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Pierce等,Proc。 natl。 学院。 ski.u.s.a. (1992)89,2056-2060•2 LOXP重组站点由Ricombinase CRE识别•PAC网站•PAC网站(162 bp),用于混合病毒颗粒中的重组分子•“填充”的“填充器”片段的“填充”(填充11 kb的adenovirus dna plapies plapies plase prastic•gene prast)复制品岩性的大量副本(在LAC启动子下)•SACB编码为Levan Sucrasi的SACB,催化蔗糖水解的酶。 在大肠杆菌中表达时,神圣的酶会产生levano,该酶积聚在周质空间中,对细胞的致命作用Pierce等,Proc。natl。学院。ski.u.s.a.(1992)89,2056-2060•2 LOXP重组站点由Ricombinase CRE识别•PAC网站•PAC网站(162 bp),用于混合病毒颗粒中的重组分子•“填充”的“填充器”片段的“填充”(填充11 kb的adenovirus dna plapies plapies plase prastic•gene prast)复制品岩性的大量副本(在LAC启动子下)•SACB编码为Levan Sucrasi的SACB,催化蔗糖水解的酶。在大肠杆菌中表达时,神圣的酶会产生levano,该酶积聚在周质空间中,对细胞的致命作用
目的:本研究帮助临床医生和研究人员在泛癌症药物遗传学背景下在当前市售的靶向测序面板和外显子组测序面板之间做出明智的选择。材料和方法:研究了九种当代市售的靶向泛癌症面板和 xGen Exome Research Panel v2,以确定它们在多大程度上覆盖了五个现有癌症知识库中的药物遗传学变体-药物相互作用以及癌症基因组图谱中的驱动突变和融合基因。结果:xGen Exome Research Panel v2 和 True-Sight Oncology 500 分别针对现有知识库中 71.0% 和 68.9% 的药物遗传学相互作用;以及癌症基因组图谱中 93.7% 和 86.0% 的驱动突变。所有其他研究面板的目标百分比都较低。结论:在涵盖的癌症药物遗传学变异-药物相互作用和药物遗传学癌症变异方面,外显子组测序优于泛癌症靶向测序组。
图 3. 与手动提取相比,从 MagNA Pure 24 和 MagNA Pure 96 系统提取的 cfDNA 具有更高的测序覆盖率和更少的重复读取。使用 MagNA Pure 24 cf ds 4000 hp 方案、MagNA Pure 96 cfdna ds 4000 方案或手动方案,从 4 mL 血浆中分离的 cfDNA 制备靶标富集文库。使用 KAPA HyperPrep Kit 和 SeqCap EZ Human Oncology Panel (2.75 Mb),将每个样本的 cfDNA 总产量用作 HyperCap 2.0 工作流程的输入。在捕获靶标之前,对文库进行多路复用;每次捕获都包含从三个提取工作流程中获得的样本。在 NextSeq 500 (2 x 75 bp) 上进行测序。在分析之前,将原始读取随机下采样至 6M。每个条形图代表 5 次重复提取的平均值;误差线表示标准差。