在非裔美国人 (AA) 等混血人群中开展的全基因组关联研究 (GWAS) 样本量有限,导致多基因风险评分 (PRS) 表现不佳。根据 AA 和欧洲血统 (EA) 人群之间共享许多致病基因,并且一些致病变异位于这些基因边界内的观察结果,我们利用位于疾病相关基因内的变异,提出了一种基于基因的新型 PRS 框架 (PRS 基因)。使用百万退伍军人计划的酒精使用障碍 (AUD) AA GWAS 和问题酒精使用的 EA GWAS 作为发现 GWAS,我们从 410 个基因中鉴定出 858 种与 AA 和 EA 中均与 AUD 相关的变异。使用这些变体计算的 PRS 基因与三个 AA 目标数据集中的 AUD 显著相关( P 值范围从 7.61E − 05 到 6.27E − 03;Beta 范围从 0.15 到 0.21)并且优于使用所有变体计算的 PRS( P 值范围从 7.28E − 03 到 0.16;Beta 范围从 0.06 到 0.18)。PRS 基因也与 EA 目标数据集中的 AUD 相关( P 值 = 0.02,Beta = 0.11)。在 AA 中,与最低十分位数的个体相比,最高 PRS 基因十分位数的个体患上 AUD 的优势比为 1.76(95% CI:1.32 – 2.34)。这 410 个基因在 54 个基因本体生物学过程中富集,包括乙醇氧化和涉及突触系统的过程,这些过程已知与 AUD 相关。此外,26 个基因是用于治疗 AUD 或其他疾病的药物的靶标,这些药物可能被考虑用于治疗 AUD。我们的研究表明,基于基因的 PRS 在评估 AA 中的 AUD 风险方面表现更好,并为 AUD 遗传学提供了新的见解。
在非裔美国人 (AA) 等混血人群中开展的全基因组关联研究 (GWAS) 样本量有限,导致多基因风险评分 (PRS) 表现不佳。根据 AA 和欧洲血统 (EA) 人群之间共享许多致病基因,并且一些致病变异位于这些基因边界内的观察结果,我们利用位于疾病相关基因内的变异,提出了一种基于基因的新型 PRS 框架 (PRS 基因)。使用百万退伍军人计划的酒精使用障碍 (AUD) AA GWAS 和问题酒精使用的 EA GWAS 作为发现 GWAS,我们从 410 个基因中鉴定出 858 种与 AA 和 EA 中均与 AUD 相关的变异。使用这些变体计算的 PRS 基因与三个 AA 目标数据集中的 AUD 显著相关( P 值范围从 7.61E − 05 到 6.27E − 03;Beta 范围从 0.15 到 0.21)并且优于使用所有变体计算的 PRS( P 值范围从 7.28E − 03 到 0.16;Beta 范围从 0.06 到 0.18)。PRS 基因也与 EA 目标数据集中的 AUD 相关( P 值 = 0.02,Beta = 0.11)。在 AA 中,与最低十分位数的个体相比,最高 PRS 基因十分位数的个体患上 AUD 的优势比为 1.76(95% CI:1.32 – 2.34)。这 410 个基因在 54 个基因本体生物学过程中富集,包括乙醇氧化和涉及突触系统的过程,这些过程已知与 AUD 相关。此外,26 个基因是用于治疗 AUD 或其他疾病的药物的靶标,这些药物可能被考虑用于治疗 AUD。我们的研究表明,基于基因的 PRS 在评估 AA 中的 AUD 风险方面表现更好,并为 AUD 遗传学提供了新的见解。