底评估靶向编辑和非预期编辑的后果。然而，目前缺乏一种全面、流水线化、大规模且经济的工作流程来检测基因组编辑结果，特别是插入或删除大片段。在这里，我们描述了一种通过对条形码长距离 PCR 产物进行纳米孔池测序来有效准确地检测 CRISPR-Cas9 编辑后的多个基因变化的方法。为了克服纳米孔测序的高错误率和插入缺失，我们开发了一种流程，通过对纳米孔扩增子测序 (GREPore-seq) 的读取进行 grepping 来捕获条形码序列。GREPore-seq 可以检测 NHEJ 介导的双链寡脱氧核苷酸 (dsODN) 插入，其准确度与 Illumina 下一代测序 (NGS) 相当。GREPore-seq 还可以识别 HDR 介导的大基因敲入，这与 FACS 分析数据高度相关。还检测到了 HDR 编辑后的低水平质粒骨架插入。我们建立了一个实用的工作流程来识别遗传变化，包括量化 dsODN 插入、敲入、质粒骨架插入和 CRISPR 编辑后的大片段缺失。该工具包用于对汇集的长扩增子进行纳米孔测序，在评估靶向 HDR 编辑和超过 1 kb 的意外大插入缺失方面应具有广泛的应用。GREPore-seq 可在 GitHub 上免费获取（https://github.com/lisiang/GREPore-seq）。
利益相关者流程投票列表
•中西部电力传输Arkansas，LLC 126。Midland Cogeneration Venture Limited合作伙伴关系127。中西部工业客户（C/O Wisconsin Industrial Energy Group，Inc。）128。中西部大能消费者组129。明尼苏达州商会*130。明尼苏达州能源部门工商部* 131。明尼苏达州森林工业*132。明尼苏达州市政电动局133。明尼苏达州公用事业委员会*134。密西西比公共服务委员会* 135。密西西比州公用事业人员*136。密苏里盆地市政电动局（D/B/A密苏里河能源服务）137。密苏里州联合市政电力委员会D/B/A密苏里电气委员会138。密苏里州公共顾问办公室*139。密苏里公共服务委员会*140。Mn8 Energy LLC* 141。蒙大拿州消费者律师* 142。Montana-Dakota Utilities Co. 143。蒙大拿州公共服务委员会* 144。Monterey MW，LLC。145。Morgan Stanley Capital Group Inc. 146。Cedar Falls市的市政电力公司，IA147。内布拉斯加州市政能源局148。自然资源国防委员会*149。新奥尔良市议会*150。Nextera Energy，Inc。 - 1票作为控股公司的投票：
MicroAnnot：用于精确注释微孢子虫基因组的专用工作流程
摘要：微孢子虫有近 1700 个种，是一类专性胞内真核生物，对兽医、经济和医学有影响。为了帮助了解这些微生物的生物学功能，通常使用全基因组测序。然而，由于它们具有特定于分类单元的进化特征，因此很难正确预测它们的基因目录。由于需要创新的基因组注释策略来获得这些寄生虫整体生活方式的代表性快照，因此开发了 MicroAnnot 工具，这是一种专用的工作流程，使用来自精确注释的微孢子虫基因的精选数据库的数据进行微孢子虫序列注释。此外，还实施了特定模块来执行小基因（<300 bp）和转座因子识别。最后，使用基于签名的 InterProScan 软件进行功能注释。MicroAnnot 的准确性已通过对四个微孢子虫基因组的重新注释得到验证，这些基因组的结构注释之前已经得到验证。 MicroAnnot 通过比较方法和转录信号识别方法，可以准确预测翻译起始位点，有效识别转座因子，并对包括 300 bp 以下的微孢子虫基因具有高特异性和灵敏度。
在EOSC-LIFE工作流程中实现公平的数字对象
工作流语言（CWL）[15]，更具体地说是抽象的CWL [20]（不可执行）描述变体，伴随本机工作流定义。这以跨工作流语言的互操作方式呈现结构，组成的工具和外部接口。wfms可以生成抽象的CWL，已经为银河系演示，旁边是“本机” Galaxy Workflow描述。此语言二元性是可重复性的重要保留方面，因为可以独立于其本机格式作为CWL访问工作流的结构和元数据，即使可能不再可执行，也可以以公平的格式捕获规范的工作流。本机格式的共同存在可以从特定的WFM中直接重复使用，从而受益于其所有功能。●使用最小信息模型的有关工作流及其工具的元数据：我们使用BioSchemas [16]配置文件